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基于生物信息学分析铁死亡相关lncRNA对肾透明细胞癌组织免疫浸润和患者预后评估的意义
被引量：
3
1
作者
扈星
扈亮
+2 位作者
余亭
王茜
张志红
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期237-248,共12页
目的:采用生物信息学方法探索与肾透明细胞癌(ccRCC)组织中铁死亡相关的lncRNA,并探讨其与免疫细胞浸润及患者预后的相关性,为ccRCC患者提供新的分子靶点。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载cc RCC的转录本数据和临床数据,利用单...
目的:采用生物信息学方法探索与肾透明细胞癌(ccRCC)组织中铁死亡相关的lncRNA,并探讨其与免疫细胞浸润及患者预后的相关性,为ccRCC患者提供新的分子靶点。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载cc RCC的转录本数据和临床数据,利用单样本基因集富集分析(ssGSEA)及相关性分析获得与铁死亡相关的lncRNA;通过单因素和多因素回归分析构建与铁死亡相关的lncRNA特征图,分析其与预后的关系;利用R软件分析铁死亡相关lncRNA与肿瘤免疫细胞浸润和药物敏感性之间的关系。构建铁死亡相关RNA网络,并通过qPCR验证中国人ccRCC组织和癌旁组织(取自2019年12月至2021年03月间在西南医科大学附属医院手术切除8例标本)中关键lncRNA的表达。结果:Kaplan-Meier分析表明,铁死亡评分高的患者总OS率低于铁死亡评分低的患者。单因素和多因素回归分析确定11个ccRCC铁死亡相关lncRNA可评估患者预后,并构建ccRCC患者1、3、5年预后预测列线图。免疫细胞浸润分析表明,铁死亡相关lncRNA与ccRCC免疫细胞浸润密切相关,其中LINC01871、PRKAR1B-AS1和CYTOR是调节肿瘤免疫细胞浸润的关键lncRNA。化疗药物敏感性分析表明,高风险患者对甲氨蝶呤、紫杉醇、顺铂和多柔比星更为敏感。构建的包含3个lncRNA、15个miRNA和15个mRNA的RNA网络中,验证实验显示LINC01871、LINC00472和CYTOR在ccRCC组织中显著上调。结论:通过生物信息学方法获得11个与铁死亡相关的lncRNA,证明其与ccRCC组织免疫细胞浸润、化疗药物敏感性和患者预后相关,为探索ccRCC铁死亡相关lncRNA标志物提供重要参考。
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关键词
肾透明细胞癌
铁死亡
lncRNA
标志物
预后
免疫浸润
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职称材料
VTA/SN-NAc通路及其参与痛信息和痒信息调控的机理
2
作者
贺成博
王舰
+1 位作者
李云庆
张潜
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
2021年第1期111-115,共5页
中脑腹侧被盖区(VTA)/黑质(SN)至伏核(NAc)通路是脑内多巴胺系统和与奖赏相关的重要通路,主要参与机体药物成瘾、动机等功能。痛刺激可激活VTA/SN-NAc通路,说明该通路可能直接参与痛信息的传递与调控。VTA/SN-NAc通路可能通过内侧前额...
