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藏鸡不同发育阶段腿部肌肉组织转录组及microRNA联合分析
被引量：
13
1
作者
袁茂
江明锋
+5 位作者
徐亚欧
林亚秋
蒋小松
杨朝武
余春林
李志雄
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期2400-2412,共13页
旨在从转录组和miRNA角度探讨藏鸡肌肉发育的调控机制,了解藏鸡肌肉发育的特殊性。本研究对120和150日龄藏鸡的肌肉组织进行转录组和small RNA测序,筛选出两个日龄阶段差异表达的基因和miRNA,并利用qRT-PCR技术对测序结果进行验证。结果...
旨在从转录组和miRNA角度探讨藏鸡肌肉发育的调控机制,了解藏鸡肌肉发育的特殊性。本研究对120和150日龄藏鸡的肌肉组织进行转录组和small RNA测序,筛选出两个日龄阶段差异表达的基因和miRNA,并利用qRT-PCR技术对测序结果进行验证。结果,共筛选出1691个差异表达基因,其中上调基因330个,下调基因1361个。差异表达miRNA共有22个,其中9个上调,13个下调。随机选择的5个基因和miRNAs的qPCR验证结果表明表达趋势与测序结果一致。GO富集分析显示,在富集前10的条目中,与免疫相关的条目占较大比例。KEGG分析结果显示,在19个显著富集通路中,与免疫相关的通路占较大比例,且83个miRNA的靶基因出现在显著富集通路上。转录组和small RNA测序数据联合分析表明,343个miRNA-mRNA对为负相关调控模式。本研究从多组学层面为进一步理解藏鸡的肌肉发育提供了理论基础。
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关键词
藏鸡
肌肉发育
转录组
miRNA
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职称材料
题名
藏鸡不同发育阶段腿部肌肉组织转录组及microRNA联合分析
被引量：
13
1
作者
袁茂
江明锋
徐亚欧
林亚秋
蒋小松
杨朝武
余春林
李志雄
机构
西南民族大学生命科学与技术学院青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室
西南民族大学生命科学与技术学院青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室
四川省畜牧科学研究院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期2400-2412,共13页
基金
四川省“十三五”畜禽育种攻关项目(2016NYZ0043)
四川省应用基础项目(2016JY0068)
中央高校基本科研业务费专项资金项目(2018NQN10)
文摘
旨在从转录组和miRNA角度探讨藏鸡肌肉发育的调控机制,了解藏鸡肌肉发育的特殊性。本研究对120和150日龄藏鸡的肌肉组织进行转录组和small RNA测序,筛选出两个日龄阶段差异表达的基因和miRNA,并利用qRT-PCR技术对测序结果进行验证。结果,共筛选出1691个差异表达基因,其中上调基因330个,下调基因1361个。差异表达miRNA共有22个,其中9个上调,13个下调。随机选择的5个基因和miRNAs的qPCR验证结果表明表达趋势与测序结果一致。GO富集分析显示,在富集前10的条目中,与免疫相关的条目占较大比例。KEGG分析结果显示,在19个显著富集通路中,与免疫相关的通路占较大比例,且83个miRNA的靶基因出现在显著富集通路上。转录组和small RNA测序数据联合分析表明,343个miRNA-mRNA对为负相关调控模式。本研究从多组学层面为进一步理解藏鸡的肌肉发育提供了理论基础。
关键词
藏鸡
肌肉发育
转录组
miRNA
Keywords
Tibetan chicken
muscle development
transcriptome
miRNA
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
藏鸡不同发育阶段腿部肌肉组织转录组及microRNA联合分析
袁茂
江明锋
徐亚欧
林亚秋
蒋小松
杨朝武
余春林
李志雄
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
13
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