目的 探讨基于PDZ结合基序的转录共激活因子(transcriptional coactivator with PDZ-binding motif, TAZ)在卵巢癌中的表达情况,并进一步分析其在卵巢癌中的作用机制。方法 利用仙桃学术分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TC...目的 探讨基于PDZ结合基序的转录共激活因子(transcriptional coactivator with PDZ-binding motif, TAZ)在卵巢癌中的表达情况,并进一步分析其在卵巢癌中的作用机制。方法 利用仙桃学术分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库中卵巢癌组织及正常对照组织中TAZ mRNA表达水平,并进行受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic, ROC)分析。通过人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas, HPA)数据库提供的免疫组化切片,分析TAZ蛋白在卵巢癌组织及正常对照组织中的表达。将卵巢癌细胞SKOV3分为2组:阴性对照组和缺氧组,采用实时定量PCR和Western blot分别检测TAZ的mRNA及蛋白表达;在HIF-2α过表达质粒转染SKOV3细胞后,检测TAZ的表达变化。获取TCGA数据库中376例卵巢癌RNAseq数据及相应的临床信息,通过基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析TAZ相关的差异表达基因,并分析TAZ高、低表达组中铁死亡相关基因的表达差异。结果 卵巢癌中Hippo通路核心分子TAZ的mRNA水平显著下调(P<0.05),蛋白水平上调,TAZ在卵巢癌诊断中的曲线下面积为0.739。与对照组比较,缺氧组SKOV3细胞中TAZ的表达水平显著升高(P<0.05)。转染HIF-2α过表达质粒后,TAZ的mRNA和蛋白表达水平均显著上调(P<0.05)。富集分析结果显示,TAZ可能参与细胞外基质-受体相互作用、局灶黏附、PI3K-Akt信号通路、胶原纤维结构等信号通路及生物学过程。此外,部分铁死亡相关基因的表达在TAZ高、低表达组间存在显著差异。结论 TAZ在卵巢癌中呈现异常表达,并与缺氧反应及铁死亡等关键生物过程密切相关,提示其作为卵巢癌潜在生物标志物和治疗靶点的可能性。展开更多
目的探讨人参皂苷20(S)-Rg3抑制卵巢癌细胞增殖和迁移的机制。方法在西安交通大学第一附属医院收集卵巢癌组织19例,正常卵巢组织18例,采用real-time PCR检测lncRNA KRT18P55的表达。将卵巢癌细胞SKOV3和3AO分别分为2组:阴性对照组和20(S...目的探讨人参皂苷20(S)-Rg3抑制卵巢癌细胞增殖和迁移的机制。方法在西安交通大学第一附属医院收集卵巢癌组织19例,正常卵巢组织18例,采用real-time PCR检测lncRNA KRT18P55的表达。将卵巢癌细胞SKOV3和3AO分别分为2组:阴性对照组和20(S)-Rg3组,通过real-time PCR检测KRT18P55的表达水平,CCK-8和平板克隆实验检测SKOV3和3AO细胞增殖能力,Transwell小室法检测SKOV3和3AO细胞迁移能力。将KRT18P55 siRNA分别转染SKOV3和3AO细胞,通过real-time PCR检测KRT18P55的表达水平,CCK-8和平板克隆实验检测SKOV3和3AO细胞增殖能力,Transwell小室法检测SKOV3和3AO细胞迁移能力。癌症基因组学门户网站(cBioPortal for Cancer Genomics,cBioPortal)提取KRT18P55共表达基因数据;基因功能分析数据库(Gene Annotation and Analysis Resource,Metascape)对KRT18P55及其显著相关基因进行功能富集分析;基因表达谱交互式分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)、阿拉巴马大学癌症数据分析门户(University of Alabama at Birmingham Cancer Data Analysis Portal,UALCAN)在线数据库对筛选的KRT18P55显著相关基因进行表达分析。结果人卵巢癌组织中的KRT18P55表达水平显著高于正常卵巢组织,经20(S)-Rg3处理的卵巢癌细胞SKOV3和3AO的增殖和迁移能力均下降,KRT18P55的表达水平显著降低,差异均具有统计学意义(P<0.05)。敲低KRT18P55后,卵巢癌细胞的增殖和迁移能力下降(P<0.05)。基因本体(Gene Ontology,GO)功能富集分析显示,KRT18P55可能参与中间丝细胞骨架组成、外源性凋亡信号通路等。GEPIA及UALCAN数据库的表达分析显示,KRT18P55相关性最强的两个基因KRT18、KRT8的mRNA及蛋白水平在卵巢癌中均较正常对照显著增高(P<0.05)。结论人参皂苷20(S)-Rg3可能通过降低KRT18P55的表达水平抑制卵巢癌细胞的增殖与迁移,进而抑制卵巢癌的进展。展开更多
