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糖尿病前期患者循环miR-103b表达、临床意义及靶基因功能研究 被引量:3
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作者 罗宇霖 方丹 +3 位作者 刘钰熙 贺朝晖 吴剑波 罗茂 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期663-670,共8页
目的:探讨2型糖尿病前期患者循环血清中微小RNA(miR)-103b的表达变化与临床意义,并分析其靶基因生物信息学功能。方法:收集糖尿病前期患者(n=48)、糖尿病无并发症患者(n=47)及正常健康人群(n=50)的血清标本,用real-time PCR检测各血清... 目的:探讨2型糖尿病前期患者循环血清中微小RNA(miR)-103b的表达变化与临床意义,并分析其靶基因生物信息学功能。方法:收集糖尿病前期患者(n=48)、糖尿病无并发症患者(n=47)及正常健康人群(n=50)的血清标本,用real-time PCR检测各血清样本中miR-103b的表达水平,并比较3组miR-103b表达水平的差异与临床病理特征之间的相关性,运用受试者工作特征(ROC)曲线评估诊断效率及特异性。利用生物信息学技术,对hsa-miR-103b的特征、进化保守性、靶基因功能以及GO信号通路等进行深入分析。结果:Real-time PCR结果显示,与健康人群相比,循环血清中miR-103b在糖尿病前期及糖尿病无并发症患者的表达显著降低(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,糖尿病前期患者血清中miR-103b的ROC曲线下面积(AUC)达到0.877,提示miR-103b是糖尿病前期具有较高灵敏性和特异性的临床诊断标志物。生物信息学分析结果表明,hsa-miR-103b定位于人染色体5q34,并在10个物种间具有高度的保守性。靶基因预测共获得53个潜在的功能性靶向基因。进一步应用DAVID数据库和GO数据库进行靶基因功能富集分类,结果显示miR-103b靶基因功能主要涉及蛋白质氨基酸的磷酸化、RNA聚合酶II启动子转录调控和DNA依赖的转录调节,参与细胞周期、细胞生长增殖和细胞凋亡,调节功能蛋白结合并与PIP3结合激活下游信号通路。这些功能因子主要富集于MAPK、Wnt、胰岛素和Ras等信号通路,少量因子参与调节细胞周期和脂肪酸代谢等生理过程。结论:2型糖尿病前期患者血清中低水平miR-103b可能是潜在的2型糖尿病早期超前诊断标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 微小RNA-103b 糖尿病前期 受试者工作特征曲线 生物信息学分析
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四川新康温石棉通过活性氧/c-Jun氨基末端激酶(ROS/JNK)通路诱导A549细胞凋亡 被引量:1
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作者 刘琬薰 邓建军 +3 位作者 董发勤 霍婷婷 王玉琳 王利民 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1217-1222,共6页
目的研究活性氧/c-Jun氨基末端激酶(ROS/JNK)途径在四川新康温石棉诱导A549人肺上皮细胞凋亡过程的作用。方法采用(12.5、25、50、100、200)μg/m L温石棉作用A549细胞24 h,MTT法检测细胞存活率;设置ROS抑制组,异硫氰酸荧光素标记的膜... 目的研究活性氧/c-Jun氨基末端激酶(ROS/JNK)途径在四川新康温石棉诱导A549人肺上皮细胞凋亡过程的作用。方法采用(12.5、25、50、100、200)μg/m L温石棉作用A549细胞24 h,MTT法检测细胞存活率;设置ROS抑制组,异硫氰酸荧光素标记的膜联素Ⅴ/碘化丙啶(annexinⅤ-FITC/PI)双染色结合流式细胞术检测细胞凋亡、JC-1标记检测线粒体膜电位、二氯二氢荧光黄乙酰乙酯(DCFH-DA)负载检测ROS水平,Western blot法检测磷酸化的c-JNK1(p-JNK1)、p-JNK2、裂解型胱天蛋白酶3(c-caspase-3)蛋白水平。结果随着温石棉剂量增大,细胞存活率下降,温石棉半数抑制剂量为223.43μg/m L;细胞凋亡率呈现剂量-效应关系,胞内ROS水平升高,p-JNK1、p-JNK2、c-caspase-3蛋白水平明显上调,线粒体膜电位降低;与相同剂量温石棉组比较,ROS抑制剂能显著抑制细胞凋亡,降低ROS水平,减少线粒体膜电位的降低程度,并下调p-JNK1、p-JNK2和c-caspase-3蛋白的表达。结论四川新康温石棉可能通过ROS/JNK途径诱导A549细胞发生凋亡。 展开更多
关键词 温石棉 A549细胞 细胞凋亡 活性氧(ROS) c-Jun氨基末端激酶(JNK)
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基于生物信息学分析铁死亡相关lncRNA对肾透明细胞癌组织免疫浸润和患者预后评估的意义 被引量:3
