-
题名朝仓花椒DIR基因家族的鉴定及分析
被引量：1
- 1
-
-
作者
陈炳竹
王润英
赵懿琛
赵德刚
-
机构
贵州大学生命科学学院/茶学院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室/贵州省农业生物工程重点实验室
贵州省农业科学院/国家农业部植物新品种dus测试贵阳分中心
-
出处
《山地农业生物学报》
2020年第2期21-26,共6页
-
基金
贵州省科技计划项目(黔科合计Z字[2012]4008)
国家自然科学基金“杜仲松脂醇双糖苷生物合成关键蛋白DIRIGENT编码基因的克隆与功能分析”(31660076)
贵州省特色植物种质资源利用与创新人才基地(RCJD2018-14)。
-
文摘
本研究通过NCBI的BLAST比对分析,最终从朝仓花椒转录组数据库筛选出28条朝仓花椒Dirigent(DIR)蛋白家族的编码基因序列。利用MEGA、MEME、DNAMAN等软件对该蛋白家族进行生物信息学分析,结果显示:从朝仓花椒转录组中获得的28个DIR基因,经过鉴定,在进化上分为6个小组,每个小组的基因数量分别为7、5、1、0、5、10。该家族的蛋白等电点均小于7,均偏酸性,且多数属于稳定蛋白。多基因序列比对比发现,该家族蛋白均具有一个高保守性的DIR结构域。空间结构的分析预测ZpDIR蛋白多为多链线性折叠卷曲蛋白,且以线性无链非规则多链卷曲蛋白为主。
-
关键词
朝仓花椒
DIR基因家族
生信分析
-
Keywords
Zanthoxylum piperitum
DIR gene family
bioinformatics analysis
-
分类号
Q811.4
[生物学—生物工程]
-
