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毛莲蒿叶绿体基因组结构及其物种鉴定意义
1
作者
李晋任
索郎纳甲
+3 位作者
赵志礼
米玛卓嘎
尕让甲
倪梁红
《中成药》
北大核心
2025年第6期1901-1909,共9页
目的 测定毛莲蒿Artemisia vestita Wall. ex Bess.叶绿体基因组序列。方法 基于民族植物学考察,采集样品并进行原植物鉴定;采用Illumina高通量测序平台进行叶绿体基因组测序,相关软件组装序列、注释及结构分析;与蒿属6个近缘物种进行...
目的 测定毛莲蒿Artemisia vestita Wall. ex Bess.叶绿体基因组序列。方法 基于民族植物学考察,采集样品并进行原植物鉴定;采用Illumina高通量测序平台进行叶绿体基因组测序,相关软件组装序列、注释及结构分析;与蒿属6个近缘物种进行叶绿体基因组进行比较分析;以桔梗科植物毛细钟花Leptocodon hirsutus D. Y. Hong为外类群,基于毛莲蒿与菊科其他32个分类群的叶绿体基因组序列构建ML系统发育树。结果 毛莲蒿叶绿体基因组大小为151 204 bp,总GC含量为36.88%;大单拷贝区、小单拷贝区长度分别为82 949、18 331 bp,反向重复区长度为24 962 bp;共编码134个基因,包括89个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因。基因组中共检测到67个简单重复序列SSRs和44个长重复序列LSRs。与蒿属近缘物种比较,筛选到3个基因高突变区(clpP、rpl36、ycf1)和6个基因间区高突变区(trnK-UUU-matK、rps18-rpl20、rpl36-infA、rpl14-rpl16、rpl16-rpl3、trnL-UAG-ccsA),可作为蒿属物种鉴定的候选DNA条形码序列;系统发育分析显示,蒿属形成一个高度支持的单系群,毛莲蒿与白莲蒿A.gmelinii Web. ex Stechm.的亲缘关系最近。结论 本研究可为蒿属植物系统发育分析、藏药基原植物鉴定及物种DNA条形码构建等提供基础资料。
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关键词
毛莲蒿
藏药
叶绿体基因组
系统发育分析
物种鉴定
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题名
毛莲蒿叶绿体基因组结构及其物种鉴定意义
1
作者
李晋任
索郎纳甲
赵志礼
米玛卓嘎
尕让甲
倪梁红
机构
上海中医药大学中药学院
西藏自治区拉萨市林周县人民医院唐古乡分院
西藏自治区
藏
医院
出处
《中成药》
北大核心
2025年第6期1901-1909,共9页
基金
国家自然科学基金面上项目(82073959)
2020年度西藏自治区藏医药管理局局级科技计划项目(JJKT2020017)。
文摘
目的 测定毛莲蒿Artemisia vestita Wall. ex Bess.叶绿体基因组序列。方法 基于民族植物学考察,采集样品并进行原植物鉴定;采用Illumina高通量测序平台进行叶绿体基因组测序,相关软件组装序列、注释及结构分析;与蒿属6个近缘物种进行叶绿体基因组进行比较分析;以桔梗科植物毛细钟花Leptocodon hirsutus D. Y. Hong为外类群,基于毛莲蒿与菊科其他32个分类群的叶绿体基因组序列构建ML系统发育树。结果 毛莲蒿叶绿体基因组大小为151 204 bp,总GC含量为36.88%;大单拷贝区、小单拷贝区长度分别为82 949、18 331 bp,反向重复区长度为24 962 bp;共编码134个基因,包括89个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因。基因组中共检测到67个简单重复序列SSRs和44个长重复序列LSRs。与蒿属近缘物种比较,筛选到3个基因高突变区(clpP、rpl36、ycf1)和6个基因间区高突变区(trnK-UUU-matK、rps18-rpl20、rpl36-infA、rpl14-rpl16、rpl16-rpl3、trnL-UAG-ccsA),可作为蒿属物种鉴定的候选DNA条形码序列;系统发育分析显示,蒿属形成一个高度支持的单系群,毛莲蒿与白莲蒿A.gmelinii Web. ex Stechm.的亲缘关系最近。结论 本研究可为蒿属植物系统发育分析、藏药基原植物鉴定及物种DNA条形码构建等提供基础资料。
关键词
毛莲蒿
藏药
叶绿体基因组
系统发育分析
物种鉴定
Keywords
Artemisia vestita Wall.ex Bess.
Tibetan herb
chloroplast genome
phylogenetic analysis
species identification
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
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作者
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1
毛莲蒿叶绿体基因组结构及其物种鉴定意义
李晋任
索郎纳甲
赵志礼
米玛卓嘎
尕让甲
倪梁红
《中成药》
北大核心
2025
0
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参考文献
引证文献
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