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贵州省黄精和多花黄精45S rDNA位点的分析
1
作者
程靖雯
丁龙雨
+8 位作者
李沛铌
余珺
赵丹
张密密
王顺林
王文斌
王娟
武海燕
李鹏飞
《植物科学学报》
北大核心
2025年第4期494-501,共8页
本研究利用常规压片法和荧光原位杂交技术,分析黄精(Polygonatum sibiricum Red.)和多花黄精(P.cyrtonema Hua)的染色体核型及其45S rDNA的物理定位。结果显示:(1)黄精的核型公式为2n=2x=24=2m+8sm+14st(2SAT),核型属于3B型,具有2对45S ...
本研究利用常规压片法和荧光原位杂交技术,分析黄精(Polygonatum sibiricum Red.)和多花黄精(P.cyrtonema Hua)的染色体核型及其45S rDNA的物理定位。结果显示:(1)黄精的核型公式为2n=2x=24=2m+8sm+14st(2SAT),核型属于3B型,具有2对45S rDNA位点,分别位于3号染色体长臂和6号染色体短臂上。(2)多花黄精核型公式为2n=2x=22=6m+12sm(2SAT)+4st(2SAT),核型属于3B型,具有3对45S rDNA位点,分别位于1、5、10号染色体长臂上。本研究为黄精、多花黄精染色体核型和45S rDNA位点的数目、分布位置提供了新信息,有利于黄精属物种的遗传进化研究。
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关键词
黄精
多花黄精
染色体核型
荧光原位杂交
RDNA
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职称材料
头花蓼叶绿体基因组结构及其特征分析
2
作者
王顺林
武海燕
+3 位作者
张密密
彭梓然
杨芩芩
李鹏飞
《西南农业学报》
北大核心
2025年第4期683-693,共11页
【目的】探明药用植物头花蓼(Persicaria capitata)叶绿体高质量全基因组信息,明确其结构、序列特征及系统发育关系,为其分子鉴定与遗传多样性研究,种质资源保护与开发利用提供参考依据。【方法】采用Illumina Novaseq 6000测序平台并...
【目的】探明药用植物头花蓼(Persicaria capitata)叶绿体高质量全基因组信息,明确其结构、序列特征及系统发育关系,为其分子鉴定与遗传多样性研究,种质资源保护与开发利用提供参考依据。【方法】采用Illumina Novaseq 6000测序平台并结合生物信息学软件,研究头花蓼叶绿体基因组结构,并对其序列特征、重复序列、基因多样性和系统发育进行分析。【结果】头花蓼叶绿体基因组总长158817 bp,反向重复区IRa和IRb的长度均为30931 bp,大单拷贝区LSC和小单拷贝区SSC长度分别是84049和12906 bp;其总GC含量为38.0%;叶绿体基因组含有127个编码基因,包括82个蛋白质编码基因、37个tRNA基因和8个rRNA基因,其中,ndhB^(a,b)、rrn16^(a)和rrn23^(a)等19个基因有2个拷贝,petB^(b)、petD^(b)和atpF^(b)等15个基因有1个内含子,rps12^(a,c)、clpP^(c)和ycf3c^(3)个基因有2个内含子。头花蓼系统发育与同属火炭母聚为一支且靴带支持率为100%。【结论】成功组装头花蓼叶绿体高质量基因组,获得头花蓼叶绿体基因组的结构及序列特征信息,为蓼属药用植物的鉴定、进化和系统发育研究奠定理论基础。
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关键词
头花蓼
药用植物
叶绿体基因组
结构特征
系统发育
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职称材料
题名
贵州省黄精和多花黄精45S rDNA位点的分析
1
作者
程靖雯
丁龙雨
李沛铌
余珺
赵丹
张密密
王顺林
王文斌
王娟
武海燕
李鹏飞
机构
贵州中医药大学中药民族药资源研究院/贵州省道地药材种质创新与资源高效利用全省重点实验室
贵州
中医药大学
药
学院
出处
《植物科学学报》
北大核心
