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低温机械灌注参数与移植物功能延迟恢复的非线性关系分析及基于采样算法优化预测模型的构建
1
作者
董博清
王崇峰
+8 位作者
赵雨亭
毕焕京
王颖
王靖雯
陈祖涵
马睿阳
薛武军
李杨
丁小明
《器官移植》
北大核心
2025年第4期582-590,共9页
目的分析低温机械灌注(HMP)参数与移植物功能延迟恢复(DGF)的非线性关系,优化DGF预测模型的构建。方法回顾性分析923例接受公民逝世后器官捐献肾移植的受者资料,根据DGF的发生情况分为DGF组(823例)和非DGF组(100例)。分析两组供者资料、...
目的分析低温机械灌注(HMP)参数与移植物功能延迟恢复(DGF)的非线性关系,优化DGF预测模型的构建。方法回顾性分析923例接受公民逝世后器官捐献肾移植的受者资料,根据DGF的发生情况分为DGF组(823例)和非DGF组(100例)。分析两组供者资料、HMP参数及受者资料。基于限制性立方样条(RCS)探索HMP参数与DGF发生间的非线性关系。采用过采样、欠采样及平衡采样解决DGF比例不平衡问题,以构建逻辑回归预测模型。在验证集中比较各个模型的曲线下面积(AUC),并绘制列线图模型。结果DGF组供者BMI、供肾冷缺血时间及HMP参数(初始和终末压力、阻力,灌注时间)等变量与非DGF组差异均有统计学意义(均为P<0.05)。RCS分析显示HMP参数与DGF风险存在拐点式非线性关系。基于不同采样方式构建的模型中,平衡采样模型具有最高AUC。利用该模型构建列线图模型,将受者依据风险评分分组,高风险组受者肾移植术后1、6、12个月血清肌酐水平高于低风险组受者(均为P<0.05)。结论HMP参数与DGF风险存在非线性关系,其阈值有助于器官质量评估以及移植后的移植物功能监测。基于平衡采样算法构建的DGF预测模型有助于肾移植围手术期决策及术后移植物功能监测。
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关键词
肾移植
移植物功能延迟恢复
低温机械灌注
限制性立方样条
非线性关系
列线图
平衡采样
血清肌酐
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职称材料
基于加权基因共表达网络鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型相关基因
被引量：
1
2
作者
董博清
李杨
+6 位作者
石玉婷
张静
冯新顺
郑瑾
李潇
丁小明
薛武军
《器官移植》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期83-92,共10页
目的鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型表达的相关基因并构建风险模型预测移植肾存活。方法在基因表达综合(GEO)数据库下载肾移植术后的GSE36059及GSE21374数据集。GSE36059包括发生排斥反应和稳定移植物的样本,使用该数据集进行...
目的鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型表达的相关基因并构建风险模型预测移植肾存活。方法在基因表达综合(GEO)数据库下载肾移植术后的GSE36059及GSE21374数据集。GSE36059包括发生排斥反应和稳定移植物的样本,使用该数据集进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异分析筛选差异表达的巨噬细胞M1亚型相关差异表达基因(M1-DEG)。随后将GSE21374数据集(包含了移植物丢失的随访数据)按照7∶3拆分为训练集以及验证集,在训练集中使用最小绝对收缩和选择算法(LASSO)筛选变量构建多因素Cox模型,并评估模型预测移植物存活的能力。使用CIBERSORT分析高、低风险组浸润的免疫细胞的差异,并分析两组间人类白细胞抗原(HLA)相关基因的分布,基因集富集分析(GSEA)用于进一步明确高风险组中富集的生物学过程以及通路。最后使用数据库预测与预后基因互作的微小核糖核酸(miRNA)。结果在GSE36059数据集中,筛选得到14个M1-DEG。在GSE21374数据集中,使用LASSO-Cox回归筛选出Toll样受体8(TLR8)、Fcγ受体1B(FCGR1B)、BCL2相关蛋白A1(BCL2A1)、组织蛋白酶S(CTSS)、鸟苷酸结合蛋白2(GBP2)及半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶招募域家族成员16(CARD16),基于这6个M1-DEG构建多因素Cox模型。风险模型在训练集中预测1年及3年移植物存活的受试者工作特征曲线下面积(AUC)分别为0.918和0.877,在验证集中预测1年及3年移植物存活的AUC分别为0.765及0.736。免疫浸润分析表明,高风险组静息及活化的CD4+记忆T细胞、γδT细胞、巨噬细胞M1亚型浸润增多(均为P<0.05)。高风险组HLAⅠ类基因表达上调。GSEA分析表明,高风险组免疫反应及移植物排斥反应富集。CTSS与8个miRNA相互作用、BCL2A1和GBP2与3个miRNA相互作用、FCGR1B与1个miRNA相互作用。结论本研究基于6个M1-DEG构建的预后风险模型对于预测移植肾存活具有良好的表现,可为早期对高风险受者干预提供依据。
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关键词
肾移植
排斥反应
移植肾丢失
巨噬细胞
M1亚型
加权基因共表达网络分析
差异表达基因
免疫反应
微小核糖核酸
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职称材料
题名
低温机械灌注参数与移植物功能延迟恢复的非线性关系分析及基于采样算法优化预测模型的构建
1
作者
董博清
王崇峰
赵雨亭
毕焕京
王颖
王靖雯
陈祖涵
马睿阳
薛武军
李杨
丁小明
机构
西安交通大学第一附属医院肾移植科、西安交通大学器官移植研究所
中国医学
科
学院北京协和医学院肿瘤
医院
妇瘤
科
出处
《器官移植》
北大核心
2025年第4期582-590,共9页
基金
国家自然科学基金(82370802、82400935)
创新药物上市后临床研究科研专项(WKZX2023CX190002)
+1 种基金
陕西省卫生健康科研创新能力提升计划平台建设项目(2023PT-06)
中国器官移植发展基金课题。
文摘
