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滇水金凤花距发育相关基因MADS-EJ2和MADS2的克隆及表达分析
1
作者
王天野
杨梦情
+3 位作者
马慧
梁光容
黄美娟
黄海泉
《山东农业科学》
北大核心
2025年第9期1-8,共8页
E类MADS-box转录因子基因SEPALLATA(SEP)-like在花器官发育方面发挥着重要作用。为了探究基因SEP-like在滇水金凤(Impatiens uliginosa)花距发育中的功能,本研究成功克隆出基因MADS-EJ2和MADS2,分别命名为IuMADS-EJ2和IuMADS2,其cDNA全...
E类MADS-box转录因子基因SEPALLATA(SEP)-like在花器官发育方面发挥着重要作用。为了探究基因SEP-like在滇水金凤(Impatiens uliginosa)花距发育中的功能,本研究成功克隆出基因MADS-EJ2和MADS2,分别命名为IuMADS-EJ2和IuMADS2,其cDNA全长均为762 bp,编码253 aa。生物信息学分析表明,IuMADS-EJ2为亲水性稳定蛋白,IuMADS2为亲水性不稳定蛋白,二者均含MIKC结构,在C-端都有其亚家族特异的SEPⅠ和SEPⅡ基序,均为E类基因;亚细胞定位预测IuMADS-EJ2和IuMADS2均定位在细胞核。IuMADS-EJ2和IuMADS2的氨基酸序列与喜马拉雅凤仙花的同源序列相似性分别为98.03%和95.26%。qRT-PCR分析表明,两基因在滇水金凤花距发育的3个时期及2个不同部位均有表达,IuMADS-EJ2在花苞期距部的表达量最高,IuMADS2在花苞期檐部的表达量最高,推测两基因调控花距发育且主要在花距发育初期发挥作用。本研究结果可为凤仙花花距发育分子机制解析、花形改良和新品种培育提供一定的基础数据和理论依据。
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关键词
滇水金凤
花距发育
MADS-EJ2基因
MADS2基因
生物信息学分析
表达分析
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职称材料
濒危植物峨眉凤仙花叶绿体基因组分析
被引量：
4
2
作者
赵秋燕
曹孟会
+6 位作者
李新艺
周敏
魏春梅
张茜
瞿素萍
黄海泉
黄美娟
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期174-182,共9页
[目的]对峨眉凤仙花(Impatiens omeiana Hook.f.)叶绿体基因组的结构特征及系统发育进行研究,为其资源保护及开发利用提供理论依据。[方法]基于峨眉凤仙花叶绿体基因组序列,利用生物信息学软件,对叶绿体基因组进行组装、注释、基因特征...
[目的]对峨眉凤仙花(Impatiens omeiana Hook.f.)叶绿体基因组的结构特征及系统发育进行研究,为其资源保护及开发利用提供理论依据。[方法]基于峨眉凤仙花叶绿体基因组序列,利用生物信息学软件,对叶绿体基因组进行组装、注释、基因特征、序列重复和系统发育分析。[结果]峨眉凤仙花完整的叶绿体基因组长度为152 527bp,共有130个基因,包括86个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和36个tRNA基因,GC含量为37%,且具有保守的四分体结构,包括大单拷贝区、小单拷贝区各1个和2个相同的反向重复区域,其长度分别为83 150、17 903、25 737 bp,其中13个基因有1个内含子,2个基因有2个内含子。特征分析表明:峨眉凤仙花叶绿体全基因组中共检测到76个SSR序列,且多以A/T单核苷酸序列为主,其长度为10-91 bp;检测到50 842个密码子,其中以亮氨酸(Leu)最多,色氨酸(Tyr)最少;密码子偏好性分析显示33个RSCU≥1的密码子多数以A/U结尾。通过邻接法(NJ)构建系统发育树发现,峨眉凤仙花与贵州凤仙花亲缘关系最近,均属于棒凤仙花亚属植物。[结论]峨眉凤仙花叶绿体基因组呈典型的四分体结构,SSR序列以A/T单碱基为主;系统发育分析结果将其归为棒凤仙花亚属,上述结果为峨眉凤仙花系统发育学地位及物种鉴定工作提供了重要的分子信息。
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关键词
峨眉凤仙花
叶绿体基因组
序列结构与特征分析
系统发育
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职称材料
题名
滇水金凤花距发育相关基因MADS-EJ2和MADS2的克隆及表达分析
1
作者
王天野
杨梦情
马慧
梁光容
黄美娟
黄海泉
机构
西南林业大学园林园艺学院/西南林业大学园林园艺花卉研发中心
出处
《山东农业科学》
北大核心
2025年第9期1-8,共8页
基金
国家自然科学基金项目(32060364)
云南省重大科技专项计划项目(202102AE090052)。
文摘
