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OAT在非小细胞肺癌中的表达及生物信息学分析
被引量：
4
1
作者
周丹菲
程西安
+4 位作者
杨拴盈
明宗娟
李维
张秋红
张玉萍
《中国肺癌杂志》
CAS
北大核心
2012年第9期521-530,共10页
背景与目的已有的研究表明,鸟氨酸氨基转移酶(ornithine aminotransferase,OAT)可能参与多种恶性肿瘤的发生和发展,本研究旨在检测非小细胞肺癌(non-small cell lungcancer,NSCLC)中OAT mRNA和蛋白质的表达,并对其进行生物信息学分析。...
背景与目的已有的研究表明,鸟氨酸氨基转移酶(ornithine aminotransferase,OAT)可能参与多种恶性肿瘤的发生和发展,本研究旨在检测非小细胞肺癌(non-small cell lungcancer,NSCLC)中OAT mRNA和蛋白质的表达,并对其进行生物信息学分析。方法通过RT-PCR的方法比较A549和16HBE细胞间OAT mRNA水平的差异;采用免疫组织化学SP法检测55例肺癌组织和17例癌旁肺组织中OAT蛋白表达;利用生物信息学的方法对OAT蛋白的生物信息学特征和相互作用蛋白进行分析,并对筛选出来的相互作用蛋白进行GO注释和信号通路分析。结果①A549中OAT mRNA相对含量较16HBE中低,两者差异约2.85倍。②NSCLC中OAT蛋白的表达明显高于癌旁肺组织(P<0.05);OAT蛋白在鳞癌和腺癌间的表达差异有统计学意义,而与患者性别、年龄、有无淋巴结转移、肿瘤直径及TNM分期无关。③生物信息学分析提示OAT蛋白定位于线粒体、为高度保守的亲水性蛋白,具有Aminotran-3结构域,可能存在多个丝/苏氨酸磷酸化位点,在信号转导、转录和分子转运等方面发挥一定的作用;在筛选出来的54种可能和OAT存在相互作用的蛋白质中,TNF和TRAF6这两种蛋白参与了NF-κB信号通路。结论 OAT可能在NSCLC的发生和发展中发挥重要作用,有望成为肺癌的早期诊断标志物和治疗的新靶点。
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关键词
鸟氨酸氨基转移酶
肺肿瘤
表达
生物信息学
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职称材料
题名
OAT在非小细胞肺癌中的表达及生物信息学分析
被引量：
4
1
作者
周丹菲
程西安
杨拴盈
明宗娟
李维
张秋红
张玉萍
机构
西安交通大学附属第二医院呼吸内科
铜川市人民
医院
出处
《中国肺癌杂志》
CAS
北大核心
2012年第9期521-530,共10页
基金
国家自然基金项目(No.81172234)资助~~
文摘
背景与目的已有的研究表明,鸟氨酸氨基转移酶(ornithine aminotransferase,OAT)可能参与多种恶性肿瘤的发生和发展,本研究旨在检测非小细胞肺癌(non-small cell lungcancer,NSCLC)中OAT mRNA和蛋白质的表达,并对其进行生物信息学分析。方法通过RT-PCR的方法比较A549和16HBE细胞间OAT mRNA水平的差异;采用免疫组织化学SP法检测55例肺癌组织和17例癌旁肺组织中OAT蛋白表达;利用生物信息学的方法对OAT蛋白的生物信息学特征和相互作用蛋白进行分析,并对筛选出来的相互作用蛋白进行GO注释和信号通路分析。结果①A549中OAT mRNA相对含量较16HBE中低,两者差异约2.85倍。②NSCLC中OAT蛋白的表达明显高于癌旁肺组织(P<0.05);OAT蛋白在鳞癌和腺癌间的表达差异有统计学意义,而与患者性别、年龄、有无淋巴结转移、肿瘤直径及TNM分期无关。③生物信息学分析提示OAT蛋白定位于线粒体、为高度保守的亲水性蛋白,具有Aminotran-3结构域,可能存在多个丝/苏氨酸磷酸化位点,在信号转导、转录和分子转运等方面发挥一定的作用;在筛选出来的54种可能和OAT存在相互作用的蛋白质中,TNF和TRAF6这两种蛋白参与了NF-κB信号通路。结论 OAT可能在NSCLC的发生和发展中发挥重要作用,有望成为肺癌的早期诊断标志物和治疗的新靶点。
关键词
鸟氨酸氨基转移酶
肺肿瘤
表达
生物信息学
Keywords
Ornithine aminotransferase （OAT）
Lung neoplasms
Expression
Btoinformatics
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
OAT在非小细胞肺癌中的表达及生物信息学分析
周丹菲
程西安
杨拴盈
明宗娟
李维
张秋红
张玉萍
《中国肺癌杂志》
CAS
北大核心
2012
4
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