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贵州普安四球茶(Camellia tetracocca Zhang)种质资源的遗传多样性分析
被引量：
9
1
作者
罗雯
陈艳艳
+4 位作者
尹世华
王莉飞
黄晓霞
耿芳
程小毛
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期74-85,共12页
【目的】从分子水平上分析普安四球茶的遗传多样性,为今后四球茶的保护、育种及利用研究奠定基础。【方法】利用22对EST-SSR引物分析贵州普安的4个不同居群的141份四球茶(Camellia tetracocca Zhang)种质资源的遗传多样性和居群结构。...
【目的】从分子水平上分析普安四球茶的遗传多样性,为今后四球茶的保护、育种及利用研究奠定基础。【方法】利用22对EST-SSR引物分析贵州普安的4个不同居群的141份四球茶(Camellia tetracocca Zhang)种质资源的遗传多样性和居群结构。【结果】22对EST-SSR引物共扩增出72条多态性谱带,物种水平上,观测等位基因(N_(a))的数值最小为3.0000,分别是CsEMS147、CsEMS148、CsEMS152和CsEMS194,最大为6.0000,是CsEMS27和CsEMS117,平均为4.2273;有效等位基因数(N_(e))最小值为1.6473,是CsEMS152,最大值为3.7981,是CsEMS117,平均2.7874;Shannon信息多样性指数(I)在0.6846(CsEMS152)~1.5059(CsEMS117),变幅0.8213,变化范围较大,平均Shannon指数为1.1454,Nei基因多样性指数(H)平均值是0.6227,范围在0.3929(CsEMS152)~0.7367(CsEMS117);引物的多态信息含量(PIC)在13.3%~78.69%,平均为64.38%,说明普安四球茶树居群遗传多样性高。通过POPGENE分析得到居群内近交系数F_(is)为0.1293,居群分化系数F_(st)仅为0.046,基因流N_(m)为5.0853,说明普安四球茶树遗传变异主要分布于其居群内部,基因交流丰富。分子差异分析表明,四球茶树居群的遗传变异7%发生在居群间,93%发生在居群内。遗传相似系数为0.8380~0.9438,平均值为0.898,遗传距离在0.0578~0.1767,平均值为0.1084。以遗传相似度为阈值,对普安四球茶不同居群进行UPGMA聚类分析得到野生型古茶树和栽培型古茶树遗传相似度最高,栽培型茶树和千年野生型古茶树遗传相似度最低,与POPGENE分析得到的不同居群遗传相似性和遗传距离结果一致。STRUCTURE和PCA分析,得到四球茶居群间遗传距离较近,遗传分化明显。【结论】普安四球茶树居群具有丰富的遗传多样性,4个居群间遗传分化明显,亲缘关系较近。
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关键词
四球茶
遗传多样性
居群结构
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题名
贵州普安四球茶(Camellia tetracocca Zhang)种质资源的遗传多样性分析
被引量：
9
1
作者
罗雯
陈艳艳
尹世华
王莉飞
黄晓霞
耿芳
程小毛
机构
西南林业大学园林园艺学院/云南省古茶树资源保护与利用研究中心
出处
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期74-85,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31760197)
国家“十三五”重点研发计划项目子课题(2019YFD100005-2)。
文摘
【目的】从分子水平上分析普安四球茶的遗传多样性,为今后四球茶的保护、育种及利用研究奠定基础。【方法】利用22对EST-SSR引物分析贵州普安的4个不同居群的141份四球茶(Camellia tetracocca Zhang)种质资源的遗传多样性和居群结构。【结果】22对EST-SSR引物共扩增出72条多态性谱带,物种水平上,观测等位基因(N_(a))的数值最小为3.0000,分别是CsEMS147、CsEMS148、CsEMS152和CsEMS194,最大为6.0000,是CsEMS27和CsEMS117,平均为4.2273;有效等位基因数(N_(e))最小值为1.6473,是CsEMS152,最大值为3.7981,是CsEMS117,平均2.7874;Shannon信息多样性指数(I)在0.6846(CsEMS152)~1.5059(CsEMS117),变幅0.8213,变化范围较大,平均Shannon指数为1.1454,Nei基因多样性指数(H)平均值是0.6227,范围在0.3929(CsEMS152)~0.7367(CsEMS117);引物的多态信息含量(PIC)在13.3%~78.69%,平均为64.38%,说明普安四球茶树居群遗传多样性高。通过POPGENE分析得到居群内近交系数F_(is)为0.1293,居群分化系数F_(st)仅为0.046,基因流N_(m)为5.0853,说明普安四球茶树遗传变异主要分布于其居群内部,基因交流丰富。分子差异分析表明,四球茶树居群的遗传变异7%发生在居群间,93%发生在居群内。遗传相似系数为0.8380~0.9438,平均值为0.898,遗传距离在0.0578~0.1767,平均值为0.1084。以遗传相似度为阈值,对普安四球茶不同居群进行UPGMA聚类分析得到野生型古茶树和栽培型古茶树遗传相似度最高,栽培型茶树和千年野生型古茶树遗传相似度最低,与POPGENE分析得到的不同居群遗传相似性和遗传距离结果一致。STRUCTURE和PCA分析,得到四球茶居群间遗传距离较近,遗传分化明显。【结论】普安四球茶树居群具有丰富的遗传多样性,4个居群间遗传分化明显,亲缘关系较近。
关键词
四球茶
遗传多样性
居群结构
Keywords
Camellia tetracocca Zhang
genetic diversity
population structure
分类号
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
贵州普安四球茶(Camellia tetracocca Zhang)种质资源的遗传多样性分析
罗雯
陈艳艳
尹世华
王莉飞
黄晓霞
耿芳
程小毛
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
9
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