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基于拮抗及ITS序列分析的河南香菇主产区种质资源鉴定及遗传多样性分析
被引量：
5
1
作者
崔筱
刘芹
+6 位作者
孔维丽
张玉亭
胡素娟
王彦坡
康源春
孔维威
袁瑞奇
《中国瓜菜》
CAS
北大核心
2022年第7期31-38,共8页
应用核糖体基因转录间隔区域(Internal Transcribed Spacer,ITS)序列及拮抗法对河南食用菌主产区香菇栽培菌株进行鉴定,并分析遗传多样性。以收集的41个香菇栽培菌株为样本,两两之间进行拮抗测试分析,提取DNA并进行PCR扩增、回收、测序...
应用核糖体基因转录间隔区域(Internal Transcribed Spacer,ITS)序列及拮抗法对河南食用菌主产区香菇栽培菌株进行鉴定,并分析遗传多样性。以收集的41个香菇栽培菌株为样本,两两之间进行拮抗测试分析,提取DNA并进行PCR扩增、回收、测序,采用比对邻接法(neighbor-joinging,NJ)构建系统进化树。结果表明,16个差异菌株拮抗现象明显,其余菌株无拮抗或者拮抗不显著,41个香菇菌株初步分为16个不同菌株及7个不同亚种;ITS序列比对及系统发育分析将41个香菇品种聚为独立进化的4个大类,即3个不同的菌株和8个不同的亚种,种内遗传距离为0.0000~0.0065,与Pleurotus ostreatus(KY962509)种间遗传距离为0.3740。综上所述,“ITS+拮抗法”结合可以明确区分菌株间拮抗、无拮抗及拮抗不明显现象基因序列的相似度、遗传距离的差异及亲缘关系的远近,为香菇品种的鉴定提供理论支撑。
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关键词
香菇
ITS
拮抗鉴定
遗传多样性分析
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职称材料
平菇生长发育过程中对IAA响应的转录组分析
被引量：
1
2
作者
崔筱
张玉亭
+5 位作者
孔维丽
胡素娟
刘芹
王彦坡
吴杰
师子文
《河南农业科学》
北大核心
2022年第12期97-109,共13页
为了探究不同生长阶段平菇对IAA的响应机制,分别用高浓度(1×10-3mol/L)、低浓度(1×10-8mol/L)IAA处理平菇生长发育过程的菌丝体(7 d、15 d)及子实体(25 d、27 d、31 d),以不处理为对照(CK),通过转录组筛选差异表达基因(Differ...
为了探究不同生长阶段平菇对IAA的响应机制,分别用高浓度(1×10-3mol/L)、低浓度(1×10-8mol/L)IAA处理平菇生长发育过程的菌丝体(7 d、15 d)及子实体(25 d、27 d、31 d),以不处理为对照(CK),通过转录组筛选差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。采用Venn分析、聚类分析、功能富集分析及共表达网络揭示平菇不同生长阶段对IAA响应的分子机制。结果表明,高浓度IAA处理菌丝体和子实体,分别筛选到DEGs 217个和10个,共表达关系对6735个和32个;低浓度IAA处理菌丝体和子实体分别获得DEGs 81个和87个,共表达关系对766个和1565个。GO及KEGG富集结果显示,低浓度IAA通过TRINITY_DN2732_c0_g1调控核糖体合成内源植物激素,通过TRINITY_DN530_c0_g1及TRINITY_DN3832_c0_g1促进子实体阶段的代谢进程;高浓度IAA通过TRINITY_DN41591_c0_g1调控甘油磷脂代谢过程,TRINITY_DN14069_c0_g1调控几丁质代谢及TRINITY_DN35150_c0_g1、TRINITY_DN5314_c0_g1、TRINITY_DN43009_c0_g1调节氧化还原酶活性,同时通过TRINITY_DN21430_c0_g1调控子实体阶段ATP的合成。以上结果表明,低浓度IAA通过DEGs影响平菇菌丝体阶段的激素合成及子实体阶段的代谢过程;高浓度IAA通过DEGs调控平菇菌丝体阶段的氧化应激机制及子实体阶段的ATP合成。
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关键词
平菇
IAA
菌丝体阶段
子实体阶段
转录组分析
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职称材料
袋栽香菇部分菌袋不出菇的解决办法
3
作者
李超敏
张大鹏
+1 位作者
周建祥
陈东旭
《农技服务》
2000年第1期23-23,共1页
在袋料香菇栽培过程中,往往发现有10％左右的菌袋不容易出菇,群众俗称之为“哑巴袋”。为了弄清不出菇的原因,提出解决办法,我们经过两年多的试验和实践,对其中的原因有了比较清楚的认识,并研究了相应的解决办法,这些办法在实践中运用...
