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花生茎源茉莉炭疽菌的分离鉴定及生物学特性研究
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作者 郑芮 刘紫石 +7 位作者 张康友 颜勇 魏玲 泽仁翁姆 丁则德米 黄建钧 王利 魏勇 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期2206-2213,共8页
旨在探究首次从花生茎中分离出茉莉炭疽菌(Colletotrichum jasminigenum)的生物学特性。通过三点接种法,经马铃薯葡萄糖琼脂(potato dextrose agar, PDA)培养基分离培养,分别用乳酸酚棉蓝染色和扫描电镜观察其形态,提取分离真菌DNA,用PC... 旨在探究首次从花生茎中分离出茉莉炭疽菌(Colletotrichum jasminigenum)的生物学特性。通过三点接种法,经马铃薯葡萄糖琼脂(potato dextrose agar, PDA)培养基分离培养,分别用乳酸酚棉蓝染色和扫描电镜观察其形态,提取分离真菌DNA,用PCR方法扩增ITS区并测序,比对该基因同源性及遗传进化关系。将孢子悬液以5×10^(7) CFU·mL^(-1)剂量感染昆明小鼠,并观察小鼠的临床症状、血清生化指标和剖检病变。用K-B纸片法探究其耐药表型。结果显示,分离株分生孢子长29.6μm±0.87μm,呈月牙形;菌丝透明无性,有隔和分枝,无刚毛;附着孢呈棍棒状或者卵球形。PCR扩增得到该菌ITS区序列长度为586 bp,序列提交GenBank(OR472966)。根据形态学结合ITS区序列分析结果确定分离株为茉莉炭疽菌,命名为SLY01。用SLY01菌株攻毒小鼠14 d后导致血清碱性磷酸酶含量极显著升高(P<0.01),肝脏器指数显著下降(P<0.05),并从感染小鼠体内再次分离鉴定出茉莉炭疽菌。组织病理学结果显示,试验组小鼠肺泡壁水肿伴有大量淋巴细胞浸润;肝细胞出现大面积颗粒变性,肝小叶内见出血和肝细胞坏死;肾可见肾小管上皮发生颗粒变性。药敏试验显示,SLY01菌株对卡泊芬净和伏立康唑耐药,对两性霉素B敏感,对伊曲康唑中度敏感。本研究分离鉴定得到茉莉炭疽菌,感染小鼠主要损伤靶器官为肝、肺,并且对多种药物耐药。这为进一步研究茉莉炭疽菌的防治提供理论依据。 展开更多
关键词 茉莉炭疽菌 分离鉴定 致病性 耐药性
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舍饲养殖对麦洼牦牛瘤胃微生物宏基因组的影响 被引量:5
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作者 李娟 王利 +3 位作者 罗晓林 官久强 安添午 张翔飞 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期4185-4193,共9页
本试验旨在探讨舍饲养殖对牦牛生长性能和瘤胃微生物物种组成及相对丰度、微生物碳水化合物酶(CAZy)以及蛋白质代谢通路的影响。选取2~3岁的健康雄性麦洼牦牛10只,体重在150~180 kg,采用完全随机试验设计,将其分为舍饲组和放牧组,每组5... 本试验旨在探讨舍饲养殖对牦牛生长性能和瘤胃微生物物种组成及相对丰度、微生物碳水化合物酶(CAZy)以及蛋白质代谢通路的影响。选取2~3岁的健康雄性麦洼牦牛10只,体重在150~180 kg,采用完全随机试验设计,将其分为舍饲组和放牧组,每组5只,正试期为4个月。养殖结束后,每组5只牦牛进行屠宰,采集瘤胃液,提取DNA构建测序文库,采用宏基因组方法分析瘤胃微生物变化。结果表明:与放牧养殖相比,舍饲养殖显著增加了麦洼牦牛的平均增重和平均日增重(P<0.05)。瘤胃微生物基因预测共得到2065638个开放阅读框(ORFs),经去冗余后,共获得1571578个ORFs,其中完整基因数为333371个。与放牧养殖相比,舍饲组厚壁菌门、拟杆菌门、软壁菌门、浮霉菌门的相对丰度均增加(P>0.05),纤维杆菌门相对丰度显著下降(P<0.05);普雷沃氏菌属、梭菌属、拟杆菌属、丁酸弧菌属、假丁酸弧菌属、另枝菌属、产琥珀酸菌属相对丰度均增加(P>0.05),丝状杆菌属相对丰度显著下降(P<0.05)。与放牧养殖相比,舍饲组糖苷水解酶(GH)、糖基转移酶(GT)相对丰度增加(P>0.05),且舍饲养殖对GT相对丰度的上调和碳水化合物结合模块(CBM)相对丰度的下调影响最大。此外,舍饲养殖还增加了瘤胃微生物转录、辅酶转运和代谢等功能蛋白的相对丰度(P>0.05),增加了碳水化合物代谢、氨基酸代谢和核苷酸代谢通路蛋白的相对丰度(P>0.05)。综上所述,舍饲养殖显著增加了麦洼牦牛的体重,影响了牦牛瘤胃微生物的组成结构。 展开更多
关键词 瘤胃微生物 牦牛 宏基因组 舍饲养殖
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牦牛水通道蛋白AQP1和AQP3基因克隆及在不同组织中表达和定位 被引量:5
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作者 李娟 王利 +2 位作者 罗晓林 官久强 张翔飞 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期51-58,共8页
水通道蛋白(Aquaporin,AQP)广泛存在于生物体的各组织部位,影响着生物体水代谢的过程。为进一步研究水通道蛋白1(AQP1)和水通道蛋白3(AQP3)生物学功能,本文对牦牛(Bos grunniens)不同组织中AQP1和AQP3基因的表达与定位进行了研究。采用... 水通道蛋白(Aquaporin,AQP)广泛存在于生物体的各组织部位,影响着生物体水代谢的过程。为进一步研究水通道蛋白1(AQP1)和水通道蛋白3(AQP3)生物学功能,本文对牦牛(Bos grunniens)不同组织中AQP1和AQP3基因的表达与定位进行了研究。采用PCR方法扩增牦牛AQP1和AQP3基因,对其序列进行生物信息学分析,采用qPCR方法检测2个基因在牦牛不同种组织中的表达量,采用免疫组织化学的方法分析AQP1和AQP3蛋白在组织中的定位和表达。结果表明,牦牛AQP1和AQP3基因CDS区分别为816 bp和840 bp,与野牦牛的同源性最高为99%。AQP1和AQP3基因的表达量在肾脏中最高,显著高于心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肌肉、小肠和瘤胃,AQP1基因在各组织中的表达均高于AQP3基因的表达。AQP1和AQP3蛋白定位发现其主要分布于肾脏近曲小管、小肠固有层细胞和瘤胃颗粒层细胞中,均在肾脏中的表达量最高。AQP1蛋白在脾脏、小肠和肌肉组织中的表达极显著高于AQP3蛋白表达。该研究结果对高寒低氧环境中动物的研究具有借鉴意义,有助于牦牛AQP1和AQP3功能研究。 展开更多
