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337份小麦品种籽粒相关性状的全基因组关联分析
被引量:
5
1
作者
席甜甜
吴倩
+5 位作者
杨建光
马新
陈彦竹
李煜
王军卫
马守才
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期547-558,共12页
小麦籽粒大小和形态是决定产量的主要因素之一,挖掘籽粒相关性状的关联位点,筛选相关候选基因为提高小麦产量奠定了重要基础。本研究以337份小麦品种作为研究对象,利用Q+K混合线性模型(MLM)在3个环境(E1:2020年陕西杨凌;E2:2020年陕西斗...
小麦籽粒大小和形态是决定产量的主要因素之一,挖掘籽粒相关性状的关联位点,筛选相关候选基因为提高小麦产量奠定了重要基础。本研究以337份小麦品种作为研究对象,利用Q+K混合线性模型(MLM)在3个环境(E1:2020年陕西杨凌;E2:2020年陕西斗口;E3:2021年陕西杨凌)下对小麦的千粒重、粒长、粒宽以及籽粒长宽比4个性状进行了全基因组关联分析(GWAS)。在3种环境中,不同小麦品种的4个籽粒性状都表现出了广泛的表型差异,变异系数为5.31%~14.76%,其中粒长的变异幅度最小,千粒重的变异幅度最大。GWAS结果表明,49个显著SNP位点至少在2个环境中被检测到,分布在除1B、4A和7D外的染色体上,解释了3.36%~12.73%的表型变异。检测到一因多效位点31个,在5A染色体上检测到3个环境下与3个籽粒性状(千粒重、粒长、粒宽)稳定相关的位点,表型贡献率为3.51%~7.74%。对稳定关联的SNP位点上下游各200 kb的物理区间内进行候选基因挖掘,筛选到5个(TraesCS2B01G225400、TraesCS4D01G016900、TraesCS5A01G454100、TraesCS5B01G459500、TraesCS6B01G064000)可能与小麦籽粒性状相关的基因,分布在2B、4D、5A、5B和6B染色体上。
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关键词
小麦
全基因组关联分析
籽粒性状
SNP
候选基因
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职称材料
小麦隐性核不育保持系表达载体的构建及拟南芥遗传转化
2
作者
高聪
李紫良
+7 位作者
胡甘
张建朝
冯小雨
牛娜
宋瑜龙
马守才
刘东涛
王军卫
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期669-676,共8页
利用小麦杂种优势能够创制稳定的雄性不育系。相比于细胞质雄性不育系和光温敏雄性不育系,细胞核雄性不育具有育性稳定、易恢复、不受环境影响等特点。小麦隐性核不育基因ms1的克隆以及杂交制种技术(hybridseedproductiontechnology,SPT...
利用小麦杂种优势能够创制稳定的雄性不育系。相比于细胞质雄性不育系和光温敏雄性不育系,细胞核雄性不育具有育性稳定、易恢复、不受环境影响等特点。小麦隐性核不育基因ms1的克隆以及杂交制种技术(hybridseedproductiontechnology,SPT)的开发,为雄性不育的保持和杂种优势利用奠定了基础。本研究将小麦花粉育性恢复基因Ms1、花粉致死基因ZmAA1、红色荧光蛋白基因DsRed2及其特异性启动子和终止子连接到表达载体pGEII上,转化野生型拟南芥,得到6株转基因拟南芥。通过荧光显微镜观察拟南芥种子,发现野生型拟南芥种子表面平滑,不能发出红色荧光;而转基因种子表面呈现颗粒状,能够发出红色荧光。这说明表达载体构建成功,并能够在拟南芥中成功表达。这为创制人工小麦隐性核不育系奠定了理论和材料基础。
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关键词
小麦
隐性核不育系
MS1
载体构建
基因工程
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职称材料
题名
337份小麦品种籽粒相关性状的全基因组关联分析
被引量:
5
1
作者
席甜甜
吴倩
杨建光
马新
陈彦竹
李煜
王军卫
马守才
机构
西北农林科技大学农学院/小麦育种教育部工程研究中心/陕西省作物杂种优势研究与利用重点实验室
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期547-558,共12页
