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我国特有三个小型猪品系PPARα基因的多态性分析 被引量:3
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作者 赵玉琼 姚春涛 +4 位作者 刘亚千 黄丽洁 赵亚力 赵权 陈华 《中国比较医学杂志》 CAS 2008年第10期41-44,共4页
目的分析我国特有三个小型猪品系巴马小型猪、五指山小型猪,中国农大小型猪过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因exon5-intron5这段序列的单核苷酸多态性(SNPs)分布特点,为我国小型猪在糖尿病和代谢性疾病的研究中提供基础资料。... 目的分析我国特有三个小型猪品系巴马小型猪、五指山小型猪,中国农大小型猪过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)基因exon5-intron5这段序列的单核苷酸多态性(SNPs)分布特点,为我国小型猪在糖尿病和代谢性疾病的研究中提供基础资料。方法提取三个品系小型猪血液基因组DNA,以基因组DNA为模板,应用多聚合酶链式反应(PCR)技术在合成的特异性引物引导下扩增,将PCR产物纯化,然后进行测序,再将测序结果在NCBI中进行BLAST比对分析。结果测序结果显示:在PPARα基因exon 5-intron 5中存在12个单核苷酸位点,分别为83G→A,133C→T,134G→T,141C→G,146T→G,150T→G,179C→A,196C→T,205C→T,212C→T,218T→C,219T→C,其中只有83G→A这一单核苷酸突变位点位于编码区内,密码子TCA→TCG,氨基酸为Ser163Ser。结论在三个品系小型猪中PPARα基因多态位点的分布存在差异,表明小型猪的品种不同多态情况不同。 展开更多
关键词 小型猪 PPARα基因 单核苷酸多态性
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中国3种特有小型猪品系脂联素受体1基因外显子5的多态性分析 被引量:1
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作者 姚春涛 赵玉琼 +1 位作者 赵权 陈华 《中国比较医学杂志》 CAS 2008年第9期44-47,I0007,共5页
目的探讨我国三个特有的小型猪品系-中国农大小型猪,五指山小型猪,广西巴马小型猪脂联素受体1基因多态性分布,为这些小型猪在代谢性疾病和2型糖尿病研究中的应用提供基础资料。方法提取三个品系小型猪血液基因组DNA,针对脂联素受体... 目的探讨我国三个特有的小型猪品系-中国农大小型猪,五指山小型猪,广西巴马小型猪脂联素受体1基因多态性分布,为这些小型猪在代谢性疾病和2型糖尿病研究中的应用提供基础资料。方法提取三个品系小型猪血液基因组DNA,针对脂联素受体1基因外显子5~内含子5的部分序列进行PCR扩增,对产物进行鉴定和测序,分析基因多态性。结果在所扩增的片段中共检测出5个sNPs——sNP1:G138A,发生在所有的小型猪品系中,并导致第45位的氨基酸由甘氨酸(Gly)转变为谷氨酸(Glu);SNP2:G185A,所有的纯合突变均发生在五指山小型猪品系中(4/6,66.67%),而所有的杂合突变则发生在中国农大小型猪品系中(3/10,30%);SNP3:G200A,全部发生在中国农大小型猪品系中,且均为杂合突变(3/10,30%);SNP4:C295T,发生在广西巴马小型猪品系中的突变既有杂合突变(1/6,16.67%)也有纯合突变(2/6,33.33%),发生在中国农大小型猪品系中的突变全为杂合突变(2/10,20%);SNP5:T337G,只出现在中国农大小型猪品系中,且为杂合突变(1/10,10%)。结论SNP1,在所有测定的小型猪品系中检出,这可能是所测小型猪共有的特性。SNP2,可能是小型猪品系之间的差异。SNP3和SNP4,可能是小型猪品系之间的差异,也可能是个体的差异。SNP5,可能是个体差异。 展开更多
关键词 小型猪 脂联素受体1 多态性
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我国特有三个小型猪品系PGC-1基因外显子8的多态性分析
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作者 赵玉琼 姚春涛 +4 位作者 赵权 赵亚力 郭雄明 张铁军 陈华 《中国比较医学杂志》 CAS 2008年第10期81-81,共1页
目的分析我国特有的三个小型猪品系巴马小型猪、中国农大小型猪、五指山小型猪过氧化物酶体增殖物激活受体γ协同激活子1基因第8外显子的单核苷酸多态性(SNPs)分布特点,为我国小型猪在糖尿病和代谢性疾病研究中提供基础资料。方法以三... 目的分析我国特有的三个小型猪品系巴马小型猪、中国农大小型猪、五指山小型猪过氧化物酶体增殖物激活受体γ协同激活子1基因第8外显子的单核苷酸多态性(SNPs)分布特点,为我国小型猪在糖尿病和代谢性疾病研究中提供基础资料。方法以三个品系小型猪基因组DNA为模板,应用特异性引物进行PCR扩增,扩增产物纯化测序,进行BLAST比对分析。结果测序结果表明在小型猪PGC-1基因外显子8有5个单核苷酸多态性位点为:Ala354Val(450C→T),Gly363Gly(478C→T),Arg369Arg(494C→A),Leu570Leu(913G→A),Ser551Ser(1039A→G),其中,只有45O位C→T的杂合突变导致了编码氨基酸的改变。结论小型猪品种不同PGC-1基因外显子8的多态性分布有很大差异。 展开更多
