目的探究铜死亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者中的预后价值及其在治疗中的潜在价值。方法从肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中收集肝细胞癌的转录...目的探究铜死亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者中的预后价值及其在治疗中的潜在价值。方法从肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中收集肝细胞癌的转录组数据及对应患者的临床资料。筛选癌组织与正常肝组织差异表达的铜死亡相关基因,并进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析。筛选与肝细胞癌预后相关的铜死亡lncRNA,对肝细胞癌患者进行分组并比较总体生存率。采用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)Cox回归分析建立预后风险模型。建立用于预测肝细胞癌患者总体生存率的列线图。结果获得由5个铜死亡相关lncRNA组成的预后模型,包括:RPS6KA6、SNRPEP2、PRELID2、GOT2和RTL8A。风险评分和TNM分期的列线图显示出该模型具有较好的预测能力。该预后模型与肿瘤免疫逃逸及免疫功能下相关基因的表达有关。结论本研究成功构建的铜死亡相关lncRNA预后模型对预测HCC患者生存预后具有一定的准确性和可靠性,为铜死亡和HCC免疫之间的相互作用提供了线索。以铜死亡为核心的治疗有望为HCC治疗提供新的思路。展开更多
文摘目的探究铜死亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者中的预后价值及其在治疗中的潜在价值。方法从肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中收集肝细胞癌的转录组数据及对应患者的临床资料。筛选癌组织与正常肝组织差异表达的铜死亡相关基因,并进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析。筛选与肝细胞癌预后相关的铜死亡lncRNA,对肝细胞癌患者进行分组并比较总体生存率。采用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)Cox回归分析建立预后风险模型。建立用于预测肝细胞癌患者总体生存率的列线图。结果获得由5个铜死亡相关lncRNA组成的预后模型,包括:RPS6KA6、SNRPEP2、PRELID2、GOT2和RTL8A。风险评分和TNM分期的列线图显示出该模型具有较好的预测能力。该预后模型与肿瘤免疫逃逸及免疫功能下相关基因的表达有关。结论本研究成功构建的铜死亡相关lncRNA预后模型对预测HCC患者生存预后具有一定的准确性和可靠性,为铜死亡和HCC免疫之间的相互作用提供了线索。以铜死亡为核心的治疗有望为HCC治疗提供新的思路。
