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斑马鱼核纤层蛋白Lamins的生物信息学分析
1
作者
张衡璐
黄惠敏
+3 位作者
叶芝旭
王志华
何志旭
舒莉萍
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期351-357,共7页
目的了解斑马鱼核纤层蛋白(lamins)的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列,利用Clustal X工具进行分析,并用MEGA 4.0软件绘制进化树;通过NCBI网站上BLAST工具将斑马鱼核纤层...
目的了解斑马鱼核纤层蛋白(lamins)的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列,利用Clustal X工具进行分析,并用MEGA 4.0软件绘制进化树;通过NCBI网站上BLAST工具将斑马鱼核纤层蛋白的蛋白质序列与不同物种的相对应的蛋白质序列进行对比,最后将人类、小鼠及斑马鱼的lamins基因信息,进行共线性分析。结果对核纤层蛋白相关基因进行生物信息学分析后显示斑马鱼的核纤层蛋白与人类的相似程度高,推断lmna、lmnb1和lmnb2基因在进化过程中高度保守。结论编码斑马鱼lamins的基因lmna、lmnb1和lmnb2等可能是人类LMNA、LMNB1和LMNB2等基因的直向同源物。
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关键词
斑马鱼
核纤层蛋白
lmna基因
进化树
共线性分析
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职称材料
利用吗啉代寡核苷酸技术下调早期斑马鱼胚胎lmna基因的初步研究
被引量：
5
2
作者
刘丰
黄慧敏
+3 位作者
王志华
吴西军
何志旭
舒莉萍
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2016年第8期85-90,共6页
目的利用吗啉代寡核苷酸技术建立下调斑马鱼lmna基因的技术方法。方法在斑马鱼lmna基因序列中选择靶点,设计针对斑马鱼lmna基因的吗啉代寡核苷酸序列(lmna-MO),构建能特异指示lmna基因表达的lmna-EGFP-pCS^(2+)重组质粒,并通过显微注射...
目的利用吗啉代寡核苷酸技术建立下调斑马鱼lmna基因的技术方法。方法在斑马鱼lmna基因序列中选择靶点,设计针对斑马鱼lmna基因的吗啉代寡核苷酸序列(lmna-MO),构建能特异指示lmna基因表达的lmna-EGFP-pCS^(2+)重组质粒,并通过显微注射方式将二者共注射入斑马鱼胚胎中,通过观察胚胎中绿色荧光表达量反应lmna基因表达量,并通过蛋白质印迹法检测胚胎中lamin蛋白表达量。结果蛋白质印迹法检测斑马鱼体内lamin蛋白的表达,分别有大小为69 KD和62 KD两种蛋白表达。设计并构建了lmna-MO和重组质粒lmnaEGFP-pCS^(2+),单独注射lmna-EGFP-pCS^(2+)质粒后观察到从6 hpf到96 hpf胚胎均有绿色荧光蛋白表达;二者共注射后观察到,与对照组相比,实验组从6 hpf至30 hpf胚胎中绿色荧光蛋白表达量均不同程度下降或消失;蛋白质印迹实验结果显示实验组胚胎内lamin蛋白表达量明显下降。表明已成功下调了斑马鱼胚胎lmna基因表达。结论可通过lmna-MO和重组质粒lmna-EGFP-pCS^(2+)共注射方法下调斑马鱼lmna基因表达,并通过绿色荧光蛋白表达量反映下调效果。该方法可为深入研究人核纤层病提供良好的动物模型。
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关键词
斑马鱼
LMNA
基因下调
吗啉代寡核苷酸技术
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职称材料
题名
斑马鱼核纤层蛋白Lamins的生物信息学分析
1
作者
张衡璐
黄惠敏
叶芝旭
王志华
何志旭
舒莉萍
机构
贵州医科大学附属医院儿科学教研室
贵州
医科
大学
免疫
学
教研室
贵州
医科
大学
组织工程与干细胞实验中心
贵州
医科
大学
动物实验中心
出处
