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干热河谷不同树龄攀枝花苏铁丛枝菌根真菌多样性研究 被引量:4
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作者 魏玉倩 陈健鑫 +3 位作者 郑艳玲 王芳 马焕成 伍建榕 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2022年第4期203-209,共7页
攀枝花苏铁是我国特有的古老残遗树种,为适应干热河谷气候,攀枝花苏铁与丛枝菌根真菌(arbuscular mycorrhizal fungi,AMF)建立特殊的共生体系。选用不同树龄的攀枝花苏铁为研究对象,采集攀枝花苏铁根系及根际土壤样品,采用醋酸墨水染色... 攀枝花苏铁是我国特有的古老残遗树种,为适应干热河谷气候,攀枝花苏铁与丛枝菌根真菌(arbuscular mycorrhizal fungi,AMF)建立特殊的共生体系。选用不同树龄的攀枝花苏铁为研究对象,采集攀枝花苏铁根系及根际土壤样品,采用醋酸墨水染色法观察根系的AMF定殖情况并计算定殖率;同时采用湿筛沉淀法对AMF孢子进行分离,通过形态学特征及分子生物学鉴定相结合的方法研究攀枝花苏铁AMF的种类、多样性及与树龄的关系。结果表明,14年生、8年生和3年生攀枝花苏铁根系AMF定殖率分别为36.13%、28.54%、21.10%;根际土壤AMF孢子密度分别为16.02、14.13、13.3个·g^(-1),形态学鉴定到6属22种,分别为球囊霉属(Glomus)、无梗囊霉属(Acaulospora)、近明球囊霉属(Claroideoglomus)、斗管囊霉属(Funneliforms)、盾巨孢囊霉属(Scutellospora)和硬囊霉属(Sclerocystis),球囊霉属和无梗囊霉属为优势属,相对多度分别为56.91%和28.23%。分子生物学鉴定到3属6种,分别为近明球囊霉(C.claroideum)、明球囊霉(G.clarum)、缩球囊霉(G.constrictum)、无梗囊霉属(A.srobiculata)、黑球囊霉(G.melanosporum)和地表球囊霉(G.versiforme)。统计分析表明,AMF定殖率与AMF孢子密度之间的相关性是0.8739,呈显著的正相关关系。该研究为攀枝花苏铁的保育提供了理论依据。 展开更多
关键词 攀枝花苏铁 丛枝菌根真菌(AMF)多样性 树龄 菌根定殖率 干热河谷
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软鳍新光唇鱼MC4R基因多态性与生长性状关联性分析
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作者 唐智慧 殷艳慧 +4 位作者 潘晓赋 吴安丽 张源伟 王茉 王晓爱 《渔业研究》 2025年第1期1-10,共10页
【背景】软鳍新光唇鱼(Neolissochilus benasi)是重要的水产种质资源,但在培育过程中存在个体间生长速度差异较大的问题。【目的】筛选与软鳍新光唇鱼生长性状显著相关的分子标记,推动其生长性状的改良。【方法】本研究对与摄食、能量... 【背景】软鳍新光唇鱼(Neolissochilus benasi)是重要的水产种质资源,但在培育过程中存在个体间生长速度差异较大的问题。【目的】筛选与软鳍新光唇鱼生长性状显著相关的分子标记,推动其生长性状的改良。【方法】本研究对与摄食、能量代谢、生长发育密切相关的黑素皮质素受体-4(MC4R)基因开展研究,通过PCR-Sanger测序技术进行单核苷酸多态性(SNP)检测和分型,并将SNP位点与其生长性状进行关联性分析,挖掘软鳍新光唇鱼生长性状关联的SNP标记。【结果】MC4R基因2个拷贝共存在15个SNP位点,其中第1个拷贝有1个SNP位点,第2个拷贝有14个SNP位点。15个SNP位点中仅G227A为错义突变,氨基酸类型由缬氨酸(V)变为异亮氨酸(I),其余位点均为同义突变;群体遗传分析结果显示,除第1个拷贝SNP位点G669C遗传参数值较低外,MC4R基因第2个拷贝的SNP位点期望杂合度(He)和观测杂合度(Ho)分别为0.860±0.027和0.503±0.001,多态信息含量(PIC)为0.373~0.375,属于中度多态性,表明该群体的遗传多样性处于中上水平;关联性分析显示,MC4R基因2个拷贝15个SNP位点中,13个位点对软鳍新光唇鱼的生长性状具有不同程度的影响:位点G227A、A322G、C364T、G403A、T451C、G457A、G472A、T484C、G520A、T583C、G736A、C775G与体长、体质量显著相关(P<0.05),且均以纯合子为优势基因型,分别为AA、GG、TT、AA、CC、AA、AA、CC、AA、CC、AA、GG型;位点C664T仅检测到CC和CT两种基因型,并以杂合子CT型为优势基因型,与体质量显著相关(P<0.05)。【结论】本研究初步筛选了15个与软鳍新光唇鱼生长性状相关联的候选SNP位点,为今后其生长相关机制和分子标记的进一步解析,以及生长性状的改良提供了科学依据。 展开更多
