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小细胞肺癌及其配对的正常肺组织差异表达蛋白质的双相电泳-飞行时间质谱研究
被引量:
3
1
作者
杨拴盈
张王刚
+7 位作者
张潍
周斌
田应选
南岩东
卜丽娜
阮禹松
孙秀珍
杨德昌
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第6期533-537,共5页
目的应用比较蛋白质组学方法分析小细胞肺癌(SCLC)与其配对的正常肺组织差异表达蛋白质,为阐明SCLC发病机制、筛选其早期诊断标志物提供有益的思路。方法应用双相电泳(2-DE)分离6例SCLC及其配对的正常肺组织可溶性总蛋白;应用基质辅助...
目的应用比较蛋白质组学方法分析小细胞肺癌(SCLC)与其配对的正常肺组织差异表达蛋白质,为阐明SCLC发病机制、筛选其早期诊断标志物提供有益的思路。方法应用双相电泳(2-DE)分离6例SCLC及其配对的正常肺组织可溶性总蛋白;应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)获得差异蛋白点的肽质量指纹图谱(PMF);通过Mascot软件查询NCBI或SWISS-PROT数据库鉴定蛋白质。结果每张图谱约检测到800多个蛋白质点。经匹配分析,肺癌组织之间和正常肺组织之间凝胶图像的匹配率分别为75.5%和78.2%;选择14个背景清晰、重复性及分辨率较好、蛋白表达差异明显的点进行质谱分析,结合表观分子量及等电点(pI),初步鉴定了11种(六类)蛋白质:①与蛋白质降解通路有关的蛋白质:蛋白酶体α亚单位3型、蛋白酶体β亚单位2型及β亚单位5型;②自由基/抗氧化剂类:锰-超氧化物歧化酶(Mn-SOD)、过氧化氢酶(CAT)和黄素还原酶(FR);③细胞骨架类:原肌球蛋白-3(Tpm-3);④与能量代谢有关的蛋白质:硫氧还蛋白过氧化物酶(TPX1);⑤分子伴侣:抑制素(PHB),内质网蛋白ER29(Erp29);⑥其他:可溶性NSF黏附蛋白(alpha SNAP)。结论应用2-DE及MALDI-TOF-MS方法分离并初步鉴定了11种(六类)蛋白质;这些蛋白质与SCLC发生发展密切相关,部分可能成为SCLC诊断及治疗的分子靶点。
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关键词
小细胞肺癌
蛋白质组学
双相电泳
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
肽质量指纹图谱
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职称材料
黑豆盐溶球蛋白的研究
被引量:
6
2
作者
阮禹松
赵文明
《西北植物学报》
CAS
CSCD
2003年第4期581-585,共5页
对经凝胶过滤后的黑豆盐溶球蛋白进行Native-PAGE及双向SDS-PAGE电泳分析,结果表明黑豆7S球蛋白是由3个以非共价键相结合的亚基 MW:84.7kD,72.6kD和49.2kD 连接而成;黑豆11S球蛋白中则含有以共价键相结合的亚基,同时也可能存在非共价键...
对经凝胶过滤后的黑豆盐溶球蛋白进行Native-PAGE及双向SDS-PAGE电泳分析,结果表明黑豆7S球蛋白是由3个以非共价键相结合的亚基 MW:84.7kD,72.6kD和49.2kD 连接而成;黑豆11S球蛋白中则含有以共价键相结合的亚基,同时也可能存在非共价键结合的亚基.其在还原条件下,可分解出5个肽链 MW:38.4kD,35.4kD,34.5kD,21kD和20.6kD ,且在电泳图片上明显分为两个区域.
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关键词
黑豆
盐溶球蛋白
电泳
亚基
共价键
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职称材料
小麦低分子量麦谷蛋白亚基组成研究
被引量:
3
3
作者
段淑娥
阮禹松
+1 位作者
赵文明
王波
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第4期719-722,共4页
利用改良的两步一向SDS-PAGE two-step one-dimensional SDS-PAGE 分析了几种小麦低分子量麦谷蛋白亚基 L MW-GS 组成. 70 %热乙醇提取总谷蛋白,1 1 %分离胶进行第一步SDS-PAGE分离,电泳1 h后切取顶端1 cm胶条并置于巯基乙醇溶液进行...
