基于WGCNA揭示贝沙罗汀通过调控c-Myc通路抑制双打击淋巴瘤的机制

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作者 何田田 李泓毅 +6 位作者 耿杰 侯传东 张虹 张辉 赵鹏 卢学春 贺培风 《中国肿瘤生物治疗杂志》 北大核心 2025年第7期716-722,共7页

目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨贝沙罗汀治疗双打击淋巴瘤(DHL)的分子机制,为DHL治疗提供潜在靶点和实验依据。方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE44164和GSE43677表达谱数据集,筛选出差异表达基因(DEG)。采用WGCNA识... 目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨贝沙罗汀治疗双打击淋巴瘤(DHL)的分子机制,为DHL治疗提供潜在靶点和实验依据。方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE44164和GSE43677表达谱数据集,筛选出差异表达基因(DEG)。采用WGCNA识别与DHL相关的基因模块,构建蛋白质相互作用(PPI)网络以筛选关键基因。通过药物预测平台EpiMed进行关联分析以确定DHL的潜在靶向治疗药物。利用CCK-8法和WB法检测贝沙罗汀对DHL细胞增殖及关键蛋白表达的影响,通过流式细胞术评估贝沙罗汀诱导细胞凋亡的效果。结果:WGCNA识别出与DHL高度相关的碧绿色模块,在PPI网络中筛选出10个枢纽基因,包括COL1A2、COL3A1、MMP2、COL5A2、DCN、BGN、FN1、MMP9、FBN1和LUM。药物关联分析确定贝沙罗汀为潜在治疗药物。体外实验显示,贝沙罗汀显著抑制U2932细胞活力(P<0.05)、促进细胞凋亡(P<0.001)、下调细胞中c-Myc和COL1A2的表达(均P<0.05)。结论:贝沙罗汀可能通过抑制c-Myc信号通路及调控细胞外基质相关基因发挥抗DHL作用,其体内疗效及联合治疗潜力需进一步验证。 展开更多

关键词 双打击淋巴瘤 贝沙罗汀 基于加权基因共表达网络分析 生物标志物 分子机制

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血液系统恶性肿瘤治疗相关的心血管疾病研究进展 被引量：4

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作者 王紫宁 王益民 卢学春 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期1100-1106,共7页

血液系统恶性肿瘤诊疗的持续进步改善了患者的长期预后,同时也凸显了肿瘤进展及抗肿瘤治疗引起的心血管事件的重要性。血液系统恶性肿瘤患者在接受现有及新兴的肿瘤治疗方案如蒽环类药物、蛋白酶体抑制剂、靶向治疗、免疫治疗后,部分患... 血液系统恶性肿瘤诊疗的持续进步改善了患者的长期预后,同时也凸显了肿瘤进展及抗肿瘤治疗引起的心血管事件的重要性。血液系统恶性肿瘤患者在接受现有及新兴的肿瘤治疗方案如蒽环类药物、蛋白酶体抑制剂、靶向治疗、免疫治疗后,部分患者在疾病缓解后可能出现心血管事件,严重影响其生存率及生存质量。本文从血液系统恶性肿瘤治疗药物引起的心脏毒性的机制、临床表现和干预治疗三方面进行综述,旨在为血液系统恶性肿瘤治疗相关心血管事件的预防和治疗提供参考。 展开更多

关键词 肿瘤心脏病学 抗肿瘤药物 血液系统恶性肿瘤 心血管疾病

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非编码RNA对血友病A的调控机制研究进展 被引量：1

3

作者 张辉 李泓毅 +1 位作者 王紫宁 卢学春 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1196-1200,共5页

