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题名荞麦不同种间BW10KD过敏蛋白基因序列比较
被引量：4
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作者
陈晴晴
石桃雄
陈庆富
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机构
贵州师范大学生命科学学院植物遗传育种研究所/荞麦产业技术研究中心
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出处
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期133-139,共7页
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基金
国家自然科学基金(31060207
31171609)
+3 种基金
国家现代农业产业技术体系专项资金(CARS-08-A4)
贵州省农业攻关项目(黔科合NY字[2010]3094)
贵州省科技创新团队(黔科合人才团队[2011]4007)
贵阳市科技计划项目(筑科合同[2011102]1-12)
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文摘
荞麦过敏蛋白(BW10KD)与变应原病人的血清免疫球蛋白(immunoglobulin E,IgE)有强烈反应。通过对属于8个荞麦种和1个变种的58个收集系中的BW10KD过敏蛋白基因保守片段进行差异分析与系统进化关系研究,为探讨BW10KD基因的结构功能及其在不同种间的进化奠定了基础,并为发生在物种基因DNA水平的微尺度的变异与进化研究中提供新的分析方法。用设计的特异引物进行扩增,所得序列与已报道过敏蛋白编码基因序列相似性达99%。各收集系间进行序列比对,得到307个排列位点(不含缺失位点),其中单型不变位点150个,多态位点S为157个(含简约信息位点数101个和单型可变位点56个)。整个序列突变位点Eta为201个。选择特定分类群内变异小、分类群间变异大的19个位点进行系统聚类分析得到清晰的种系关系图。金荞、细柄野荞、硬枝万年荞聚在一起,暗示其具有较保守的BW10KD过敏蛋白基因序列;栽培甜荞与野甜荞亲缘关系近,其次与左贡野荞较近缘;毛野荞与大野荞彼此较近缘;栽培苦荞与野苦荞亲缘关系最近,与毛野荞和大野荞亲缘关系次之。
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关键词
荞麦
过敏蛋白基因
序列分析
系统发育
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Keywords
buckwheat
allergen protein gene
sequence analysis
phylogeny
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分类号
Q754
[生物学—分子生物学]
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