利用改良的两步一向SDS-PAGE two-step one-dimensional SDS-PAGE 分析了几种小麦低分子量麦谷蛋白亚基 L MW-GS 组成. 70 %热乙醇提取总谷蛋白,1 1 %分离胶进行第一步SDS-PAGE分离,电泳1 h后切取顶端1 cm胶条并置于巯基乙醇溶液进行还原,还原后的胶条于1 1 %~1 6.5%的梯度胶进行第二步SDS-PAGE分离.结果显示,两步一向SDS-PAGE可以彻底除去清蛋白、球蛋白和醇溶蛋白对L MW-GS分离的背景干扰,提高L MW-GS的分辨率.对几种小麦低分子量麦谷蛋白亚基分析表明:L MW-GS组合比HMW-GS更为丰富,每种小麦含有2~5种B亚基,2~4种C亚基,B。
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关键词
两步一向SDS—PAGE
麦谷蛋白
LMW—GS
梯度胶
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职称材料
种子盐溶球蛋白的结构特征
被引量:
5
4
作者
阮禹松
赵文明
《西北植物学报》
CAS
CSCD
2002年第4期999-1003,共5页
种子球蛋白一直是人类食物的主要来源。随着对种子球蛋白药理作用认识的不断深入 ,近年来研究重点已从单纯的序列转向结构的研究。种子球蛋白二级结构 (如α-螺旋和β-折叠 )存在较大程度的相似性 ,具有较大的保守性且与蛋白质的特殊功...
种子球蛋白一直是人类食物的主要来源。随着对种子球蛋白药理作用认识的不断深入 ,近年来研究重点已从单纯的序列转向结构的研究。种子球蛋白二级结构 (如α-螺旋和β-折叠 )存在较大程度的相似性 ,具有较大的保守性且与蛋白质的特殊功能关系密切 ;而三级结构之间差异明显 ,属易变异区 。
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关键词
种子
盐溶球蛋白
结构特征
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职称材料
题名
小细胞肺癌及其配对的正常肺组织差异表达蛋白质的双相电泳-飞行时间质谱研究
被引量:
3
1
作者
杨拴盈
张王刚
张潍
周斌
田应选
南岩东
卜丽娜
阮禹松
孙秀珍
杨德昌
机构
西安交通大学
医
学院
第二附属医院呼吸内科
西安交通大学
医
学院
第二附属医院血液科
西安交通大学
医
学院
第二附属医院胸外科
西安交通大学生命科学与技术学院信息中心
出处
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第6期533-537,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.30570795)
陕西省自然科学基金资助项目(No.2005C253)
文摘
目的应用比较蛋白质组学方法分析小细胞肺癌(SCLC)与其配对的正常肺组织差异表达蛋白质,为阐明SCLC发病机制、筛选其早期诊断标志物提供有益的思路。方法应用双相电泳(2-DE)分离6例SCLC及其配对的正常肺组织可溶性总蛋白;应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)获得差异蛋白点的肽质量指纹图谱(PMF);通过Mascot软件查询NCBI或SWISS-PROT数据库鉴定蛋白质。结果每张图谱约检测到800多个蛋白质点。经匹配分析,肺癌组织之间和正常肺组织之间凝胶图像的匹配率分别为75.5%和78.2%;选择14个背景清晰、重复性及分辨率较好、蛋白表达差异明显的点进行质谱分析,结合表观分子量及等电点(pI),初步鉴定了11种(六类)蛋白质:①与蛋白质降解通路有关的蛋白质:蛋白酶体α亚单位3型、蛋白酶体β亚单位2型及β亚单位5型;②自由基/抗氧化剂类:锰-超氧化物歧化酶(Mn-SOD)、过氧化氢酶(CAT)和黄素还原酶(FR);③细胞骨架类:原肌球蛋白-3(Tpm-3);④与能量代谢有关的蛋白质:硫氧还蛋白过氧化物酶(TPX1);⑤分子伴侣:抑制素(PHB),内质网蛋白ER29(Erp29);⑥其他:可溶性NSF黏附蛋白(alpha SNAP)。结论应用2-DE及MALDI-TOF-MS方法分离并初步鉴定了11种(六类)蛋白质;这些蛋白质与SCLC发生发展密切相关,部分可能成为SCLC诊断及治疗的分子靶点。
关键词
小细胞肺癌
蛋白质组学
双相电泳
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
肽质量指纹图谱
Keywords
small cell lung cancer
proteomics
two dimensional gel electrophoresis
matrix- assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry
peptide mass fingerprinting
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
黑豆盐溶球蛋白的研究
被引量:
6
2
作者
阮禹松
赵文明
机构
西安交通大学生命科学与技术学院信息中心
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
2003年第4期581-585,共5页
基金
西安交通大学青年教师科研基金
文摘
对经凝胶过滤后的黑豆盐溶球蛋白进行Native-PAGE及双向SDS-PAGE电泳分析,结果表明黑豆7S球蛋白是由3个以非共价键相结合的亚基 MW:84.7kD,72.6kD和49.2kD 连接而成;黑豆11S球蛋白中则含有以共价键相结合的亚基,同时也可能存在非共价键结合的亚基.其在还原条件下,可分解出5个肽链 MW:38.4kD,35.4kD,34.5kD,21kD和20.6kD ,且在电泳图片上明显分为两个区域.