血友病是一种遗传性凝血功能异常的出血性疾病,包括血友病A和血友病B等不同类型,主要临床表现为关节、肌肉和深部组织自发或者创伤后反复出血,常幼年起病并累及终身。血友病的治疗以替代治疗为主,补充相应的凝血因子,此外还有双特异性... 血友病是一种遗传性凝血功能异常的出血性疾病,包括血友病A和血友病B等不同类型,主要临床表现为关节、肌肉和深部组织自发或者创伤后反复出血,常幼年起病并累及终身。血友病的治疗以替代治疗为主,补充相应的凝血因子,此外还有双特异性单克隆抗体等非因子药物治疗以及基因治疗等。近年来,血友病A发病机制的研究取得较大进展,不再局限于凝血因子基因编码序列的突变是引起血友病的唯一原因。许多研究发现,非编码RNA(ncRNA)的异常表达参与调控凝血因子Ⅷ(FⅧ) mRNA和蛋白的表达,不仅解释了FⅧ基因型正常的患者仍然表现为血友病A,也为理解其他血友病类型的发病机制提供了新的方向。本文就ncRNA调控血友病A的机制研究进展进行综述。 展开更多

关键词 血友病 凝血因子 MIRNA 基因调控

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急性髓系白血病患者预后不良相关基因的多组学分析 被引量：16

4

作者 陈熙勐 张皓旻 +2 位作者 杨波 卢学春 贺培凤 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期331-338,共8页

目的:利用GEO数据库和TCGA数据库的数据,通过多组学分析方法分析与急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)发生、发展及不良预后相关的分子标志物。方法:从GEO数据库下载符合要求的转录组数据,运用R语言Limma程序包进行差异表达基... 目的:利用GEO数据库和TCGA数据库的数据,通过多组学分析方法分析与急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)发生、发展及不良预后相关的分子标志物。方法:从GEO数据库下载符合要求的转录组数据,运用R语言Limma程序包进行差异表达基因的筛选,并对差异表达基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,同时使用STRING数据库数据,利用Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络,筛选出hub gene,结合TCGA数据库附带的临床信息对hub gene进行预后分析。结果:共筛选出620个差异基因,上调的差异表达基因162个,下调的差异表达基因458个。综合GO功能富集、KEGG通路富集分析及蛋白相互作用网络结果,筛选出CXCL4、CXCR4、CXCR1、CXCR2、CCL5、JUN为hub gene。生存分析显示,CXCL4、CXCR1、CCL5高表达是患者预后不良的危险因素。结论:CXCL4、CXCR1、CCL5可以作为AML发生、发展的相关生物标志物,且与不良预后相关,这可以为进一步研究提供依据。 展开更多

关键词 急性髓系白血病 多组学分析方法 生物信息学

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冠状病毒感染相关心肌损伤机制的组学分析及治疗药物的预测 被引量：2

5

作者 陈熙勐 张皓旻 +6 位作者 陈浩然 张钧栋 智鹏 李卓阳 王毅兴 迟小华 卢学春 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2020年第5期474-478,共5页

目的研究冠状病毒感染相关心肌损伤机制并预测可能有效的治疗药物。方法在基因表达数据库检索并筛选得到GSE59185数据集,根据不同的亚型分为wt组、ΔE组、Δ3组、Δ5组和对照组。用R语言Limma程序包对各组进行差异表达基因分析,将各组... 目的研究冠状病毒感染相关心肌损伤机制并预测可能有效的治疗药物。方法在基因表达数据库检索并筛选得到GSE59185数据集,根据不同的亚型分为wt组、ΔE组、Δ3组、Δ5组和对照组。用R语言Limma程序包对各组进行差异表达基因分析,将各组上调、下调表达基因分别取交集,作为共同差异表达基因,在DAVID数据库进行基因本体学(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用自主研发的表观精准治疗预测平台(EpiMed)进行治疗药物预测。用STRING数据库对共同差异表达基因构建蛋白质互作网络并筛选核心基因。结果各组差异表达基因分析,共交集上调基因191个,下调基因18个,共同差异表达基因共209个。GO富集分析发现,共同差异基因主要富集在病毒反应、病毒防御反应、Ⅰ型干扰素反应、γ干扰素调节、γ干扰素介导的信号通路、先天免疫反应调节等;KEGG通路富集主要与细胞因子与受体相互作用、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体相互作用、TNF、Toll样受体、缺氧诱导因子1及白细胞介素17信号通路等有关。通过EpiMed预测的药物主要为白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、连翘、鱼腥草等。网络分析筛选得到干扰素调节因子7、干扰素刺激基因15、抗粘液病毒基因1、β型蛋白酶体亚基8、干扰素调节因子9、 2′,5′-寡聚腺苷酸合成酶(OAS)1、OAS2、OAS3、含基本S腺苷蛋氨酸域2、2′,5′-寡聚腺苷酸合成酶样等核心基因。结论多个炎症通路的异常活化可能是冠状病毒感染后患者发生心肌损伤的原因。白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、连翘、鱼腥草可能对此具有治疗作用。 展开更多