中脑腹侧被盖区(VTA)/黑质(SN)至伏核(NAc)通路是脑内多巴胺系统和与奖赏相关的重要通路,主要参与机体药物成瘾、动机等功能。痛刺激可激活VTA/SN-NAc通路,说明该通路可能直接参与痛信息的传递与调控。VTA/SN-NAc通路可能通过内侧前额叶皮质(mPFC)直接或间接提高脊髓背角处的多巴胺浓度,激活脊髓背角内的多巴胺2型受体(D2R),抑制脊髓背角的痛敏神经元的兴奋性从而起到镇痛作用。该通路不仅间接通过奖赏系统缓解瘙痒的症状,还能直接调控搔抓行为,参与对痒觉信息的调控。因此,VTA/SNNAc通路今后可能成为临床治疗急性和慢性痛和痒的新靶点。
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关键词
腹侧被盖区
黑质
伏核
奖赏通路
痛
痒
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职称材料
题名
基于生物信息学分析铁死亡相关lncRNA对肾透明细胞癌组织免疫浸润和患者预后评估的意义
被引量：
3
1
作者
扈星
扈亮
余亭
王茜
张志红
机构
西南医科大学附属
医院
全科医学科
西南医科大学附属
医院
老年医学科
西部战区总医院心血管外科
西南医科大学临床医学系
出处
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期237-248,共12页
基金
四川省科研项目(No.LY-105)
西南医科大学青年基金(No.2018-ZRQN-142)。
文摘
目的:采用生物信息学方法探索与肾透明细胞癌(ccRCC)组织中铁死亡相关的lncRNA,并探讨其与免疫细胞浸润及患者预后的相关性,为ccRCC患者提供新的分子靶点。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载cc RCC的转录本数据和临床数据,利用单样本基因集富集分析(ssGSEA)及相关性分析获得与铁死亡相关的lncRNA;通过单因素和多因素回归分析构建与铁死亡相关的lncRNA特征图,分析其与预后的关系;利用R软件分析铁死亡相关lncRNA与肿瘤免疫细胞浸润和药物敏感性之间的关系。构建铁死亡相关RNA网络,并通过qPCR验证中国人ccRCC组织和癌旁组织(取自2019年12月至2021年03月间在西南医科大学附属医院手术切除8例标本)中关键lncRNA的表达。结果:Kaplan-Meier分析表明,铁死亡评分高的患者总OS率低于铁死亡评分低的患者。单因素和多因素回归分析确定11个ccRCC铁死亡相关lncRNA可评估患者预后,并构建ccRCC患者1、3、5年预后预测列线图。免疫细胞浸润分析表明,铁死亡相关lncRNA与ccRCC免疫细胞浸润密切相关,其中LINC01871、PRKAR1B-AS1和CYTOR是调节肿瘤免疫细胞浸润的关键lncRNA。化疗药物敏感性分析表明,高风险患者对甲氨蝶呤、紫杉醇、顺铂和多柔比星更为敏感。构建的包含3个lncRNA、15个miRNA和15个mRNA的RNA网络中,验证实验显示LINC01871、LINC00472和CYTOR在ccRCC组织中显著上调。结论:通过生物信息学方法获得11个与铁死亡相关的lncRNA,证明其与ccRCC组织免疫细胞浸润、化疗药物敏感性和患者预后相关,为探索ccRCC铁死亡相关lncRNA标志物提供重要参考。
关键词
肾透明细胞癌
铁死亡
lncRNA
标志物
预后
免疫浸润
Keywords
clear cell renal cell carcinoma(ccRCC)
ferroptosis
lncRNA
marker
prognosis
immune infiltration
分类号
R37.11 [医药卫生—病原生物学]
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
VTA/SN-NAc通路及其参与痛信息和痒信息调控的机理
2
作者
贺成博
王舰
李云庆
张潜
机构
遵义医科大学人体解剖与组织胚胎教研室
西部战区总医院心血管外科
空军军医大学基础医学院人体解剖与组织胚胎教研室暨梁銶琚脑研究中心
出处
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
2021年第1期111-115,共5页
基金
国家自然科学基金项目(81701115,81620108008)。
文摘
中脑腹侧被盖区(VTA)/黑质(SN)至伏核(NAc)通路是脑内多巴胺系统和与奖赏相关的重要通路,主要参与机体药物成瘾、动机等功能。痛刺激可激活VTA/SN-NAc通路,说明该通路可能直接参与痛信息的传递与调控。VTA/SN-NAc通路可能通过内侧前额叶皮质(mPFC)直接或间接提高脊髓背角处的多巴胺浓度,激活脊髓背角内的多巴胺2型受体(D2R),抑制脊髓背角的痛敏神经元的兴奋性从而起到镇痛作用。该通路不仅间接通过奖赏系统缓解瘙痒的症状,还能直接调控搔抓行为,参与对痒觉信息的调控。因此,VTA/SNNAc通路今后可能成为临床治疗急性和慢性痛和痒的新靶点。
关键词
腹侧被盖区
黑质
伏核
奖赏通路
痛
痒
分类号
R741.02 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学分析铁死亡相关lncRNA对肾透明细胞癌组织免疫浸润和患者预后评估的意义
扈星
扈亮
余亭
王茜
张志红
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
VTA/SN-NAc通路及其参与痛信息和痒信息调控的机理
贺成博
王舰
李云庆
张潜
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
2021
0
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