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林烟草(Nicotiana sylvestris)K+通道蛋白基因NsAKT 1克隆及生物信息学分析
被引量：
2
1
作者
韦春
宋小潘
秦利军
《种子》
北大核心
2020年第11期19-25,共7页
AKT 1是一种重要的钾离子通道蛋白,负责植物体中K+的吸收和运输。为探讨烟草中AKT 1编码基因的序列结构和蛋白功能,以林烟草(N.sylvestris)为材料,以cDNA为模板对NsAKT 1基因进行同源克隆,同时对NsAKT 1编码蛋白的结构及功能进行预测。...
AKT 1是一种重要的钾离子通道蛋白,负责植物体中K+的吸收和运输。为探讨烟草中AKT 1编码基因的序列结构和蛋白功能,以林烟草(N.sylvestris)为材料,以cDNA为模板对NsAKT 1基因进行同源克隆,同时对NsAKT 1编码蛋白的结构及功能进行预测。结果表明,NsAKT 1基因的开放阅读框全长2682 bp,可编码893个AA,分子量为100.375 kDa。利用ProtParam、SignalP 4.0软件及Tmpred等软件对NsAKT 1蛋白的结构预测显示,该蛋白是一个亲水性的酸性跨膜蛋白,无信号肽,为非分泌型蛋白。NsAKT 1主要定位于内质网膜、高尔基体、质膜等部位,其二级结构由48个α螺旋(α-helix)、35个延伸链(extended strand)、36个β转角(β-turn)及59个无规则卷曲(random coil)组成,三者间通过无规则卷曲(random coil)进行连接。本研究为进一步探讨NsAKT 1的生物学功能提供了理论依据。
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关键词
林烟草
NsAKT
1
基因克隆
生物信息学
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职称材料
拟南芥(Arabidopsis thaliana)DWF4基因克隆、生物学信息分析及过表达载体构建
被引量：
1
2
作者
韦春
杨莉琴
秦利军
《种子》
北大核心
2021年第1期1-5,10,共6页
BRs(Brassinosteroids)是植物体内一种重要的类固醇激素,具有十分重要的生理功能。DWF 4是BRs生物合成的关键限速酶,显著影响BRs在植物体中的含量。本研究以拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,利用同源克隆技术从A.thaliana cDNA中克...
BRs(Brassinosteroids)是植物体内一种重要的类固醇激素,具有十分重要的生理功能。DWF 4是BRs生物合成的关键限速酶,显著影响BRs在植物体中的含量。本研究以拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,利用同源克隆技术从A.thaliana cDNA中克隆到全长为1542 bp的特异性条带,测序结果表明该条带为AtDWF4基因;生物学信息分析显示该基因可编码513个氨基酸(amino acid,aa),Proscale在线预测该蛋白为亲水性蛋白,且SOPM分析表明DWF 4蛋白含有α-螺旋(alpha-helix)、β-折叠(beta-fold)、β-转角(beta-angle)等多个二级结构。同时,研究还构建了含AtDWF4基因的超量表达载体pRI 201-RdDwf 4,并遗传转化烟草K 326,已获得抗性愈伤组织及抗性芽。本研究为进一步探究过表达AtDWF4基因对烟草形态及抗逆胁迫能力的影响提供理想的实验材料。
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关键词
拟南芥
BRs
DWF4基因
过表达载体构建
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职称材料
寡聚核苷酸介导的基因突变技术创制抗除草剂烟草新种质
3
作者
谢宇峰
秦利军
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期1551-1560,共10页
为进一步优化烟草(Nicotiana tabacum)品种‘K326’的种质,该研究采用寡聚核苷酸介导的基因突变(oligonucleotide-mediated mutagenesis,OMM)技术,利用植物中支链氨基酸合成途径中第一个关键酶——乙酰乳酸合成酶(acetolactate synthase...