关键词 冠状病毒感染 心肌疾病 白细胞介素17 基因表达

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新型冠状病毒感染致造血损伤及潜在治疗药物的生物信息学分析 被引量：2

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作者 张钧栋 杨波 +8 位作者 陈浩然 王紫宁 陈熙勐 智鹏 张皓旻 迟小华 郭斌 王毅兴 卢学春 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期947-956,共10页

目的分析预测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染所致造血损伤及潜在的治疗药物,为临床救治SARSCoV-2感染所致造血损伤提供理论依据。方法利用基因表达数据库(GEO)筛选SARS-CoV-2感染相关的全基因组表达数据,使用R语言包对数据进行差异分析... 目的分析预测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染所致造血损伤及潜在的治疗药物,为临床救治SARSCoV-2感染所致造血损伤提供理论依据。方法利用基因表达数据库(GEO)筛选SARS-CoV-2感染相关的全基因组表达数据,使用R语言包对数据进行差异分析以及基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过蛋白-蛋白相互作用数据库(STRING)在线分析网站进行蛋白互作(PPI)网络分析,筛选核心基因。应用自主研发的表观精准治疗预测平台(EpiMed)进行疾病、药物和关联靶基因分析。结果共筛选出差异基因222个,其中上调172个,下调50个。GO富集分析结果显示,差异基因主要与Ⅰ型干扰素反应、细胞周期调节、炎性细胞迁移、先天免疫反应、血液微粒和囊泡分泌、趋化因子及其受体等有关。KEGG富集分析结果显示,差异基因主要与病毒感染、心肌损伤、补体及凝血级联、细胞趋化、血小板活化、急性炎症、免疫反应、细胞信号转导等相关信号通路有关。PPI网络分析筛选得到STAT1、IL-6、IRF7、TNF、MX1、ISG15、IFIH1、IRF9、DDX58和GBP1等10个核心基因。EpiMed平台筛选出具有潜在治疗作用的药物包括冬凌草、西罗莫司、糖皮质激素、鱼腥草、何首乌、赤芍、维甲酸、甘草、环孢素A、氟伐他汀等。结论SARS-CoV-2感染可通过改变一系列基因的表达从而影响造血系统,据此筛选出的潜在治疗药物可为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的基础和临床研究提供参考。 展开更多

关键词 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 造血损伤 药物 生物信息学

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冠状病毒感染对造血系统影响及潜在干预药物的生物信息学分析及其对新型冠状病毒肺炎的意义 被引量：2

7

作者 张钧栋 杨波 +9 位作者 陈浩然 迟小华 陈熙勐 智鹏 张皓旻 王紫宁 郭斌 王毅兴 孙万军 卢学春 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期975-982,共8页

目的:分析预测冠状病毒感染对造血系统影响及潜在干预药物,探索其对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的意义。方法:利用基因表达数据库(GEO),筛选冠状病毒感染相关的全基因组表达数据,使用R语言包对数据进行差异表达分析及KEGG和GO富集分析... 目的:分析预测冠状病毒感染对造血系统影响及潜在干预药物,探索其对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的意义。方法:利用基因表达数据库(GEO),筛选冠状病毒感染相关的全基因组表达数据,使用R语言包对数据进行差异表达分析及KEGG和GO富集分析。使用STRING在线分析网站进行PPI网络分析,筛选出核心基因。再应用自主研发的表观精准治疗预测平台(EpiMed)进行疾病、药物和关联靶基因的分析。结果:检索到1个符合标准的数据库,来源于SARS冠状病毒,共筛选出差异基因3 606个,其中表达上调2 148个,下调1 458个。GO富集主要与病毒感染、造血调节、细胞趋化、血小板颗粒内容物分泌、免疫活化和急性炎症反应等有关。KEGG富集主要与造血功能、凝血级联反应、急性炎症和免疫反应等相关。蛋白互作网络分析中,筛选得到PTPRC、ICAM1、TIMP1、CXCR5、IL-1B、MYC、CR2、FSTL1、SOX1、COL3A1共10个核心基因。EpiMed平台筛选出具有潜在干预作用的药物,包括糖皮质激素、肿瘤坏死因子α抑制剂、丹参、西罗莫司、甘草、赤芍、泛昔洛韦、环孢素A、鱼腥草、氟伐他汀等。结论:SARS冠状病毒感染可通过改变一系列基因表达影响造血系统,据此筛选出的潜在干预药物对于COVID-19的基础和临床研究具有一定的参考意义。 展开更多

