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基于超高分辨质谱的家蚕脂肪体样品处理方案优化研究
1
作者
赵东超
刘丽婧
+4 位作者
赵莉
张艳
董照明
夏庆友
赵萍
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期109-116,共8页
随着家蚕基因组图谱的发布,家蚕的研究逐渐进入后基因组时代,家蚕蛋白质组样品前处理方法没有统一的标准,鉴定到的蛋白质数量差异较大.基于超高分辨率质谱仪,建立冰上组织研磨器研磨提取蛋白质的方法,能极大地避免材料的损失,具有稳定...
随着家蚕基因组图谱的发布,家蚕的研究逐渐进入后基因组时代,家蚕蛋白质组样品前处理方法没有统一的标准,鉴定到的蛋白质数量差异较大.基于超高分辨率质谱仪,建立冰上组织研磨器研磨提取蛋白质的方法,能极大地避免材料的损失,具有稳定和快速的优点.通过对不同提取试剂的摸索,发现尿素+DTT对家蚕组织样品的提取效果最好.通过对上样量和上样时间的摸索,确定最佳上样量为10μL,最佳上样时间为120 min.利用90%序列相似性原则构建非冗余家蚕数据库Strealine,在家蚕5龄第3 d脂肪体材料中,使用该库能鉴定到1910种蛋白质.进一步采用反相色谱柱对肽段进行分级,将鉴定到的蛋白数量提升至3986种.
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关键词
家蚕
蛋白质组
脂肪体
蛋白质数量
肽段分级
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职称材料
家蚕30K蛋白BmLP1的表达模式及其在胚胎中的作用
2
作者
张艳
董照明
+6 位作者
夏建华
令狐青青
万娜
张仁义
卢忠燕
林英
赵萍
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期99-106,共8页
家蚕30K蛋白是家蚕血液和卵中的高丰度蛋白,参与营养、免疫、抑制细胞凋亡等功能.探究30K蛋白在家蚕体内的表达模式有助于更清楚地了解30K蛋白的功能.利用生物信息学方法发现4种30K蛋白基因Bmlp1,Bmlp2,Bmlp3和Bmlp7都含有信号肽.其中,B...
家蚕30K蛋白是家蚕血液和卵中的高丰度蛋白,参与营养、免疫、抑制细胞凋亡等功能.探究30K蛋白在家蚕体内的表达模式有助于更清楚地了解30K蛋白的功能.利用生物信息学方法发现4种30K蛋白基因Bmlp1,Bmlp2,Bmlp3和Bmlp7都含有信号肽.其中,Bmlp1与其他30K蛋白的序列相似性小于50%.半定量RT-PCR结果表明,Bmlp1从5龄第3 d到化蛹第1 d在脂肪体中表达量都比较高,之后表达量降低.Western blotting结果表明,BmLP1从5龄第5 d到化蛹第4 d在血淋巴中的含量都比较高,之后含量降低.与血淋巴中的变化趋势不同,卵巢中的BmLP1在上蔟第2 d被检测到,之后含量一直增加,化蛾时含量达到最高.这是由于上蔟第2 d卵巢管迅速长大,血液中的BmLP1等营养蛋白逐渐转运至卵巢管的未受精卵并开始积累.免疫组织化学定位结果表明,在胚胎发育前期,BmLP1分布于蚕卵的卵黄颗粒中,在孵化前期,BmLP1被吞入胚胎的肠道内.体外孵育结果表明,蚁蚕粗提物可以降解BmLP1,暗示蚁蚕肠道内可能存在某种蛋白酶可以将大部分BmLP1水解,最终为蚁蚕的孵化提供能量或者氨基酸.系统分析了BmLP1在不同发育时期脂肪体、血液、卵巢和胚胎中的表达特征,揭示了其在胚胎发育过程中的重要作用.
