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梁山慈竹体细胞突变体特性及分子水平变化 被引量:5
1
作者 周振华 胡尚连 +3 位作者 徐刚 曹颖 卢学琴 龙治坚 《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2015年第1期67-73,共7页
以同期生长的梁山慈竹体细胞突变体No.29植株和实生植株(对照)为材料,对其茎秆化学成分和光合生理相关指标进行测定,并基于RNA高通量转录组测序结果,对No.29植株的纤维素、木质素等合成有关的基因差异表达进行分析。结果表明,与实生植... 以同期生长的梁山慈竹体细胞突变体No.29植株和实生植株(对照)为材料,对其茎秆化学成分和光合生理相关指标进行测定,并基于RNA高通量转录组测序结果,对No.29植株的纤维素、木质素等合成有关的基因差异表达进行分析。结果表明,与实生植株相比,No.29植株具有较高的株高、胸径、茎秆的鲜重和干重以及纤维素含量、纤维长度和宽度;纤维素含量比实生植株高12.89%;外方和内方纤维股明显增大;灰分含量、卷曲指数和扭结指数明显降低;但发笋量、木质素含量和细小纤维含量没有明显差异。No.29植株中的Ces A、Su Sy、UDPase基因分别比实生植株上调了117%、205%、115%,转录因子MYB基因表达上调了214%,驱动蛋白基因表达上调了10倍,动力蛋白基因表达上调了760%。No.29植株纤维素含量与纤维形态上明显的改变有其遗传基础,为No.29的进一步研究与利用奠定了基础。 展开更多
关键词 梁山慈竹 体细胞突变体 木质素 纤维素 基因表达分析
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梁山慈竹体细胞突变体No.30的SLAF-seq特异分子标记分析 被引量:3
2
作者 王懋林 胡尚连 +4 位作者 曹颍 卢学琴 徐刚 黄艳 龙志坚 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期596-602,共7页
梁山慈竹体细胞突变体No.30具有纤维素含量高、木质素含量高、纤维细胞长度长、纤维细胞长宽比大等特点,但由于梁山慈竹主要进行无性繁殖,不易获得纯合植株,突变体No.30的分子水平鉴定一直无法进行,严重阻碍了该突变体的推广利用。对梁... 梁山慈竹体细胞突变体No.30具有纤维素含量高、木质素含量高、纤维细胞长度长、纤维细胞长宽比大等特点,但由于梁山慈竹主要进行无性繁殖,不易获得纯合植株,突变体No.30的分子水平鉴定一直无法进行,严重阻碍了该突变体的推广利用。对梁山慈竹体细胞突变体No.30进行特异分子标记分析,并初步确定其性状变异来源。本研究利用SLAF-seq技术分别对突变体No.30以及同地区野生型梁山慈竹群体(CK)的基因组进行了简化基因组测序。经过了测序、建库、多态位点开发、特异多态性位点筛选等过程,最后对特异多态性位点筛选结果进行注释分析。结果发现突变体No.30的GC含量、纯合InDel数低于野生型梁山慈竹,而检测到的InDel总数以及杂合InDel数却高于野生群体。对SLAF-seq得到的InDel、SNP位点进行特异性筛选,获得了突变体No.30中稳定存在的特异InDel/SNP标签,包括特异C-T转换9381个、特异A-G转换9472个、特异InDel 329个。通过对这些特异SLAF标签进行注释,发现有6个特异SNP标签和1个特异InDel与纤维素合成相关,3个特异SNP标签与木质素合成相关,以及4个特异SNP标签和1个特异InDel与纤维细胞形态建成有关。这些结果表明突变体No.30在体细胞培养的过程中在基因组水平上发生了突变,并初步确定了其性状变异来源。但这些特异SLAF标签与突变体No.30在纤维素含量和木质素含量,以及纤维细胞发育等性状方面的相关性仍需进一步验证。 展开更多
关键词 克隆植物 突变体鉴定 梁山慈竹 体细胞无性系 SLAF-seq
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2个慈竹NAC转录因子的克隆与组织表达分析
3
作者 李会萍 黎帮勇 +1 位作者 胡尚连 曹颖 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期895-901,共7页
