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从江香猪IFN-β基因的序列分析及原核表达 被引量:6
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作者 温贵兰 张升波 +6 位作者 李昌红 徐丽 田浪 文明 王开功 程振涛 赵德刚 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第1期10-19,共10页
试验旨在探明从江香猪β-干扰素(interferon-beta,IFN-β)基因编码区分子序列及原核表达产物特征。以从江香猪为研究对象,提取肝脏总RNA并反转录为cDNA,设计特异性引物扩增IFN-β基因编码区,将目的基因片段克隆至原核表达质粒pET-28a上... 试验旨在探明从江香猪β-干扰素(interferon-beta,IFN-β)基因编码区分子序列及原核表达产物特征。以从江香猪为研究对象,提取肝脏总RNA并反转录为cDNA,设计特异性引物扩增IFN-β基因编码区,将目的基因片段克隆至原核表达质粒pET-28a上,获得重组质粒pET28a-CJpoIFN-β,并利用生物学软件对江香猪IFN-β基因编码区进行序列分析;将鉴定正确的重组质粒pET28a-CJpoIFN-β转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,经IPTG诱导表达、SDS-PAGE与Western blotting分析原核表达蛋白。结果表明,从江香猪IFN-β基因编码区长为561bp,编码186个氨基酸;该蛋白为分泌性蛋白,前21个氨基酸为信号肽序列;二级结构主要以α-螺旋(77.42%)和无规则卷曲(17.74%)为主。从江香猪与其他猪源IFN-β基因核苷酸序列同源性为99.5%~100.0%,与禽的同源性最低(35.2%);从江香猪与巴马猪、梅山猪IFN-β氨基酸同源性均为100.0%,但与贵州白香猪IFN-β同源性为99.5%,存在E43Q、K73R和C161R3处氨基酸的差异。Western blotting结果显示,带His标签的重组表达蛋白能被His单抗识别,条带大小约为24ku。本试验结果为进一步研究IFN-β基因生物学活性及加快从江香猪这一品种资源的有效利用提供参考依据。 展开更多
关键词 从江香猪 IFN-β基因 序列分析 原核表达
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从江香猪源干扰素α2基因的克隆与序列分析 被引量:1
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作者 温贵兰 陈绍品 +2 位作者 张升波 林汉卿 赵德刚 《动物医学进展》 北大核心 2018年第12期54-60,共7页
选取我国珍稀物种贵州从江香猪作为研究对象,提取贵州从江香猪肝脏组织总RNA,反转录生成cDNA,采用特异性引物扩增从江香猪的IFN-α2(CJ-poIFN-α2)基因编码区,克隆至pUCm-T载体后送上海英骏公司测序,并用生物学软件对CJ-poIFN-α2基因... 选取我国珍稀物种贵州从江香猪作为研究对象,提取贵州从江香猪肝脏组织总RNA,反转录生成cDNA,采用特异性引物扩增从江香猪的IFN-α2(CJ-poIFN-α2)基因编码区,克隆至pUCm-T载体后送上海英骏公司测序,并用生物学软件对CJ-poIFN-α2基因进行序列分析。测序结果显示,从江香猪IFN-α2编码区长为546bp;序列比对结果表明CJ-poIFN-α2与猪源IFN-α2核苷酸序列同源性最高,为98.7%,遗传进化树结果也显示两者在同一分支上,说明两者遗传关系较近;在线服务器软件分析结果显示,CJ-poIFN-α2二级结构主要以α-螺旋、无规则卷曲为主,23-24aa位点预测为信号肽酶切位点;CJ-poIFN-α2基因编码蛋白B细胞表位主要位于46-48aa、56-58aa、70-73aa、155-159aa、175-178aa。试验结果为进一步研究干扰素的生物学活性、加快从江香猪的资源开发与利用奠定基础。 展开更多
关键词 从江香猪 IFN-α2 基因克隆 序列分析