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作者 扈星 扈亮 +2 位作者 余亭 王茜 张志红 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期237-248,共12页
目的:采用生物信息学方法探索与肾透明细胞癌(ccRCC)组织中铁死亡相关的lncRNA,并探讨其与免疫细胞浸润及患者预后的相关性,为ccRCC患者提供新的分子靶点。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载cc RCC的转录本数据和临床数据,利用单... 目的:采用生物信息学方法探索与肾透明细胞癌(ccRCC)组织中铁死亡相关的lncRNA,并探讨其与免疫细胞浸润及患者预后的相关性,为ccRCC患者提供新的分子靶点。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载cc RCC的转录本数据和临床数据,利用单样本基因集富集分析(ssGSEA)及相关性分析获得与铁死亡相关的lncRNA;通过单因素和多因素回归分析构建与铁死亡相关的lncRNA特征图,分析其与预后的关系;利用R软件分析铁死亡相关lncRNA与肿瘤免疫细胞浸润和药物敏感性之间的关系。构建铁死亡相关RNA网络,并通过qPCR验证中国人ccRCC组织和癌旁组织(取自2019年12月至2021年03月间在西南医科大学附属医院手术切除8例标本)中关键lncRNA的表达。结果:Kaplan-Meier分析表明,铁死亡评分高的患者总OS率低于铁死亡评分低的患者。单因素和多因素回归分析确定11个ccRCC铁死亡相关lncRNA可评估患者预后,并构建ccRCC患者1、3、5年预后预测列线图。免疫细胞浸润分析表明,铁死亡相关lncRNA与ccRCC免疫细胞浸润密切相关,其中LINC01871、PRKAR1B-AS1和CYTOR是调节肿瘤免疫细胞浸润的关键lncRNA。化疗药物敏感性分析表明,高风险患者对甲氨蝶呤、紫杉醇、顺铂和多柔比星更为敏感。构建的包含3个lncRNA、15个miRNA和15个mRNA的RNA网络中,验证实验显示LINC01871、LINC00472和CYTOR在ccRCC组织中显著上调。结论:通过生物信息学方法获得11个与铁死亡相关的lncRNA,证明其与ccRCC组织免疫细胞浸润、化疗药物敏感性和患者预后相关,为探索ccRCC铁死亡相关lncRNA标志物提供重要参考。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 铁死亡 lncRNA 标志物 预后 免疫浸润
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E3泛素连接酶32调控血管平滑肌细胞增殖及迁移的作用机制 被引量:1
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作者 冯菲菲 谷敏 +3 位作者 甘雪晴 李霜 孙雄山 杨大春 《中华老年心脑血管病杂志》 北大核心 2021年第6期642-646,共5页
目的探讨E3泛素连接酶32(Trim32)调控血管平滑肌细胞(VSMC)增殖与迁移的作用机制。方法选择C57雄性野生型小鼠40只,其中10只小鼠从胸主动脉获得VSMC后,分为空白组、对照组、转染组、模型组、对照1组、转染1组和激动剂组(β-catenin激动... 目的探讨E3泛素连接酶32(Trim32)调控血管平滑肌细胞(VSMC)增殖与迁移的作用机制。方法选择C57雄性野生型小鼠40只,其中10只小鼠从胸主动脉获得VSMC后,分为空白组、对照组、转染组、模型组、对照1组、转染1组和激动剂组(β-catenin激动剂同时处理),后4组用重组人血小板衍生生长因子30 mg/L干预24 h,再按分组分别转染阴性干扰siControl和siTrim32,用PCR和Western blot检测各组Trim32、β-catenin mRNA和蛋白表达。观察各组细胞增殖和迁移情况。另30只小鼠左颈动脉损伤处理,取右、左颈动脉分为假手术组、假手术对照组、假手术转染组、损伤组、损伤对照组和损伤转染组,每组10只,按分组处理后,检测Trim32表达和血管内膜增生情况。结果与空白组比较,模型组Trim32 mRNA和蛋白表达升高(1.89±0.30 vs 0.99±0.06,1.82±0.30 vs 1.02±0.05,P<0.01)。与对照组比较,转染组细胞增殖、阳性细胞、β-catenin蛋白表达降低,对照1组各项明显升高(P<0.05,P<0.01),与转染1组比较,对照1组和激动剂组阳性细胞升高(P<0.01)。与假手术组比较,损伤组Trim32 mRNA和蛋白明显升高(P<0.01)。与损伤对照组比较,假手术对照组和损伤转染组内膜/中膜面积比值降低(P<0.01),损伤转染组内膜/中膜面积比值较假手术转染组升高(2.11±0.64 vs 0.37±0.04,P<0.05)。结论Trim32可能通过β-catenin途径促进VSMC增殖及迁移。 展开更多
关键词 平滑 血管 细胞运动 细胞增殖 Β连环素 基因沉默
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