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一株具有多位点核苷酸替换的新型猪圆环病毒2d亚型毒株的分离与鉴定
1
作者
陈云龙
樊港
+4 位作者
樊心怡
郭永超
张鑫淼
王妍
张仕强
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第6期3032-3040,共9页
猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)是引起猪圆环病毒相关性疾病(porcine circovirus associated diseases,PCVAD)的主要病原。患病猪表现为发育不良、呼吸困难、生殖障碍等症状。目前,PCV多种亚型在中国流行,给养猪业造成了巨大经济...
猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)是引起猪圆环病毒相关性疾病(porcine circovirus associated diseases,PCVAD)的主要病原。患病猪表现为发育不良、呼吸困难、生殖障碍等症状。目前,PCV多种亚型在中国流行,给养猪业造成了巨大经济损失。为了鉴定一株疑似新型PCV2感染死亡的猪病料,本研究采集疑似PCV感染的病料组织并对病毒进行分离培养,通过PCR,免疫荧光染色和序列测定分析对病毒进行鉴定。并对阳性样品进行全基因组扩增,测序后与GenBank上其他不同国家和地区来源的28株PCV的同源性、系统发育树和重组特性进行分析。使用6周龄BALB/c小鼠模型,感染毒株后观察不同组织病理切片。使用第5代病毒液滴鼻和颈部肌肉注射两种方式感染14周龄健康猪,观察和分析试验猪的体温、增重、病毒血症、各组织病毒载量等评价该毒株的致病性。结果显示,本试验分离到一株PCV2d亚型毒株,命名为SD02,该毒株全基因组大小为1767 bp(GenBank登录号为OQ730503),其中ORF2大小为705 bp,共编码234个氨基酸。SD02相较于其他已报道的PCV2d毒株,在ORF2编码的Cap蛋白羧基末端增加了1个赖氨酸。SD02株与参考毒株基因全序列的核苷酸同源性为94.2%~99.1%,与22625-33毒株(PCV2d)相似性最高,为99.1%。该毒株感染的小鼠出现明显间质性肺炎和坏死性肝炎等症状。该毒株感染后会引起猪消瘦和生长缓慢等现象,病毒血症存在时间超过21 d,并且具有广泛的组织嗜性,其中各淋巴结病毒载量更高,会引起机体的免疫抑制。本研究为PCV流行病学研究和疫苗开发提供了新的参考。
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关键词
猪圆环病毒2型
分离鉴定
遗传变异分析
致病性
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职称材料
牛胚胎角芽组织基因表达特征分析
2
作者
闫茜茜
王伟
+5 位作者
马楠謌
路钰怡
孟凡欣
李洋
刘昊
王禹
《中国牛业科学》
2024年第1期9-13,共5页
[目的] 通过基因表达特征的分析,揭示在形成牛胚胎角芽组织中起关键作用的基因和通路,从而更深入地了解角芽发育过程中的分子机制。[方法] 基于牛胚胎角芽组织、额部皮肤组织、脑、心脏、肾、肝脏、肺、瘤胃、骨骼肌、脾脏的转录组测序...
[目的] 通过基因表达特征的分析,揭示在形成牛胚胎角芽组织中起关键作用的基因和通路,从而更深入地了解角芽发育过程中的分子机制。[方法] 基于牛胚胎角芽组织、额部皮肤组织、脑、心脏、肾、肝脏、肺、瘤胃、骨骼肌、脾脏的转录组测序数据,利用主成分分析(PCA)、差异表达基因分析和基因富集分析来解析角芽组织的基因表达特征。 [结果] 多组织基因表达比较鉴定到810个角芽组织特异高表达基因。主成分分析表明牛胚胎角芽组织与额部皮肤组织的基因表达模式最为相似,但存在1695个显著上调基因(校正p<=0.05), 这些基因功能富集到与神经和骨发育相关的通路。[结论] 从多组织比较、角芽组织和额部皮肤的差异比较两个方面分别鉴定了角芽组织的基因表达特征,角芽组织特异高表达基因富集到骨、神经和皮肤发育相关通路,暗示着角芽组织发育涉及多组织协同,具有复杂的调控机制。
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关键词
牛角芽组织
转录组
基因表达特征
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职称材料
题名
一株具有多位点核苷酸替换的新型猪圆环病毒2d亚型毒株的分离与鉴定
1
作者
陈云龙
樊港
樊心怡
郭永超
张鑫淼
王妍
张仕强
机构
西北农林科技大学
动物医学院/陕西省干细胞工程技术研究中心
西北农林科技大学家畜生物学重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第6期3032-3040,共9页
