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基于网络药理学和分子对接分析红景天抑制手术应激过程中CRH、GC释放的机制
1
作者
胡宝平
卢红燕
+5 位作者
王玉梁
王莉
李卫斌
李友安
金天博
袁东亚
《山东医药》
CAS
2024年第35期36-39,共4页
目的基于网络药理学和分子对接分析红景天抑制手术应激过程中促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)、糖皮质激素(GC)释放的有效活性成分及相关靶基因,并探讨其可能的机制。方法使用中药系统药理学数据库、STRING数据库检索红景天的有效活性成...
目的基于网络药理学和分子对接分析红景天抑制手术应激过程中促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)、糖皮质激素(GC)释放的有效活性成分及相关靶基因,并探讨其可能的机制。方法使用中药系统药理学数据库、STRING数据库检索红景天的有效活性成分并分析其药物靶基因,NCBI数据库、OMIM数据库分别检索手术应激、CRH和GC的靶基因,二者取交集后得到红景天降低手术应激过程中CRH、GC的核心靶基因,进行GO功能和KEGG通路富集分析。使用Cytoscape软件绘制蛋白质相互作用网络(PPI)图,根据degree值获得排名前五的核心靶基因,采用分子对接方法分析其与红景天有效活性成分的结合能。结果筛选后得到红景天有效活性成分10个及其药物靶基因191个,其中degree值排名前三的有效活性成分分别为槲皮素、山柰酚和木犀草素。共得到手术应激相关靶基因118个、CRH相关靶基因44个、GC相关靶基因502个,与药物靶基因取交集后获得核心靶基因16个。GO功能分析结果显示,核心靶基因富集在生物过程136个、细胞成分6个、分子功能15个;KEGG通路分析结果显示,核心靶基因主要富集在高级糖基化终产物—高级糖基化终产物受体(AGE/RAGE)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路和人类巨细胞病毒感染等。PPI图中degree值排名前五的核心靶基因分别为前列腺素—内过氧化物合酶2(PTGS2)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素6(IL-6)、分泌磷蛋白1(SPP1)、肿瘤蛋白p53基因(TP53)。槲皮素、山柰酚、木犀草素与PTGS2、IL-6、SPP1、TP53均具有较强的结合作用(结合能均≤-5 kcal/mol)。结论红景天可通过其活性成分槲皮素、山柰酚、木犀草素调节PTGS2、IL-6、SPP1、TP53表达而抑制手术应激过程中CRH、GC释放,其机制可能与AGE/RAGE信号通路有关。
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关键词
红景天
手术应激
促肾上腺皮质激素释放激素
糖皮质激素
槲皮素
前列腺素—内过氧化物合酶2
白细胞介素6
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题名
基于网络药理学和分子对接分析红景天抑制手术应激过程中CRH、GC释放的机制
1
作者
胡宝平
卢红燕
王玉梁
王莉
李卫斌
李友安
金天博
袁东亚
机构
西藏
民族大学
附属
医院
麻醉
科
西藏
民族大学
医学院
西藏
高原相关疾病分子机制与干预研究重点实验室
高原低氧环境与生命健康实验室
西藏民族大学附属医院超声科
出处
《山东医药》
CAS
2024年第35期36-39,共4页
基金
西藏自治区自然科学基金资助项目[XZ2018ZRG-77(Z)]。
文摘
目的基于网络药理学和分子对接分析红景天抑制手术应激过程中促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)、糖皮质激素(GC)释放的有效活性成分及相关靶基因,并探讨其可能的机制。方法使用中药系统药理学数据库、STRING数据库检索红景天的有效活性成分并分析其药物靶基因,NCBI数据库、OMIM数据库分别检索手术应激、CRH和GC的靶基因,二者取交集后得到红景天降低手术应激过程中CRH、GC的核心靶基因,进行GO功能和KEGG通路富集分析。使用Cytoscape软件绘制蛋白质相互作用网络(PPI)图,根据degree值获得排名前五的核心靶基因,采用分子对接方法分析其与红景天有效活性成分的结合能。结果筛选后得到红景天有效活性成分10个及其药物靶基因191个,其中degree值排名前三的有效活性成分分别为槲皮素、山柰酚和木犀草素。共得到手术应激相关靶基因118个、CRH相关靶基因44个、GC相关靶基因502个,与药物靶基因取交集后获得核心靶基因16个。GO功能分析结果显示,核心靶基因富集在生物过程136个、细胞成分6个、分子功能15个;KEGG通路分析结果显示,核心靶基因主要富集在高级糖基化终产物—高级糖基化终产物受体(AGE/RAGE)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路和人类巨细胞病毒感染等。PPI图中degree值排名前五的核心靶基因分别为前列腺素—内过氧化物合酶2(PTGS2)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素6(IL-6)、分泌磷蛋白1(SPP1)、肿瘤蛋白p53基因(TP53)。槲皮素、山柰酚、木犀草素与PTGS2、IL-6、SPP1、TP53均具有较强的结合作用(结合能均≤-5 kcal/mol)。结论红景天可通过其活性成分槲皮素、山柰酚、木犀草素调节PTGS2、IL-6、SPP1、TP53表达而抑制手术应激过程中CRH、GC释放,其机制可能与AGE/RAGE信号通路有关。
关键词
红景天
手术应激
促肾上腺皮质激素释放激素
糖皮质激素
槲皮素
前列腺素—内过氧化物合酶2
白细胞介素6
Keywords
Rhodiola rosea
surgical stress
corticotropin-releasing hormone
glucocorticoids
quercetin
prosta-glandin-endoperoxide synthase 2
interleukin-6
分类号
R932 [医药卫生—生药学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接分析红景天抑制手术应激过程中CRH、GC释放的机制
胡宝平
卢红燕
王玉梁
王莉
李卫斌
李友安
金天博
袁东亚
《山东医药》
CAS
2024
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