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幽门螺杆菌阿莫西林稳定耐药克隆的筛选及其基因突变的检测
被引量：
1
1
作者
陆秋丹
糜孟衡
+3 位作者
崔古贞
张峥嵘
吴晓娟
陈峥宏
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第1期39-44,共6页
目的探讨阿莫西林(AMX)不稳定耐药的幽门螺杆菌(Hp)演化成AMX稳定高水平耐药的表型及其突变基因的检测。方法以冻存后的Hp菌株H390作为出发菌株,在不断增加AMX浓度的培养基上连续传代,筛选对AMX耐药的克隆,检测耐药克隆的最小抑菌浓度(M...
目的探讨阿莫西林(AMX)不稳定耐药的幽门螺杆菌(Hp)演化成AMX稳定高水平耐药的表型及其突变基因的检测。方法以冻存后的Hp菌株H390作为出发菌株,在不断增加AMX浓度的培养基上连续传代,筛选对AMX耐药的克隆,检测耐药克隆的最小抑菌浓度(MIC),置于-80℃冻存3个月后再复苏,根据冻存后MIC下降情况判断其耐药性是否稳定。对获得的AMX最高MIC值的克隆H390r和出发菌株H390进行基因组测序分析和外排泵抑制试验,检测并鉴定与H390r获得的AMX高水平耐药性相关的基因突变。结果通过AMX筛选获得4个AMX高水平耐药克隆,MIC分别为12、32、64和≥256 mg/L,经-80℃冻存后,MIC均未发生改变。相比于亲本菌株H390,AMX稳定耐药克隆H390r存在多个基因的突变,包括与AMX耐药性相关的编码RND外排系统的hefC、编码孔蛋白的hopB与hopC和编码青霉素结合蛋白的ftsI。H390r在有外排泵抑制剂存在时对AMX的MIC大幅降低。结论AMX能够在不稳定耐药的Hp中筛选出稳定耐药的克隆;H390r存在与AMX耐药相关的hefC、hopB、hopC和ftsI基因突变。这些突变可能是H390r获得AMX稳定高水平耐药的主要原因。
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关键词
幽门螺杆菌
阿莫西林
不稳定耐药
稳定耐药
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职称材料
鱼腥草共附生细菌组成及其对小鼠肠道菌群的影响
2
作者
陆秋丹
徐芳
+3 位作者
崔古贞
刘翔
张峥嵘
陈峥宏
《贵州农业科学》
CAS
2023年第8期85-92,共8页
【目的】了解鱼腥草共附生细菌的组成,以及小鼠食用新鲜鱼腥草对其肠道菌群的影响,为探明鱼腥草的药用价值及其相关机制提供参考。【方法】采用高通量测序技术对鱼腥草进行共附生细菌16S rRNA基因测序;试验组和对照组小鼠分别用鱼腥草(...
【目的】了解鱼腥草共附生细菌的组成,以及小鼠食用新鲜鱼腥草对其肠道菌群的影响,为探明鱼腥草的药用价值及其相关机制提供参考。【方法】采用高通量测序技术对鱼腥草进行共附生细菌16S rRNA基因测序;试验组和对照组小鼠分别用鱼腥草(试验组)和生理盐水(对照组)连续灌胃20 d,在灌胃前和停止灌胃7 d后分别采集试验组与对照组小鼠粪便进行细菌16S rRNA基因高通量测序分析。【结果】鱼腥草共附生细菌的优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria),其相对丰度分别为85.45%、10.52%和1.63%。试验组中,灌胃后与灌胃前相比,小鼠粪便菌群中变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)的相对丰度并未增加;菌群多样性的Shannon指数显著增高。灌胃后,试验组较对照组小鼠粪便菌群结构有显著差异,在门分类水平上,试验组厚壁菌门/拟杆菌门(Firmicutes/Bacteroidetes)显著高于对照组。【结论】新鲜鱼腥草能增加小鼠肠道菌群的多样性以及调节小鼠肠道菌群结构;鱼腥草对小鼠肠道菌群的调节作用主要是通过调节厚壁菌门/拟杆菌门(Firmicutes/Bacteroidetes)的比值实现。
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关键词
鱼腥草
共附生细菌
肠道菌群
高通量测序
厚壁菌门
拟杆菌门
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职称材料
题名
幽门螺杆菌阿莫西林稳定耐药克隆的筛选及其基因突变的检测
被引量：
1
1
作者
陆秋丹
糜孟衡
崔古贞
张峥嵘
吴晓娟
陈峥宏
机构
贵州医科大学基础医学院贵州省普通高等学校病原生物学特色重点实验室
黔东南州人民医院检验科
贵州
医科
大学
地方病与少数民族疾病教育部
重点
实验室
(
贵州省
医学
分子
生物学
重点
实验室
)
出处
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第1期39-44,共6页
基金
国家自然科学基金(编号:81860353)