关键词 牦牛 水通道蛋白1 水通道蛋白3 免疫组织化学
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牦牛AIF-1蛋白表达及对巨噬细胞炎性因子mRNA的影响
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作者 李娟 王利 +3 位作者 罗晓林 官久强 安添午 张翔飞 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1163-1166,共4页
旨在对牦牛同种移植炎症因子-1(allograft inflammatory factor-1,AIF-1)蛋白进行原核表达、纯化,并探讨其对巨噬细胞炎性因子的影响。采用q-PCR检测AIF-1基因在牦牛5种组织中的表达量,构建原核表达载体表达纯化AIF-1蛋白,q-PCR检测小... 旨在对牦牛同种移植炎症因子-1(allograft inflammatory factor-1,AIF-1)蛋白进行原核表达、纯化,并探讨其对巨噬细胞炎性因子的影响。采用q-PCR检测AIF-1基因在牦牛5种组织中的表达量,构建原核表达载体表达纯化AIF-1蛋白,q-PCR检测小鼠巨噬细胞4种炎性因子的表达量。结果表明,AIF-1基因在麦洼牦牛脾中表达水平最高,极显著高于其它组织(P<0.01)。表达并纯化出约29.47 ku的AIF-1重组蛋白,1.0、10.0、100.0μg·mL^-1 AIF-1蛋白均能促进小鼠巨噬细胞IL-1β、IL-6、TNF-α和iNOS的表达。这表明AIF-1在巨噬细胞免疫应答中发挥着一定作用,为深入研究牦牛AIF-1功能提供参考。 展开更多
关键词 同种移植炎症因子-1 原核表达 巨噬细胞 炎性因子
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牦牛AQP8基因克隆及其在各组织和肝脏不同生长阶段中的表达分析
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作者 李娟 王利 +1 位作者 罗晓林 官久强 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2021年第1期219-224,共6页
为鉴定牦牛水通道蛋白8(Aquaporin,AQP8)基因,并分析其在不同组织及不同生长阶段肝脏中的表达差异,探讨AQP8蛋白的表达分布差异。采用RT-PCR技术克隆牦牛AQP8基因的CDS序列并进行生物信息学分析,利用qRT-PCR技术检测AQP8在成年牦牛8种... 为鉴定牦牛水通道蛋白8(Aquaporin,AQP8)基因,并分析其在不同组织及不同生长阶段肝脏中的表达差异,探讨AQP8蛋白的表达分布差异。采用RT-PCR技术克隆牦牛AQP8基因的CDS序列并进行生物信息学分析,利用qRT-PCR技术检测AQP8在成年牦牛8种组织和不同年龄段肝脏中的表达水平,采用免疫组织化学方法分析AQP8蛋白在不同年龄肝脏中的分布和表达。结果表明,AQP8基因的开放阅读框为792 bp,编码263个氨基酸,系统进化树分析显示,麦洼牦牛与野牦牛的亲缘关系最近,蛋白具有AQPs特有的MIP稳定结构域。AQP8在成年牦牛肝脏中的mRNA相对表达量最高,且显著高于心脏、脾脏和肾脏等组织(P<0.05),幼年时期(15月)肝脏中的AQP8表达量显著高于胎儿时期(1 d)和成年时期(5岁)(P<0.05)。免疫组化结果表明,AQP8蛋白在幼年肝脏组织中的表达量最高(P<0.05)。研究结果为深入探究牦牛AQP8在生长过程中作用机制提供基础依据,对高寒低氧环境中动物的适应性机制研究具有借鉴意义。 展开更多
关键词 牦牛 水通道蛋白8 基因克隆 组织表达 肝脏
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不同断奶模式对犊牦牛生长发育、血清生化指标及抗氧化能力的影响 被引量:8
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作者 魏佳 柏琴 +9 位作者 罗晓林 官久强 安添午 赵洪文 谭武 李华德 谢荣清 沙泉 江明锋 张翔飞 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第9期3400-3410,共11页
【目的】本研究通过比较不同断奶模式对犊牦牛生长发育、血清生化指标及抗氧化能力的影响,以期探索科学的犊牦牛早期培育模式。【方法】选取体重相近、健康的新生犊牦牛24头,随机分为3个处理组,每组8头,公母各半。对照组(GF)犊牦牛出生... 【目的】本研究通过比较不同断奶模式对犊牦牛生长发育、血清生化指标及抗氧化能力的影响,以期探索科学的犊牦牛早期培育模式。【方法】选取体重相近、健康的新生犊牦牛24头,随机分为3个处理组,每组8头,公母各半。对照组(GF)犊牦牛出生后在天然牧场内随母放牧哺乳;早期断奶组(EW)犊牦牛随母放牧哺乳至15日龄时隔离母犊,逐渐过渡为饲喂代乳粉,提供开食料及天然牧草自由采食,至犊牦牛固体饲料采食量达到0.5 kg/d时停喂代乳粉,90日龄后停喂开食料转入天然牧场放牧饲养;早期断奶+益生菌组(EWP)断奶过程同EW组,并在代乳粉、开食料中添加复合益生菌(乳酸杆菌、芽孢杆菌、酵母菌,≥9.98×10^(11)CFU/g)。分别于犊牦牛30、60、90、150日龄时测定体重及体尺指标,于30、60、90日龄晨饲前采集犊牦牛颈静脉血,测定血清中生化指标、激素、免疫球蛋白水平及抗氧化能力指标。