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基于高通量测序方法研究不同海拔梯度云南松根际根内细菌群落多样性
被引量：
2
1
作者
普蕾
周宇杨
+4 位作者
和滢埝
母德锦
华国莉
陈林
陈诗
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2024年第3期133-143,共11页
探究不同海拔梯度云南松根际土壤及根内细菌种类、群落结构组成及多样性,为研究云南松在不同海拔条件下的适应机制提供一定的微生物学角度的证据。采用高通量测序技术对不同海拔云南松根和根际土壤细菌16S rRNA基因V5~V7区域进行测序,...
探究不同海拔梯度云南松根际土壤及根内细菌种类、群落结构组成及多样性,为研究云南松在不同海拔条件下的适应机制提供一定的微生物学角度的证据。采用高通量测序技术对不同海拔云南松根和根际土壤细菌16S rRNA基因V5~V7区域进行测序,并对其群落结构组成、多样性以及功能进行分析。结果显示:(1)通过高通量测序分析,云南松根内生细菌共鉴定出41门118纲277目465科893属1755种,而根际土壤细菌共鉴定出34门96纲230目395科761属1626种。(2)云南松根际土壤细菌群落香农指数显著高于根内,并且根际土壤中细菌丰度最高的为变形菌门,而根内丰度最高的为放线菌门,根内放线菌门和厚壁菌门相对丰度是根际土壤的2倍,而根际土壤中酸杆菌门相对丰度是根内的2倍,此外根内生细菌群落代谢功能丰度相较于根际土壤细菌较高。(3)云南松根际土壤和根内生细菌群落在不同海拔梯度间的β-多样性存在显著差异(P<0.05),此外不同海拔梯度之间优势物种相对丰度占比存在差异。PICRUSt2功能预测表明,根际土壤细菌基因二级功能表达量随海拔梯度增加而逐渐增加,并且根内生细菌基因功能表达量仅在海拔2900 m处较高。可得结论:不同海拔梯度下云南松根际土壤与根内生细菌多样性、细菌群落的环境适应、功能上均存在差异,这可能与云南松对外界环境的适应有关。本研究为进一步探究云南松的环境适应机制提供了一定的数据支撑。
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关键词
云南松
海拔
细菌群落
多样性
高通量测序
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职称材料
题名
基于高通量测序方法研究不同海拔梯度云南松根际根内细菌群落多样性
被引量：
2
1
作者
普蕾
周宇杨
和滢埝
母德锦
华国莉
陈林
陈诗
机构
西南林业大学、西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室
出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2024年第3期133-143,共11页
基金
云南省“兴滇英才支持计划”青年人才专项(XDYC-QNRC-2022-0250)
云南省科技厅应用基础研究项目(202201AT070023)
+1 种基金
云南省研究生导师团队建设项目(2022-97)
云南省教育厅研究生科研创新项目(2022Y586)。
文摘
探究不同海拔梯度云南松根际土壤及根内细菌种类、群落结构组成及多样性,为研究云南松在不同海拔条件下的适应机制提供一定的微生物学角度的证据。采用高通量测序技术对不同海拔云南松根和根际土壤细菌16S rRNA基因V5~V7区域进行测序,并对其群落结构组成、多样性以及功能进行分析。结果显示:(1)通过高通量测序分析,云南松根内生细菌共鉴定出41门118纲277目465科893属1755种,而根际土壤细菌共鉴定出34门96纲230目395科761属1626种。(2)云南松根际土壤细菌群落香农指数显著高于根内,并且根际土壤中细菌丰度最高的为变形菌门,而根内丰度最高的为放线菌门,根内放线菌门和厚壁菌门相对丰度是根际土壤的2倍,而根际土壤中酸杆菌门相对丰度是根内的2倍,此外根内生细菌群落代谢功能丰度相较于根际土壤细菌较高。(3)云南松根际土壤和根内生细菌群落在不同海拔梯度间的β-多样性存在显著差异(P<0.05),此外不同海拔梯度之间优势物种相对丰度占比存在差异。PICRUSt2功能预测表明,根际土壤细菌基因二级功能表达量随海拔梯度增加而逐渐增加,并且根内生细菌基因功能表达量仅在海拔2900 m处较高。可得结论:不同海拔梯度下云南松根际土壤与根内生细菌多样性、细菌群落的环境适应、功能上均存在差异,这可能与云南松对外界环境的适应有关。本研究为进一步探究云南松的环境适应机制提供了一定的数据支撑。
关键词
云南松
海拔
细菌群落
多样性
高通量测序
Keywords
Pinus yunnanensis
altidude
bacterial community
diversity
high-throughput sequencing
分类号
S791.257 [农业科学—林木遗传育种]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于高通量测序方法研究不同海拔梯度云南松根际根内细菌群落多样性
普蕾
周宇杨
和滢埝
母德锦
华国莉
陈林
陈诗
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2024
2
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