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高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡GH基因多态性及生物信息学分析
被引量:
4
1
作者
杨红
张勇
+4 位作者
田启培
韦世文
何琦
杨隆
王芳芳
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第11期38-41,共4页
以高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡为研究对象,构建品种DNA池,PCR扩增生长激素(GH)基因所有外显子和部分内含子序列,采用直接测序法对3个鸡种的GH基因进行多态性检测,利用生物信息学软件预测不同多态性位点对GH基因m RNA二级结构的影响,旨在...
以高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡为研究对象,构建品种DNA池,PCR扩增生长激素(GH)基因所有外显子和部分内含子序列,采用直接测序法对3个鸡种的GH基因进行多态性检测,利用生物信息学软件预测不同多态性位点对GH基因m RNA二级结构的影响,旨在通过对贵州胫长差异较大的高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡GH基因的多态性及其生物信息学进行分析,研究GH基因对不同鸡种胫骨发育的影响。结果表明:在高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡3个鸡种GH基因中共检测到8个SNPs位点,其中A1133G、G1166A位于第2内含子区,C2027G、C2030T位于第4外显子区,G2152A位于第4内含子区,G3347A位于第5外显子区,T3416C和C3436T位于3'非编码区。生物信息学分析显示位于外显子区的3个SNPs均为同义突变,对GH基因的m RNA二级结构有一定影响。
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关键词
DNA池
GH基因
胫骨长度
SNPS
高脚鸡
矮脚鸡
百宜黑鸡
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职称材料
3个鸡种NKX2-5基因多态性与胫长的关联性分析
2
作者
杨红
张勇
+3 位作者
何琦
李俊
张雄
彭松
《广东农业科学》
CAS
2016年第6期156-162,共7页
以贵州特有鸡种高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡为试验对象,利用PCR-SSCP和DNA测序等方法检测了NKX2-5基因T563C、C675T位点在3个试验鸡群中不同基因型与胫长的关联性。T563C与胫长关联分析表明,高脚鸡群体中TT基因型个体胫长显著高于CC型,百...
以贵州特有鸡种高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡为试验对象,利用PCR-SSCP和DNA测序等方法检测了NKX2-5基因T563C、C675T位点在3个试验鸡群中不同基因型与胫长的关联性。T563C与胫长关联分析表明,高脚鸡群体中TT基因型个体胫长显著高于CC型,百宜黑鸡群体中TT基因型显著高于CT型,矮脚鸡群体中不同基因型个体间胫长差异不显著;C675T突变位点在3个鸡种中只有CC和CT两种基因型,且各鸡种不同基因型个体间胫长差异不显著。
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关键词
NKX2-5基因
鸡
胫长
SSCP
多态性
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职称材料
题名
高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡GH基因多态性及生物信息学分析
被引量:
4
1
作者
杨红
张勇
田启培
韦世文
何琦
杨隆
王芳芳
机构
贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室/贵州大学动物科学学院/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室
贵州大学
教学
实验
场
贵州省
兴义市农业局品改站
贵州省
贵阳市花溪区农业局
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第11期38-41,共4页
基金
贵州省科技计划(编号:黔合科NZ字[2012]3007号)
贵州省农业动植物育种专项(编号:黔农育专字[2012]10号)
浙江大学基本科研业务费专项资金(编号:2012XZZX003-1)
文摘
以高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡为研究对象,构建品种DNA池,PCR扩增生长激素(GH)基因所有外显子和部分内含子序列,采用直接测序法对3个鸡种的GH基因进行多态性检测,利用生物信息学软件预测不同多态性位点对GH基因m RNA二级结构的影响,旨在通过对贵州胫长差异较大的高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡GH基因的多态性及其生物信息学进行分析,研究GH基因对不同鸡种胫骨发育的影响。结果表明:在高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡3个鸡种GH基因中共检测到8个SNPs位点,其中A1133G、G1166A位于第2内含子区,C2027G、C2030T位于第4外显子区,G2152A位于第4内含子区,G3347A位于第5外显子区,T3416C和C3436T位于3'非编码区。生物信息学分析显示位于外显子区的3个SNPs均为同义突变,对GH基因的m RNA二级结构有一定影响。
关键词
DNA池
GH基因
胫骨长度
SNPS
高脚鸡
矮脚鸡
百宜黑鸡
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
3个鸡种NKX2-5基因多态性与胫长的关联性分析
2
作者
杨红
张勇
何琦
李俊
张雄
彭松
机构
毕节市农业经营管理站
贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室/贵州大学动物科学学院/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室
贵阳市花溪区农业局
出处
《广东农业科学》
CAS
2016年第6期156-162,共7页
基金
贵州省农业动植物育种专项(黔农育专字[2012]10号)
浙江大学基本科研业务费专项(2012XZZX003-1)
文摘
以贵州特有鸡种高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡为试验对象,利用PCR-SSCP和DNA测序等方法检测了NKX2-5基因T563C、C675T位点在3个试验鸡群中不同基因型与胫长的关联性。T563C与胫长关联分析表明,高脚鸡群体中TT基因型个体胫长显著高于CC型,百宜黑鸡群体中TT基因型显著高于CT型,矮脚鸡群体中不同基因型个体间胫长差异不显著;C675T突变位点在3个鸡种中只有CC和CT两种基因型,且各鸡种不同基因型个体间胫长差异不显著。
关键词
NKX2-5基因
鸡
胫长
SSCP
多态性
Keywords
NKX2-5 gene
chicken
shank length
SSCP
polymorphism
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
Q343.15 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡GH基因多态性及生物信息学分析
杨红
张勇
田启培
韦世文
何琦
杨隆
王芳芳
《江苏农业科学》
北大核心
2015
4
在线阅读
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职称材料
2
3个鸡种NKX2-5基因多态性与胫长的关联性分析
杨红
张勇
何琦
李俊
张雄
彭松
《广东农业科学》
CAS
2016
0
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已选择
0
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参考文献
引证文献
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