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斑马鱼核纤层蛋白Lamins的生物信息学分析
1
作者
张衡璐
黄惠敏
+3 位作者
叶芝旭
王志华
何志旭
舒莉萍
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期351-357,共7页
目的了解斑马鱼核纤层蛋白(lamins)的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列,利用Clustal X工具进行分析,并用MEGA 4.0软件绘制进化树;通过NCBI网站上BLAST工具将斑马鱼核纤层...
目的了解斑马鱼核纤层蛋白(lamins)的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列,利用Clustal X工具进行分析,并用MEGA 4.0软件绘制进化树;通过NCBI网站上BLAST工具将斑马鱼核纤层蛋白的蛋白质序列与不同物种的相对应的蛋白质序列进行对比,最后将人类、小鼠及斑马鱼的lamins基因信息,进行共线性分析。结果对核纤层蛋白相关基因进行生物信息学分析后显示斑马鱼的核纤层蛋白与人类的相似程度高,推断lmna、lmnb1和lmnb2基因在进化过程中高度保守。结论编码斑马鱼lamins的基因lmna、lmnb1和lmnb2等可能是人类LMNA、LMNB1和LMNB2等基因的直向同源物。
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关键词
斑马鱼
核纤层蛋白
lmna基因
进化树
共线性分析
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职称材料
题名
斑马鱼核纤层蛋白Lamins的生物信息学分析
1
作者
张衡璐
黄惠敏
叶芝旭
王志华
何志旭
舒莉萍
机构
贵州
医科
大学
附属医院儿科学教研室
贵州
医科
大学
免疫学教研室
贵州
医科
大学
组织工程与干细胞
实验
中心
贵州医科大学动物实验中心
出处
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期351-357,共7页
基金
国家自然科学基金(编号:31260284)
文摘
目的了解斑马鱼核纤层蛋白(lamins)的重要遗传信息。方法在UCSC、Vega及Ensemble数据库上收集了不同物种核纤层蛋白家族相关蛋白质序列,利用Clustal X工具进行分析,并用MEGA 4.0软件绘制进化树;通过NCBI网站上BLAST工具将斑马鱼核纤层蛋白的蛋白质序列与不同物种的相对应的蛋白质序列进行对比,最后将人类、小鼠及斑马鱼的lamins基因信息,进行共线性分析。结果对核纤层蛋白相关基因进行生物信息学分析后显示斑马鱼的核纤层蛋白与人类的相似程度高,推断lmna、lmnb1和lmnb2基因在进化过程中高度保守。结论编码斑马鱼lamins的基因lmna、lmnb1和lmnb2等可能是人类LMNA、LMNB1和LMNB2等基因的直向同源物。
关键词
斑马鱼
核纤层蛋白
lmna基因
进化树
共线性分析
Keywords
Zebrafish
Lamins
lmna gene
Phylogeny analysis
Synteny analysis
分类号
Q95-33 [生物学—动物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
斑马鱼核纤层蛋白Lamins的生物信息学分析
张衡璐
黄惠敏
叶芝旭
王志华
何志旭
舒莉萍
《中国实验动物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
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