基金
国家自然科学基金(32072856)
动物基因工程疫苗国家重点实验室开放课题(SKLGEVV-ZD/ZY-2019)
大学生创新创业训练计划项目(202400560A3,202400560AD)。
文摘
猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)是引起猪圆环病毒相关性疾病(porcine circovirus associated diseases,PCVAD)的主要病原。患病猪表现为发育不良、呼吸困难、生殖障碍等症状。目前,PCV多种亚型在中国流行,给养猪业造成了巨大经济损失。为了鉴定一株疑似新型PCV2感染死亡的猪病料,本研究采集疑似PCV感染的病料组织并对病毒进行分离培养,通过PCR,免疫荧光染色和序列测定分析对病毒进行鉴定。并对阳性样品进行全基因组扩增,测序后与GenBank上其他不同国家和地区来源的28株PCV的同源性、系统发育树和重组特性进行分析。使用6周龄BALB/c小鼠模型,感染毒株后观察不同组织病理切片。使用第5代病毒液滴鼻和颈部肌肉注射两种方式感染14周龄健康猪,观察和分析试验猪的体温、增重、病毒血症、各组织病毒载量等评价该毒株的致病性。结果显示,本试验分离到一株PCV2d亚型毒株,命名为SD02,该毒株全基因组大小为1767 bp(GenBank登录号为OQ730503),其中ORF2大小为705 bp,共编码234个氨基酸。SD02相较于其他已报道的PCV2d毒株,在ORF2编码的Cap蛋白羧基末端增加了1个赖氨酸。SD02株与参考毒株基因全序列的核苷酸同源性为94.2%~99.1%,与22625-33毒株(PCV2d)相似性最高,为99.1%。该毒株感染的小鼠出现明显间质性肺炎和坏死性肝炎等症状。该毒株感染后会引起猪消瘦和生长缓慢等现象,病毒血症存在时间超过21 d,并且具有广泛的组织嗜性,其中各淋巴结病毒载量更高,会引起机体的免疫抑制。本研究为PCV流行病学研究和疫苗开发提供了新的参考。
关键词
猪圆环病毒2型
分离鉴定
遗传变异分析
致病性
Keywords
porcine circovirus type 2
isolation and identification
analysis of genetic variation
pathogenicity
分类号
S852.659.2 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
牛胚胎角芽组织基因表达特征分析
2
作者
闫茜茜
王伟
马楠謌
路钰怡
孟凡欣
李洋
刘昊
王禹
机构
西北农林科技大学家畜生物学重点实验室
出处
《中国牛业科学》
2024年第1期9-13,共5页
基金
中国博士后创新人才培养计划项目(K3080220045)。
文摘
[目的] 通过基因表达特征的分析,揭示在形成牛胚胎角芽组织中起关键作用的基因和通路,从而更深入地了解角芽发育过程中的分子机制。[方法] 基于牛胚胎角芽组织、额部皮肤组织、脑、心脏、肾、肝脏、肺、瘤胃、骨骼肌、脾脏的转录组测序数据,利用主成分分析(PCA)、差异表达基因分析和基因富集分析来解析角芽组织的基因表达特征。 [结果] 多组织基因表达比较鉴定到810个角芽组织特异高表达基因。主成分分析表明牛胚胎角芽组织与额部皮肤组织的基因表达模式最为相似,但存在1695个显著上调基因(校正p<=0.05), 这些基因功能富集到与神经和骨发育相关的通路。[结论] 从多组织比较、角芽组织和额部皮肤的差异比较两个方面分别鉴定了角芽组织的基因表达特征,角芽组织特异高表达基因富集到骨、神经和皮肤发育相关通路,暗示着角芽组织发育涉及多组织协同,具有复杂的调控机制。
关键词
牛角芽组织
转录组
基因表达特征
Keywords
Cattle
horn bud
RNA-seq
gene expression characteristics
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一株具有多位点核苷酸替换的新型猪圆环病毒2d亚型毒株的分离与鉴定
陈云龙
樊港
樊心怡
郭永超
张鑫淼
王妍
张仕强
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025
0
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下载PDF
职称材料
2
牛胚胎角芽组织基因表达特征分析
闫茜茜
王伟
马楠謌
路钰怡
孟凡欣
李洋
刘昊
王禹
《中国牛业科学》
2024
0
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职称材料
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