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关键词
家蚕
30K蛋白
BmLP1
胚胎发育
血淋巴
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职称材料
题名
基于超高分辨质谱的家蚕脂肪体样品处理方案优化研究
1
作者
赵东超
刘丽婧
赵莉
张艳
董照明
夏庆友
赵萍
机构
西南大学
西部
(
重庆
)
科学城
种质
创制大
科学
中心/
前沿
交叉学科
研究院
生物学
研究
中心
重庆
市中药
研究院
中药创新药物与健康干预
重庆
市重点实验室
兰州
大学
生态学院
出处
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期109-116,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2022YFD1201600)
国家自然科学基金项目(32030103)
西南大学实验技术研究项目(SYJ2024022)。
文摘
随着家蚕基因组图谱的发布,家蚕的研究逐渐进入后基因组时代,家蚕蛋白质组样品前处理方法没有统一的标准,鉴定到的蛋白质数量差异较大.基于超高分辨率质谱仪,建立冰上组织研磨器研磨提取蛋白质的方法,能极大地避免材料的损失,具有稳定和快速的优点.通过对不同提取试剂的摸索,发现尿素+DTT对家蚕组织样品的提取效果最好.通过对上样量和上样时间的摸索,确定最佳上样量为10μL,最佳上样时间为120 min.利用90%序列相似性原则构建非冗余家蚕数据库Strealine,在家蚕5龄第3 d脂肪体材料中,使用该库能鉴定到1910种蛋白质.进一步采用反相色谱柱对肽段进行分级,将鉴定到的蛋白数量提升至3986种.
关键词
家蚕
蛋白质组
脂肪体
蛋白质数量
肽段分级
Keywords
silkworm(Bombyx mori)
proteome
fat body
number of proteins
peptide fractionation
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
O657.63 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
家蚕30K蛋白BmLP1的表达模式及其在胚胎中的作用
2
作者
张艳
董照明
夏建华
令狐青青
万娜
张仁义
卢忠燕
林英
赵萍
机构
西南大学
西部
(
重庆
)
科学城
种质
创制大
科学
中心/
前沿
交叉学科
研究院
生物学
研究
中心
出处
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期99-106,共8页
基金
国家自然科学基金项目(32202750)
重庆市基础与前沿研究计划项目(cstc2021jcyj-msxmX0582)
重庆市创新群体项目(cstc2020jcyj-cxtt)。
文摘
家蚕30K蛋白是家蚕血液和卵中的高丰度蛋白,参与营养、免疫、抑制细胞凋亡等功能.探究30K蛋白在家蚕体内的表达模式有助于更清楚地了解30K蛋白的功能.利用生物信息学方法发现4种30K蛋白基因Bmlp1,Bmlp2,Bmlp3和Bmlp7都含有信号肽.其中,Bmlp1与其他30K蛋白的序列相似性小于50%.半定量RT-PCR结果表明,Bmlp1从5龄第3 d到化蛹第1 d在脂肪体中表达量都比较高,之后表达量降低.Western blotting结果表明,BmLP1从5龄第5 d到化蛹第4 d在血淋巴中的含量都比较高,之后含量降低.与血淋巴中的变化趋势不同,卵巢中的BmLP1在上蔟第2 d被检测到,之后含量一直增加,化蛾时含量达到最高.这是由于上蔟第2 d卵巢管迅速长大,血液中的BmLP1等营养蛋白逐渐转运至卵巢管的未受精卵并开始积累.免疫组织化学定位结果表明,在胚胎发育前期,BmLP1分布于蚕卵的卵黄颗粒中,在孵化前期,BmLP1被吞入胚胎的肠道内.体外孵育结果表明,蚁蚕粗提物可以降解BmLP1,暗示蚁蚕肠道内可能存在某种蛋白酶可以将大部分BmLP1水解,最终为蚁蚕的孵化提供能量或者氨基酸.系统分析了BmLP1在不同发育时期脂肪体、血液、卵巢和胚胎中的表达特征,揭示了其在胚胎发育过程中的重要作用.
关键词
家蚕
30K蛋白
BmLP1
胚胎发育
血淋巴
Keywords
silkworm(Bombyx mori)
30K protein
BmLP1
embryonic development
hemolymph
分类号
S881.2 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于超高分辨质谱的家蚕脂肪体样品处理方案优化研究
赵东超
刘丽婧
赵莉
张艳
董照明
夏庆友
赵萍
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
2
家蚕30K蛋白BmLP1的表达模式及其在胚胎中的作用
张艳
董照明
夏建华
令狐青青
万娜
张仁义
卢忠燕
林英
赵萍
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
已选择
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