关键词 PGC-1基因 SNPS
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小型猪胰淀素基因的多态性分析
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作者 赵玉琼 姚春涛 +1 位作者 赵权 陈华 《中国比较医学杂志》 CAS 2009年第2期17-20,共4页
目的探讨我国3个特有的小型猪品系,巴马小型猪,五指山小型猪,中国农大小型猪胰淀素(IAPP)基因多态性分布,为我国小型猪在2型糖尿病及代谢性疾病研究中的应用提供基础资料。方法提取3个品系小型猪血液基因组DNA,针对IAPP基因外显子3~... 目的探讨我国3个特有的小型猪品系,巴马小型猪,五指山小型猪,中国农大小型猪胰淀素(IAPP)基因多态性分布,为我国小型猪在2型糖尿病及代谢性疾病研究中的应用提供基础资料。方法提取3个品系小型猪血液基因组DNA,针对IAPP基因外显子3~内含子3的部分序列进行PCR扩增,产物鉴定、测序,统计分析基因多态。结果在所扩增的片段中共检测出2个SNPs位点,SNPs1:43G→A,位于外显子上,未引起的氨基酸的改变,突变发生在五指山猪(G/A杂合突变为16.7%,A纯合突变为83.3%)和中国农大猪(G/A杂合突变60%,A纯合突变为20%两个品系中。SNPs2:214C→T,位于内含子上,发生在五指山猪(T/C杂合突变为16.7%,T纯合突变为83.3%)和中国农大猪(T/C杂合突变为20%,T纯合突变为60%)两个品系中。结论在IAPP基因外显子3-内含子3的部分扩增序列中发现了2个SNPs位点,在3个品系小型猪中的分布不同。 展开更多
关键词 小型猪 胰淀素基因 多态性
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我国特有三个小型猪品系胰岛素受体底物1基因外显子1的多态性分析
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作者 姚春涛 赵玉琼 +1 位作者 赵权 陈华 《中国比较医学杂志》 CAS 2008年第10期81-81,共1页
目的探讨我国三个特有的小型猪品系——中国农大小型猪,五指山小型猪,广西巴马小型猪--胰岛素受体底物1基因多态性分布,为这些小型猪在代谢性疾病和2型糖尿病研究中的应用提供基础资料。方法提取三个品系小型猪血液基因组DNA,针对胰岛... 目的探讨我国三个特有的小型猪品系——中国农大小型猪,五指山小型猪,广西巴马小型猪--胰岛素受体底物1基因多态性分布,为这些小型猪在代谢性疾病和2型糖尿病研究中的应用提供基础资料。方法提取三个品系小型猪血液基因组DNA,针对胰岛素受体底物1基因外显子1的部分序列进行PCR扩增,对产物进行鉴定和测序,分析基因多态性。结果在所扩增的片段中共检测出2个SNPs,均发生在中国农大小型猪中,其中第2870位置上的C到G的颠换引起了第956位上的丙氨酸(Ala)转变为甘氨酸(Gly),没有发现人最常见的SNP——Gly972Arg。结论两处SNPs均发生在中国农大小型猪中,这可能是因为小型猪品系之间存在遗传差异所导致的。 展开更多
关键词 小型猪 胰岛素受体底物-1 多态性
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小型猪葡萄糖转运子4外显子4a的基因多态性分析
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作者 姚春涛 赵玉琼 +1 位作者 赵权 陈华 《中国比较医学杂志》 CAS 2009年第2期9-10,25,共3页
目的分析我国特有的3个小型猪品系巴马小型猪、中国农大小型猪、五指山小型猪葡萄糖转运子4基因外显子4a的单核苷酸多态性(SNPs)分布特点,为我国小型猪在糖尿病和代谢性疾病研究中提供基础资料。方法以3个品系小型猪基因组DNA为模板,应... 目的分析我国特有的3个小型猪品系巴马小型猪、中国农大小型猪、五指山小型猪葡萄糖转运子4基因外显子4a的单核苷酸多态性(SNPs)分布特点,为我国小型猪在糖尿病和代谢性疾病研究中提供基础资料。方法以3个品系小型猪基因组DNA为模板,应用特异性引物进行PCR扩增,扩增产物纯化测序,进行BLAST比对分析。结果在小型猪GLUT-4基因外显子4a上有2个SNP位点:SNP1:GCT→GCC(Ala133 Ala),3个品系均发生了变化,均为纯合突变,其突变率为(22/22,100%)。SNP2:GGC→GGT(Gly146 Gly),巴马小型猪突变率为(6/6,100%),均为纯合突变;五指山小型猪突变率为(6/6,100%),均为纯合突变;中国农大小型猪突变率为(10/10,100%),其中包括6例纯合突变(6/10,60%)和4例杂合突变(4/10,40%)。结论SNPs1,在所有测定的小型猪品系中检出,这可能是所测小型猪的共有特征。SNPs2可能是小型猪品系之间的差异。 展开更多
关键词 小型猪 GLUT-4基因 SNPS
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