2025年第4期494-501,共8页
基金
贵州中医药大学本科教学质量工程建设项目(贵中医大创合字(2022)64号)
国家重点研发计划项目(2023YFC3503801)
中央本级重大增减支项目“名贵中药资源可持续利用能力建设项目”(2060302)。
文摘
本研究利用常规压片法和荧光原位杂交技术,分析黄精(Polygonatum sibiricum Red.)和多花黄精(P.cyrtonema Hua)的染色体核型及其45S rDNA的物理定位。结果显示:(1)黄精的核型公式为2n=2x=24=2m+8sm+14st(2SAT),核型属于3B型,具有2对45S rDNA位点,分别位于3号染色体长臂和6号染色体短臂上。(2)多花黄精核型公式为2n=2x=22=6m+12sm(2SAT)+4st(2SAT),核型属于3B型,具有3对45S rDNA位点,分别位于1、5、10号染色体长臂上。本研究为黄精、多花黄精染色体核型和45S rDNA位点的数目、分布位置提供了新信息,有利于黄精属物种的遗传进化研究。
关键词
黄精
多花黄精
染色体核型
荧光原位杂交
RDNA
Keywords
Polygonatum sibiricum
Polygonatum cyrtonema
Chromosome karyotype
Fluorescence in situ hybridization
rDNA
分类号
Q949.718.23 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
头花蓼叶绿体基因组结构及其特征分析
2
作者
王顺林
武海燕
张密密
彭梓然
杨芩芩
李鹏飞
机构
贵州中医药大学中药民族药资源研究院/贵州省道地药材种质创新与资源高效利用全省重点实验室
出处
《西南农业学报》
北大核心
2025年第4期683-693,共11页
基金
贵州中医药大学博士启动基金项目[(2020)42]。
文摘
【目的】探明药用植物头花蓼(Persicaria capitata)叶绿体高质量全基因组信息,明确其结构、序列特征及系统发育关系,为其分子鉴定与遗传多样性研究,种质资源保护与开发利用提供参考依据。【方法】采用Illumina Novaseq 6000测序平台并结合生物信息学软件,研究头花蓼叶绿体基因组结构,并对其序列特征、重复序列、基因多样性和系统发育进行分析。【结果】头花蓼叶绿体基因组总长158817 bp,反向重复区IRa和IRb的长度均为30931 bp,大单拷贝区LSC和小单拷贝区SSC长度分别是84049和12906 bp;其总GC含量为38.0%;叶绿体基因组含有127个编码基因,包括82个蛋白质编码基因、37个tRNA基因和8个rRNA基因,其中,ndhB^(a,b)、rrn16^(a)和rrn23^(a)等19个基因有2个拷贝,petB^(b)、petD^(b)和atpF^(b)等15个基因有1个内含子,rps12^(a,c)、clpP^(c)和ycf3c^(3)个基因有2个内含子。头花蓼系统发育与同属火炭母聚为一支且靴带支持率为100%。【结论】成功组装头花蓼叶绿体高质量基因组,获得头花蓼叶绿体基因组的结构及序列特征信息,为蓼属药用植物的鉴定、进化和系统发育研究奠定理论基础。
关键词
头花蓼
药用植物
叶绿体基因组
结构特征
系统发育
Keywords
Persicaria capitata
Medicinal plant
Chloroplast genome
Structural characteristics
Phylogeny
分类号
S567 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
贵州省黄精和多花黄精45S rDNA位点的分析
程靖雯
丁龙雨
李沛铌
余珺
赵丹
张密密
王顺林
王文斌
王娟
武海燕
李鹏飞
《植物科学学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
头花蓼叶绿体基因组结构及其特征分析
王顺林
武海燕
张密密
彭梓然
杨芩芩
李鹏飞
《西南农业学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
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