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冈田绕眼果蝇触角OBP基因家族鉴定和PoOBP83a克隆分析
1
作者
董贤凤
杨惠棋
+4 位作者
陈原
谢治梅
吴渊明
刘同先
郑明辉
《环境昆虫学报》
北大核心
2025年第2期515-525,共11页
为了解冈田绕眼果蝇Phortica okadai触角中气味结合蛋白(OBPs)的多样性、进化关系、功能特征以及在嗅觉功能中可能发挥的作用,本研究基于冈田绕眼果蝇触角转录组测序数据进行了生物信息学分析,对转录组中的OBPs家族基因进行了鉴定和序...
为了解冈田绕眼果蝇Phortica okadai触角中气味结合蛋白(OBPs)的多样性、进化关系、功能特征以及在嗅觉功能中可能发挥的作用,本研究基于冈田绕眼果蝇触角转录组测序数据进行了生物信息学分析,对转录组中的OBPs家族基因进行了鉴定和序列分析,并重点对该家族中的PoOBP83a基因进行了克隆、蛋白质理化性质、基因表达量检测以及分子对接模拟。结果表明:触角转录组中存在15个具有OBP保守结构域的PoOBPs基因,大部分PoOBPs蛋白为亲水性蛋白。PoOBPs家族的系统发育分析表明,可以将15个PoOBPs共分为5个亚家族;蛋白结构预测表明,PoOBPs均含有PBP-GOBP结构域,PoOBP83a基因编码区全长501 bp,编码166个氨基酸,蛋白分子量约19 kDa,理论等电点(pI)为6.15。PoOBP83a氨基酸序列中有6个保守半胱氨酸位点,属于Classic-C OBP家族蛋白;PoOBP83a在每个阶段均有表达,PoOBP83a在雌雄成虫触角中的相对表达量最高,其次为翅、口器和头部,在足、腹部和胸部的表达量最低。分子对接表明PoOBP83a与芳樟醇、苯甲酸乙酯、月桂酸乙酯、苯乙醇及吲哚具有较好的结合能力。本研究结果可为进一步研究冈田绕眼果蝇的嗅觉功能提供理论基础。
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关键词
冈田绕眼果蝇
气味结合蛋白
PoOBP83a
分子对接
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题名
冈田绕眼果蝇触角OBP基因家族鉴定和PoOBP83a克隆分析
1
作者
董贤凤
杨惠棋
陈原
谢治梅
吴渊明
刘同先
郑明辉
机构
遵义
医科
大学
寄生虫学
教研室
黔南民族医学高等专科学校护理系
贵州医科大学病原生物学教研室
贵州
大学
昆虫研究所
出处
《环境昆虫学报》
北大核心
2025年第2期515-525,共11页
基金
国家自然科学基金(31960025)
贵州省科技厅技术基金(黔科合基础项目[2016]1168号)
黔南民族医学高等专科学校科研基金(Qnyz202208)。
文摘
为了解冈田绕眼果蝇Phortica okadai触角中气味结合蛋白(OBPs)的多样性、进化关系、功能特征以及在嗅觉功能中可能发挥的作用,本研究基于冈田绕眼果蝇触角转录组测序数据进行了生物信息学分析,对转录组中的OBPs家族基因进行了鉴定和序列分析,并重点对该家族中的PoOBP83a基因进行了克隆、蛋白质理化性质、基因表达量检测以及分子对接模拟。结果表明:触角转录组中存在15个具有OBP保守结构域的PoOBPs基因,大部分PoOBPs蛋白为亲水性蛋白。PoOBPs家族的系统发育分析表明,可以将15个PoOBPs共分为5个亚家族;蛋白结构预测表明,PoOBPs均含有PBP-GOBP结构域,PoOBP83a基因编码区全长501 bp,编码166个氨基酸,蛋白分子量约19 kDa,理论等电点(pI)为6.15。PoOBP83a氨基酸序列中有6个保守半胱氨酸位点,属于Classic-C OBP家族蛋白;PoOBP83a在每个阶段均有表达,PoOBP83a在雌雄成虫触角中的相对表达量最高,其次为翅、口器和头部,在足、腹部和胸部的表达量最低。分子对接表明PoOBP83a与芳樟醇、苯甲酸乙酯、月桂酸乙酯、苯乙醇及吲哚具有较好的结合能力。本研究结果可为进一步研究冈田绕眼果蝇的嗅觉功能提供理论基础。
关键词
冈田绕眼果蝇
气味结合蛋白
PoOBP83a
分子对接
Keywords
Phortica okadai
odorant binding proteins
PoOBP83a
molecular docking
分类号
Q968.1 [生物学—昆虫学]
Q963 [生物学—昆虫学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
冈田绕眼果蝇触角OBP基因家族鉴定和PoOBP83a克隆分析
董贤凤
杨惠棋
陈原
谢治梅
吴渊明
刘同先
郑明辉
《环境昆虫学报》
北大核心
2025
0
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