【结果】30日龄时,EW、EWP组犊牦牛体重、体尺,血清葡萄糖(GLU)、甘油三酯(TG)、胆固醇(CHO),生长激素(GH)、胰岛素样生长因子1(IGF-1),以及免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白G(IgG)水平均显著低于GF组(P<0.05),EW组皮质醇水平显著高于GF组(P<0.05);60~150日龄各组犊牦牛体重、体尺均无显著差异(P>0.05);60日龄时,EW、EWP组犊牦牛血清IGF-1以及谷胱甘肽过氧化物酶(GSH)含量均显著高于GF组(P<0.05);90日龄时EW、EWP组犊牦牛血清GLU、尿素氮(BUN)、IGF-1、甲状腺素(T_(4))及IgA水平均显著高于GF组(P<0.05),且EWP组血清TG、GH含量及过氧化氢酶(CAT)活性均显著高于GF组(P<0.05)。【结论】与随母放牧哺乳模式相比,两种早期断奶方式在断奶初期(30日龄)对犊牦牛均产生了一定负面影响,但在断奶后补饲代乳粉与开食料有利于改善犊牦牛后期的生长发育、营养代谢、机体免疫与抗氧化能力,且补充益生菌能够缓解犊牦牛的早期断奶应激,并对犊牦牛生长发育及抗氧化能力的提升有进一步促进作用。 展开更多
关键词 犊牦牛 断奶模式 生长发育 血清生化指标 抗氧化能力
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牦牛IGFBP4和IGFBP5基因的克隆及其在各组织和不同生长阶段肝中的差异表达分析 被引量:5
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作者 傅芳 王利 +1 位作者 罗晓林 官久强 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期1858-1868,共11页
旨在克隆牦牛胰岛素样生长因子结合蛋白4和5(insulin-like growth factor binding protein 4 and 5,IGFBP4 and IGFBP5)基因,并检测其在牦牛不同组织及不同生长阶段肝中的表达水平。本研究选取1日龄、15月龄和5岁龄健康雌性麦洼牦牛共9... 旨在克隆牦牛胰岛素样生长因子结合蛋白4和5(insulin-like growth factor binding protein 4 and 5,IGFBP4 and IGFBP5)基因,并检测其在牦牛不同组织及不同生长阶段肝中的表达水平。本研究选取1日龄、15月龄和5岁龄健康雌性麦洼牦牛共9头(每组各3头),体重分别约为(12.35±1.85)、(98.88±2.50)和(268.55±27.82)kg,采集5岁龄牦牛心、肝、脾、肺、肾、小肠组织及3个不同生长阶段牦牛肝组织。本试验克隆IGFBP4和IGFBP5基因,并对其序列进行生物信息学分析,采用qRT-PCR方法、Western blot技术与免疫组化技术检测其在5岁龄牦牛6种组织及1日龄、15月龄和5岁龄3个不同生长阶段肝中的表达差异。结果表明,获得牦牛IGFBP4和IGFBP5基因的CDS序列分别为777和816 bp,分别编码258和271个氨基酸,GenBank序列号分别为MT012934和MT003005。在同源性比较中,牦牛IGFBP4和IGFBP5序列均与黄牛的同源性最高,分别为99.6%、99.5%。组织表达谱分析显示,IGFBP4和IGFBP5基因均在5岁龄牦牛肝中表达量最高,与肾、心、小肠、脾、肺相比差异极显著(P<0.01),且6种组织中IGFBP4基因的表达量均极显著高于IGFBP5基因(P<0.01)。不同生长阶段肝中差异表达结果显示,随着年龄的增长,IGFBP4和IGFBP5的mRNA与蛋白水平在牦牛肝脏组织中的表达量均呈现上升趋势,即5岁龄>15月龄>1日龄,在5岁龄时表达量最高,与1日龄和15月龄均存在极显著差异(P<0.01),且IGFBP4的表达量极显著高于IGFBP5(P<0.01)。结果提示,IGFBP4和IGFBP5可能协同调控牦牛肝的生长发育,这为深入研究IGFBP4和IGFBP5在牦牛肝生长发育过程中的作用以及表达调控提供了一定的基础数据。 展开更多
关键词 IGFBP4 IGFBP5 牦牛 克隆与表达
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金堂黑山羊不同组织内参基因筛选与稳定性分析 被引量:5
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作者 张楠驰 李娟 +1 位作者 王利 魏勇 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1109-1115,共7页
为筛选检测金堂黑山羊不同组织转录水平的荧光定量PCR方法中的最佳内参基因,本实验首先利用荧光定量PCR(qPCR)检测16个候选基因在金堂黑山羊心、肝、脾、瘤胃、背最长肌和臀肌中的转录水平,并利用geNorm、NormFinder、BestKeeper程序分... 为筛选检测金堂黑山羊不同组织转录水平的荧光定量PCR方法中的最佳内参基因,本实验首先利用荧光定量PCR(qPCR)检测16个候选基因在金堂黑山羊心、肝、脾、瘤胃、背最长肌和臀肌中的转录水平,并利用geNorm、NormFinder、BestKeeper程序分析候选基因转录水平的稳定性。再以最佳内参基因组合、最佳内参基因和2个转录水平稳定性相对最差的候选基因作为内参基因,经qPCR检测黑山羊心、脾和臀肌中相容性复合体Ⅱ类基因(MHC class II DQ-beta 1 chain gene,DQB1)的转录水平,验证筛选基因的稳定性。结果显示,不同候选基因在不同组织中的转录水平稳定性存在一定的差异性。经geNorm、NormFinder、BestKeeper程序分析得出最稳定内参基因为PPIB和YWHAZ,相对最不稳定内参基因为18S rRNA、TOP2β和EIF3K。以最佳内参基因组合(PPIB和YWHAZ)、最佳内参基因(PPIB)和两个最不稳定基因(TOP2β和EIF3K)作为内参基因检测DQB1在黑山羊心、脾和臀肌中转录水平,前两者分别与后两者所得到的DQB1转录水平差异显著(p<0.05),验证了本实验所筛选内参基因的稳定性。本实验首次筛选出了金堂黑山羊最佳内参基因组合为PPIB和YWHAZ,为金堂黑山羊不同组织qPCR分析中的内参基因选择提供参考。 展开更多
