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基于序列模式挖掘的基因剪接位点
被引量：
1
1
作者
孙永山
赵海峰
+3 位作者
汤振宇
李旦
马猛
陈荣
《数据采集与处理》
CSCD
北大核心
2016年第5期1010-1019,共10页
剪接是基因表达过程中连接转录和翻译的中枢步骤,是一个高度调控的过程。剪接位点是基因剪接过程中的核心调控元件。本文通过挖掘剪接位点序列中蕴含的序列特征,提出了一个基于序列模式挖掘的基因剪接位点序列打分模型。通过该模型,实...
剪接是基因表达过程中连接转录和翻译的中枢步骤,是一个高度调控的过程。剪接位点是基因剪接过程中的核心调控元件。本文通过挖掘剪接位点序列中蕴含的序列特征,提出了一个基于序列模式挖掘的基因剪接位点序列打分模型。通过该模型,实现对剪接位点序列信号强度的定量度量。实验结果表明,该模型可有效分类真假剪接位点序列,分类效果优于最大信息熵模型,模型具有良好的鲁棒性,并且可有效识别致病剪接位点序列突变。
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关键词
剪接位点
序列模式
最大信息熵模型
致病突变
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职称材料
题名
基于序列模式挖掘的基因剪接位点
被引量：
1
1
作者
孙永山
赵海峰
汤振宇
李旦
马猛
陈荣
机构
安徽大
学
计算机科
学
技术
学院
西奈山伊坎医学院遗传学与基因组学系
出处
《数据采集与处理》
CSCD
北大核心
2016年第5期1010-1019,共10页
基金
国家自然科学基金(61300057
81000321)资助项目
+6 种基金
安徽省自然科学基金(1208085QF120
1408085QF120
1408085MKL94)资助项目
国家高技术研究发展计划("八六三"计划)子项目(2014AA015104)资助项目
安徽省教育厅重点(KJ2016A040)资助项目
教育部留学回国启动资金(教外司留【2014】1685)资助项目
2013年安徽省留学人员择优资助项目
文摘
剪接是基因表达过程中连接转录和翻译的中枢步骤,是一个高度调控的过程。剪接位点是基因剪接过程中的核心调控元件。本文通过挖掘剪接位点序列中蕴含的序列特征,提出了一个基于序列模式挖掘的基因剪接位点序列打分模型。通过该模型,实现对剪接位点序列信号强度的定量度量。实验结果表明,该模型可有效分类真假剪接位点序列,分类效果优于最大信息熵模型,模型具有良好的鲁棒性,并且可有效识别致病剪接位点序列突变。
关键词
剪接位点
序列模式
最大信息熵模型
致病突变
Keywords
splice sites
sequential pattern
maximum entropy model
pathogenic mutation
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于序列模式挖掘的基因剪接位点
孙永山
赵海峰
汤振宇
李旦
马猛
陈荣
《数据采集与处理》
CSCD
北大核心
2016
1
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