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期351-357,共7页
基金
国家自然科学基金(编号:31260284)
文摘
目的了解斑马鱼核纤层蛋白(lamins)的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列,利用Clustal X工具进行分析,并用MEGA 4.0软件绘制进化树;通过NCBI网站上BLAST工具将斑马鱼核纤层蛋白的蛋白质序列与不同物种的相对应的蛋白质序列进行对比,最后将人类、小鼠及斑马鱼的lamins基因信息,进行共线性分析。结果对核纤层蛋白相关基因进行生物信息学分析后显示斑马鱼的核纤层蛋白与人类的相似程度高,推断lmna、lmnb1和lmnb2基因在进化过程中高度保守。结论编码斑马鱼lamins的基因lmna、lmnb1和lmnb2等可能是人类LMNA、LMNB1和LMNB2等基因的直向同源物。
关键词
斑马鱼
核纤层蛋白
lmna基因
进化树
共线性分析
Keywords
Zebrafish
Lamins
lmna gene
Phylogeny analysis
Synteny analysis
分类号
Q95-33 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
利用吗啉代寡核苷酸技术下调早期斑马鱼胚胎lmna基因的初步研究
被引量：
5
2
作者
刘丰
黄慧敏
王志华
吴西军
何志旭
舒莉萍
机构
贵州
医科
大学
免疫
学
教研室
贵州
医科
大学
组织工程与干细胞实验中心
贵州医科大学附属医院儿科学教研室
贵州
医科
大学
实验动物中心
出处
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2016年第8期85-90,共6页
基金
国家自然科学基金项目资助(NO.31260284)
文摘
目的利用吗啉代寡核苷酸技术建立下调斑马鱼lmna基因的技术方法。方法在斑马鱼lmna基因序列中选择靶点,设计针对斑马鱼lmna基因的吗啉代寡核苷酸序列(lmna-MO),构建能特异指示lmna基因表达的lmna-EGFP-pCS^(2+)重组质粒,并通过显微注射方式将二者共注射入斑马鱼胚胎中,通过观察胚胎中绿色荧光表达量反应lmna基因表达量,并通过蛋白质印迹法检测胚胎中lamin蛋白表达量。结果蛋白质印迹法检测斑马鱼体内lamin蛋白的表达,分别有大小为69 KD和62 KD两种蛋白表达。设计并构建了lmna-MO和重组质粒lmnaEGFP-pCS^(2+),单独注射lmna-EGFP-pCS^(2+)质粒后观察到从6 hpf到96 hpf胚胎均有绿色荧光蛋白表达;二者共注射后观察到,与对照组相比,实验组从6 hpf至30 hpf胚胎中绿色荧光蛋白表达量均不同程度下降或消失;蛋白质印迹实验结果显示实验组胚胎内lamin蛋白表达量明显下降。表明已成功下调了斑马鱼胚胎lmna基因表达。结论可通过lmna-MO和重组质粒lmna-EGFP-pCS^(2+)共注射方法下调斑马鱼lmna基因表达,并通过绿色荧光蛋白表达量反映下调效果。该方法可为深入研究人核纤层病提供良好的动物模型。
关键词
斑马鱼
LMNA
基因下调
吗啉代寡核苷酸技术
Keywords
Zebrafish
lmna
Gene knockdown
Morpholino oligonucleotides
Laminopathy
分类号
R-33 [医药卫生]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
斑马鱼核纤层蛋白Lamins的生物信息学分析
张衡璐
黄惠敏
叶芝旭
王志华
何志旭
舒莉萍
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
在线阅读
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职称材料
2
利用吗啉代寡核苷酸技术下调早期斑马鱼胚胎lmna基因的初步研究
刘丰
黄慧敏
王志华
吴西军
何志旭
舒莉萍
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2016
5
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