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大肠杆菌茶氨酸合成酶基因γ-GGT的生物信息学分析
被引量：
4
1
作者
吕晶晶
张天缘
+2 位作者
杨仕梅
宋莉
赵德刚
《山地农业生物学报》
2019年第1期74-78,共5页
γ-谷氨酰转肽酶(γ-GGT)是催化L-茶氨酸合成的关键酶之一,对其编码基因的解析有助于进行茶氨酸的合成调控和异源表达生产研究,本论文利用生物信息学方法,对大肠杆菌(Escherichia coli)γ-GGT基因的结构和特性进行分析。结果显示,E.coli...
γ-谷氨酰转肽酶(γ-GGT)是催化L-茶氨酸合成的关键酶之一,对其编码基因的解析有助于进行茶氨酸的合成调控和异源表达生产研究,本论文利用生物信息学方法,对大肠杆菌(Escherichia coli)γ-GGT基因的结构和特性进行分析。结果显示,E.coliγ-GGT基因编码580个氨基酸,主要氨基酸为甘氨酸和亮氨酸,γ-GGT酶蛋白等电点为5.38,分子量为61.7 kDa,属于酸性不稳定亲水性蛋白,具有信号肽序列和保守功能结构域,在细胞质周质中发挥作用,其二级结构元件主要是α-螺旋和无规卷曲,在微生物中进化较为保守。研究结果为进一步研究γ-GGT基因功能及其应用奠定了基础。
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关键词
大肠杆菌
γ-谷氨酰胺转肽酶
茶氨酸合成
GGT酶蛋白
生物信息学
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职称材料
杜仲SQS基因的特征信息分析
被引量：
4
2
作者
雷跃
杨仕梅
+2 位作者
张天缘
赵德刚
宋莉
《山地农业生物学报》
2019年第6期1-7,共7页
鲨烯合酶(SQS)是催化植物细胞合成甾醇和三萜类化合物的一种关键酶。为探明杜仲SQS基因家族成员的存在及其特性,本文通过生物信息学分析方法,对杜仲SQS基因(EuSQS)进行发掘,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体定位、蛋白理化...
鲨烯合酶(SQS)是催化植物细胞合成甾醇和三萜类化合物的一种关键酶。为探明杜仲SQS基因家族成员的存在及其特性,本文通过生物信息学分析方法,对杜仲SQS基因(EuSQS)进行发掘,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体定位、蛋白理化性质、空间结构、调控元件等进行分析。从杜仲基因组数据中获得3条EuSQS基因,它们分布于不同的scaffold上,有5~6个外显子;EuSQS蛋白含396~440 aa,相对分子质量为45.73~49.06 kDa,均属于不稳定蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;EuSQS1和EuSQS3在结构上较为接近,二者与EuSQS2差异较大;除含有基本元件外,EuSQSs的顺式作用元件还包括光照和激素响应、分生组织表达、逆境胁迫及类黄酮生物合成等六类;在进化关系上,杜仲EuSQSs与产胶植物橡胶草及橡胶树的亲缘关系较近。分析结果为进一步对EuSQS基因的功能鉴定和利用提供了依据。
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关键词
杜仲鲨烯合酶基因
萜类化合物
生物信息学
基因结构
功能预测
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职称材料
题名
大肠杆菌茶氨酸合成酶基因γ-GGT的生物信息学分析
被引量：
4
1
作者
吕晶晶
张天缘
杨仕梅
宋莉
赵德刚
机构
贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室贵州省农业生物工程重点实验室
贵州省
农业
科学
院
出处
《山地农业生物学报》
2019年第1期74-78,共5页
基金
国家转基因生物新品种培育重大专项子项目(2016ZX08010003-009)
贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2017]5788号)资助
文摘
γ-谷氨酰转肽酶(γ-GGT)是催化L-茶氨酸合成的关键酶之一,对其编码基因的解析有助于进行茶氨酸的合成调控和异源表达生产研究,本论文利用生物信息学方法,对大肠杆菌(Escherichia coli)γ-GGT基因的结构和特性进行分析。结果显示,E.coliγ-GGT基因编码580个氨基酸,主要氨基酸为甘氨酸和亮氨酸,γ-GGT酶蛋白等电点为5.38,分子量为61.7 kDa,属于酸性不稳定亲水性蛋白,具有信号肽序列和保守功能结构域,在细胞质周质中发挥作用,其二级结构元件主要是α-螺旋和无规卷曲,在微生物中进化较为保守。研究结果为进一步研究γ-GGT基因功能及其应用奠定了基础。
关键词
大肠杆菌
γ-谷氨酰胺转肽酶
茶氨酸合成
GGT酶蛋白
生物信息学
Keywords
Escherichia coli strain
γ-Glutamyltranspeptidase
synthesis of L-theanine
GGT protein
bioinformatics
分类号
Q180.99 [生物学—普通生物学]
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职称材料
题名
杜仲SQS基因的特征信息分析
被引量：
4
2
作者
雷跃
杨仕梅
张天缘
赵德刚
宋莉
机构
贵州大学
生命科学
学院/
农业
生物工程
研究院
/山地
植物
资源
保护与
种质
创新
教育部
重点
实验室
/
贵州省
农业
生物工程
重点
实验室
贵州省
农业
科学
院
出处
《山地农业生物学报》
2019年第6期1-7,共7页
基金
国家转基因生物新品种培育重大专项(2016ZX08010003)
文摘
鲨烯合酶(SQS)是催化植物细胞合成甾醇和三萜类化合物的一种关键酶。为探明杜仲SQS基因家族成员的存在及其特性,本文通过生物信息学分析方法,对杜仲SQS基因(EuSQS)进行发掘,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体定位、蛋白理化性质、空间结构、调控元件等进行分析。从杜仲基因组数据中获得3条EuSQS基因,它们分布于不同的scaffold上,有5~6个外显子;EuSQS蛋白含396~440 aa,相对分子质量为45.73~49.06 kDa,均属于不稳定蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;EuSQS1和EuSQS3在结构上较为接近,二者与EuSQS2差异较大;除含有基本元件外,EuSQSs的顺式作用元件还包括光照和激素响应、分生组织表达、逆境胁迫及类黄酮生物合成等六类;在进化关系上,杜仲EuSQSs与产胶植物橡胶草及橡胶树的亲缘关系较近。分析结果为进一步对EuSQS基因的功能鉴定和利用提供了依据。
关键词
杜仲鲨烯合酶基因
萜类化合物
生物信息学
基因结构
功能预测
Keywords
EuSQS genes
terpenoids
bioinformatics
gene structure
function prediction
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大肠杆菌茶氨酸合成酶基因γ-GGT的生物信息学分析
吕晶晶
张天缘
杨仕梅
宋莉
赵德刚
《山地农业生物学报》
2019
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
杜仲SQS基因的特征信息分析
雷跃
杨仕梅
张天缘
赵德刚
宋莉
《山地农业生物学报》
2019
4
在线阅读
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职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
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