贵州医科大学国基培育项目(编号:20NSP005)
贵州省教育厅滚动支持省属高校科研平台团队项目(编号:黔教技〔2022〕019号)。
文摘
目的探讨阿莫西林(AMX)不稳定耐药的幽门螺杆菌(Hp)演化成AMX稳定高水平耐药的表型及其突变基因的检测。方法以冻存后的Hp菌株H390作为出发菌株,在不断增加AMX浓度的培养基上连续传代,筛选对AMX耐药的克隆,检测耐药克隆的最小抑菌浓度(MIC),置于-80℃冻存3个月后再复苏,根据冻存后MIC下降情况判断其耐药性是否稳定。对获得的AMX最高MIC值的克隆H390r和出发菌株H390进行基因组测序分析和外排泵抑制试验,检测并鉴定与H390r获得的AMX高水平耐药性相关的基因突变。结果通过AMX筛选获得4个AMX高水平耐药克隆,MIC分别为12、32、64和≥256 mg/L,经-80℃冻存后,MIC均未发生改变。相比于亲本菌株H390,AMX稳定耐药克隆H390r存在多个基因的突变,包括与AMX耐药性相关的编码RND外排系统的hefC、编码孔蛋白的hopB与hopC和编码青霉素结合蛋白的ftsI。H390r在有外排泵抑制剂存在时对AMX的MIC大幅降低。结论AMX能够在不稳定耐药的Hp中筛选出稳定耐药的克隆;H390r存在与AMX耐药相关的hefC、hopB、hopC和ftsI基因突变。这些突变可能是H390r获得AMX稳定高水平耐药的主要原因。
关键词
幽门螺杆菌
阿莫西林
不稳定耐药
稳定耐药
Keywords
Helicobacter pylori
amoxicillin
unstable resistance
stable resistance
分类号
R378.99 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
鱼腥草共附生细菌组成及其对小鼠肠道菌群的影响
2
作者
陆秋丹
徐芳
崔古贞
刘翔
张峥嵘
陈峥宏
机构
贵州医科大学基础医学院贵州省普通高等学校病原生物学特色重点实验室
北京佑安医院肝病研究所
出处
《贵州农业科学》
CAS
2023年第8期85-92,共8页
基金
贵州省教育厅平台项目“贵州省普通高等学校病原生物学特色重点实验室”[黔教技(2022)019]
贵州省科技计划基础研究项目“幽门螺旋杆菌经母婴传播的机制研究”[ZK(2022)341]。
文摘
【目的】了解鱼腥草共附生细菌的组成,以及小鼠食用新鲜鱼腥草对其肠道菌群的影响,为探明鱼腥草的药用价值及其相关机制提供参考。【方法】采用高通量测序技术对鱼腥草进行共附生细菌16S rRNA基因测序;试验组和对照组小鼠分别用鱼腥草(试验组)和生理盐水(对照组)连续灌胃20 d,在灌胃前和停止灌胃7 d后分别采集试验组与对照组小鼠粪便进行细菌16S rRNA基因高通量测序分析。【结果】鱼腥草共附生细菌的优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria),其相对丰度分别为85.45%、10.52%和1.63%。试验组中,灌胃后与灌胃前相比,小鼠粪便菌群中变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)的相对丰度并未增加;菌群多样性的Shannon指数显著增高。灌胃后,试验组较对照组小鼠粪便菌群结构有显著差异,在门分类水平上,试验组厚壁菌门/拟杆菌门(Firmicutes/Bacteroidetes)显著高于对照组。【结论】新鲜鱼腥草能增加小鼠肠道菌群的多样性以及调节小鼠肠道菌群结构;鱼腥草对小鼠肠道菌群的调节作用主要是通过调节厚壁菌门/拟杆菌门(Firmicutes/Bacteroidetes)的比值实现。
关键词
鱼腥草
共附生细菌
肠道菌群
高通量测序
厚壁菌门
拟杆菌门
Keywords
Houttuynia cordata
symbiotic bacteria
gut microbiota
high-throughput sequencing
Firmicutes
Bacteroidetes
分类号
S567.9 [农业科学—中草药栽培]
S58 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
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被引量
操作
1
幽门螺杆菌阿莫西林稳定耐药克隆的筛选及其基因突变的检测
陆秋丹
糜孟衡
崔古贞
张峥嵘
吴晓娟
陈峥宏
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2024
1
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职称材料
2
鱼腥草共附生细菌组成及其对小鼠肠道菌群的影响
陆秋丹
徐芳
崔古贞
刘翔
张峥嵘
陈峥宏
《贵州农业科学》
CAS
2023
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