在袋料香菇栽培过程中,往往发现有10％左右的菌袋不容易出菇,群众俗称之为“哑巴袋”。为了弄清不出菇的原因,提出解决办法,我们经过两年多的试验和实践,对其中的原因有了比较清楚的认识,并研究了相应的解决办法,这些办法在实践中运用效果很好。
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关键词
袋栽香菇
菌袋不出菇
解决办法
栽培技术
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职称材料
题名
基于拮抗及ITS序列分析的河南香菇主产区种质资源鉴定及遗传多样性分析
被引量：
5
1
作者
崔筱
刘芹
孔维丽
张玉亭
胡素娟
王彦坡
康源春
孔维威
袁瑞奇
机构
河南省农业科学院植物营养与资源环境研究所
西峡县食用菌生产办公室
出处
《中国瓜菜》
CAS
北大核心
2022年第7期31-38,共8页
基金
河南省现代农业产业技术体系专项资金(S2013-09,S2013-09-G02)
河南省农业科学院自主创新项目(2022ZC31)
河南省重大公益性专项基金(201300110700)。
文摘
应用核糖体基因转录间隔区域(Internal Transcribed Spacer,ITS)序列及拮抗法对河南食用菌主产区香菇栽培菌株进行鉴定,并分析遗传多样性。以收集的41个香菇栽培菌株为样本,两两之间进行拮抗测试分析,提取DNA并进行PCR扩增、回收、测序,采用比对邻接法(neighbor-joinging,NJ)构建系统进化树。结果表明,16个差异菌株拮抗现象明显,其余菌株无拮抗或者拮抗不显著,41个香菇菌株初步分为16个不同菌株及7个不同亚种;ITS序列比对及系统发育分析将41个香菇品种聚为独立进化的4个大类,即3个不同的菌株和8个不同的亚种,种内遗传距离为0.0000~0.0065,与Pleurotus ostreatus(KY962509)种间遗传距离为0.3740。综上所述,“ITS+拮抗法”结合可以明确区分菌株间拮抗、无拮抗及拮抗不明显现象基因序列的相似度、遗传距离的差异及亲缘关系的远近,为香菇品种的鉴定提供理论支撑。
关键词
香菇
ITS
拮抗鉴定
遗传多样性分析
Keywords
Lentinus edodes
ITS
Antagonistic identification
Genetic diversity analysis
分类号
S646 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
平菇生长发育过程中对IAA响应的转录组分析
被引量：
1
2
作者
崔筱
张玉亭
孔维丽
胡素娟
刘芹
王彦坡
吴杰
师子文
机构
河南省农业科学院植物营养与资源环境研究所
西峡县食用菌生产办公室
出处
《河南农业科学》
北大核心
2022年第12期97-109,共13页
基金
河南省现代农业产业技术体系专项(S2013-09,S2013-09-G02)
河南省重大公益性专项(201300110700)
+1 种基金
河南省农业科学院自主创新项目(2022ZC31)
河南省农业科学院优秀青年科技基金计划项目(2020YQ18)。
文摘
为了探究不同生长阶段平菇对IAA的响应机制,分别用高浓度(1×10-3mol/L)、低浓度(1×10-8mol/L)IAA处理平菇生长发育过程的菌丝体(7 d、15 d)及子实体(25 d、27 d、31 d),以不处理为对照(CK),通过转录组筛选差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。采用Venn分析、聚类分析、功能富集分析及共表达网络揭示平菇不同生长阶段对IAA响应的分子机制。结果表明,高浓度IAA处理菌丝体和子实体,分别筛选到DEGs 217个和10个,共表达关系对6735个和32个;低浓度IAA处理菌丝体和子实体分别获得DEGs 81个和87个,共表达关系对766个和1565个。GO及KEGG富集结果显示,低浓度IAA通过TRINITY_DN2732_c0_g1调控核糖体合成内源植物激素,通过TRINITY_DN530_c0_g1及TRINITY_DN3832_c0_g1促进子实体阶段的代谢进程;高浓度IAA通过TRINITY_DN41591_c0_g1调控甘油磷脂代谢过程,TRINITY_DN14069_c0_g1调控几丁质代谢及TRINITY_DN35150_c0_g1、TRINITY_DN5314_c0_g1、TRINITY_DN43009_c0_g1调节氧化还原酶活性,同时通过TRINITY_DN21430_c0_g1调控子实体阶段ATP的合成。以上结果表明,低浓度IAA通过DEGs影响平菇菌丝体阶段的激素合成及子实体阶段的代谢过程;高浓度IAA通过DEGs调控平菇菌丝体阶段的氧化应激机制及子实体阶段的ATP合成。
关键词
平菇
IAA
菌丝体阶段
子实体阶段
转录组分析
Keywords
Pleurotus ostreatus
IAA
Mycelium stage
Fruiting body stage
Transcriptome analysis
分类号
S646 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
袋栽香菇部分菌袋不出菇的解决办法
3
作者
李超敏
张大鹏
周建祥
陈东旭
机构
河南省
西峡县食用菌生产办公室
出处
《农技服务》
2000年第1期23-23,共1页
文摘
在袋料香菇栽培过程中,往往发现有10％左右的菌袋不容易出菇,群众俗称之为“哑巴袋”。为了弄清不出菇的原因,提出解决办法,我们经过两年多的试验和实践,对其中的原因有了比较清楚的认识,并研究了相应的解决办法,这些办法在实践中运用效果很好。
关键词
袋栽香菇
菌袋不出菇
解决办法
栽培技术
分类号
S646.120.4 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于拮抗及ITS序列分析的河南香菇主产区种质资源鉴定及遗传多样性分析
崔筱
刘芹
孔维丽
张玉亭
胡素娟
王彦坡
康源春
孔维威
袁瑞奇
《中国瓜菜》
CAS
北大核心
2022
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
平菇生长发育过程中对IAA响应的转录组分析
崔筱
张玉亭
孔维丽
胡素娟
刘芹
王彦坡
吴杰
师子文
《河南农业科学》
北大核心
2022
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
袋栽香菇部分菌袋不出菇的解决办法
李超敏
张大鹏
周建祥
陈东旭
《农技服务》
2000
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职称材料
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