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U6和let-7a作为定量检测miRNAs的内参在大鼠软骨中稳定性的比较
1
作者
易林
郭华
+6 位作者
郭东贤
闵自信
袁莹
赵益童
韩燕
钟楠楠
孙健
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期497-501,535,共6页
目的比较U6和let-7a两种内参在RT-qPCR方法检测大鼠股骨头软骨样本microRNAs(miRNAs)的稳定性。方法取软骨生成过程的新生(D0)、断乳(D21)、性成熟(D42)3个时间节点的雌性近交系DA大鼠股骨头软骨,提取总RNA,用RT-qPCR方法分别在U6和let...
目的比较U6和let-7a两种内参在RT-qPCR方法检测大鼠股骨头软骨样本microRNAs(miRNAs)的稳定性。方法取软骨生成过程的新生(D0)、断乳(D21)、性成熟(D42)3个时间节点的雌性近交系DA大鼠股骨头软骨,提取总RNA,用RT-qPCR方法分别在U6和let-7a两种内参体系下,检测miR-1、-25、-26a、-140、-146a、-150、-181a、-195、-223、-337等的表达,并与课题组前期获得的二代测序绝对定量结果进行比较,综合评价两种内参的稳定性。结果在D42样本中U6(P=0.045)、let-7a(P=0.021 5)的相对值出现了显著性差异;在两种内参体系中miR-26a、-140、-223、-337的表达趋势相同,miR-1、-146a差异无统计学意义,miR-25、-150、-181a、-195都出现了显著性差异(P<0.05)。综合二代测序绝对定量结果比较,let-7a稳定性优于U6。结论 let-7a稳定性优于U6,更适合做软骨miRNA定量的内参。
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关键词
软骨
内参
RT-QPCR
U6
Let-7a
microRNAs(miRNAs)
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职称材料
题名
U6和let-7a作为定量检测miRNAs的内参在大鼠软骨中稳定性的比较
1
作者
易林
郭华
郭东贤
闵自信
袁莹
赵益童
韩燕
钟楠楠
孙健
机构
西安交通大学医学部附属红会医院急诊科
西安交通大学
医学
部
基础
医学
院生物化学与分子生物学系
环境与疾病相关基因教育
部
重点实验室
出处
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期497-501,535,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81371986
81301598)
+2 种基金
中国博士后科学基金(No.2014T70928
2013M530427)
中央高校基本研究基金(No.xjj2015073)~~
文摘
目的比较U6和let-7a两种内参在RT-qPCR方法检测大鼠股骨头软骨样本microRNAs(miRNAs)的稳定性。方法取软骨生成过程的新生(D0)、断乳(D21)、性成熟(D42)3个时间节点的雌性近交系DA大鼠股骨头软骨,提取总RNA,用RT-qPCR方法分别在U6和let-7a两种内参体系下,检测miR-1、-25、-26a、-140、-146a、-150、-181a、-195、-223、-337等的表达,并与课题组前期获得的二代测序绝对定量结果进行比较,综合评价两种内参的稳定性。结果在D42样本中U6(P=0.045)、let-7a(P=0.021 5)的相对值出现了显著性差异;在两种内参体系中miR-26a、-140、-223、-337的表达趋势相同,miR-1、-146a差异无统计学意义,miR-25、-150、-181a、-195都出现了显著性差异(P<0.05)。综合二代测序绝对定量结果比较,let-7a稳定性优于U6。结论 let-7a稳定性优于U6,更适合做软骨miRNA定量的内参。
关键词
软骨
内参
RT-QPCR
U6
Let-7a
microRNAs(miRNAs)
Keywords
cartilage
internal reference
RT-qPCR
U6
Let-7a
microRNAs (miRNAs)
分类号
R393 [医药卫生—基础医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
U6和let-7a作为定量检测miRNAs的内参在大鼠软骨中稳定性的比较
易林
郭华
郭东贤
闵自信
袁莹
赵益童
韩燕
钟楠楠
孙健
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
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