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猪HINT1基因多态性及其在肌肉组织中表达差异的分析 被引量:3
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作者 梁馨文 邢璐 +5 位作者 董世雄 徐士军 张健 段梦琪 张博 商鹏 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2021年第5期633-638,共6页
【目的】探究HINT1基因在猪肌肉生长分子调控机制中的作用。【方法】试验选取30、90和180日龄的藏猪和大约克猪(各8头)作为试验对象,利用实时荧光定量PCR技术检测HINT1基因在背最长肌、腿肌组织中mRNA的差异表达,采用Sanger测序法对藏猪... 【目的】探究HINT1基因在猪肌肉生长分子调控机制中的作用。【方法】试验选取30、90和180日龄的藏猪和大约克猪(各8头)作为试验对象,利用实时荧光定量PCR技术检测HINT1基因在背最长肌、腿肌组织中mRNA的差异表达,采用Sanger测序法对藏猪(48头)和大约克猪(45头)HINT1基因的起始密码子上游3 000 bp区域左右进行单核苷酸多态性分析。【结果】在背最长肌和腿肌组织中,藏猪(TP)和大约克猪(YY)HINT1基因mRNA的表达量均随着日龄的增长呈逐渐降低的趋势;在背最长肌组织中,30日龄藏猪表达量极显著高于大约克猪(P<0.01),90日龄藏猪和大约克猪表达差异不显著(P=0.284),180日龄藏猪显著高于大约克猪(P<0.05);在腿肌组织中,30日龄和90日龄的藏猪HINT1基因表达量均极显著高于大约克猪(P<0.01),180日龄藏猪的表达量显著高于大约克猪(P<0.05);在起始密码子上游3 000 bp区域左右筛选到5个SNPs位点:A-2230G、C-2209T、A-2174G、T-2083C和A-2082G,且两猪种间等位基因频率存在极显著差异(P<0.01),品种内基因频率均符合哈迪温伯格定律。【结论】推测HINT1基因的表达与骨骼肌组织的生长发育呈负相关。研究结果为进一步改善猪肉质品质及调控猪肌肉组织生长发育的分子机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 HINT1基因 藏猪 肌肉生长
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藏猪和大约克猪FBXO32基因多态性及表达差异分析 被引量:1
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作者 王宇 徐士军 +3 位作者 孙雪倩 叶幼荣 张健 商鹏 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第5期146-150,共5页
为明确FBXO32基因在高原藏猪与大约克猪肌肉中的表达差异性,选取这2个猪种作为试验动物,采用双脱氧测序技术对藏猪(33头)、大约克猪(32头)FBXO32基因的5′UTR启动子区进行单核苷酸多态性(SNPs)筛选,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-q... 为明确FBXO32基因在高原藏猪与大约克猪肌肉中的表达差异性,选取这2个猪种作为试验动物,采用双脱氧测序技术对藏猪(33头)、大约克猪(32头)FBXO32基因的5′UTR启动子区进行单核苷酸多态性(SNPs)筛选,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)技术检测FBXO32基因在藏猪、大约克猪腿肌及背最长肌组织中mRNA的相对表达量。研究结果表明,在FBXO32基因的5′UTR启动子区筛选到了G-257A和A-556G这2个SNPs位点,且SNPs位点在2个猪种群体间的基因型频率有着显著性差异(P<0.05);通过转录因子预测,发现这2个SNPs位点与肌细胞的更新、分化和增殖相关,推测FBXO32基因的SNPs位点是调控肌肉生长的关键位点;藏猪腿肌、背最长肌组织中FBXO32基因的mRNA相对表达量都显著高于大约克猪(P<0.05),由此推测FBXO32基因可以负向调控肌肉生长,这可能是导致高原藏猪生长速度慢的主要原因之一。本研究结果为进一步探究FBXO32基因在猪肌肉生长相关的调控机制提供了必要的理论依据。 展开更多
关键词 藏猪 FBXO32基因 肌肉生长 多态性位点 相对表达量
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藏猪和大约克猪FABP1基因多态性及差异表达分析
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作者 杨绍康 常振宇 +2 位作者 严飞飞 商鹏 强巴央宗 《高原农业》 2023年第4期400-408,共9页
本文旨在探究FABP1基因在猪脂肪沉积性状中所发挥的作用,试验选用180日龄藏猪与大约克猪,对藏猪和大约克猪FABP1基因5’侧翼区(起始密码子上游3000 bp左右序列)进行了单核苷酸多态性(SNPs)位点筛选,并分析其对FABP1基因转录的影响。采用... 本文旨在探究FABP1基因在猪脂肪沉积性状中所发挥的作用,试验选用180日龄藏猪与大约克猪,对藏猪和大约克猪FABP1基因5’侧翼区(起始密码子上游3000 bp左右序列)进行了单核苷酸多态性(SNPs)位点筛选,并分析其对FABP1基因转录的影响。采用RT-qPCR检测两试验猪种在肝脏、背最长肌和背脂组织中的FABP1基因的mRNA相对表达量。结果显示,在FABP1基因5’侧翼区存在A-1717G、G-1701A、C-1547T、T-1523C、C-1484A、C-1453A、G-1377A、T-1331G共8个突变位点。在藏猪和大约克猪背最长肌、背脂和肝脏组织中FABP1基因的mRNA相对表达量趋势基本一致,FABP1基因在两品种肝脏组织中的表达量最高。FABP1基因在两品种间8个突变的位点的P值均为极显著差异,通过转录因子预测发现在A-1717G、C-1484A、C-1453A以及G-1377A四个位点中均存在与脂肪相关的转录因子出现或消失。综上,FABP1基因可能为调控脂肪沉积的关键基因。 展开更多
关键词 藏猪 FABP1基因 脂肪沉积 SNPS
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