目的分析低温机械灌注(HMP)参数与移植物功能延迟恢复(DGF)的非线性关系,优化DGF预测模型的构建。方法回顾性分析923例接受公民逝世后器官捐献肾移植的受者资料,根据DGF的发生情况分为DGF组(823例)和非DGF组(100例)。分析两组供者资料、HMP参数及受者资料。基于限制性立方样条(RCS)探索HMP参数与DGF发生间的非线性关系。采用过采样、欠采样及平衡采样解决DGF比例不平衡问题,以构建逻辑回归预测模型。在验证集中比较各个模型的曲线下面积(AUC),并绘制列线图模型。结果DGF组供者BMI、供肾冷缺血时间及HMP参数(初始和终末压力、阻力,灌注时间)等变量与非DGF组差异均有统计学意义(均为P<0.05)。RCS分析显示HMP参数与DGF风险存在拐点式非线性关系。基于不同采样方式构建的模型中,平衡采样模型具有最高AUC。利用该模型构建列线图模型,将受者依据风险评分分组,高风险组受者肾移植术后1、6、12个月血清肌酐水平高于低风险组受者(均为P<0.05)。结论HMP参数与DGF风险存在非线性关系,其阈值有助于器官质量评估以及移植后的移植物功能监测。基于平衡采样算法构建的DGF预测模型有助于肾移植围手术期决策及术后移植物功能监测。
关键词
肾移植
移植物功能延迟恢复
低温机械灌注
限制性立方样条
非线性关系
列线图
平衡采样
血清肌酐
Keywords
Kidney transplantation
Delayed graft function
Hypothermic machine perfusion
Restricted cubic spline
Nonlinear relationship
Nomogram
Balanced sampling
Serum creatinine
分类号
R617 [医药卫生—外科学]
R692 [医药卫生—泌尿科学]
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职称材料
题名
基于加权基因共表达网络鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型相关基因
被引量：
1
2
作者
董博清
李杨
石玉婷
张静
冯新顺
郑瑾
李潇
丁小明
薛武军
机构
西安交通大学第一附属医院肾移植科、西安交通大学器官移植研究所
出处
《器官移植》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期83-92,共10页
基金
国家自然科学基金(81970668)
陕西省重点研发计划(2022SF-148)
+1 种基金
西安交通大学基本科研业务基金(xzy012021060)
中国器官移植发展基金课题。
文摘
目的鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型表达的相关基因并构建风险模型预测移植肾存活。方法在基因表达综合(GEO)数据库下载肾移植术后的GSE36059及GSE21374数据集。GSE36059包括发生排斥反应和稳定移植物的样本,使用该数据集进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异分析筛选差异表达的巨噬细胞M1亚型相关差异表达基因(M1-DEG)。随后将GSE21374数据集(包含了移植物丢失的随访数据)按照7∶3拆分为训练集以及验证集,在训练集中使用最小绝对收缩和选择算法(LASSO)筛选变量构建多因素Cox模型,并评估模型预测移植物存活的能力。使用CIBERSORT分析高、低风险组浸润的免疫细胞的差异,并分析两组间人类白细胞抗原(HLA)相关基因的分布,基因集富集分析(GSEA)用于进一步明确高风险组中富集的生物学过程以及通路。最后使用数据库预测与预后基因互作的微小核糖核酸(miRNA)。结果在GSE36059数据集中,筛选得到14个M1-DEG。在GSE21374数据集中,使用LASSO-Cox回归筛选出Toll样受体8(TLR8)、Fcγ受体1B(FCGR1B)、BCL2相关蛋白A1(BCL2A1)、组织蛋白酶S(CTSS)、鸟苷酸结合蛋白2(GBP2)及半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶招募域家族成员16(CARD16),基于这6个M1-DEG构建多因素Cox模型。风险模型在训练集中预测1年及3年移植物存活的受试者工作特征曲线下面积(AUC)分别为0.918和0.877,在验证集中预测1年及3年移植物存活的AUC分别为0.765及0.736。免疫浸润分析表明,高风险组静息及活化的CD4+记忆T细胞、γδT细胞、巨噬细胞M1亚型浸润增多(均为P<0.05)。高风险组HLAⅠ类基因表达上调。GSEA分析表明,高风险组免疫反应及移植物排斥反应富集。CTSS与8个miRNA相互作用、BCL2A1和GBP2与3个miRNA相互作用、FCGR1B与1个miRNA相互作用。结论本研究基于6个M1-DEG构建的预后风险模型对于预测移植肾存活具有良好的表现,可为早期对高风险受者干预提供依据。
关键词
肾移植
排斥反应
移植肾丢失
巨噬细胞
M1亚型
加权基因共表达网络分析
差异表达基因
免疫反应
微小核糖核酸
Keywords
Kidney transplantation
Rejection
Renal graft loss
Macrophages
M1 subtype
Weighted gene coexpression network analysis
Differentially expressed gene
Immunoreaction
MicroRNA
分类号
R617 [医药卫生—外科学]
R392.12 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
低温机械灌注参数与移植物功能延迟恢复的非线性关系分析及基于采样算法优化预测模型的构建
董博清
王崇峰
赵雨亭
毕焕京
王颖
王靖雯
陈祖涵
马睿阳
薛武军
李杨
丁小明
《器官移植》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
基于加权基因共表达网络鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型相关基因
董博清
李杨
石玉婷
张静
冯新顺
郑瑾
李潇
丁小明
薛武军
《器官移植》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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