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从江香猪源切除信号肽β干扰素原核载体的构建
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作者 温贵兰 陈绍品 +7 位作者 张升波 李昌红 徐丽 田浪 文明 王开功 程振涛 赵德刚 《贵州畜牧兽医》 2018年第5期1-4,共4页
β干扰素(IFN-β)具有重要的抗病毒生物学功能,为了研究从江香猪源IFN-β生物活性,试验设计1对扩增切除信号肽序列的香猪源IFN-β编码区引物,以pUCm-T-IFN-β为模板进行PCR扩增,经菌液PCR筛选、测序鉴定后,获得重组质粒pColdⅠ-CJ-poIFN... β干扰素(IFN-β)具有重要的抗病毒生物学功能,为了研究从江香猪源IFN-β生物活性,试验设计1对扩增切除信号肽序列的香猪源IFN-β编码区引物,以pUCm-T-IFN-β为模板进行PCR扩增,经菌液PCR筛选、测序鉴定后,获得重组质粒pColdⅠ-CJ-poIFN-β,将其转入大肠埃希菌BL21(DE3)感受态细胞中,IPTG诱导表达后用SDS-PAGE蛋白电泳,Western blot方法对重组表达蛋白进行分析。结果:切除信号肽序列的从江香猪源IFN-β序列编码区长为498 bp,表明该片段已正确插入原核表达质粒pColdⅠ中;SDS-PAGE蛋白电泳在预期位置未见蛋白条带,但Western blot检测显示带His标签的重组表达蛋白能被His单抗识别,显色后条带为18.26 ku,与预期大小相符。结果显示:试验成功构建了携带切除信号肽序列的香猪源IFN-β基因的原核表达质粒,但重组蛋白表达量极低,试验结果为进一步研究从江香猪源-β干扰素的生物活性奠定基础。 展开更多
关键词 从江香猪 Β干扰素 信号肽 原核表达
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猪繁殖与呼吸综合征病毒GZZJ201711株全基因组序列分析 被引量:2
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作者 陈广 张升波 +8 位作者 温贵兰 李昌红 徐丽 田浪 张喜懿 龚新勇 陈彦希 文明 王开功 《动物医学进展》 北大核心 2020年第1期20-26,共7页
为了解贵州省毕节地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)基因变异情况,于2017年从贵州毕节地区某疑似感染PRRSV猪群分离到1株PRRSV,将其命名为GZZJ201711毒株。采用RT-PCR分段扩增出PRRSV GZZJ201711株13个基因片段,分别连接到pMD19-T载体... 为了解贵州省毕节地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)基因变异情况,于2017年从贵州毕节地区某疑似感染PRRSV猪群分离到1株PRRSV,将其命名为GZZJ201711毒株。采用RT-PCR分段扩增出PRRSV GZZJ201711株13个基因片段,分别连接到pMD19-T载体上进行测序,拼接后得到PRRSV GZZJ201711株全基因组长15 322 bp (去除polyA尾),包括5’UTR、ORFla-ORF7、3’UTR。序列分析表明,GZZJ201711株与欧洲型Lelystad virus(LV)株核苷酸同源性为60.3%,与美洲型毒株代表株ATCC VR-2332核苷酸同源性为89.2%,与HP-PRRSV(HUN4、JXA1、TJ)等毒株同源性在98.8%~98.9%之间。GZZJ201711株与高致病性毒株JXA1、HUN4、TJ属于同一小分支,其中与XJu-1、GDHY毒株遗传关系最近。GZZJ201711毒株的NSP2基因有30个氨基酸缺失,与JXA1、HUN4、TJ等HP-PRRSV毒株缺失位置一致。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 全基因组 序列分析
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猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株E11105 N基因的序列分析与原核表达 被引量:1