以慈竹转录组数据为基础,结合毛竹基因组数据,采用同源克隆技术从慈竹中克隆到两个NAC基因Be NAC1(Gen Bank注册号:KU550706)和Be NAC2(Gen Bank注册号:KU821586),分别编码313和389个氨基酸残基。蛋白功能域预测和保守结构域多重对比分... 以慈竹转录组数据为基础,结合毛竹基因组数据,采用同源克隆技术从慈竹中克隆到两个NAC基因Be NAC1(Gen Bank注册号:KU550706)和Be NAC2(Gen Bank注册号:KU821586),分别编码313和389个氨基酸残基。蛋白功能域预测和保守结构域多重对比分析表明,Be NAC1和Be NAC2基因均含有NAM保守域,其模拟的蛋白质三维结构与已知晶体结构的水稻模型蛋白高度相似。亚细胞定位预测分析显示,Be NAC1主要集中在细胞质中;Be NAC2则主要集中在细胞核中。表达分析表明,Be NAC1和Be NAC2具有相似的组织特异性表达,在茎中表达量均明显高于笋和叶片,且Be NAC1在除笋之外各组织中的表达量均显著高于Be NAC2。 展开更多
关键词 慈竹 NAC转录因子 克隆 生物信息学分析 组织表达模式
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毛竹bZIP转录因子的基因结构与进化分析 被引量:6
4
作者 张庆波 胡尚连 +3 位作者 徐刚 曹颖 卢学琴 龙治坚 《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2016年第1期54-61,共8页
以毛竹基因组数据库中的107个编码b ZIP转录因子的基因为材料,对其进行系统发育分析,筛选得到了A、D和S亚族的b ZIP家族成员,并对其基因结构、适应性进化、与水稻基因对之间的进化分歧时间及蛋白质同源建模等进行生物信息学分析。结果表... 以毛竹基因组数据库中的107个编码b ZIP转录因子的基因为材料,对其进行系统发育分析,筛选得到了A、D和S亚族的b ZIP家族成员,并对其基因结构、适应性进化、与水稻基因对之间的进化分歧时间及蛋白质同源建模等进行生物信息学分析。结果表明,毛竹A、D和S亚族共有47个b ZIP家族成员,其中A亚族18个,D亚族16个,S亚族13个。基因结构分析表明,3个亚族中内含子数量为0-16个,而且D亚族基因的内含子—外显子组成比A亚族和S亚族更为复杂。适应性进化分析表明,3个亚族总体上处于净化选择压力之下;A、D和S亚族的平均进化分歧时间分别为279.0,265.6和202.9 Mya;47个毛竹b ZIP蛋白质主要以α-螺旋为主,且D亚族的三级结构比A和S亚族复杂。 展开更多
关键词 毛竹 bZIP转录因子 生物信息学分析
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基于慈竹转录组MYB基因的克隆及胁迫诱导表达 被引量:4
5
作者 杨传凤 曹颖 +3 位作者 胡尚连 徐刚 黄艳 龙治坚 《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2015年第1期60-66,共7页
从慈竹笋转录组数据库中克隆出2个MYB基因(Be MYB1、Be MYB2)进行生物信息学分析,探讨其响应脱落酸(ABA)、Na Cl、聚乙二醇6000(PEG 6000)胁迫的机制。结果表明,Be MYB1与Be MYB2基因分别编码632个和338个氨基酸;Be MYB1蛋白属于MYB相... 从慈竹笋转录组数据库中克隆出2个MYB基因(Be MYB1、Be MYB2)进行生物信息学分析,探讨其响应脱落酸(ABA)、Na Cl、聚乙二醇6000(PEG 6000)胁迫的机制。结果表明,Be MYB1与Be MYB2基因分别编码632个和338个氨基酸;Be MYB1蛋白属于MYB相关蛋白,与小麦Ta MYB48蛋白聚为一枝,具有2个序列模体(motif);Be MYB2蛋白属于R2R3-MYB蛋白,与毛竹Pe MYB2蛋白、水稻Os MYB18蛋白聚为一枝,具有3个motif。Be MYB1和Be MYB2基因均响应了ABA、Na Cl和PEG 6000,但Be MYB2基因对胁迫的响应能力更强,Be MYB1和Be MYB2基因在响应非生物胁迫时发挥重要作用。 展开更多