关键词 SARS冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 造血系统 药物 生物信息学

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十二指肠型滤泡性淋巴瘤的临床研究进展 被引量：3

8

作者 李泓毅 张钧栋 卢学春 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期581-584,共4页

十二指肠型滤泡性淋巴瘤(DFL)是滤泡性淋巴瘤的一种独特亚型,常累及十二指肠第二部(降部),因其特殊的病理特征,如滤泡树突状细胞网状结构缺乏、活化诱导的胞苷脱氨酶表达消失等,呈现惰性的临床病程且病变常局限于肠道内。炎症相关标志... 十二指肠型滤泡性淋巴瘤(DFL)是滤泡性淋巴瘤的一种独特亚型,常累及十二指肠第二部(降部),因其特殊的病理特征,如滤泡树突状细胞网状结构缺乏、活化诱导的胞苷脱氨酶表达消失等,呈现惰性的临床病程且病变常局限于肠道内。炎症相关标志物提示微环境可能在DFL的发病机制及其良好的预后中发挥作用。由于患者一般无明显临床症状且进展率低,故DFL的治疗方案主要为观察和等待。本文将对DFL近年来的流行病学、诊断、治疗和预后的最新研究进展作一综述。 展开更多

关键词 滤泡性淋巴瘤 十二指肠型滤泡性淋巴瘤 十二指肠淋巴瘤 治疗 预后

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桑黄酸性多糖对胆管结扎所致小鼠肝纤维化的改善作用及其机制 被引量：2

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作者 谷明柳 林逢源 +4 位作者 吴雪峰 周嘉宁 卢学春 杜培革 安丽萍 《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1167-1174,共8页

目的:探讨桑黄酸性多糖(PIP)对胆管结扎(BDL)所致小鼠肝纤维化的改善作用,阐明其可能的作用机制。方法:60只4周龄雄性C57/BL6小鼠随机分为对照组、模型组、阳性药组和PIP给药组(PIP组),每组15只。对照组小鼠只绕胆总管穿过手术线但不结... 目的:探讨桑黄酸性多糖(PIP)对胆管结扎(BDL)所致小鼠肝纤维化的改善作用,阐明其可能的作用机制。方法:60只4周龄雄性C57/BL6小鼠随机分为对照组、模型组、阳性药组和PIP给药组(PIP组),每组15只。对照组小鼠只绕胆总管穿过手术线但不结扎,模型组、阳性药组和PIP组小鼠结扎胆管。术后给药3周,末次给药12 h后眼球取血,处死小鼠。称量小鼠体质量和肝脏质量,并计算肝脏指数;微板法检测各组小鼠血清中丙氨酸氨基转移酶(ALT)和天门冬氨酸氨基转移酶(AST)水平;双抗体夹心法检测各组小鼠血清中Ⅲ型前胶原(PCⅢ)和Ⅳ型胶原(ColⅣ)水平;HE染色和天狼猩红染色观察各组小鼠肝组织病理形态表现和肝纤维化程度;检测各组小鼠肝组织中超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性及丙二醛(MDA)和谷胱甘肽(GSH)水平。Western blotting法检测各组小鼠肝组织中核因子E2相关因子(Nrf2)、血红素加氧酶1(HO-1)和醌氧化还原酶1(NQO1)蛋白表达水平。结果:与对照组比较,模型组小鼠体质量差异无统计学意义(P>0.05),肝脏质量和肝脏指数均升高(P<0.05);与模型组比较,PIP组小鼠体质量无明显变化(P>0.05),肝脏质量和肝脏指数降低(P<0.05)。HE染色,对照组小鼠肝组织无异常表现;模型组小鼠肝组织中肝小叶结构破坏,可见灶状液化性肝坏死和较多炎症细胞浸润;与模型组比较,阳性药组和PIP组小鼠肝组织坏死程度明显减轻,炎症细胞浸润减少。天狼猩红染色,与对照组比较,模型组小鼠肝组织中胶原纤维含量明显增加;与模型组比较,PIP组小鼠肝组织胶原纤维含量明显减少。与对照组比较,模型组小鼠血清中ALT和AST水平明显升高(P<0.01),PCⅢ和ColⅣ水平明显升高(P<0.05),小鼠肝组织中SOD和GSH-Px活性明显降低(P<0.01),MDA和GSH水平明显升高(P<0.05或P<0.01);与模型组比较,阳性药组和PIP组小鼠血清中ALT和AST水平明显降低(P<0.01),PCⅢ和ColⅣ水平明显降低(P<0.05或P<0.01),小鼠肝组织中SOD和GSH-Px活性升高(P<0.05),GSH和MDA水平降低(P<0.05)。Western blotting法检测,与对照组比较,模型组小鼠肝组织中Nrf2、HO-1和NQO1蛋白表达水平均降低(P<0.05);与模型组比较,PIP组小鼠肝组织中Nrf2、HO-1和NQO1蛋白表达水平明显升高(P<0.05或P<0.01)。结结论论:PIP能改善BDL导致的小鼠肝纤维化,其作用机制可能与降低肝脏氧化应激水平,调节Nrf2/HO-1信号通路中关键因子Nrf2、HO-1和NQO1蛋白表达水平有关。 展开更多