为进一步优化烟草(Nicotiana tabacum)品种‘K326’的种质,该研究采用寡聚核苷酸介导的基因突变(oligonucleotide-mediated mutagenesis,OMM)技术,利用植物中支链氨基酸合成途径中第一个关键酶——乙酰乳酸合成酶(acetolactate synthase,ALS)突变后烟草对氯磺隆除草剂不敏感且产生抗性的特征,以及NCBI报道的ALS基因序列同源克隆了烟草品种‘K326’中的ALS基因,并根据ALS基因序列设计用于定点突变的RNA/DNA嵌合体,导入烟草品种‘K326’创制对氯磺隆除草剂具有抗性的烟草新种质。结果表明:(1)烟草品种‘K326’具有2条ALS基因,即ALS SuRA和ALS SuRB,大小分别为2004 bp和2010 bp。(2)根据2个基因的保守位点ALS SuRA 588脯氨酸位点和ALS SuRB 1719色氨酸位点设计用于ALS基因核苷酸第588位点的Chl-588嵌合体和第1719位点的Chl-1719嵌合体。(3)利用基因枪成功将这2个片段导入烟草愈伤组织,愈伤组织依次经抗性芽分化和生根,共获得氯磺隆抗性植株22株。(4)抗性植株ALS酶活性测定显示,8株抗性植株具有较强的活性,进一步对抗性植株中跨突变位点保守扩增、测序,最终确定有2株(f11和b18)分别在588、1719位点产生定点突变。综上认为,该研究在获得烟草品种‘K326’抗氯磺隆新种质同时,也为培育抗性烟草新种质提供了理想的亲本材料。
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关键词
烟草
ALS基因
除草剂抗性
氯磺隆
OMM技术
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职称材料
题名
林烟草(Nicotiana sylvestris)K+通道蛋白基因NsAKT 1克隆及生物信息学分析
被引量：
2
1
作者
韦春
宋小潘
秦利军
机构
贵州大学农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室/生命科学学院
出处
《种子》
北大核心
2020年第11期19-25,共7页
基金
贵州省科技计划项目“烟草钾离子通道蛋白及BR对植株抗非生物胁迫研究”(黔科合LH[2016]7449号)
贵大人才培育项目“油菜素内酯介导的烟草抗TMV机理研究”(黔科合平台人才[2018]5781号)。
文摘
AKT 1是一种重要的钾离子通道蛋白,负责植物体中K+的吸收和运输。为探讨烟草中AKT 1编码基因的序列结构和蛋白功能,以林烟草(N.sylvestris)为材料,以cDNA为模板对NsAKT 1基因进行同源克隆,同时对NsAKT 1编码蛋白的结构及功能进行预测。结果表明,NsAKT 1基因的开放阅读框全长2682 bp,可编码893个AA,分子量为100.375 kDa。利用ProtParam、SignalP 4.0软件及Tmpred等软件对NsAKT 1蛋白的结构预测显示,该蛋白是一个亲水性的酸性跨膜蛋白,无信号肽,为非分泌型蛋白。NsAKT 1主要定位于内质网膜、高尔基体、质膜等部位,其二级结构由48个α螺旋(α-helix)、35个延伸链(extended strand)、36个β转角(β-turn)及59个无规则卷曲(random coil)组成,三者间通过无规则卷曲(random coil)进行连接。本研究为进一步探讨NsAKT 1的生物学功能提供了理论依据。
关键词
林烟草
NsAKT
1
基因克隆
生物信息学
Keywords
Nicotiana sylvestris
NsAKT 1
gene clone
bioinformatics
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
拟南芥(Arabidopsis thaliana)DWF4基因克隆、生物学信息分析及过表达载体构建
被引量：
1
2
作者
韦春
杨莉琴
秦利军
机构
贵州大学农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室/生命科学学院
出处
《种子》
北大核心
2021年第1期1-5,10,共6页
基金
贵州省科技计划项目“烟草钾离子通道蛋白及BR对植株抗非生物胁迫研究”(黔科合LH[2016]7449号)
贵大人才培育项目“油菜素内酯介导的烟草抗TMV机理研究”(黔科合平台人才[2018]5781号)。
文摘