关键词 慈竹 MYB基因 克隆 生物信息学分析 诱导表达
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梁山慈竹高通量转录组测序及差异表达基因分析 被引量:9
6
作者 王身昌 胡尚连 +1 位作者 曹颖 徐刚 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第3期65-71,共7页
分析梁山慈竹及其体细胞突变体的转录组,挖掘功能基因并对其差异表达基因进行筛选和分析,为梁山慈竹遗传改良提供理论依据。利用RNA-Seq技术进行转录组测序,对测序结果进行de novo拼接和功能注释;并对差异表达基因进行筛选及COG、GO、K... 分析梁山慈竹及其体细胞突变体的转录组,挖掘功能基因并对其差异表达基因进行筛选和分析,为梁山慈竹遗传改良提供理论依据。利用RNA-Seq技术进行转录组测序,对测序结果进行de novo拼接和功能注释;并对差异表达基因进行筛选及COG、GO、KEGG数据库中进行比对注释,此外,基于Swiss-Prot功能注释结果,分析纤维素和木质素相关功能基因的表达量差异。测序结果表明,共获得86 575 631条reads,de novo组装得到84 741条unigenes,共有49 829条被Nr、COG、GO、KEGG、Swiss-Prot注释。从梁山慈竹实生植株(对照)和体细胞突变体No.30这2个测序样本中,筛选出3 572条差异表达unigenes,757条差异表达unigenes在COG分类体系中具有详细的蛋白功能释义,2 213条差异表达unigenes在GO数据库具有功能定义,385条unigenes被注释到94条KEGG Pathways中。纤维素合成相关纤维素合酶、过氧化物酶、泛素连接酶和热休克蛋白在梁山慈竹体细胞突变体No.30中表达量升高,木质素合成相关MYB4、4-香豆酸CoA连接酶、肉桂醇脱氢酶、肉桂酰-CoA还原酶和漆酶在突变体中表达量降低。提供了全面的梁山慈竹转录组信息,获得了一批在梁山慈竹纤维素和木质素生物合成过程中有重要功能的基因序列。 展开更多
关键词 梁山慈竹 体细胞突变体 转录组 差异表达基因
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青杨4CL基因的克隆及生物信息学分析 被引量:2
7
作者 姜勇 胡尚连 +4 位作者 曹颖 卢学琴 徐刚 龙治坚 黄艳 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第7期1547-1553,共7页
4CL是木质素合成途径中的关键酶,对其进行生物信息学分析,为深入研究4CL的作用奠定基础并为进一步改良青杨提供理论支撑。以青杨嫩茎为试材,采用RT—PCR方法克隆膏杨4CL基因,使用NCBI、DNAMAN及ExPASy等一系列在线软件及工具,对青... 4CL是木质素合成途径中的关键酶,对其进行生物信息学分析,为深入研究4CL的作用奠定基础并为进一步改良青杨提供理论支撑。以青杨嫩茎为试材,采用RT—PCR方法克隆膏杨4CL基因,使用NCBI、DNAMAN及ExPASy等一系列在线软件及工具,对青杨4CL基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。克隆了青杨4CL基因,命名为Pe4CL(GenBank注册号:KJ490636)。该基因全长1623bp,开放阅读框为1—1611bp,编码536个氨基酸,含有4CL的保守域SSGTTGLPKGV和GEICIRG及催化活性残基His-234。Pe4CL与PtCACL同源性最高达97.95%。 展开更多
关键词 青杨 4CL基因 克隆 生物信息学分析
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3种盐胁迫对玉米幼苗生长及叶片抗氧化酶和离子累积的影响 被引量:6
8
作者 Shabeer Ahmed 沈彦合 +5 位作者 马文豪 董江波 屈芯宇 曹颖 胡尚连 罗学刚 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2020年第3期112-117,共6页