关键词 软鳍新光唇鱼 黑素皮质素受体-4 SNP 性状关联
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干热河谷的形成特征与植被恢复相关问题探析 被引量:19
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作者 马焕成 伍建榕 +1 位作者 郑艳玲 唐军荣 《西南林业大学学报(自然科学)》 CAS 北大核心 2020年第3期1-8,F0002,共9页
通过对西南地区干热河谷的形成过程及其相关的气候、土壤、植被和微生物共生系统进行分析,探讨进一步实现森林重建的相关问题。笔者认为:干热河谷现有植被是植物与当地环境经历数百万年的协同进化形成的,地质历史上和人类历史上记载的... 通过对西南地区干热河谷的形成过程及其相关的气候、土壤、植被和微生物共生系统进行分析,探讨进一步实现森林重建的相关问题。笔者认为:干热河谷现有植被是植物与当地环境经历数百万年的协同进化形成的,地质历史上和人类历史上记载的植被类型不能作为当前植被恢复的终极目标。干热河谷植被恢复目标树种和生态效果的确定,应与当地的生态容量相适应,采取宜林则林、宜灌则灌、宜草则草的策略,对于极端困难地段不应盲目追求恢复森林。植被恢复区所处的生物气候条件和土壤地质条件决定了该区域的生态容量,对于不同树种有所差异,一旦超出了该树种相对应的生态承载力,不管造林成活率和造林保存率有多高,随着林分郁闭度的提高,树木个体的竞争不断加剧,有些树木会逐渐死亡,树种特性和生态容量将决定最终形成的森林生物量和林分密度。适地适树是植被工作的基本原则,抗旱保水技术只能帮助树木避免短期的气候波动所造成的土壤干旱对苗木的胁迫,是适地适树基础上的辅助措施,并不能保证在不适宜造林的地区实现森林恢复。因此,植被恢复的验收标准应该根据不同树种和不同地区的实际情况有所调整。 展开更多
关键词 干热河谷 气候 土壤 植被演替 植被恢复
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云南金花茶转录组序列分析及功能注释 被引量:5
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作者 辛静 李斌 +4 位作者 叶鹏 刘成 唐军荣 张贵良 辛培尧 《经济林研究》 北大核心 2020年第3期85-94,共10页
【目的】深入研究云南金花茶优良性状、基因功能和基因分布特征,可为云南金花茶乃至山茶属植物功能基因的探索以及该物种的遗传保护提供基础生物信息学理论参考。【方法】采用Illumina Hi Seq 2000技术,对云南金花茶叶片进行转录组测序... 【目的】深入研究云南金花茶优良性状、基因功能和基因分布特征,可为云南金花茶乃至山茶属植物功能基因的探索以及该物种的遗传保护提供基础生物信息学理论参考。【方法】采用Illumina Hi Seq 2000技术,对云南金花茶叶片进行转录组测序及相关数据分析,在对测序数据整理、de novo组装后,获得Unigene序列,继而利用相关生物信息学数据库进行序列比对。【结果】组装后,共获得95979条Unigenes,其中N50(拼接转录本不小于总长50%的长度)为1660 nt,平均长度为1124 nt,Q20和Q30序列(处理后质量高于20和30的碱基)分别占96.39%和91.28%。经比对,在Nr、Nt、Swiss-Prot中能得到注释的Unigene分别为58830、43623、44315条。在GO中,有41905条(43.66%)Unigenes注释224129个GO功能,将其分为3个大类和56亚类,所占比例最多的为生物过程这一类功能。在KOG中,有23499条(24.48%)Unigenes注释26430个KOG功能信息,将其分为26个基因功能大类,其中表达量较高的分别是一般功能基因和翻译后修饰、蛋白质转化、伴侣功能的相关基因。另外,共有23214条(24.18%)Unigenes在KEGG中得到注释,根据其涉及的相关通路可将其归为19个亚类,其中以代谢通路较为丰富。此外,利用相关数据库和ESTScan软件对云南金花茶转录组Unigene进行CDS比对和预测,共预测到26428条CDS,其长度集中在100~500 nt,占总CDS的82.10%。【结论】云南金花茶所含基因信息丰富,利用分析得到的所有注释信息可以更深层次地探索其基因组信息和基因分布情况。 展开更多
关键词 云南金花茶 转录组 UNIGENE 功能 注释
