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西安市耐利福平结核分枝杆菌rpoB基因的突变型分析
被引量:
2
1
作者
杜蓬
李峰
+1 位作者
董兆麟
陈超
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期19-23,共5页
目的西安市结核分枝杆菌临床分离株rpoB基因RRDR的基因型分析。方法采用PCR-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析32株结核分枝杆菌耐RFP株和10株RFP敏感株的rpoB基因PCR产物,并对8株具有代表性的菌株rpoB基因片段通过DNA测序进行验证。结果 r...
目的西安市结核分枝杆菌临床分离株rpoB基因RRDR的基因型分析。方法采用PCR-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析32株结核分枝杆菌耐RFP株和10株RFP敏感株的rpoB基因PCR产物,并对8株具有代表性的菌株rpoB基因片段通过DNA测序进行验证。结果 rpoB基因PCR-SSCP分析灵敏度为56.3%(18/32),特异性为80%(8/10)。8株结核分枝杆菌rpoB基因经测序,6株耐RFP菌株中有5株的rpoB基因突变均发生在531或526密码子上。其中有两株在526密码子均发生了双碱基突变;1株PCR-SSCP呈现阴性的耐RFP结核分枝杆菌存在513密码子突变;两株RFP敏感株出现PCR-SSCP假阳性,其rpoB基因均涉及2~3个密码子的突变,其中518密码子突变型AAC→GAC为首次报道。结论 531和526密码子除了单点突变之外,亦出现同密码子双碱基突变型;RFP敏感株多密码子突变型值得关注。
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关键词
结核分枝杆菌
耐利福平
RPOB基因
突变
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职称材料
新型Taq Man-MGB探针在结核分枝杆菌实时PCR检测中的应用
被引量:
11
2
作者
赵锦荣
白玉杰
+4 位作者
罗明
张庆华
郭晏海
张菊1
阎小君
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期807-810,共4页
为建立一种比现有方法敏感、准确性高、重复性好的结核分枝杆菌DNA定性定量检测方法 ,以TaqMan探针技术为基础 ,运用TaqMan MGB探针 ,实时检测临床标本中的结核分枝杆菌DNA .用来自临床标本的DNA及克隆于载体的IS6 1 1 0序列检测所建立...
为建立一种比现有方法敏感、准确性高、重复性好的结核分枝杆菌DNA定性定量检测方法 ,以TaqMan探针技术为基础 ,运用TaqMan MGB探针 ,实时检测临床标本中的结核分枝杆菌DNA .用来自临床标本的DNA及克隆于载体的IS6 1 1 0序列检测所建立方法的有效性 .结果显示 ,所建立方法的最低检测限度为 1个基因拷贝 反应 ,在每反应 1 0 0 ~ 1 0 8拷贝范围内 ,Ct 值同DNA量的对数呈线性关系 .同一模板不同时间或同一时间不同管内扩增 ,所得Ct 值恒定 .用该方法检测 37例结核分枝杆菌培养阳性的痰液标本 ,敏感度为 1 0 0 % ;用该方法检测 1 6例TB系列阴性参考品 ,特异性为1 0 0 % .结果表明 。
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关键词
结核分枝杆菌
聚合酶链式反应
荧光定量PCR
TAQMAN-MGB探针
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职称材料
题名
西安市耐利福平结核分枝杆菌rpoB基因的突变型分析
被引量:
2
1
作者
杜蓬
李峰
董兆麟
陈超
机构
国家微检测系统工程技术研究中心
浙江医学高等专
科
学校基础医学部
西安市结核病医院检验科
西北大学生命
科
学学院
出处
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期19-23,共5页
文摘
目的西安市结核分枝杆菌临床分离株rpoB基因RRDR的基因型分析。方法采用PCR-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析32株结核分枝杆菌耐RFP株和10株RFP敏感株的rpoB基因PCR产物,并对8株具有代表性的菌株rpoB基因片段通过DNA测序进行验证。结果 rpoB基因PCR-SSCP分析灵敏度为56.3%(18/32),特异性为80%(8/10)。8株结核分枝杆菌rpoB基因经测序,6株耐RFP菌株中有5株的rpoB基因突变均发生在531或526密码子上。其中有两株在526密码子均发生了双碱基突变;1株PCR-SSCP呈现阴性的耐RFP结核分枝杆菌存在513密码子突变;两株RFP敏感株出现PCR-SSCP假阳性,其rpoB基因均涉及2~3个密码子的突变,其中518密码子突变型AAC→GAC为首次报道。结论 531和526密码子除了单点突变之外,亦出现同密码子双碱基突变型;RFP敏感株多密码子突变型值得关注。
关键词
结核分枝杆菌
耐利福平
RPOB基因
突变
Keywords
Mycobacterium tuberculosis
rifampin-resistance
rpoB gene
mutation
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
新型Taq Man-MGB探针在结核分枝杆菌实时PCR检测中的应用
被引量:
11
2
作者
赵锦荣
白玉杰
罗明
张庆华
郭晏海
张菊1
阎小君
机构
第四军医大学基因诊断研究所
西安市结核病医院检验科
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期807-810,共4页
文摘
为建立一种比现有方法敏感、准确性高、重复性好的结核分枝杆菌DNA定性定量检测方法 ,以TaqMan探针技术为基础 ,运用TaqMan MGB探针 ,实时检测临床标本中的结核分枝杆菌DNA .用来自临床标本的DNA及克隆于载体的IS6 1 1 0序列检测所建立方法的有效性 .结果显示 ,所建立方法的最低检测限度为 1个基因拷贝 反应 ,在每反应 1 0 0 ~ 1 0 8拷贝范围内 ,Ct 值同DNA量的对数呈线性关系 .同一模板不同时间或同一时间不同管内扩增 ,所得Ct 值恒定 .用该方法检测 37例结核分枝杆菌培养阳性的痰液标本 ,敏感度为 1 0 0 % ;用该方法检测 1 6例TB系列阴性参考品 ,特异性为1 0 0 % .结果表明 。
关键词
结核分枝杆菌
聚合酶链式反应
荧光定量PCR
TAQMAN-MGB探针
Keywords
Mycobacterium tuberculosis, fluorescence quantitative polymerase chain reaction
分类号
R378.911 [医药卫生—病原生物学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
西安市耐利福平结核分枝杆菌rpoB基因的突变型分析
杜蓬
李峰
董兆麟
陈超
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
新型Taq Man-MGB探针在结核分枝杆菌实时PCR检测中的应用
赵锦荣
白玉杰
罗明
张庆华
郭晏海
张菊1
阎小君
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003
11
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职称材料
已选择
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条
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引证文献
统计分析
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