关键词 桑黄酸性多糖 肝纤维化 胆管结扎 核因子E2相关因子 血红素加氧酶1

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含Tu GTP结合结构域延伸因子2(Eftud2)增强小鼠巨噬细胞功能的生物信息学分析 被引量：1

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作者 孙莹 杨鹏 +3 位作者 吕忠霖 郑源强 石艳春 陈国江 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期704-711,共8页

目的通过生物信息学方法分析含Tu GTP结合结构域延伸因子2(Eftud2)增强小鼠巨噬细胞免疫功能的作用机制。方法分别收集10例Eftud2髓系细胞特异性敲除(MKO)小鼠及野生型(WT)小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM),经100 ng/mL脂多糖(LPS)刺激2 h。... 目的通过生物信息学方法分析含Tu GTP结合结构域延伸因子2(Eftud2)增强小鼠巨噬细胞免疫功能的作用机制。方法分别收集10例Eftud2髓系细胞特异性敲除(MKO)小鼠及野生型(WT)小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM),经100 ng/mL脂多糖(LPS)刺激2 h。采用生物信息学方法对样本进行基因表达差异以及mRNA水平可变剪接差异的检测。分别利用RNA序列差异表达基因(DEGseq)软件包、复制转录本剪接多变量分析(rMATS)软件对两组小鼠BMDM样本中基因表达及可变剪接差异进行统计;利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)分类与富集法统计两组小鼠BMDM样本中基因表达与可变剪接差异所影响的信号通路。结果与WT小鼠相比,MKO小鼠的BMDM经LPS刺激后白细胞介素6(IL-6)、IL-1β、肿瘤坏死因子α(TNF-α)及与免疫反应相关的基因显著下调;KEGG通路分析表明,BMDM基因表达差异及可变剪接差异主要影响信号转导及免疫系统相关代谢通路,且与磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-AKT)信号通路相关性较强。其中可变剪接差异还存在于泛素化及细胞内吞作用中。与WT小鼠相比,MKO小鼠BMDM可变剪接差异共232处,其中跳过外显子的可变剪接共有125处,占比最多。此外,对可变剪接差异的分析也证实了前期实验结果,即Eftud2可通过影响Toll样受体4/核因子κB(TLR4/NF-κB)信号通路中髓样分化因子88(MyD88)等关键分子的可变剪接,调控相关炎性信号通路的激活,增强巨噬细胞的功能。结论Eftud2通过影响基因的表达及可变剪接促进巨噬细胞释放炎性细胞因子,从而增强巨噬细胞免疫功能。 展开更多