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攀枝花苏铁珊瑚根共生放线菌鉴定及共生体养分吸收 被引量:2
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作者 魏玉倩 陈健鑫 +4 位作者 郑艳玲 王芳 马焕成 王国娟 伍建榕 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期44-52,共9页
【目的】攀枝花苏铁是生长在干热河谷地区植被稀少土壤贫瘠的石质山地的一类古老植物。攀枝花苏铁的侧根特化为发达的珊瑚状根,提高了攀枝花苏铁根系对养分的利用,本研究旨在探明珊瑚状根内共生放线菌的种类及其对养分吸收的影响。【方... 【目的】攀枝花苏铁是生长在干热河谷地区植被稀少土壤贫瘠的石质山地的一类古老植物。攀枝花苏铁的侧根特化为发达的珊瑚状根,提高了攀枝花苏铁根系对养分的利用,本研究旨在探明珊瑚状根内共生放线菌的种类及其对养分吸收的影响。【方法】采用稀释涂布法对原生地攀枝花苏铁珊瑚状根内放线菌进行分离培养,通过16S rRNA基因进行分子鉴定;将内生放线菌接种到无菌砂培苏铁苗根系,经18 m共生培养后,通过石蜡切片观察珊瑚状根内放线菌的定殖位置,并利用全自动间断化学分析仪及同位素示踪法探究氮素的吸收形式。【结果】珊瑚状根共生放线菌TB-6、TB-7和TB-10分别为Streptacidiphulus griseoplanus、Streptomyces spororaveu和S. xanthophaeus;共生培养后的无菌苏铁苗均能够形成珊瑚状根,石蜡切片显示放线菌定殖于根的外皮层和内皮层细胞中,证明它们与攀枝花苏铁形成共生体,没有共生的无珊瑚根形成;共生后的无菌苏铁苗根系全氮全磷全钾含量增加,氮素的积累量增加最为显著,同位素示踪结果显示,接种放线菌后形成珊瑚状根的苏铁苗吸收硝态氮和铵态氮的比例从1:1.3增加至1:2.03,表明接种放线菌能增加对铵态氮的吸收。【结论】原生地攀枝花苏铁能与放线菌形成珊瑚状根共生体,选择性吸收土壤中易被植物吸收利用的铵态氮,共生体通过提高苏铁根系对养分的吸收与利用,使得攀枝花苏铁能在干热河谷长期稳定地生存,本研究为攀枝花苏铁的保护繁育提供了理论支持。 展开更多
关键词 攀枝花苏铁 珊瑚状共生体 放线菌 氮素吸收 同位素标记
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云南金花茶SSR-PCR反应体系的建立与优化 被引量:8
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作者 李显煌 高丽云 +5 位作者 王娟 张贵良 唐军荣 叶鹏 雷瀚 辛培尧 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期101-108,共8页
以云南金花茶为试验材料,利用试剂盒法、SDS法及CTAB法3种方法提取其DNA,并对3种方法的提取结果进行比较;经初筛合成云南金花茶EST-SSR引物,并对影响SSR-PCR体系的Mg^2+、Taq DNA聚合酶、dNTP、引物及模板DNA这5个因素进行L16(4^5)正交... 以云南金花茶为试验材料,利用试剂盒法、SDS法及CTAB法3种方法提取其DNA,并对3种方法的提取结果进行比较;经初筛合成云南金花茶EST-SSR引物,并对影响SSR-PCR体系的Mg^2+、Taq DNA聚合酶、dNTP、引物及模板DNA这5个因素进行L16(4^5)正交实验,以期建立较为稳定的云南金花茶SSR-PCR体系。试验结果表明:试剂盒法提取得到的云南金花茶DNA质量最好且符合SSR分子标记试验。各因素对PCR扩增效果的影响程度为:Mg^2+>引物> Taq DNA聚合酶> dNTP>模板DNA。试验最终确定的金花茶SSR-PCR最佳反应体系(20μL)为:2.0μL Taq Buffer、1.5μL Mg^2+(25 mmol/L)、0.3μL dNTP(10 mmol/L)、0.2μL Taq DNA聚合酶(5 U/μL)、前后引物各0.4μL(10μmol/L)、0.5μL模板DNA(50 ng/μL)、14.7μL ddH2O。建立和优化云南金花茶SSR反应体系,可为云南金花茶不同种群的遗传变异研究提供基础。 展开更多
关键词 云南金花茶 SSR-PCR 体系建立 优化
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滇杨性别相关的SRAP分子标记 被引量:6
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作者 雷瀚 刘成 +6 位作者 唐军荣 瞿绍宏 董章宏 李显煌 李斌 常晓勇 辛培尧 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期139-146,共8页
