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禽流感病毒H9N2亚型西藏分离株HA和NA基因的克隆与序列分析
被引量：
4
1
作者
索朗斯珠
邹威
+2 位作者
王灿
陈焕春
金梅林
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第12期1659-1666,共8页
为了从分子水平上掌握西藏各地区H9亚型禽流感病毒的遗传进化情况及其与国内外H9亚型禽流感病毒的变异情况和流行规律之间的关系,作者选择了2009年不同时间从西藏部分地市养殖场分离的3株禽流感H9N2亚型毒株,采用RT-PCR技术对其HA和NA...
为了从分子水平上掌握西藏各地区H9亚型禽流感病毒的遗传进化情况及其与国内外H9亚型禽流感病毒的变异情况和流行规律之间的关系,作者选择了2009年不同时间从西藏部分地市养殖场分离的3株禽流感H9N2亚型毒株,采用RT-PCR技术对其HA和NA基因进行扩增、克隆和测序,并对所得全序列进行同源性和遗传进化分析。结果显示,3株西藏分离病毒之间的HA和NA基因变异程度不大,同源性达到98%以上,在遗传进化中均属于欧亚分支中的类Bj/94亚分支,3株西藏分离毒的HA基因与Bj/94的同源性在核苷酸水平为88.7%～88.8%,在氨基酸水平为93.4%～93.6%;NA基因与Bj/94的同源性在核苷酸水平为92.7%～93.0%,在氨基酸水平为93.4%～94.0%;3株西藏分离毒株可能与Bj/94由同一毒株进化而来。由于基因突变使Tb/1毒株的HA基因在313位出现了1个新的糖基化位点,Tb/4毒株的NA基因缺失了146位的糖基化位点;唾液酸吸附位点上有明显的突变;HA的裂解位点附近和NA基因的受体结合位点区域内都有氨基酸突变。HA和NA基因的变异可能与适应高原缺氧、高海拔等特殊气候环境有关。
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关键词
禽流感病毒
H9N2亚型
HA基因
NA基因
遗传变异分析
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题名
禽流感病毒H9N2亚型西藏分离株HA和NA基因的克隆与序列分析
被引量：
4
1
作者
索朗斯珠
邹威
王灿
陈焕春
金梅林
机构
华中农业大学农业微生物国家重点实验室
动物
病毒分室
西藏农牧学院动物科学技术学院高原动物疫病研究室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第12期1659-1666,共8页
基金
973项目(2010CB534002
2011CB505004)
+2 种基金
科技重大专项(2008zx10004013
2009zx1004-109)
华中农业大学农业微生物国家重点实验室开放基金项目(AML-200904)
文摘
为了从分子水平上掌握西藏各地区H9亚型禽流感病毒的遗传进化情况及其与国内外H9亚型禽流感病毒的变异情况和流行规律之间的关系,作者选择了2009年不同时间从西藏部分地市养殖场分离的3株禽流感H9N2亚型毒株,采用RT-PCR技术对其HA和NA基因进行扩增、克隆和测序,并对所得全序列进行同源性和遗传进化分析。结果显示,3株西藏分离病毒之间的HA和NA基因变异程度不大,同源性达到98%以上,在遗传进化中均属于欧亚分支中的类Bj/94亚分支,3株西藏分离毒的HA基因与Bj/94的同源性在核苷酸水平为88.7%～88.8%,在氨基酸水平为93.4%～93.6%;NA基因与Bj/94的同源性在核苷酸水平为92.7%～93.0%,在氨基酸水平为93.4%～94.0%;3株西藏分离毒株可能与Bj/94由同一毒株进化而来。由于基因突变使Tb/1毒株的HA基因在313位出现了1个新的糖基化位点,Tb/4毒株的NA基因缺失了146位的糖基化位点;唾液酸吸附位点上有明显的突变;HA的裂解位点附近和NA基因的受体结合位点区域内都有氨基酸突变。HA和NA基因的变异可能与适应高原缺氧、高海拔等特殊气候环境有关。
关键词
禽流感病毒
H9N2亚型
HA基因
NA基因
遗传变异分析
Keywords
avian influenza virus
sequence analysis
HA gene
NA gene
H9N2 subtype
分类号
S852.659.5 [农业科学—基础兽医学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
禽流感病毒H9N2亚型西藏分离株HA和NA基因的克隆与序列分析
索朗斯珠
邹威
王灿
陈焕春
金梅林
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
4
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