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苦荞二磷酸尿核苷-半乳糖转运载体FtUTR的鉴定与分析
1
作者
石桃雄
汪燕
+4 位作者
梁成刚
韦春玉
关志秀
黄娟
朱丽伟
《江苏农业科学》
北大核心
2021年第15期53-57,共5页
植物二磷酸尿核苷-半乳糖转运蛋白(UDP-galactose transporter, UTR)参与介导UDP-半乳糖的跨膜运输,对于高尔基体内非纤维素多糖和糖蛋白合成至关重要。为了给苦荞糖运输及调控机制研究提供科学参考,本研究基于基因功能注释与同源基因比...
植物二磷酸尿核苷-半乳糖转运蛋白(UDP-galactose transporter, UTR)参与介导UDP-半乳糖的跨膜运输,对于高尔基体内非纤维素多糖和糖蛋白合成至关重要。为了给苦荞糖运输及调控机制研究提供科学参考,本研究基于基因功能注释与同源基因比对,鉴定到9个苦荞FtUTR基因,其序列长度在1 920~5 975 bp间,氨基酸残基在81~352个间。FtUTR氨基酸序列的一致性为19.14%,说明苦荞不同FtUTR蛋白间序列保守性较低。但多个苦荞FtUTR可分别与同源的拟南芥AtUTR聚在一起,说明不同物种间UTR蛋白的进化关系较为紧密。基于茎的转录组测序鉴定到5个差异表达基因(DEGs),其中FtPinG0001931200.01在出苗后5 d高表达;FtPinG0001901300.01和FtPinG0002689200.01在出苗后10 d高表达;FtPinG0001931400.01和FtPinG0001052700.01在出苗后15 d高表达,推测它们可能在幼苗的特定发育阶段发挥作用。另外,幼苗发育过程中苦荞DEGs的表达量存在多个显著正相关或负相关关系。本研究结果可为下一步深入探索苦荞FtUTR调控UDP-半乳糖运输以及生长发育提供基础。
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关键词
苦荞
二磷酸尿核苷-半乳糖转运体
蛋白序列分析
基因表达
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题名
苦荞二磷酸尿核苷-半乳糖转运载体FtUTR的鉴定与分析
1
作者
石桃雄
汪燕
梁成刚
韦春玉
关志秀
黄娟
朱丽伟
机构
贵州师范大学生命科学学院/荞麦产业技术研究中心
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2021年第15期53-57,共5页
基金
国家自然科学基金(编号:32060511)
贵州省科技支撑计划(编号:黔科合ZC[2019]2298)
+2 种基金
贵州省高层次创新型人才“千层次人才”项目
贵州省荞麦种质资源保育及创新重点实验室建设基金(编号:黔教合KY[2017]002)
贵州省研究生教育创新计划(编号:黔教合YJSCXJH[2020]100)。
文摘
植物二磷酸尿核苷-半乳糖转运蛋白(UDP-galactose transporter, UTR)参与介导UDP-半乳糖的跨膜运输,对于高尔基体内非纤维素多糖和糖蛋白合成至关重要。为了给苦荞糖运输及调控机制研究提供科学参考,本研究基于基因功能注释与同源基因比对,鉴定到9个苦荞FtUTR基因,其序列长度在1 920~5 975 bp间,氨基酸残基在81~352个间。FtUTR氨基酸序列的一致性为19.14%,说明苦荞不同FtUTR蛋白间序列保守性较低。但多个苦荞FtUTR可分别与同源的拟南芥AtUTR聚在一起,说明不同物种间UTR蛋白的进化关系较为紧密。基于茎的转录组测序鉴定到5个差异表达基因(DEGs),其中FtPinG0001931200.01在出苗后5 d高表达;FtPinG0001901300.01和FtPinG0002689200.01在出苗后10 d高表达;FtPinG0001931400.01和FtPinG0001052700.01在出苗后15 d高表达,推测它们可能在幼苗的特定发育阶段发挥作用。另外,幼苗发育过程中苦荞DEGs的表达量存在多个显著正相关或负相关关系。本研究结果可为下一步深入探索苦荞FtUTR调控UDP-半乳糖运输以及生长发育提供基础。
关键词
苦荞
二磷酸尿核苷-半乳糖转运体
蛋白序列分析
基因表达
分类号
S517.01 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
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被引量
操作
1
苦荞二磷酸尿核苷-半乳糖转运载体FtUTR的鉴定与分析
石桃雄
汪燕
梁成刚
韦春玉
关志秀
黄娟
朱丽伟
《江苏农业科学》
北大核心
2021
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