关键词 金堂黑山羊 内参基因 荧光定量PCR
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羊源解淀粉芽孢杆菌fsznc-06对小鼠生长和免疫功能的影响 被引量:2
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作者 张楠驰 李娟 +1 位作者 王利 魏勇 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期2861-2868,共8页
本试验旨在探究羊源解淀粉芽孢杆菌fsznc-06对小鼠生长和免疫功能的影响。选取36只健康的小鼠,随机分为3组,每组3个重复,每个重复4只。低剂量组(JD1组)和高剂量组(JD2组)每2 d灌胃1次浓度分别为1×10^8和1×10^10CFU/mL的羊源... 本试验旨在探究羊源解淀粉芽孢杆菌fsznc-06对小鼠生长和免疫功能的影响。选取36只健康的小鼠,随机分为3组,每组3个重复,每个重复4只。低剂量组(JD1组)和高剂量组(JD2组)每2 d灌胃1次浓度分别为1×10^8和1×10^10CFU/mL的羊源解淀粉芽孢杆菌fsznc-06菌悬液,灌胃量为0. 3 mL/只;对照组(DZ组)每2 d灌胃1次0. 9%生理盐水,灌胃量为0.3 mL/只。试验期为28 d。测定各组小鼠生长性能、血清生化指标、生长和免疫相关基因表达量以及肠道菌群多样性。结果表明:1)与DZ组相比,JD1组第7、14、21和28天体增重显著或极显著提高(P<0.05或P<0.01),JD2组第7和14天体增重显著或极显著提高(P<0.05或P<0.01)。与DZ组相比,JD1组第1~7天、第8~14天、第15~21天和第22~28天料重比显著或极显著降低(P<0.05或P<0.01),JD2组第1~7天、第15~21天和第22~28天料重比显著或极显著降低(P<0.05或P<0.01)。2)与DZ组相比,JD1组心脏、小肠指数以及JD2组心脏、脾脏、胸腺、大肠指数显著或极显著提高(P <0. 05或P <0. 01), JD1组血清总超氧化物歧化酶(T-SOD)、碱性磷酸酶(AKP)活性以及JD2组血清AKP活性显著或极显著提高(P<0.05或P<0.01)。3)与DZ组相比,JD1组脾脏胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因表达量和JD2组脾脏IGF-1和干扰素α11(IFNα11)基因表达量显著或极显著提高(P<0.05或P<0.01),JD1组脾脏白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和JD2组IL-1β、白细胞介素-6(IL-6)、一氧化氮合酶(iNOS)和TNF-α基因表达量显著或极显著降低(P<0.05或P<0.01)。4)与DZ组相比,JD1和JD2组小鼠肠道菌群多样性和双歧杆菌属的相对丰度均明显提高,优势物种相对丰度也明显提高。由此可见,羊源解淀粉芽孢杆菌fsznc-06可促进小鼠生长,提高免疫功能,且JD2组效果相对更佳。 展开更多
关键词 解淀粉芽孢杆菌 小鼠 生长 免疫 肠道菌群
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羊源腐生葡萄球菌的鉴定及生物学特性分析 被引量:4
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作者 向益 王利 +1 位作者 魏勇 张桦 《动物医学进展》 北大核心 2021年第4期12-16,共5页
为鉴定羊源腐生葡萄球菌QJ-01菌株并探讨其生物学特性,进行常规生理生化试验、16 S rDNA基因序列分析、小鼠致病性试验、耐药基因检测以及药敏试验。结果显示,分离菌株QJ-01与腐生葡萄球菌生化特性基本一致,16 S rDNA基因扩增获得长度为... 为鉴定羊源腐生葡萄球菌QJ-01菌株并探讨其生物学特性,进行常规生理生化试验、16 S rDNA基因序列分析、小鼠致病性试验、耐药基因检测以及药敏试验。结果显示,分离菌株QJ-01与腐生葡萄球菌生化特性基本一致,16 S rDNA基因扩增获得长度为1465 bp的片段,与GenBank中腐生葡萄球菌的同源性高达99%,在系统进化树中与腐生葡萄球菌(NR041324)聚为一支,结合生理生化特性和16 S rDNA基因序列分析,鉴定该菌株为腐生葡萄球菌。该菌株对小鼠致病性较强,主要损伤肺、脾等脏器。检测出TEM、aac(6′)-Ⅰb、aac(3)-Ⅱa和Sul2共4种耐药基因;该菌株对头孢唑林、环丙沙星和复方新诺明等12种抗菌药物敏感,对青霉素、克林霉素和多黏菌素E等7种抗菌药物耐药。研究结果为进一步探究该菌的致病性及疫病的防治提供参考依据。 展开更多
关键词 腐生葡萄球菌 鉴定 病理组织学 药敏试验
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2株羊源芽孢杆菌的筛选及其对小鼠肠道生化指标和肠道菌群的影响 被引量:4
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作者 张楠驰 王利 魏勇 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期3374-3385,共12页