关键词
黑豆
盐溶球蛋白
电泳
亚基
共价键
Keywords
black soya
salt-soluble globulin
electrophoresis
subunit
covalent bond
分类号
S529 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
小麦低分子量麦谷蛋白亚基组成研究
被引量:
3
3
作者
段淑娥
阮禹松
赵文明
王波
机构
西安交通大学
生命科学
与技术
学院
生物
信息
中心
西安
文理
学院
化学与
生命科学
系
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第4期719-722,共4页
基金
陕计投资 [1 997] 42 2号资助项目
文摘
利用改良的两步一向SDS-PAGE two-step one-dimensional SDS-PAGE 分析了几种小麦低分子量麦谷蛋白亚基 L MW-GS 组成. 70 %热乙醇提取总谷蛋白,1 1 %分离胶进行第一步SDS-PAGE分离,电泳1 h后切取顶端1 cm胶条并置于巯基乙醇溶液进行还原,还原后的胶条于1 1 %~1 6.5%的梯度胶进行第二步SDS-PAGE分离.结果显示,两步一向SDS-PAGE可以彻底除去清蛋白、球蛋白和醇溶蛋白对L MW-GS分离的背景干扰,提高L MW-GS的分辨率.对几种小麦低分子量麦谷蛋白亚基分析表明:L MW-GS组合比HMW-GS更为丰富,每种小麦含有2~5种B亚基,2~4种C亚基,B。
关键词
两步一向SDS—PAGE
麦谷蛋白
LMW—GS
梯度胶
Keywords
two step and one dimension SDS PAGE
glutenin
LMW GS
gradient gel
分类号
Q946-33 [生物学—植物学]
S512.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
种子盐溶球蛋白的结构特征
被引量:
5
4
作者
阮禹松
赵文明
机构
西安交通大学
生命科学
与技术
学院
生物
信息
中心
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
2002年第4期999-1003,共5页
文摘
种子球蛋白一直是人类食物的主要来源。随着对种子球蛋白药理作用认识的不断深入 ,近年来研究重点已从单纯的序列转向结构的研究。种子球蛋白二级结构 (如α-螺旋和β-折叠 )存在较大程度的相似性 ,具有较大的保守性且与蛋白质的特殊功能关系密切 ;而三级结构之间差异明显 ,属易变异区 。
关键词
种子
盐溶球蛋白
结构特征
Keywords
salt soluble seed globulin
α helix
β sheet
分类号
Q946.1 [生物学—植物学]
S330.2 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小细胞肺癌及其配对的正常肺组织差异表达蛋白质的双相电泳-飞行时间质谱研究
杨拴盈
张王刚
张潍
周斌
田应选
南岩东
卜丽娜
阮禹松
孙秀珍
杨德昌
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2006
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
黑豆盐溶球蛋白的研究
阮禹松
赵文明
《西北植物学报》
CAS
CSCD
2003
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
小麦低分子量麦谷蛋白亚基组成研究
段淑娥
阮禹松
赵文明
王波
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
种子盐溶球蛋白的结构特征
阮禹松
赵文明
《西北植物学报》
CAS
CSCD
2002
5
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职称材料
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