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作者 张升波 陈绍品 +6 位作者 温贵兰 伍昌华 李天珍 李晨 王开功 文明 龚新勇 《动物医学进展》 北大核心 2016年第10期41-47,共7页
为研究PRRSV N蛋白的结构、功能以及N蛋白在病毒致病中的作用,以临床分离PRRSV毒株E11105为研究对象,采用Primer Premier 5.0设计一对特异性引物,经RT-PCR扩增出N基因片段,利用相关分子生物学软件对N基因序列进行分析;将N基因克隆连接到... 为研究PRRSV N蛋白的结构、功能以及N蛋白在病毒致病中的作用,以临床分离PRRSV毒株E11105为研究对象,采用Primer Premier 5.0设计一对特异性引物,经RT-PCR扩增出N基因片段,利用相关分子生物学软件对N基因序列进行分析;将N基因克隆连接到pColdⅠ原核表达载体上,经PCR、双酶切鉴定及序列测定后,得到重组质粒pColdⅠ-N,将pColdⅠ-N转入大肠埃希菌BL21(DE3)感受态细胞中,IPTG诱导表达后用SDS-PAGE蛋白电泳及Western blot验证分析。结果显示,分离株E11105N基因与北美洲型代表株VR-2332、欧洲型代表株Lelystad virus(LV)、中国2006年暴发的高致病性PRRSV代表株JXA1、中国代表株CH-1a的核苷酸序列同源性分别为93.3%、34.7%、99.2%、95.4%,氨基酸序列同源性分别为94.4%、15.3%、94.4%、99.2%;系统进化树显示,E11105株N基因与美洲型代表株VR-2332、中国高致病性JXA1毒株的亲缘关系较近;分离株E11105N基因所编码蛋白不存在跨膜区;二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,分别占20.33%和63.41%;预测该蛋白可能存在5个较为明显的B细胞优势抗原表位。SDS-PAGE蛋白电泳结果表明,重组N蛋白主要存在于菌体沉淀中,分子质量约为16.7ku;Western blot结果显示,带His标签的重组表达蛋白能被His单克隆抗体识别,显色后条带约为16.7ku,与SDS-PAGE蛋白电泳的条带大小一致。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 N基因扩增 序列分析 原核表达
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鸡滑液囊支原体的RT-PCR检测及基因序列分析 被引量:4
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作者 田浪 温贵兰 +9 位作者 程振涛 王开功 文明 周碧君 张升波 杨佰启 李昌红 徐丽 张喜懿 陈广 《贵州畜牧兽医》 2019年第1期45-47,共3页
为确诊某鸡场肉鸡发病死亡的病因,通过临床症状、病理变化、RT-PCR检测、病原S1基因序列分析进行综合诊断。结果:(1)病鸡表现食欲不振、精神沉郁、跛行及无法站立、关节肿大等症状,剖检发现肿大关节内有大量黏液。(2)鸡滑液囊支原体RT-... 为确诊某鸡场肉鸡发病死亡的病因,通过临床症状、病理变化、RT-PCR检测、病原S1基因序列分析进行综合诊断。结果:(1)病鸡表现食欲不振、精神沉郁、跛行及无法站立、关节肿大等症状,剖检发现肿大关节内有大量黏液。(2)鸡滑液囊支原体RT-PCR扩增出现207 bp特异性条带,与预期结果一致。(3)病原S1基因序列分析显示与GenBank公布的鸡滑液囊支原体基因序列同源性均达到99%,构建系统进化树分析显示与GenBank公布的参考株聚为1支。综合诊断为鸡滑液囊支原体感染。 展开更多
关键词 鸡滑液囊支原体 RT-PCR检测 基因序列分析 鉴别诊断
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超市肉制品细菌污染情况调查 被引量:5
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作者 蒋灵 温贵兰 张升波 《当代畜禽养殖业》 2019年第11期17-18,共2页