文摘目的 探讨基于PDZ结合基序的转录共激活因子(transcriptional coactivator with PDZ-binding motif, TAZ)在卵巢癌中的表达情况,并进一步分析其在卵巢癌中的作用机制。方法 利用仙桃学术分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库中卵巢癌组织及正常对照组织中TAZ mRNA表达水平,并进行受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic, ROC)分析。通过人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas, HPA)数据库提供的免疫组化切片,分析TAZ蛋白在卵巢癌组织及正常对照组织中的表达。将卵巢癌细胞SKOV3分为2组:阴性对照组和缺氧组,采用实时定量PCR和Western blot分别检测TAZ的mRNA及蛋白表达;在HIF-2α过表达质粒转染SKOV3细胞后,检测TAZ的表达变化。获取TCGA数据库中376例卵巢癌RNAseq数据及相应的临床信息,通过基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析TAZ相关的差异表达基因,并分析TAZ高、低表达组中铁死亡相关基因的表达差异。结果 卵巢癌中Hippo通路核心分子TAZ的mRNA水平显著下调(P<0.05),蛋白水平上调,TAZ在卵巢癌诊断中的曲线下面积为0.739。与对照组比较,缺氧组SKOV3细胞中TAZ的表达水平显著升高(P<0.05)。转染HIF-2α过表达质粒后,TAZ的mRNA和蛋白表达水平均显著上调(P<0.05)。富集分析结果显示,TAZ可能参与细胞外基质-受体相互作用、局灶黏附、PI3K-Akt信号通路、胶原纤维结构等信号通路及生物学过程。此外,部分铁死亡相关基因的表达在TAZ高、低表达组间存在显著差异。结论 TAZ在卵巢癌中呈现异常表达,并与缺氧反应及铁死亡等关键生物过程密切相关,提示其作为卵巢癌潜在生物标志物和治疗靶点的可能性。
文摘目的探讨人参皂苷20(S)-Rg3抑制卵巢癌细胞增殖和迁移的机制。方法在西安交通大学第一附属医院收集卵巢癌组织19例,正常卵巢组织18例,采用real-time PCR检测lncRNA KRT18P55的表达。将卵巢癌细胞SKOV3和3AO分别分为2组:阴性对照组和20(S)-Rg3组,通过real-time PCR检测KRT18P55的表达水平,CCK-8和平板克隆实验检测SKOV3和3AO细胞增殖能力,Transwell小室法检测SKOV3和3AO细胞迁移能力。将KRT18P55 siRNA分别转染SKOV3和3AO细胞,通过real-time PCR检测KRT18P55的表达水平,CCK-8和平板克隆实验检测SKOV3和3AO细胞增殖能力,Transwell小室法检测SKOV3和3AO细胞迁移能力。癌症基因组学门户网站(cBioPortal for Cancer Genomics,cBioPortal)提取KRT18P55共表达基因数据;基因功能分析数据库(Gene Annotation and Analysis Resource,Metascape)对KRT18P55及其显著相关基因进行功能富集分析;基因表达谱交互式分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)、阿拉巴马大学癌症数据分析门户(University of Alabama at Birmingham Cancer Data Analysis Portal,UALCAN)在线数据库对筛选的KRT18P55显著相关基因进行表达分析。结果人卵巢癌组织中的KRT18P55表达水平显著高于正常卵巢组织,经20(S)-Rg3处理的卵巢癌细胞SKOV3和3AO的增殖和迁移能力均下降,KRT18P55的表达水平显著降低,差异均具有统计学意义(P<0.05)。敲低KRT18P55后,卵巢癌细胞的增殖和迁移能力下降(P<0.05)。基因本体(Gene Ontology,GO)功能富集分析显示,KRT18P55可能参与中间丝细胞骨架组成、外源性凋亡信号通路等。GEPIA及UALCAN数据库的表达分析显示,KRT18P55相关性最强的两个基因KRT18、KRT8的mRNA及蛋白水平在卵巢癌中均较正常对照显著增高(P<0.05)。结论人参皂苷20(S)-Rg3可能通过降低KRT18P55的表达水平抑制卵巢癌细胞的增殖与迁移,进而抑制卵巢癌的进展。