E类MADS-box转录因子基因SEPALLATA(SEP)-like在花器官发育方面发挥着重要作用。为了探究基因SEP-like在滇水金凤(Impatiens uliginosa)花距发育中的功能,本研究成功克隆出基因MADS-EJ2和MADS2,分别命名为IuMADS-EJ2和IuMADS2,其cDNA全长均为762 bp,编码253 aa。生物信息学分析表明,IuMADS-EJ2为亲水性稳定蛋白,IuMADS2为亲水性不稳定蛋白,二者均含MIKC结构,在C-端都有其亚家族特异的SEPⅠ和SEPⅡ基序,均为E类基因;亚细胞定位预测IuMADS-EJ2和IuMADS2均定位在细胞核。IuMADS-EJ2和IuMADS2的氨基酸序列与喜马拉雅凤仙花的同源序列相似性分别为98.03%和95.26%。qRT-PCR分析表明,两基因在滇水金凤花距发育的3个时期及2个不同部位均有表达,IuMADS-EJ2在花苞期距部的表达量最高,IuMADS2在花苞期檐部的表达量最高,推测两基因调控花距发育且主要在花距发育初期发挥作用。本研究结果可为凤仙花花距发育分子机制解析、花形改良和新品种培育提供一定的基础数据和理论依据。
关键词
滇水金凤
花距发育
MADS-EJ2基因
MADS2基因
生物信息学分析
表达分析
Keywords
Impatiens uliginosa
Petal spur development
MADS-EJ2 gene
MADS2 gene
Bioinformatics analysis
Expression analysis
分类号
S681.1 [农业科学—观赏园艺]
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
濒危植物峨眉凤仙花叶绿体基因组分析
被引量：
4
2
作者
赵秋燕
曹孟会
李新艺
周敏
魏春梅
张茜
瞿素萍
黄海泉
黄美娟
机构
西南林业大学园林园艺学院/西南林业大学园林园艺花卉研发中心
云南省农业科学
院
花卉
研究所
出处
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期174-182,共9页
基金
国家自然科学基金项目(32060364、32060366、31860230)
云南省重大科技专项(202102AE090052)
云南省园林植物遗传改良与高效繁育博士生导师团队和云南省中青年学术和技术带头人培养项目(503210103、2015HB046、2018HB024)。
文摘
[目的]对峨眉凤仙花(Impatiens omeiana Hook.f.)叶绿体基因组的结构特征及系统发育进行研究,为其资源保护及开发利用提供理论依据。[方法]基于峨眉凤仙花叶绿体基因组序列,利用生物信息学软件,对叶绿体基因组进行组装、注释、基因特征、序列重复和系统发育分析。[结果]峨眉凤仙花完整的叶绿体基因组长度为152 527bp,共有130个基因,包括86个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和36个tRNA基因,GC含量为37%,且具有保守的四分体结构,包括大单拷贝区、小单拷贝区各1个和2个相同的反向重复区域,其长度分别为83 150、17 903、25 737 bp,其中13个基因有1个内含子,2个基因有2个内含子。特征分析表明:峨眉凤仙花叶绿体全基因组中共检测到76个SSR序列,且多以A/T单核苷酸序列为主,其长度为10-91 bp;检测到50 842个密码子,其中以亮氨酸(Leu)最多,色氨酸(Tyr)最少;密码子偏好性分析显示33个RSCU≥1的密码子多数以A/U结尾。通过邻接法(NJ)构建系统发育树发现,峨眉凤仙花与贵州凤仙花亲缘关系最近,均属于棒凤仙花亚属植物。[结论]峨眉凤仙花叶绿体基因组呈典型的四分体结构,SSR序列以A/T单碱基为主;系统发育分析结果将其归为棒凤仙花亚属,上述结果为峨眉凤仙花系统发育学地位及物种鉴定工作提供了重要的分子信息。
关键词
峨眉凤仙花
叶绿体基因组
序列结构与特征分析
系统发育
Keywords
Impatiens omeiana
chloroplast genome
sequence structure and characteristic analysis
phylogeny
分类号
S685.99 [农业科学—观赏园艺]
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
滇水金凤花距发育相关基因MADS-EJ2和MADS2的克隆及表达分析
王天野
杨梦情
马慧
梁光容
黄美娟
黄海泉
《山东农业科学》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
濒危植物峨眉凤仙花叶绿体基因组分析
赵秋燕
曹孟会
李新艺
周敏
魏春梅
张茜
瞿素萍
黄海泉
黄美娟
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
4
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