根据世界卫生组织报告,全世界每年死于腹泻疾病的人有200万,多数腹泻都是因为食用了被细菌污染的食物。国家卫生计生委办公厅关于2015年全国食物中毒事件情况的通报显示:2015年我国发生食物中毒事件169起,中毒总人数5926人,其中由细菌... 根据世界卫生组织报告,全世界每年死于腹泻疾病的人有200万,多数腹泻都是因为食用了被细菌污染的食物。国家卫生计生委办公厅关于2015年全国食物中毒事件情况的通报显示:2015年我国发生食物中毒事件169起,中毒总人数5926人,其中由细菌引起的食物中毒占全年食物中毒总数的53.7%。可见食源性细菌污染已经不容忽视。 展开更多
关键词 超市 肉制品 细菌 污染
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猴源DDX3X基因的克隆及生物信息学分析
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作者 杨洪 田浪 +5 位作者 张升波 张喜懿 温贵兰 程振涛 王开功 周碧君 《贵州农业科学》 CAS 2019年第12期70-75,共6页
为猴源DDX3X基因与相关病毒作用机理的深入研究奠定基础,根据Gen Bank预测的猪源DDX3X基因序列(登录号HQ266638)设计合成特异性引物,采用RT-PCR从猴源肾细胞中扩增DDX3X基因,将其克隆至pMD-19T载体测序,并对其进行生物学特征分析。结果... 为猴源DDX3X基因与相关病毒作用机理的深入研究奠定基础,根据Gen Bank预测的猪源DDX3X基因序列(登录号HQ266638)设计合成特异性引物,采用RT-PCR从猴源肾细胞中扩增DDX3X基因,将其克隆至pMD-19T载体测序,并对其进行生物学特征分析。结果表明:克隆的猴源DDX3X基因全长1989 bp,与猕猴的核苷酸序列同源性达99.6%,与绿猴、猕猴和人并列在同一遗传进化分支上,与三者的一致性较高;蛋白编码有662个氨基酸,共计20种氨基酸;甘氨酸含量最高,为11.5%,理论等电点为6.73;猴源DDX3X基因含有DEAD-Like解旋酶超家族结构域和C端结构域,DDX3X蛋白具有良好的亲水性,二级、三级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。猴源DDX3X基因与多个调节细胞进程、RNA加工的关键蛋白存在相互作用。 展开更多
关键词 DDX3X基因 猴源肾细胞 T克隆 生物信息学分析
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布氏杆菌和羊口疮血清抗体的检测与分析
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作者 魏敏 龙宥茨 +3 位作者 张煜杭 姬格金 梁倩 鲜思美 《吉林畜牧兽医》 2023年第7期121-122,共2页
布氏杆菌病(brucellosis)是由布氏杆菌(brucella)引起的一种人畜共患慢性传染病,主要侵害生殖系统,可引起流产、不育和各种组织的局部病症。羊口疮(Orf)是由羊口疮病毒(Orfvirus,OrfV)引起的主要感染绵羊和山羊的一种急性人兽共患传染病... 布氏杆菌病(brucellosis)是由布氏杆菌(brucella)引起的一种人畜共患慢性传染病,主要侵害生殖系统,可引起流产、不育和各种组织的局部病症。羊口疮(Orf)是由羊口疮病毒(Orfvirus,OrfV)引起的主要感染绵羊和山羊的一种急性人兽共患传染病,该病的传染性强,发病率高。这两种传染病不仅给羊产业带来巨大的经济损失,且存在社会公共卫生安全隐患。本试验采用虎红平板凝集试验和间接ELISA方法对临床上采集的423份羊血清样本进行了布氏杆菌和羊口疮抗体的检测。结果:血清中的羊布氏杆菌抗体为阴性;羊口疮疫苗免疫羊血清样本阳性率为62.55%(152/243),未免疫羊血清样本阳性率为14.44%(26/180)。表明采样羊群不存在布氏杆菌感染,但存在羊口疮病毒感染。 展开更多
关键词 布氏杆菌病 羊口疮 虎红平板凝集试验 间接ELISA
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