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枇杷Ty1-copia类反转录转座子RT序列克隆及分析
被引量：
2
1
作者
吴敏芳
刘厚宇
文晓鹏
《中国南方果树》
北大核心
2019年第5期1-8,共8页
为探索枇杷Eriobotrya japonica基因组进化起源和多样性的关系,本文根据Tyl-copia类反转座子反转录酶(Reverse transcriptase,RT)的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,经过克隆、测序及序列分析,获得了59条来源于枇杷的RT序列。通过系统...
为探索枇杷Eriobotrya japonica基因组进化起源和多样性的关系,本文根据Tyl-copia类反转座子反转录酶(Reverse transcriptase,RT)的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,经过克隆、测序及序列分析,获得了59条来源于枇杷的RT序列。通过系统演化分析,所得核苷酸序列可分为4个群组,序列长度变化范围为241~282 bp,同源性范围为30.8%~100%;编码氨基酸中有17条序列出现终止密码子突变;经反转录转座子RT氨基酸序列比对,枇杷与苹果、李、梅等蔷薇科植物亲缘关系较近。因此,枇杷Ty1-copia类反转录转座子RT序列具有高度异质性,枇杷与蔷薇科物种间有共同起源,而且Ty1-copia类反转座子不仅可以纵向传递,还可在不同类群间横向传递。
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关键词
枇杷
反转录转座子
Ty1-copia
同源性
起源与进化
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题名
枇杷Ty1-copia类反转录转座子RT序列克隆及分析
被引量：
2
1
作者
吴敏芳
刘厚宇
文晓鹏
机构
贵州大学农业生物工程研究院/贵州大学生命科学院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室
贵州大学
林
学院/
贵州
省森林
资源
与环境
研究
中心
贵州
省清镇市
农业
农村局
出处
《中国南方果树》
北大核心
2019年第5期1-8,共8页
基金
贵州省高层次创新型人才培养项目[黔科合人才(2016)4010]资助
文摘
为探索枇杷Eriobotrya japonica基因组进化起源和多样性的关系,本文根据Tyl-copia类反转座子反转录酶(Reverse transcriptase,RT)的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,经过克隆、测序及序列分析,获得了59条来源于枇杷的RT序列。通过系统演化分析,所得核苷酸序列可分为4个群组,序列长度变化范围为241~282 bp,同源性范围为30.8%~100%;编码氨基酸中有17条序列出现终止密码子突变;经反转录转座子RT氨基酸序列比对,枇杷与苹果、李、梅等蔷薇科植物亲缘关系较近。因此,枇杷Ty1-copia类反转录转座子RT序列具有高度异质性,枇杷与蔷薇科物种间有共同起源,而且Ty1-copia类反转座子不仅可以纵向传递,还可在不同类群间横向传递。
关键词
枇杷
反转录转座子
Ty1-copia
同源性
起源与进化
Keywords
Eriobotrya japonica
retrotransposon
Ty1-copia
homology
origin and evolution
分类号
S667.3 [农业科学—果树学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
枇杷Ty1-copia类反转录转座子RT序列克隆及分析
吴敏芳
刘厚宇
文晓鹏
《中国南方果树》
北大核心
2019
2
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