选取2个玉米品种(金玉819和金单999),探讨了3种盐胁迫(NaCl、Na2SO4和NaNO3)对玉米幼苗生长、抗氧化酶活性以及叶片中K^+、Na^+、Ca^2+累积的影响。结果表明:3种不同类型的盐胁迫均会导致玉米幼苗鲜重下降,地上部鲜重金玉819下降超过28.... 选取2个玉米品种(金玉819和金单999),探讨了3种盐胁迫(NaCl、Na2SO4和NaNO3)对玉米幼苗生长、抗氧化酶活性以及叶片中K^+、Na^+、Ca^2+累积的影响。结果表明:3种不同类型的盐胁迫均会导致玉米幼苗鲜重下降,地上部鲜重金玉819下降超过28.6%,金单999下降超过18%;盐胁迫下金玉819叶片SOD酶活上升2.1倍以上,POD酶活性最高上升4.5倍,APX最高上升2.1倍,CAT最高上升2.2倍;金单999叶片SOD酶活最高上升2.1倍,APX最高上升1.6倍,CAT最高上升1.9倍。2个基因型玉米胁迫下叶片内Na^+含量上升4.5~6.3倍;NaCl和NaNO3处理下,K^+/Na^+比对照降低90%~93%,而Na2SO4处理下K^+/Na^+下降78%~82%,金玉819和金单999的Ca^2+/Na^+比对照分别降低了85%~90%和92%~94%。综合分析表明NO-3引起的次生盐害对玉米生产危害较大。与金单999相比,金玉819对盐胁迫更加敏感,相同Na^+浓度处理下,金玉819的鲜重和SOD酶活性下降显著且拥有较低的K^+/Na^+和Ca^2+/Na^+值。 展开更多
关键词 盐胁迫 玉米幼苗 离子累积 抗氧化酶活性
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梁山慈竹UGP基因克隆与生物信息学分析
9
作者 廖倩 黄艳 +3 位作者 胡尚连 曹颖 卢学琴 徐刚 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第3期498-502,共5页
以梁山慈竹笋为材料,采用RT-PCR方法克隆梁山慈竹UGP基因,对梁山慈竹UGP基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。获得1个梁山慈竹UGP基因,命名为Df UGP(Genebank:KJ525752)。测序结果显示该序列全长1561 ... 以梁山慈竹笋为材料,采用RT-PCR方法克隆梁山慈竹UGP基因,对梁山慈竹UGP基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。获得1个梁山慈竹UGP基因,命名为Df UGP(Genebank:KJ525752)。测序结果显示该序列全长1561 bp,包含一个完整的ORF框,长度为1422 bp,编码473个氨基酸。梁山慈竹UGP基因与巨龙竹、绿竹、水稻、大麦、玉米、甘蔗的具有高度的同源相似性,编码的蛋白结构较为相似,均含有N端区域、中心区域和C端区域,且蛋白三级结构中都具有NBloop环和l-loop环。Df UGP具有N端的UDPGP功能域,其位于第90-379氨基酸,证明Df UGP属于尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因家族。 展开更多
关键词 梁山慈竹 UGP 克隆 生物信息学
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梁山慈竹DfMYB3基因克隆及启动子分析 被引量:5
10
作者 杜恬恬 李会萍 +4 位作者 王博雅 欧倩 黄艳 曹颖 胡尚连 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期729-737,共9页
基于梁山慈竹转录组数据库,以梁山慈竹叶片为材料,克隆得到一个MYB转录因子,命名为DfMYB3,其开放阅读框长度为1287 bp,编码428个氨基酸,GenBank注册号为KY963358。保守结构域分析显示,DfMYB3有典型的SANT结构域,具有DNA-Binding结构域... 基于梁山慈竹转录组数据库,以梁山慈竹叶片为材料,克隆得到一个MYB转录因子,命名为DfMYB3,其开放阅读框长度为1287 bp,编码428个氨基酸,GenBank注册号为KY963358。保守结构域分析显示,DfMYB3有典型的SANT结构域,具有DNA-Binding结构域。系统进化树分析发现,DfMYB3与甘蔗、拟南芥、毛白杨等物种的R2R3-MYB转录因子聚集在一枝上。