关键词 Eftud2 巨噬细胞 可变剪接 生物信息学

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弥漫大B细胞淋巴瘤预后相关差异表达自噬基因筛选及模型的建立 被引量：2

11

作者 张钧栋 张皓旻 +3 位作者 卢迪 王紫宁 陈浩然 卢学春 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期1101-1108,共8页

目的:筛选弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)自噬相关基因(ARG)的差异表达,探讨差异表达自噬基因(DEARG)在DLBCL发生发展中的作用机制并建立预后模型。方法:利用包含481例DLBCL患者临床信息及基因表达谱数据的NCICCR数据库与包含232个ARG的HADb... 目的:筛选弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)自噬相关基因(ARG)的差异表达,探讨差异表达自噬基因(DEARG)在DLBCL发生发展中的作用机制并建立预后模型。方法:利用包含481例DLBCL患者临床信息及基因表达谱数据的NCICCR数据库与包含232个ARG的HADb数据库,通过R语言确定DLBCL中ARG的差异表达,GO和KEGG分析ARG与DLBCL发生发展的关系,Cox回归算法建立多基因预后模型,Kaplan-Meier方法绘制生存曲线,ROC曲线评价预后模型的可靠性。结果:从481例DLBCL患者淋巴结样本及5例正常淋巴结样本中共提取DEARG 122个,其中上调基因4个,下调基因118个。GO富集主要集中在线粒体自噬、自噬调节、细胞对外部刺激的反应等本体学注释。KEGG富集主要集中在细胞衰老、NOD样受体信号通路、PI3K-Akt信号通路、PD-1/PD-L1信号通路等。对230个临床信息完整的样本进行生存分析,单因素Cox分析发现20个ARG与DLBCL患者整体生存明显相关,多因素Cox回归筛选出9个预后相关ARG(HIF1A、CAPN1、ITPR1、PRKCQ、TRAIL、HDAC1、TSC2、NRG3和MAPK3)建立DLBCL ARG预后模型。Kaplan-Meier生存曲线分析显示,高、低风险组患者的生存率比较具有显著差异(P<0.001)。多因素Cox回归分析结果表明,国际预后指数和风险值是DLBCL患者的独立预后指标(P<0.05),ROC曲线下面积分别为0.762和0.747。结论:DLBCL ARG预后模型可用于预测患者的预后,但仍需大样本的临床研究加以证实。 展开更多

关键词 弥漫大B细胞淋巴瘤 自噬相关基因 预后

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以盐酸多柔比星脂质体为基础的CHOP联合方案治疗初治高龄弥漫大B细胞淋巴瘤患者的回顾性研究 被引量：6

12

作者 王向东 郭搏 +5 位作者 翟冰 杨波 范辉 卢学春 李素霞 朱宏丽 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1136-1140,共5页

目的:评价以盐酸多柔比星脂质体为基础的CHOP联合方案治疗初治高龄弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的有效性和安全性。方法:回顾性分析2012年1月1日至2019年12月31日本中心血液科收治的初治DLBCL患者31例,中位年龄为83(71-95)岁,均为Ⅲ-... 目的:评价以盐酸多柔比星脂质体为基础的CHOP联合方案治疗初治高龄弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的有效性和安全性。方法:回顾性分析2012年1月1日至2019年12月31日本中心血液科收治的初治DLBCL患者31例,中位年龄为83(71-95)岁,均为Ⅲ-Ⅳ期患者,国际预后指数≥3分患者为17例。治疗方案采用以盐酸多柔比星脂质体为主的R-CHOP及CHOP方案。在治疗过程中和治疗后对其疗效和安全性进行评价。结果:31例患者共进行219个化疗周期,中位周期7个,总缓解率和完全缓解率分别为80.7%(25/31)和61.3%(19/31),疾病稳定2例(6.5%),疾病进展4例(12.9%)。主要毒副反应为:Ⅲ-Ⅳ级中性粒细胞减少症发生率为29%(9/31);2例(6.5%)患者出现Ⅰ-Ⅱ度心脏事件,表现为新发的Ⅰ度房室传导阻滞;未出现需要紧急治疗和中止化疗的心脏事件。1、2、3年的总生存率分别为83.9%、77.4%和61.3%,无进展生存率分别为77.4%、64.5%和61.3%。结论:对于高龄DLBCL患者,以盐酸多柔比星脂质体为主的化疗方案疗效较好,患者心脏安全性较高。 展开更多

