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题名百蕊草LRR-RLKs基因的鉴定与生物信息学分析
被引量：1
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作者
张文香
常子丽
李芳
杨香香
丁波
曹剑锋
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机构
贵州师范学院生物科学学院药用植物技术研究所
衡水学院生命科学学院
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出处
《南方农业》
2022年第9期1-6,共6页
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基金
贵州省科技厅自然科学研究基金项目(黔科合基础〔2016〕1415,黔科合基础〔2018〕1117)
贵州省科技厅平台人才项目(黔教合KY字〔2017〕5790-06)
+1 种基金
贵州林业科技项目(黔科合林〔2017〕01号)
贵州省教育厅生物科学一流专业项目(〔2019〕46)。
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文摘
以百蕊草(Thesiumchinense Turcz)为材料,根据硝酸银诱导的转录组数据,PCR克隆到两条LRR-RLK基因,通过测序、生物信息学分析、荧光定量PCR等技术对两条基因进行分析。结果发现,两条基因全长分别为1278 bp与2115 bp,分别编码425和704个氨基酸,命名为TcLRR1和TcLRR2;TcLRR1与拟南芥EFR基因一致性最高,TcLRR2与水稻Xa21一致性最高;TcLRR2具有完整的LRR-RLK蛋白结构(亮氨酸重复域、信号肽、跨膜结构域、激酶域),而TcLRR1缺乏激酶域;TcLRR1与TcLRR2在非胁迫条件下的组织表达模式一致,都在叶片中表达最高。综上所述,TcLRR2可作为百蕊草抗逆相关的LRR-RLK候选基因进行后续的深入研究。
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关键词
百蕊草
基因
LRR-RLK
TcLRR1
TcLRR2
生物信息学
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分类号
Q343.12
[生物学—遗传学]
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