亚细胞定位结果显示,DfMYB3蛋白在细胞核以及细胞膜中均有表达,在细胞核上更为显著。通过染色体步移法克隆得到DfMYB3基因5′侧翼2000 bp左右的序列。PlantCARE在线软件分析表明,该序列具有典型的启动子特征,并含有GA、ABA、MeJA等激素以及干旱等胁迫响应元件。100μmol·L^(-1)GA、100μmol·L^(-1)ABA处理梁山慈竹后,显著上调了DfMYB3基因的表达,表明DfMYB3基因能对GA及ABA处理产生应答。为探究DfMYB3启动子的功能,构建了DfMYB3启动子融合GUS基因的表达载体,并遗传转化烟草。在转基因烟草叶片及茎杆中都检测到了GUS信号,在叶脉处最为显著。 展开更多
关键词 梁山慈竹 MYB转录因子 启动子 GA、ABA处理 GUS染色
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不同维生素浸种对玉米幼苗受钠盐胁迫后根冠比和多胺代谢的影响 被引量:5
11
作者 沈彦合 胡尚连 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第11期2514-2519,共6页
【目的】探究不同维生素浸种后,盐胁迫对2种耐盐程度不同的玉米幼苗根冠比和多胺代谢途径相关酶活的影响。【方法】以杂交玉米品种金玉819(耐盐)和金单999(盐敏感)为材料,分别以100 mmol/L的V_(B1)和V_(B6)浸种24 h,然后将玉米种子在1/... 【目的】探究不同维生素浸种后,盐胁迫对2种耐盐程度不同的玉米幼苗根冠比和多胺代谢途径相关酶活的影响。【方法】以杂交玉米品种金玉819(耐盐)和金单999(盐敏感)为材料,分别以100 mmol/L的V_(B1)和V_(B6)浸种24 h,然后将玉米种子在1/2霍格兰营养液中进行萌发,7 d后将幼苗移植到含100 mmol/L Na_(2)SO_(4)/NaCl的1/2霍格兰营养液中胁迫处理10 d。通过测定玉米幼苗的根冠比和多胺代谢系统相关指标,探究不同VB浸种、不同类型钠盐胁迫对玉米幼苗根冠比和多胺代谢的影响。【结果】对金玉819而言,V_(B1)和V_(B6)浸种后不同钠盐处理间玉米幼苗根冠比的差异不明显,但NaCl比Na_(2)SO_(4)对根系伤害大;在Na_(2)SO_(4)胁迫下,V_(B6)浸种后的玉米叶片乙烯含量显著低于V_(B1)浸种的处理;同一VB处理条件下,NaCl和Na_(2)SO_(4)处理间的玉米叶片乙烯含量无明显差异,但Na_(2)SO_(4)处理H_(2)O_(2)的含量比NaCl处理的高。对金单999而言,在Na_(2)SO_(4)胁迫下,V_(B1)处理的根冠比明显高于V_(B6)处理,而在NaCl胁迫下,V_(B6)处理的根冠比明显高于V_(B1)处理;不同VB浸种,不同钠盐处理间玉米叶片乙烯含量无明显差异;V_(B1)处理下,NaCl处理的玉米的H_(2)O_(2)含量显著高于Na_(2)SO_(4)处理。V_(B1)较V_(B6)更能提高钠盐胁迫下2种玉米的精氨酸脱羧酶(ADC)活性。V_(B1)和V_(B6)浸种分别使2种玉米在Na_(2)SO_(4)和NaCl胁迫下的二胺氧化酶(DAO)活性提高。V_(B6)较V_(B1)更显著提高盐胁迫下2种玉米的多胺氧化酶(PAO)活性。V_(B6)较V_(B1)更能降低盐胁迫下2种玉米幼苗的H_(2)O_(2)含量,减缓盐对玉米幼苗的胁迫作用。【结论】用V_(B1)和V_(B6)浸种后,盐胁迫敏感性不同的玉米杂交品种幼苗的根冠比以及多胺代谢途径中相关酶活性对NaCl和Na_(2)SO_(4)胁迫的响应不同。 展开更多
关键词 玉米 外源维生素 钠盐胁迫 根冠比 多胺代谢
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2个慈竹bZIP基因的克隆、生物信息学分析及其诱导表达 被引量:4
12
作者 龚道勇 胡尚连 +2 位作者 曹颖 卢学琴 张庆波 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期268-277,共10页
