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“鸟枪”蛋白组学技术鉴定牙龈卟啉单胞菌47A-1亚型外膜蛋白 被引量：1
1
作者 孙俊毅 孙媛媛 +1 位作者 苟建重 李昂 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期170-174,共5页
目的利用shotgun（鸟枪）蛋白质组学策略鉴定牙龈卟啉单胞菌（Porphyromonas gingivalis,P.g）亚型47A-1外膜蛋白,深化P.g外膜蛋白的蛋白质组学研究,为进一步研究P.g外膜蛋白的致病性奠定基础。方法提取P.g47A-1外膜蛋白,SDS-PAGE电泳... 目的利用shotgun（鸟枪）蛋白质组学策略鉴定牙龈卟啉单胞菌（Porphyromonas gingivalis,P.g）亚型47A-1外膜蛋白,深化P.g外膜蛋白的蛋白质组学研究,为进一步研究P.g外膜蛋白的致病性奠定基础。方法提取P.g47A-1外膜蛋白,SDS-PAGE电泳分离蛋白,胶内酶解为多肽混合物,应用毛细管高效液相色谱加串联质谱分析,SEQUEST程序进行数据库搜索并鉴定蛋白。结果用考马斯亮蓝法染色凝胶分离的蛋白,发现P.g47A-1蛋白条带主要在14.3~97 ku之间。酶解的肽段经毛细管高效液相色谱分离,得到肽段水平的总离子流图,分析肽段序列后发现P.g47A-1蛋白有623个唯一肽段,鉴定出136种蛋白,包括了51种已知蛋白,85种未知蛋白。结论 Shotgun技术可分析出P.g47A-1大量未知蛋白,尤其是丰度低、疏水性强的外膜蛋白,优于二维凝胶电泳（two dimensional gelelectrophoresis,2-DE）等传统蛋白质组学方法,为进一步研究P.g外膜蛋白的致病性奠定了基础。 展开更多
关键词 牙龈卟啉单胞菌 外膜蛋白 鸟枪法 蛋白质组学
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