【目的】滇杨作为一种利用价值较高的雌雄异株树种,备受林业科学研究者的关注。由于个别不利性状的存在,限制了滇杨在生产上的有效推广。天然群体中,滇杨雌株极为罕见,导致其遗传基础较为狭窄,给其遗传改良工作带来一定的局限性。滇杨... 【目的】滇杨作为一种利用价值较高的雌雄异株树种,备受林业科学研究者的关注。由于个别不利性状的存在,限制了滇杨在生产上的有效推广。天然群体中,滇杨雌株极为罕见,导致其遗传基础较为狭窄,给其遗传改良工作带来一定的局限性。滇杨直到成年开花后,才能辨别其性别,这为研究其雌株的濒危以及雌雄植株的分别利用带来较大的困难。因此,亟需建立一种快速且准确的性别早期鉴定方法,以加速研究并解决上述问题。【方法】试验利用SRAP技术,以60株已知性别的滇杨个体为材料,筛选与滇杨性别相关的分子标记,并利用获得的SRAP标记,对30株未知性别的滇杨幼苗进行性别鉴定,并对鉴定结果的一致性进行比较。【结果】在参试的20对SRAP引物中,2对引物可在已知性别的60株滇杨植株间产生差异条带,且均为雄性相关的特异性条带。其中引物Me1可以在1 600 bp处扩增出特异性条带,而另一对引物Me10的扩增条带在710 bp处。利用这2对SRAP引物对30株苗期滇杨进行性别鉴定,2对引物所得鉴定结果完全一致。【结论】通过试验可初步认为,试验所筛选出的2对SRAP分子标记引物,可以准确对滇杨早期性别进行鉴定。研究结果可为滇杨不同性别植株的分别利用提供早期选择,也可为雌株濒危的原因提供理论参考。 展开更多
关键词 滇杨 性别 鉴定 SRAP
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叉叶苏铁和攀枝花苏铁对冰冻胁迫的生理生化响应 被引量:3
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作者 夏志宁 马焕成 郑艳玲 《西南林业大学学报(自然科学)》 CAS 北大核心 2020年第5期166-173,共8页
以叉叶苏铁和攀枝花苏铁为材料,比较2种苏铁的抗冻性,并探究其生理生化机制。结果表明:叉叶苏铁和攀枝花苏铁的低温半致死温度分别为-0.15℃和-2.05℃。冰冻处理后,叉叶苏铁的叶绿素含量比CK降低,但攀枝花苏铁的比CK升高;2种苏铁光合效... 以叉叶苏铁和攀枝花苏铁为材料,比较2种苏铁的抗冻性,并探究其生理生化机制。结果表明:叉叶苏铁和攀枝花苏铁的低温半致死温度分别为-0.15℃和-2.05℃。冰冻处理后,叉叶苏铁的叶绿素含量比CK降低,但攀枝花苏铁的比CK升高;2种苏铁光合效率均比CK下降,丙二醛含量均比CK升高,但叉叶苏铁变化幅度更大;2种苏铁的抗氧化酶活性均表现出不同的变化模式;叉叶苏铁可溶性糖含量较CK下降,攀枝花苏铁的较CK升高,但2种苏铁脯氨酸含量均比CK提高。 展开更多
关键词 冰冻胁迫 叶绿素 荧光参数 抗氧化酶 渗透调节 叉叶苏铁 攀枝花苏铁
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昆明滇润楠叶缘枯病病原鉴定及生防菌筛选 被引量:1
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作者 魏玉倩 陈健鑫 +3 位作者 唐婕 孙会林 黄培珊 伍建榕 《中国森林病虫》 2021年第4期5-10,共6页
为控制昆明城市绿化树种滇润楠Machilus yunnanensis叶缘枯病,于2018年3月至2020年3月对昆明地区滇润楠叶缘枯病的发生情况进行调查,采用组织分离法对其病原菌进行分离培养,采用形态学及分子生物学相结合的方法对病原菌进行鉴定,并采用... 为控制昆明城市绿化树种滇润楠Machilus yunnanensis叶缘枯病,于2018年3月至2020年3月对昆明地区滇润楠叶缘枯病的发生情况进行调查,采用组织分离法对其病原菌进行分离培养,采用形态学及分子生物学相结合的方法对病原菌进行鉴定,并采用柯赫氏法则测定致病性,同时进行生防菌抑菌效果检测。结果表明:昆明地区及西南林业大学校园滇润楠叶缘枯病发病率分别达68%和69%,病情指数分别为47.4和46.7;引起滇润楠叶缘枯病的病原菌为胶孢炭疽菌Colletotrichum gloeosporioides(Penz.)Penz.&Sacc.。枯草芽孢杆菌处理离体叶片后接种病原菌,18 d后滇润楠叶缘枯病发病率为25.66%,病斑直径为0.68 cm,分生孢子盘发育指数为0.12,抑菌效果为84.92%。该病害属国内首次报道,研究结果可为滇润楠叶缘枯病的绿色防治提供新思路。 展开更多
关键词 滇润楠叶缘枯病 病害调查 病原鉴定 生防菌筛选 昆明地区
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