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四川黑熊NADH脱氢酶亚基4基因的序列分析
被引量：
4
1
作者
陈瑜
侯万儒
+2 位作者
吴夏
彭正松
周才权
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期318-320,共3页
目的探讨黑熊线粒体ND4基因的序列特点。方法根据已报道的若干物种的NADH脱氢酶亚基4基因(ND4)设计引物。运用PCR技术从四川黑熊毛囊组织的总DNA中扩增出ND4基因。并对ND4基因进行分析。结果PCR扩增所得DNA序列长度为1402bp,该序列包含...
目的探讨黑熊线粒体ND4基因的序列特点。方法根据已报道的若干物种的NADH脱氢酶亚基4基因(ND4)设计引物。运用PCR技术从四川黑熊毛囊组织的总DNA中扩增出ND4基因。并对ND4基因进行分析。结果PCR扩增所得DNA序列长度为1402bp,该序列包含了ND4基因,其ORF为1377bp,编码459个氨基酸,编码蛋白的分子量为51.5×103,pI为9.37。四川黑熊的ND4基因序列及其所编码的氨基酸序列与美洲黑熊、马来熊、棕熊、北极熊、人、大鼠、小鼠和狗等其他哺乳动物的ND4基因序列和对应的氨基酸序列具有较高的相似性,分别为68%～91%和71%～95%。拓扑结构预测显示四川黑熊ND4基因的蛋白质上分别存在N-糖基化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、N-酰基化位点、亮氨酸拉链以及富含亮氨酸的区域。结论哺乳类动物的ND4基因具较高的保守性,而其所编码的蛋白在功能上具有高度的一致性。
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关键词
四川黑熊
线粒体
ND4基因
分析
进化树
构建
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职称材料
四川黑熊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的克隆及序列分析
被引量：
5
2
作者
吴夏
侯万儒
+1 位作者
陈瑜
周才权
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第3期196-198,共3页
目的探讨四川黑熊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的特征。方法根据已经报道的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochromecoxidasesubunitⅠ,COXⅠ)基因设计引物、PCR扩增和直接测序,并用软件对四川黑熊及其他几个物种的COXⅠ基因序列及COXⅠ...
目的探讨四川黑熊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的特征。方法根据已经报道的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochromecoxidasesubunitⅠ,COXⅠ)基因设计引物、PCR扩增和直接测序,并用软件对四川黑熊及其他几个物种的COXⅠ基因序列及COXⅠ蛋白的氨基酸序列进行了分析。结果四川黑熊COXⅠ基因长1605bp,编码含514个氨基酸残基的前体蛋白。碱基的含量分别为A26.9%,C23.1%,G18.3%,T31.8%。起始密码子为“ATG”,终止密码子为“TAA”。蛋白质等电点为6.29,分子质量为57.2×103。以四川黑熊和已报道的其他6种动物的COXⅠ基因序列为数据构建的分子系统发育树表明在所比较的其他3种熊类中,四川黑熊和美洲黑熊的亲缘关系最近;在牛,狗和大鼠中,四川黑熊与狗的亲缘关系最近。结论四川黑熊COXⅠ基因的DNA序列和蛋白的氨基酸序列和其他动物的相应序列有很高相似性,表明COX基因在所比较的几个物种中具有高度保守性。
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关键词
亚洲黑熊四川亚种
COX
I基因
序列分析
系统发育树
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职称材料
题名
四川黑熊NADH脱氢酶亚基4基因的序列分析
被引量：
4
1
作者
陈瑜
侯万儒
吴夏
彭正松
周才权
机构
西华师范大学生命科学学院遗传学实验室
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期318-320,共3页
基金
国家自然科学基金(30570275)
四川省应用技术项目(2006J13-057)
+2 种基金
四川省教育厅重点科研项目(2004A101)
四川省重点学科建设项目(SZD0420)
西华师范大学科研启动项目(2003)~~
文摘
目的探讨黑熊线粒体ND4基因的序列特点。方法根据已报道的若干物种的NADH脱氢酶亚基4基因(ND4)设计引物。运用PCR技术从四川黑熊毛囊组织的总DNA中扩增出ND4基因。并对ND4基因进行分析。结果PCR扩增所得DNA序列长度为1402bp,该序列包含了ND4基因,其ORF为1377bp,编码459个氨基酸,编码蛋白的分子量为51.5×103,pI为9.37。四川黑熊的ND4基因序列及其所编码的氨基酸序列与美洲黑熊、马来熊、棕熊、北极熊、人、大鼠、小鼠和狗等其他哺乳动物的ND4基因序列和对应的氨基酸序列具有较高的相似性,分别为68%～91%和71%～95%。拓扑结构预测显示四川黑熊ND4基因的蛋白质上分别存在N-糖基化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、N-酰基化位点、亮氨酸拉链以及富含亮氨酸的区域。结论哺乳类动物的ND4基因具较高的保守性,而其所编码的蛋白在功能上具有高度的一致性。
关键词
四川黑熊
线粒体
ND4基因
分析
进化树
构建
Keywords
Asian black bear Sichuan subspecies
mitochondrion
ND4 gene
analysis
phylogenetic tree
construction
分类号
Q343.3 [生物学—遗传学]
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
四川黑熊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的克隆及序列分析
被引量：
5
2
作者
吴夏
侯万儒
陈瑜
周才权
机构
西华师范大学生命科学学院遗传学实验室
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第3期196-198,共3页
基金
国家自然科学基金(30570275)
四川省教育厅重点科研项目(2004A101)
+1 种基金
四川省重点学科建设项目(SZD0420)
西华师范大学科研启动项目(2003)~~
文摘
目的探讨四川黑熊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的特征。方法根据已经报道的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochromecoxidasesubunitⅠ,COXⅠ)基因设计引物、PCR扩增和直接测序,并用软件对四川黑熊及其他几个物种的COXⅠ基因序列及COXⅠ蛋白的氨基酸序列进行了分析。结果四川黑熊COXⅠ基因长1605bp,编码含514个氨基酸残基的前体蛋白。碱基的含量分别为A26.9%,C23.1%,G18.3%,T31.8%。起始密码子为“ATG”,终止密码子为“TAA”。蛋白质等电点为6.29,分子质量为57.2×103。以四川黑熊和已报道的其他6种动物的COXⅠ基因序列为数据构建的分子系统发育树表明在所比较的其他3种熊类中,四川黑熊和美洲黑熊的亲缘关系最近;在牛,狗和大鼠中,四川黑熊与狗的亲缘关系最近。结论四川黑熊COXⅠ基因的DNA序列和蛋白的氨基酸序列和其他动物的相应序列有很高相似性,表明COX基因在所比较的几个物种中具有高度保守性。
关键词
亚洲黑熊四川亚种
COX
I基因
序列分析
系统发育树
Keywords
Asia black bear Sichuan subspecies
cytochrome c oxidase subunit I
sequence
analysis
phylogenetic tree
分类号
Q343.35 [生物学—遗传学]
Q785 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
四川黑熊NADH脱氢酶亚基4基因的序列分析
陈瑜
侯万儒
吴夏
彭正松
周才权
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
4
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职称材料
2
四川黑熊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的克隆及序列分析
吴夏
侯万儒
陈瑜
周才权
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
5
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