从慈竹笋转录组数据库中筛选并克隆出2个bZIP基因(BebZIP2和BebZIP6)进行生物信息学分析。分析结果表明,它们编码序列长度分别为504和720 bp,编码167个和239个氨基酸,BebZIP2和BebZIP6属于bZIP相关蛋白,与水稻OsbZIP52/RISBZ5蛋白聚在... 从慈竹笋转录组数据库中筛选并克隆出2个bZIP基因(BebZIP2和BebZIP6)进行生物信息学分析。分析结果表明,它们编码序列长度分别为504和720 bp,编码167个和239个氨基酸,BebZIP2和BebZIP6属于bZIP相关蛋白,与水稻OsbZIP52/RISBZ5蛋白聚在一枝。组织表达分析表明,这2个慈竹BebZIP基因在慈竹笋、茎、展开叶和未展开叶等部位均有表达,属于组成型表达,同一基因在不同组织中的表达量差异较大,表达量的大小为未展开叶>展开叶>茎>笋。对慈竹幼苗进行ABA、NaCl和PEG6000非生物胁迫处理,结果表明,BebZIP2和BebZIP6对盐、干旱和ABA胁迫均具有不同程度的响应。 展开更多
关键词 慈竹 bZIP转录因子 生物信息学分析 组织表达分析 非生物胁迫
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温度和水分对梁山慈竹生态化学计量学特征的影响 被引量:2
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作者 刘垚 韦廷舟 +3 位作者 龙治坚 徐刚 胡尚连 胡勇 《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期209-215,共7页
为探究梁山慈竹对温度和水分的响应模式,利用间歇式增温和不同浇水量处理梁山慈竹实生植株,研究其根、茎、叶干重,净光合速率以及C、N、P、S元素含量及比值。结果表明:增温处理组中,不同水分处理与增温对照组相比,梁山慈竹各器官干重、... 为探究梁山慈竹对温度和水分的响应模式,利用间歇式增温和不同浇水量处理梁山慈竹实生植株,研究其根、茎、叶干重,净光合速率以及C、N、P、S元素含量及比值。结果表明:增温处理组中,不同水分处理与增温对照组相比,梁山慈竹各器官干重、茎叶C/P显著上升(P<0.05),但根和茎的C/S和N/S极显著下降;不同水分处理下的植株各器官的干重要低于对照组,在150%的浇水量(HR)处理下,梁山慈竹叶C/N和C/P显著下降(P<0.05),根C/S和N/S极显著上升,而茎和叶的C/S和N/S极显著下降;增温与HR互作下,梁山慈竹的各器官干重上升、根C/P下降,茎叶C/P显著上升;而增温和不同水分及其交互作用下对叶片净光合速率无显著影响。研究表明,梁山慈竹能通过调节自身元素生态化学计量学比值以应对变化的环境,在增温、HR及其二者互作下,梁山慈竹的生长未受到N或P的限制,但对S元素的需求增加。 展开更多
关键词 生态化学计量学 增温 不同水分 梁山慈竹
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慈竹BeSWEET4-2和BeSWEET1a-2基因的克隆和表达分析 被引量:2
14
作者 欧倩 王博雅 +3 位作者 杜恬恬 黄艳 曹颖 胡尚连 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1833-1839,共7页
糖外排转运蛋白(sugar will eventually be exported transporters,SWEET)在植物光合同化产物的运输中主要参与韧皮部糖的装载过程。该研究基于慈竹转录组库筛选出9条完整的BeSWEET序列,对其进行生物信息学分析,以慈竹茎和嫩叶的cDNA为... 糖外排转运蛋白(sugar will eventually be exported transporters,SWEET)在植物光合同化产物的运输中主要参与韧皮部糖的装载过程。该研究基于慈竹转录组库筛选出9条完整的BeSWEET序列,对其进行生物信息学分析,以慈竹茎和嫩叶的cDNA为模板对9条BeSWEET序列中的BeSWEET4-2和BeSWEET1a-2进行基因克隆,采用实时荧光定量(qRT-PCR)分析其在叶肉、叶脉、根、茎中的表达水平以及外源糖诱导下的表达变化。结果表明:(1)系统进化分析显示,9条BeSWEET序列被分为4大类群,其中BeSWEET4-2与水稻SWEET4近缘,聚类到CladeⅡ,具有2个MtN3保守结构域;BeSWEET1a-2与水稻SWEET1a和SWEET1b近缘,聚类到CladeⅠ。