本试验旨在从川中黑山羊粪便中筛选具有广谱抑菌作用的菌株,并探究其对小鼠肠道生化指标和肠道菌群的影响。试验采用牛津杯法从粪便中筛选出具有广谱抑菌作用的菌株,分别命名为菌株fsznc-06和fsznc-09。选取60只健康的小鼠,随机分为5组... 本试验旨在从川中黑山羊粪便中筛选具有广谱抑菌作用的菌株,并探究其对小鼠肠道生化指标和肠道菌群的影响。试验采用牛津杯法从粪便中筛选出具有广谱抑菌作用的菌株,分别命名为菌株fsznc-06和fsznc-09。选取60只健康的小鼠,随机分为5组,每组3个重复,每个重复4只。JD1组和JD2组分别灌服1×10^8和1×10^10CFU/mL菌株fsznc-06,DX1组和DX2组分别灌服1×10^8和1×10^10CFU/mL菌株fsznc-09,对照组(DZ组)灌服0.9%氯化钠溶液。每2 d灌服1次,灌服量均为0.3 mL/只。饲养28 d后测定小肠组织总超氧化物歧化酶(T-SOD)、碱性磷酸酶(AKP)和溶菌酶(LZM)活性,并取小肠内容物进行微生物测序和多样性分析。结果表明:本试验筛选出2株具有广谱抑菌作用的菌株,经鉴定并分别命名为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)fsznc-06和短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)fsznc-09。与DZ组相比,JD1和DX1组小肠组织T-SOD、AKP和LZM活性显著或极显著提高(P<0.05或P<0.01),JD2组小肠组织T-SOD活性极显著提高(P<0.01),DX2组小肠组织AKP活性极显著提高(P<0.01)。各试验组小肠肠道菌群多样性均高于DZ组。各组优势物种分别为:JD1组,约氏乳杆菌(53.54%);JD2组,罗伊氏乳杆菌(44.56%);DX1组,约氏乳杆菌(45.21%);DX2组,约氏乳杆菌(41.38%);DZ组,约氏乳杆菌(44.51%)。JD1和JD2组肠道菌群主要提高了遗传信息处理方面的功能,DX1和DX2组肠道菌群主要提高了环境信息处理、新陈代谢和生物体系统方面的功能。由此可见,解淀粉芽孢杆菌fsznc-06和短小芽孢杆菌fsznc-09能提高小鼠小肠组织T-SOD、AKP和LZM活性,增加小鼠肠道菌群多样性和有益菌群相对丰度。 展开更多
关键词 解淀粉芽孢杆菌 短小芽孢杆菌 小鼠 肠道菌群
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麦洼牦牛不同生长阶段肝脏差异表达基因分析 被引量:3
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作者 傅芳 王利 字向东 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期85-94,共10页
为探讨牦牛肝脏生长过程中基因的表达特征,采用Illumina高通量测序平台(HiSeqTM2500)对1日龄组(LD)、15月龄组(LM)和5岁龄组(LY)的健康麦洼牦牛肝脏进行转录组测序,并以qRT-PCR验证差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)... 为探讨牦牛肝脏生长过程中基因的表达特征,采用Illumina高通量测序平台(HiSeqTM2500)对1日龄组(LD)、15月龄组(LM)和5岁龄组(LY)的健康麦洼牦牛肝脏进行转录组测序,并以qRT-PCR验证差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的表达量。结果显示,LD组、LM组和LY组中分别有325个、85个和84个表达水平高于其他两组的显著差异表达基因(P<0.05)。在其富集的GO条目和KEGG通路中,分别包含102个、104个和134个显著差异GO条目及19个、13个和19个显著差异KEGG通路(P<0.05)。其中占比最多的GO条目为氧化还原相关过程、发育过程和代谢过程,占比最多的KEGG通路为磷脂酰肌醇3-激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase,PI3K-Akt)信号通路、粘着斑和细胞外基质(extracellular matrix,ECM)受体相互作用。qRT-PCR差异验证结果显示,CYP7B1、PGFS2、CYP1A1、UGT2C1-1、UGT2C1L、HSD11B1、CYP2C19、UGT2C1-2基因的表达量变化与转录组测序结果相符。综上表明,本研究为进一步探讨不同生长阶段牦牛肝脏发育提供了有力的实验数据,可为深入理解牦牛肝脏生长发育过程提供参考与借鉴。 展开更多
关键词 牦牛 生长阶段 肝脏 转录组
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牦牛皱胃全长转录组测序分析 被引量:3
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作者 谢书琼 马士龙 +2 位作者 唐娇 刘益丽 江明锋 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第5期1610-1620,共11页
【目的】获得牦牛(Bos grunniens)皱胃全长转录组数据库,深入挖掘牦牛皱胃功能基因。【方法】采用PacBio Sequel高通量测序系统,使用单分子实时(single molecular real time,SMRT)测序技术对成年牦牛皱胃全长转录组进行测序,对原始数据... 【目的】获得牦牛(Bos grunniens)皱胃全长转录组数据库,深入挖掘牦牛皱胃功能基因。【方法】采用PacBio Sequel高通量测序系统,使用单分子实时(single molecular real time,SMRT)测序技术对成年牦牛皱胃全长转录组进行测序,对原始数据进行质控和去冗余分析,再比对参考基因组获取过滤后的非重复序列(Unigenes),使用多种生物信息软件对牦牛皱胃全长转录本数据进行功能注释、转录因子注释、编码区预测、简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)分析及可变剪接分析。【结果】通过测序共获得14467420条子序列,平均子序列长度为3344.23 bp,质控得到循环一致性序列(CCS)有296840条,全长非嵌合(FLNC)序列有277402条,过滤和去冗余后对比参考基因组最终获得8556条Unigenes。通过与NR、Swiss-Prot、KEGG、KOG、eggNOG、GO和Pfam数据库比对,对Unigenes进行注释,其中NR数据库注释了8544条Unigenes;Swiss-Prot数据库注释了8475条Unigenes;KEGG数据库注释了1721条Unigenes;KOG数据库注释了6572条Unigenes;eggNOG数据库注释了8491条Unigenes;GO数据库注释了7725条Unigenes;Pfam数据库注释了8162条Unigenes。此外,经鉴定或预测,还获得了943个转录因子、8544个编码区片段、3596个SSR位点和1825个可变剪接事件。【结论】本研究获得了较为可靠的牦牛皱胃全长转录组数据,可为进一步研究牦牛皱胃生物学特性、相关代谢途径、信号通路及其分子机制提供数据支持。 展开更多