基金
陕西省重点研发计划项目(2023-YBNY-024,2023-YBNY-021)
陕西省作物杂种优势研究与利用重点实验室后补助项目(2018SZS-22)
+1 种基金
西安市科技计划项目(23NYGG0021)
“两链”融合专项“小麦种业创新工程项目”(K3031222158)。
文摘
小麦籽粒大小和形态是决定产量的主要因素之一,挖掘籽粒相关性状的关联位点,筛选相关候选基因为提高小麦产量奠定了重要基础。本研究以337份小麦品种作为研究对象,利用Q+K混合线性模型(MLM)在3个环境(E1:2020年陕西杨凌;E2:2020年陕西斗口;E3:2021年陕西杨凌)下对小麦的千粒重、粒长、粒宽以及籽粒长宽比4个性状进行了全基因组关联分析(GWAS)。在3种环境中,不同小麦品种的4个籽粒性状都表现出了广泛的表型差异,变异系数为5.31%~14.76%,其中粒长的变异幅度最小,千粒重的变异幅度最大。GWAS结果表明,49个显著SNP位点至少在2个环境中被检测到,分布在除1B、4A和7D外的染色体上,解释了3.36%~12.73%的表型变异。检测到一因多效位点31个,在5A染色体上检测到3个环境下与3个籽粒性状(千粒重、粒长、粒宽)稳定相关的位点,表型贡献率为3.51%~7.74%。对稳定关联的SNP位点上下游各200 kb的物理区间内进行候选基因挖掘,筛选到5个(TraesCS2B01G225400、TraesCS4D01G016900、TraesCS5A01G454100、TraesCS5B01G459500、TraesCS6B01G064000)可能与小麦籽粒性状相关的基因,分布在2B、4D、5A、5B和6B染色体上。
关键词
小麦
全基因组关联分析
籽粒性状
SNP
候选基因
Keywords
Wheat
Genome-wide association studies
Grain traits
SNP
Candidate genes
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
小麦隐性核不育保持系表达载体的构建及拟南芥遗传转化
2
作者
高聪
李紫良
胡甘
张建朝
冯小雨
牛娜
宋瑜龙
马守才
刘东涛
王军卫
机构
西北农林科技大学农学院/小麦育种教育部工程研究中心/陕西省作物杂种优势研究与利用重点实验室
江苏徐淮地区徐州农业科学
研究
所
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期669-676,共8页
基金
陕西省作物杂种优势研究与利用重点实验室后补助项目(No.2018SZS-22)
徐州市重点研发(现代农业)计划项目(KC20036)。
文摘
利用小麦杂种优势能够创制稳定的雄性不育系。相比于细胞质雄性不育系和光温敏雄性不育系,细胞核雄性不育具有育性稳定、易恢复、不受环境影响等特点。小麦隐性核不育基因ms1的克隆以及杂交制种技术(hybridseedproductiontechnology,SPT)的开发,为雄性不育的保持和杂种优势利用奠定了基础。本研究将小麦花粉育性恢复基因Ms1、花粉致死基因ZmAA1、红色荧光蛋白基因DsRed2及其特异性启动子和终止子连接到表达载体pGEII上,转化野生型拟南芥,得到6株转基因拟南芥。通过荧光显微镜观察拟南芥种子,发现野生型拟南芥种子表面平滑,不能发出红色荧光;而转基因种子表面呈现颗粒状,能够发出红色荧光。这说明表达载体构建成功,并能够在拟南芥中成功表达。这为创制人工小麦隐性核不育系奠定了理论和材料基础。
关键词
小麦
隐性核不育系
MS1
载体构建
基因工程
Keywords
Wheat
Recessive male sterile line
Msb,Vector construction
Genetic engineering
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
337份小麦品种籽粒相关性状的全基因组关联分析
席甜甜
吴倩
杨建光
马新
陈彦竹
李煜
王军卫
马守才
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
小麦隐性核不育保持系表达载体的构建及拟南芥遗传转化
高聪
李紫良
胡甘
张建朝
冯小雨
牛娜
宋瑜龙
马守才
刘东涛
王军卫
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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