(2)序列分析显示,慈竹BeSWEET4-2和BeSWEET1a-2分别编码256个和222个氨基酸,分别具有7个和5个跨膜结构域。(3)亚细胞定位预测显示:慈竹BeSWEET4-2和BeSWEET1a-2均定位于质膜。(4)qRT-PCR结果显示,慈竹BeSWEET4-2和BeSWEET1a-2在叶肉、叶脉、根和茎中均有表达,分别在根和叶脉中最为显著,推测其可能协作参与了糖类从源到库的转运。(5)在外源己糖诱导下慈竹BeSWEET4-2和BeSWEET1a-2均显著上调表达,显示出对己糖的偏好性。该研究结果为进一步探讨慈竹BeSWEET蛋白调控糖转运的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 慈竹 BeSWEET 糖转运
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梁山慈竹BABY BOOM基因的克隆与表达分析 被引量:3
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作者 王丽丽 唐一 +2 位作者 黄艳 曹颖 胡尚连 《竹子学报》 2019年第2期24-31,共8页
以梁山慈竹Dendrocalamus farinosus转录组数据库为基础,采用同源克隆技术从梁山慈竹笋中克隆到1个BABY BOOM(BBM)基因,命名为Df BBM,其开放阅读框长度为1101 bp,推测编码366个氨基酸残基。蛋白功能域预测分析表明,Df BBM基因含有AP2结... 以梁山慈竹Dendrocalamus farinosus转录组数据库为基础,采用同源克隆技术从梁山慈竹笋中克隆到1个BABY BOOM(BBM)基因,命名为Df BBM,其开放阅读框长度为1101 bp,推测编码366个氨基酸残基。蛋白功能域预测分析表明,Df BBM基因含有AP2结构域,证明该基因确实属于AP2/ERF转录因子家族基因之一;进化树分析发现,Df BBM基因与玉米的BBM2以及山羊草和旱麦草的BBM基因在一个分支上,序列高度相似;保守结构域分析发现,Df BBM和Zm BBM2,Ae BBM1,Et BBM之间含有8个保守基序,这可能有助于研究Df BBM和其他物种BBM基因的相似功能。Df BBM的三级结构预测和乙烯反应性转录因子ERF096模型高度相似。组织表达分析表明,Df BBM基因在梁山慈竹展开叶和笋尖表达较高,Df BBM基因对ABA、IAA、NAA和Me JA激素处理均有响应,其中ABA、IAA和Me JA激素处理2 h后其表达量上升达到最高值,随后开始下降;而在NAA激素处理后其表达则明显下降。 展开更多
关键词 梁山慈竹 BBM基因 克隆 生物信息学 表达模式
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不同氮肥处理对慈竹笋生长发育的影响 被引量:3
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作者 谈佳瑞 陈宇鹏 +3 位作者 徐刚 任鹏 曹颖 胡尚连 《竹子学报》 2020年第1期79-85,共7页
研究浆用慈竹笋生长发育的适宜氮肥形态,对提高竹笋发笋量、生长量以及促进次生细胞壁的增厚和减少林田的氮污染具有重要意义,为慈竹的合理调控和优质栽培提供理论依据。研究设置4个处理,对照组(CK)仅施入磷肥和钾肥,T1施入酰胺态氮及... 研究浆用慈竹笋生长发育的适宜氮肥形态,对提高竹笋发笋量、生长量以及促进次生细胞壁的增厚和减少林田的氮污染具有重要意义,为慈竹的合理调控和优质栽培提供理论依据。研究设置4个处理,对照组(CK)仅施入磷肥和钾肥,T1施入酰胺态氮及磷肥和钾肥,T2施入硝态氮及磷肥和钾肥,T3施加铵态氮及磷肥和钾肥,研究不同形态氮肥对慈竹生长发育的影响。结果表明:不同形态氮肥处理的竹笋发笋量的动态变化都呈现出"S"型曲线。酰胺态氮处理的累计日均发笋量最高,是未施入氮肥处理的1.23倍,其次为硝态氮处理,是未施入氮肥处理的119%,铵态氮处理最低。酰胺态氮肥处理竹笋的发笋量最多,而不施氮处理的最小。铵态氮肥处理的竹笋木质化要早于酰胺态氮和硝态氮处理。 展开更多
关键词 慈竹 不同形态氮肥 发笋量 竹笋基茎
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