BRs(Brassinosteroids)是植物体内一种重要的类固醇激素,具有十分重要的生理功能。DWF 4是BRs生物合成的关键限速酶,显著影响BRs在植物体中的含量。本研究以拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,利用同源克隆技术从A.thaliana cDNA中克隆到全长为1542 bp的特异性条带,测序结果表明该条带为AtDWF4基因;生物学信息分析显示该基因可编码513个氨基酸(amino acid,aa),Proscale在线预测该蛋白为亲水性蛋白,且SOPM分析表明DWF 4蛋白含有α-螺旋(alpha-helix)、β-折叠(beta-fold)、β-转角(beta-angle)等多个二级结构。同时,研究还构建了含AtDWF4基因的超量表达载体pRI 201-RdDwf 4,并遗传转化烟草K 326,已获得抗性愈伤组织及抗性芽。本研究为进一步探究过表达AtDWF4基因对烟草形态及抗逆胁迫能力的影响提供理想的实验材料。
关键词
拟南芥
BRs
DWF4基因
过表达载体构建
Keywords
Arabidopsis thaliana
BRs
DWF4 gene
overexpression vector construction
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
在线阅读
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职称材料
题名
寡聚核苷酸介导的基因突变技术创制抗除草剂烟草新种质
3
作者
谢宇峰
秦利军
机构
贵州大学农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室/生命科学学院
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期1551-1560,共10页
基金
贵州大学人才引进基金([2015]24号)
贵州大学人才培育项目(贵州科技计划项目[2018]5781号)。
文摘
为进一步优化烟草(Nicotiana tabacum)品种‘K326’的种质,该研究采用寡聚核苷酸介导的基因突变(oligonucleotide-mediated mutagenesis,OMM)技术,利用植物中支链氨基酸合成途径中第一个关键酶——乙酰乳酸合成酶(acetolactate synthase,ALS)突变后烟草对氯磺隆除草剂不敏感且产生抗性的特征,以及NCBI报道的ALS基因序列同源克隆了烟草品种‘K326’中的ALS基因,并根据ALS基因序列设计用于定点突变的RNA/DNA嵌合体,导入烟草品种‘K326’创制对氯磺隆除草剂具有抗性的烟草新种质。结果表明:(1)烟草品种‘K326’具有2条ALS基因,即ALS SuRA和ALS SuRB,大小分别为2004 bp和2010 bp。(2)根据2个基因的保守位点ALS SuRA 588脯氨酸位点和ALS SuRB 1719色氨酸位点设计用于ALS基因核苷酸第588位点的Chl-588嵌合体和第1719位点的Chl-1719嵌合体。(3)利用基因枪成功将这2个片段导入烟草愈伤组织,愈伤组织依次经抗性芽分化和生根,共获得氯磺隆抗性植株22株。(4)抗性植株ALS酶活性测定显示,8株抗性植株具有较强的活性,进一步对抗性植株中跨突变位点保守扩增、测序,最终确定有2株(f11和b18)分别在588、1719位点产生定点突变。综上认为,该研究在获得烟草品种‘K326’抗氯磺隆新种质同时,也为培育抗性烟草新种质提供了理想的亲本材料。
关键词
烟草
ALS基因
除草剂抗性
氯磺隆
OMM技术
Keywords
tobacco
ALS gene
herbicide resistance
chlorsulfuron
OMM technology
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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1
林烟草(Nicotiana sylvestris)K+通道蛋白基因NsAKT 1克隆及生物信息学分析
韦春
宋小潘
秦利军
《种子》
北大核心
2020
2
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职称材料
2
拟南芥(Arabidopsis thaliana)DWF4基因克隆、生物学信息分析及过表达载体构建
韦春
杨莉琴
秦利军
《种子》
北大核心
2021
1
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职称材料
3
寡聚核苷酸介导的基因突变技术创制抗除草剂烟草新种质
谢宇峰
秦利军
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
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