关键词 盐酸多柔比星脂质体 弥漫大B细胞淋巴瘤 高龄 心脏毒性

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基于代谢相关基因的多发性骨髓瘤预后模型的构建 被引量：3

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作者 刘格良 陈熙勐 +6 位作者 张钧栋 陈浩然 王紫宁 智鹏 李卓阳 贺培凤 卢学春 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期162-169,共8页

目的:筛选多发性骨髓瘤(MM)患者代谢相关基因预后生物标志物,构建MM患者代谢基因生存预后模型。方法:检索MM患者相关的组学数据库。选择具有完整临床信息的病例和健康对照组数据进行分析。从HPA与MMRF数据库收集整理MM患者与健康对照骨... 目的:筛选多发性骨髓瘤(MM)患者代谢相关基因预后生物标志物,构建MM患者代谢基因生存预后模型。方法:检索MM患者相关的组学数据库。选择具有完整临床信息的病例和健康对照组数据进行分析。从HPA与MMRF数据库收集整理MM患者与健康对照骨髓组织二代测序数据与临床信息。利用Perl语言从分子签名数据库(MSig DB)提取代谢相关通路基因集。利用差异分析、单因素Cox风险回归分析和LASSO回归分析筛选MM代谢相关预后生物标志物并构建风险预后模型及列线图,利用风险曲线与生存曲线验证模型分组效果。利用基因集富集分析(GSEA)研究高、低风险组之间生物学通路富集的差异。利用多因素Cox风险回归分析验证风险评分的独立预后预测能力。结果:共筛选获取8个与MM患者生存预后显著相关的m RNA(P<0.01),作为分子标签可将MM患者分为高风险组与低风险组。生存曲线与风险曲线显示低风险组患者的总生存期显著优于高风险组(P<0.001)。GSEA富集分析表明,基础代谢相关通路、细胞分化和细胞周期等信号通路在高风险组中显著富集,核糖体与N-聚糖生物合成等相关通路则更多的在低风险组中富集。多因素Cox回归分析显示,由这8个代谢相关基因构成的风险评分可作为MM患者预后的独立危险因素,接收者操作特征曲线显示代谢相关基因分子标签预测效能最佳。结论:新陈代谢相关通路在MM患者发病及预后中具有重要意义,基于8个代谢相关核心基因构建的MM患者风险评估模型,其临床意义尚需进一步的临床研究加以证实。 展开更多

关键词 新陈代谢 风险预后模型 基因集富集分析 多发性骨髓瘤

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多发性骨髓瘤铁死亡相关组学分析及预后模型的建立 被引量：3

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作者 王紫宁 陈浩然 +1 位作者 张钧栋 卢学春 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期411-419,共9页

目的:通过TCGA及FerrDb数据库探讨铁死亡相关基因在多发性骨髓瘤(MM)中的作用,并构建MM相关铁死亡基因预后模型。方法:利用包含764例MM患者临床信息及基因表达谱数据的TCGA数据库与包括铁死亡相关基因的FerrDb数据库,通过wilcox.test函... 目的:通过TCGA及FerrDb数据库探讨铁死亡相关基因在多发性骨髓瘤(MM)中的作用,并构建MM相关铁死亡基因预后模型。方法:利用包含764例MM患者临床信息及基因表达谱数据的TCGA数据库与包括铁死亡相关基因的FerrDb数据库,通过wilcox.test函数筛选其中的差异表达铁死亡相关基因。应用Lasso回归建立铁死亡相关基因预后模型,并绘制Kaplan-Meier生存曲线。使用COX回归分析筛选独立预后因素。筛选不同风险患者组间的差异基因,并通过富集分析探究MM铁死亡与预后相关的组学机制。结果:通过对764例MM患者骨髓样本及4例正常人骨髓样本进行差异分析,共筛选出铁死亡相关差异基因36个,其中上调基因12个,下调基因24个。使用Lasso回归筛选出6个预后相关基因(GCLM、GLS2、SLC7A11、AIFM2、ACO1、G6PD)并建立了MM铁死亡相关基因预后模型;Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示,不同风险患者组间生存率具有显著统计学差异(P<0.01)。单因素COX回归分析结果显示,年龄、性别、ISS分期和风险评分与MM患者总生存期(OS)显著相关(P<0.05);多因素COX回归分析表明,年龄、ISS分期和风险评分是MM患者OS的独立预后指标(P<0.05)。GO与KEGG富集分析显示,铁死亡相关基因可能通过中性粒细胞的趋化与迁移、细胞因子活性及调控、细胞组分、抗原加工提呈、补体及凝血级联反应、造血祖细胞谱系等影响患者预后。结论:铁死亡相关基因在MM发病过程中变化显著,铁死亡相关基因预后模型可用于预测MM患者的生存情况,但铁死亡的潜在功能机制有待进一步临床研究证实。 展开更多