关键词 牦牛 皱胃 全长转录组 第3代测序 功能注释
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IFITM1基因克隆及其在不同生长阶段牦牛各组织中的表达分析 被引量:1
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作者 王海鹏 李娟 +2 位作者 王利 郑姚 张玲 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期139-144,190,共7页
为鉴定牦牛IFITM1基因并分析其在不同生长阶段牦牛5种组织中的转录水平和蛋白表达量。本研究采用根据普通牛IFITM1基因设计的引物,PCR扩增牦牛IFITM1基因并利用生物信息学软件分析其序列,结果显示,获得牦牛546 bp的IFITM1基因cDNA序列,... 为鉴定牦牛IFITM1基因并分析其在不同生长阶段牦牛5种组织中的转录水平和蛋白表达量。本研究采用根据普通牛IFITM1基因设计的引物,PCR扩增牦牛IFITM1基因并利用生物信息学软件分析其序列,结果显示,获得牦牛546 bp的IFITM1基因cDNA序列,其中编码(CDS)区为375 bp,编码124个氨基酸残基。牦牛IFITM1基因序列与普通牛的同源性最高,为98.7%。进一步采用荧光定量PCR检测IFITM1基因在不同生长阶段牦牛各组织中的转录水平,结果显示,IFITM1在1日龄、15月龄和5岁龄牦牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏中均有不同程度的转录水平,在肝脏中的转录水平均显著高于在脾脏、肺脏和肾脏中的转录水平(p<0.05),随着年龄的增长IFITM基因在牦牛肝脏中的转录水平呈现先上升后下降的趋势,15月龄相对于1日龄时的转录水平显著升高(p<0.01),随着年龄的增长IFITM1基因的转录水平在耗牛肺脏中呈现持续下降的趋势,而在脾脏和肾脏中呈现先下降后稳定的趋势,且5岁龄相对于1日龄时的转录水平均显著降低(p<0.01)。同时采用免疫组化技术检测IFITM1蛋白在牦牛肝脏中的定位及表达。结果显示,IFITM1蛋白在3个生长阶段牦牛的肝脏中均有表达并定位于细胞膜,且该蛋白表达量随着年龄的增长呈现先下降后上升的趋势。本研究为深入探究IFITM1蛋白的功能奠定基础。 展开更多
关键词 牦牛 IFITM1 基因克隆 组织表达 免疫组化
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枯草芽孢杆菌对氨氮应答的转录组及sRNA分析 被引量:2
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作者 郑姚 吴开年 +1 位作者 王利 魏勇 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2021年第2期147-154,共8页
为探索枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)脱氮的分子机制,筛选枯草芽孢杆菌对氨氮的分子生态学应答相关候选基因及small RNA(sRNA),本研究对处于富含氨氮环境和对照组的枯草芽孢杆菌R47进行原核链特异性转录组及sRNA分析,并采用Real-time... 为探索枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)脱氮的分子机制,筛选枯草芽孢杆菌对氨氮的分子生态学应答相关候选基因及small RNA(sRNA),本研究对处于富含氨氮环境和对照组的枯草芽孢杆菌R47进行原核链特异性转录组及sRNA分析,并采用Real-timePCR方法检测差异表达基因的相对表达量。结果显示,平均每个测序样本得到约1.40×10^(7)条reads。对照组与处理组DESeq2分析得到3918个差异表达基因,并富集在KEGG数据库中的176个信号通路,其中,包括8个与适应富含氨氮环境相关的信号通路(细菌双组分系统通路、精氨酸生物合成、嘌呤代谢等),同时发现,epsA、tasA、sinR、glnR、glnA、tnrA和ureABC基因可能参与枯草芽孢杆菌对氨氮的应答过程。经sRNA分析获得已注释的枯草芽孢杆菌sRNA 62条。对sRNA靶基因的分析结果显示,其有3960个对应的潜在靶基因,主要参与碳水化合物运输和新陈代谢、氨基酸转运和代谢、转录过程,其中,sRNA2073和sRNA2182对应的靶基因分别为sinR和tnrA。Real-time PCR结果显示,argH、codY、argG、glnA和glnR基因的相对表达量变化与转录组测序结果一致。本研究为进一步探究枯草芽孢杆菌污水脱氮的分子机理提供参考数据。 展开更多
关键词 枯草芽孢杆菌 氨氮应答 转录组 差异表达基因 sRNA分析
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牦牛IGFBP4对肝细胞增殖的调控及功能分析 被引量:1
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作者 傅芳 唐小凤 +2 位作者 王利 李键 官久强 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1409-1419,共11页