关键词 多发性骨髓瘤 铁死亡 预后模型

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再生障碍性贫血患者RNA互作网络分析及潜在治疗药物预测 被引量：1

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作者 王紫宁 陈浩然 +3 位作者 张钧栋 李泓毅 张昊军 卢学春 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期166-173,共8页

目的探究再生障碍性贫血(aplastic anemia,AA)患者骨髓T细胞差异表达的微小核糖核酸(microRNA,miRNA)和信使RNA(messenger RNA,mRNA)基因,构建互作调控网络并筛选药物,随后评估其治疗方案疗效。方法在基因表达数据库检索并进行综合分析... 目的探究再生障碍性贫血(aplastic anemia,AA)患者骨髓T细胞差异表达的微小核糖核酸(microRNA,miRNA)和信使RNA(messenger RNA,mRNA)基因,构建互作调控网络并筛选药物,随后评估其治疗方案疗效。方法在基因表达数据库检索并进行综合分析,使用R语言对AA相关miRNA与mRNA进行差异表达分析,并通过miRNet预测差异表达miRNAs(DE-miRNAs)的靶向mRNAs,并与差异表达mRNAs(DE-mRNAs)进行比较与负相关配对,得到失调mRNAs,再对失调mRNAs进行功能基因注释(GO)分析与通路富集(KEGG)分析,构建AA的miRNA-mRNA互作调控网络。采用自主研发的表观精准治疗平台(EpiMed)进行潜在治疗药物预测,并将盐酸二甲双胍纳入新型联合治疗方案中,对入组的40例难治性AA进行临床疗效评估,评估主要指标包括血红蛋白、中性粒细胞绝对值、血小板计数及输血依赖等。结果差异分析最终获得26个DE-miRNA与168个靶向DE-mRNA,对其进行构建调控网络。GO和KEGG分析结果显示,AA相关失调mRNA可能参与T细胞分化、造血调控、物质代谢等过程,与病毒感染、细胞脂向分化、细胞凋亡以及物质代谢等信号通路相关。通过EpiMed预测得到环孢素A、吗替麦考酚酯、雷帕霉素、二甲双胍、维生素B、白藜芦醇等药物可能具有治疗AA的作用。研究共纳入难治性再生障碍性贫血患者40例,男17例,女23例,年龄14~83岁,治疗前后血红蛋白浓度、中性粒细胞绝对值计数、血小板计数分别为83.5 g/L vs.119.0 g/L、1.600×10^(9)/L vs.1.875×10^(9)/L、32.5×10^(9)/L vs.46.0×10^(9)/L,差异具有统计学意义(均P<0.05)。治疗后1、3、6、12个月分别有28例(70%)、28例(70%)、32例(80%)、35例(88%)患者获得血液学反应。结论本研究构建的T细胞miRNA-mRNA调控网络为研究AA提供了新的视角,临床研究初步验证含盐酸二甲双胍联合环孢素A方案治疗难治性AA安全有效,副作用可接受,为临床治疗再生障碍性贫血提供了新的方法。 展开更多

关键词 再生障碍性贫血 MIRNA mRNA 药物预测 疗效评估

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