旨在探究牦牛胰岛素样生长因子结合蛋白4(Bos grunniens insulin-like growth factor binding protein 4,BgIGFBP4)在牦牛肝细胞增殖及小鼠生长中的作用。本研究构建了pET-28a-BgIGFBP4原核表达载体,对其进行表达、鉴定,用终浓度为0.002... 旨在探究牦牛胰岛素样生长因子结合蛋白4(Bos grunniens insulin-like growth factor binding protein 4,BgIGFBP4)在牦牛肝细胞增殖及小鼠生长中的作用。本研究构建了pET-28a-BgIGFBP4原核表达载体,对其进行表达、鉴定,用终浓度为0.002、0.02、0.2、2、20μg·mL^(-1)的BgIGFBP4蛋白处理肝细胞,采用CCK8法、细胞集落形成试验检测BgIGFBP4蛋白对肝细胞增殖能力的影响。再根据试验结果选取浓度蛋白处理肝细胞,检测24、48、72 h时肝细胞活性、肝细胞上清生长类激素和肝细胞PI3K-Akt信号通路的变化。选取30日龄((18±1)g)健康雄性KM小鼠,试验组每2 d灌喂100μL 50μg·mL^(-1) BgIGFBP4蛋白,对照组用等量0.9%的生理盐水进行灌喂,每组40只,共80只。试验前进行饥饿处理12 h,试验周期为28 d,在试验28 d时检测各项生长性能指标、血清生长类激素水平和肝PI3K-Akt信号通路的变化。结果显示,获得大小约28.86 ku的BgIGFBP4蛋白,并纯化鉴定得到该目的蛋白。2μg·mL^(-1) BgIGFBP4蛋白可促进牦牛肝细胞增殖及集落形成。与对照组相比,试验组(2μg·mL^(-1)BgIGFBP4蛋白处理)肝细胞上清GH、VEGF含量显著升高(P<0.05),肝细胞中PI3K-Akt信号通路细胞增殖相关基因ERBB2、IRS1、PIK3R1、AKT1、RAF1、MAPK3转录水平显著升高(P<0.05)。与对照组相比,试验组(100μL 50μg·mL^(-1) BgIGFBP4蛋白处理)小鼠平均日增重显著增加、料重比显著降低,肝、脾、肺、肾、小肠器官指数显著增加(P<0.05)。试验组小鼠血清GH、ISN、VEGF含量显著升高(P<0.05),小鼠肝中PI3K-Akt信号通路相关基因ERBB2、IRS1、PIK3R1、AKT1、RAF1、MAPK3的转录水平显著升高(P<0.05)。综上表明,BgIGFBP4可通过调控PI3K-Akt信号通路促进牦牛肝细胞增殖、并能促进小鼠生长。这为深入研究IGFBP4在牦牛肝生长发育过程中的作用提供了参考。 展开更多
关键词 IGFBP4 牦牛 肝细胞
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牦牛BNBD4组织分布及其蛋白特性的研究 被引量:1
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作者 郑姚 李娟 +1 位作者 王利 陈希文 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1045-1050,共6页
为探究牦牛中性粒细胞β防御素4(BNBD4)在牦牛组织中的分布情况以及BNBD4的蛋白特性,本研究采用RT-PCR技术扩增获得牦牛BNBD4基因序列,利用生物信息学软件预测其编码蛋白的结构与功能,结果显示,牦牛BNBD4基因开放阅读框为195 bp,编码64... 为探究牦牛中性粒细胞β防御素4(BNBD4)在牦牛组织中的分布情况以及BNBD4的蛋白特性,本研究采用RT-PCR技术扩增获得牦牛BNBD4基因序列,利用生物信息学软件预测其编码蛋白的结构与功能,结果显示,牦牛BNBD4基因开放阅读框为195 bp,编码64个氨基酸,其序列与黄牛和水牛的相似性分别为96.4%和87.7%,其在同属中具有高度的保守性。蛋白功能与结构预测结果显示,该蛋白属于分泌型阳离子β防御素,其可与病原体的磷脂膜结合,从而破坏病原体细胞膜的完整性。通过荧光定量PCR检测BNBD4在牦牛5种组织中的转录水平,结果显示该基因在牦牛肾脏的转录水平极显著高于心、肝、脾和肺(p<0.01),其次该基因在肝脏中的转录水平相对较高。构建重组表达质粒pET32a-BNBD4并诱导表达,对表达蛋白进行SDS-PAGE和western blot鉴定分析,结果显示,BNBD4重组蛋白在大肠杆菌中以包涵体形式表达,重组蛋白约为23 ku。进一步将pET32a-BNBD4/BL21(DE3)经IPTG诱导后于LB平板过夜培养,观察各组菌落数,分析BNBD4对E.coli BL21(DE3)的毒性作用,结果显示,重组蛋白BNBD4对宿主大肠杆菌的生长具有一定的抑制作用。本研究检测分析了牦牛BNBD4的组织分布,并首次原核表达了牦牛BNBD4蛋白,初步鉴定了其特性,为探究BNBD4基因在牦牛中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 BNBD4 牦牛 组织表达 原核表达
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微小根毛霉对小鼠的致病性研究 被引量:1
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作者 张桦 王利 +1 位作者 魏勇 向益 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期376-381,共6页
为探究微小根毛霉的致病性,本研究将微小根毛霉孢子悬液以6×107cfu/mL剂量感染昆明小鼠,观察小鼠临床症状和剖检病变,结果显示:感染小鼠出现精神萎靡、弓背、站立不稳等症状,死亡率为20%;剖检发现心肝脾肾肿大、肝脏表面有黄白色... 为探究微小根毛霉的致病性,本研究将微小根毛霉孢子悬液以6×107cfu/mL剂量感染昆明小鼠,观察小鼠临床症状和剖检病变,结果显示:感染小鼠出现精神萎靡、弓背、站立不稳等症状,死亡率为20%;剖检发现心肝脾肾肿大、肝脏表面有黄白色结节、肺脏多处出血灶。小鼠感染7 d后眼眶采血分离血清,检测血清生化指标,结果显示:感染小鼠血清中的谷草转氨酶(AST)和碱性磷酸酶(ALP)含量均显著升高(p<0.01),谷丙转氨酶(ALT)含量显著下降(p<0.01),总蛋白(TP)和球蛋白(GLB)含量显著升高(p<0.05),提示感染小鼠肝脏功能受到损伤;尿素(UREA)、尿酸(UA)和肌酐(CREA)含量均显著性增加(p<0.05),提示感染小鼠肾脏生理功能受到损伤。同时剖杀小鼠,制作各脏器的病理切片,光学显微镜下观察,结果显示:感染小鼠心肌中有霉菌侵入,心肌纤维变性;肝细胞肿胀、变性,汇管区有大量炎性细胞聚集;脾组织中可见菌丝和大量的孢子,中性粒细胞增多、淋巴细胞减少;肺泡膈充血、炎性细胞浸润,支气管上皮细胞脱落;肾组织发现少量菌丝,大量肾小管上皮细胞变性、脱落和坏死,肾小球萎缩;小肠组织发现霉菌孢子,黏膜固有层有淋巴细胞浸润。进一步利用透射电镜观察小鼠的肝脏和肾脏的超微组织病理学变化,结果显示:感染小鼠肝细胞肿胀,染色质稀少,线粒体增生、肿胀,胞浆电子密度降低;肾小管上皮细胞体积变小,胞核碎裂,线粒体高度肿胀,嵴断裂且模糊不清,胞浆多处空泡。采用TUNEL染色法染色感染小鼠肝肾组织后于荧光显微镜下观察,结果显示:实验组小鼠大量肝细胞和肾细胞均发生了凋亡。综上所述,微小根毛霉对小鼠具有一定的致病性。本研究首次为阐明微小根毛霉的致病机制提供系统的组织病理学资料。 展开更多
关键词 微小根毛霉 生化指标 病理组织学 透射电镜 TUNEL染色
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羊源尸毒梭菌三重PCR检测方法的建立及应用 被引量:1
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作者 豆朋朋 王利 魏勇 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1140-1144,共5页
为建立一种快速检测羊源尸毒梭菌的方法,本研究参考尸毒梭菌23S rRNA基因、高致病性毒力岛irp2基因和溶血素hlyA基因的特异序列,设计合成3对特异性引物,通过优化条件建立了检测羊源尸毒梭菌的三重PCR方法,并评估了其特异性、敏感性和重... 为建立一种快速检测羊源尸毒梭菌的方法,本研究参考尸毒梭菌23S rRNA基因、高致病性毒力岛irp2基因和溶血素hlyA基因的特异序列,设计合成3对特异性引物,通过优化条件建立了检测羊源尸毒梭菌的三重PCR方法,并评估了其特异性、敏感性和重复性。将尸毒梭菌人工感染小鼠,利用建立的三重PCR方法检测死亡小鼠各组织中的尸毒梭菌,并与16S rDNA PCR方法的检测结果相比较。结果显示,该三重PCR方法优化后的条件为:3对基因上、下游引物均为1μL终浓度均为10μmol/L,退火温度59℃。该方法仅对尸毒梭菌扩增出23S rRNA、irp2和hlyA 3个目的基因,而对蜡样芽孢杆菌、类志贺邻单胞菌、乳酸片球菌、藤黄微球菌、霍氏肠杆菌、阴沟肠杆菌、大肠杆菌、柠檬酸杆菌及枯草芽孢杆菌均未扩增出目的基因;对尸毒梭菌DNA的最低检出量为2.76×101拷贝/μL,敏感性较高;该方法对同一稀释度及不同稀释度尸毒梭菌DNA的重复性检测结果均一致,重复性较好。人工感染1.5×109 cfu/mL的尸毒梭菌的小鼠12 h全部死亡,对照组小鼠未出现发病和死亡,且经本研究建立的三重PCR方法检测结果显示,每只死亡小鼠的肝脏、肾脏和肠道样品均为阳性结果,而其心脏、脾脏、肺脏检测结果均为阴性,与16S rDNA PCR方法的阳性检测结果均一致。本实验建立的致病性羊源尸毒梭菌三重PCR检测法特异性强、敏感性高、重复性好,为致病性羊源尸毒梭菌的检测和其感染的防治提供了技术支持。 展开更多
关键词 尸毒梭菌 三重PCR 快速检测
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山羊IL-10蛋白在金黄色葡萄球菌感染免疫反应中调节机制的研究
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作者 郑姚 李娟 +1 位作者 王利 魏勇 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1167-1171,共5页
为探究金堂黑山羊白介素-10蛋白(IL-10)在金黄色葡萄球菌感染免疫反应中的调节机制,本研究构建了重组表达质粒pET32a-IL-10,经诱导后表达纯化获得山羊重组IL-10蛋白(rIL-10),SDS-PAGE和western blot鉴定结果显示,山羊IL-10在大肠杆菌中... 为探究金堂黑山羊白介素-10蛋白(IL-10)在金黄色葡萄球菌感染免疫反应中的调节机制,本研究构建了重组表达质粒pET32a-IL-10,经诱导后表达纯化获得山羊重组IL-10蛋白(rIL-10),SDS-PAGE和western blot鉴定结果显示,山羊IL-10在大肠杆菌中以包涵体形式表达,重组蛋白大小约为27 ku。每组5只通过金黄色葡萄球菌感染小鼠试验研究rIL-10的免疫调节作用,将15只SPF小鼠随机分为A、B和C组,A组为正常对照组,B和C组腹腔注射500μL金黄色葡萄球菌(1×10^8 cfu/mL),感染24 h后C组腹腔注射200μg/kg rIL-10,感染48 h后检测各组小鼠血清学指标和3种炎症因子在其6种组织中的转录水平,结果显示,B组小鼠血清丙二醛MDA含量极显著高于A和C组(p<0.01),总抗氧化能力T-AOC和谷胱甘肽过氧化物GSH-PX酶活性极显著低于A和C组(p<0.01);IL-1β基因转录水平在B组小鼠心、肝、肺和肾中极显著高于A组(p<0.01),在C组小鼠心、肝、脾和肺中低于B组(p<0.01),在脾和肾中低于A组(p<0.01);炎症因子IL-2在B组小鼠肝、脾、肺和小肠中的转录水平高于A组(p<0.05或p<0.01),在C组小鼠肝、脾、肺、肾和小肠中低于B组(p<0.05或p<0.01),在心、脾和肾中显著低于A组(p<0.05);TNF-α基因转录水平在B组小鼠的小肠中高于A组(p<0.05),在C组小鼠心、脾、肺和小肠中低于B组(p<0.05或p<0.01),在心、脾和肺中低于A组(p<0.05或p<0.01)。上述结果表明,山羊rIL-10通过调节血清MDA含量、T-AOC和GSH-PX活性,以及下调炎症因子基因转录水平,改善因金黄色葡萄球菌引起的小鼠免疫因子紊乱。本研究为深入探究山羊IL-10作用及机制提供科学依据。 展开更多
关键词 白介素-10 原核表达 金黄色葡萄球菌 炎症因子 山羊
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