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基于网络药理学和分子对接探究丹参治疗血淤证的分子机制
1
作者
周迎晨
封彦飞
+3 位作者
田诗旸
郭婷婷
边巴卓玛
刘迎秋
《动物医学进展》
北大核心
2025年第8期51-57,共7页
通过网络药理学和分子对接的方法,探究丹参治疗血淤证的分子机制。首先通过TCMSP和ETCM数据库对丹参的活性成分丹参酮ⅡA(TⅡA)、隐丹参酮(CT)、丹酚酸A(SAA)、丹酚酸B(SAB)、丹参酮Ⅰ(TⅠ)和二氢丹参酮Ⅰ(DⅠ)的靶点进行检索,再用STRIN...
通过网络药理学和分子对接的方法,探究丹参治疗血淤证的分子机制。首先通过TCMSP和ETCM数据库对丹参的活性成分丹参酮ⅡA(TⅡA)、隐丹参酮(CT)、丹酚酸A(SAA)、丹酚酸B(SAB)、丹参酮Ⅰ(TⅠ)和二氢丹参酮Ⅰ(DⅠ)的靶点进行检索,再用STRING数据库、Cystoscape软件等进行靶点的筛选。然后用GO分析、KEGG富集分析和分子对接的方法,预测丹参的活性成分在治疗血淤证过程中出现的生物学过程、代谢通路和各活性成分与其靶点的结合活性。对检索到的丹参的活性成分的靶点进行GO功能富集分析,结果显示与血淤证相关的生物过程是血管内皮生长刺激因子的细胞反应和血管内皮生长因子受体信号通路;与血淤证相关的细胞组分是血小板α颗粒区、富ficolin-1颗粒区和血液微粒;与血淤证相关的分子功能是一氧化氮合酶调节活性功能。KEGG通路富集分析共富集到3条通路,其中与血淤证相关的通路是血小板激活通路。分子对接结果显示,TⅡA、CT、SAA和SAB与靶点p38和ERK紧密结合,SAA、SAB和DⅠ与靶点SRC紧密结合。研究证明丹参的活性成分可以通过靶点p38、ERK和SRC抑制血小板聚集从而治疗血淤证。
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关键词
网络药理学
分子对接
丹参
血淤证
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职称材料
基于网络药理学探究三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓的潜在位点分析
2
作者
田诗旸
刘欣瑜
+4 位作者
边巴卓玛
范云鹏
麻武仁
张为民
刘迎秋
《动物医学进展》
北大核心
2024年第7期88-94,共7页
为探讨三七中活性成分三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓疾病的作用机制,通过Swiss Target Prediction、Super-pred、BindingDB数据库检索三七Ft1、Fc靶点,在OMIM、Gene Cards、Drug Bank数据库中检索与血栓疾病发生相关靶点,借助Venny网站和STR...
为探讨三七中活性成分三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓疾病的作用机制,通过Swiss Target Prediction、Super-pred、BindingDB数据库检索三七Ft1、Fc靶点,在OMIM、Gene Cards、Drug Bank数据库中检索与血栓疾病发生相关靶点,借助Venny网站和STRING数据库建立靶蛋白互作网络模型,使用Centiscape 2.2进行拓扑参数分析,并且对三七Ft1和Fc核心靶点进行GO、KEGG通路富集分析,最后进行分子对接验证。结果表明,三七皂苷Ft1、Fc分别有90和149个预测靶点,4303个与血栓疾病发生相关靶点,维恩图分析核心靶点分别为14和18个,其中三七Ft1与其核心靶点STAT3、VEGFA、HSP90AA1紧密结合,三七Fc与其核心靶点STAT3、VEGFA、CXCR4紧密结合。基于网络药理学,探讨三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓多靶点和多途径的特性,为三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓疾病的研究提供了新思路。
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关键词
三七皂苷Ft1
三七皂苷Fc
网络药理学
血栓疾病
血栓
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探究丹参治疗血淤证的分子机制
1
作者
周迎晨
封彦飞
田诗旸
郭婷婷
边巴卓玛
刘迎秋
机构
西北农林科技大学
动物医学院
西北农林科技大学中兽医药研究所
出处
《动物医学进展》
北大核心
2025年第8期51-57,共7页
基金
陕西省农业关键核心技术攻关项目(2024NYGG005)。
文摘
通过网络药理学和分子对接的方法,探究丹参治疗血淤证的分子机制。首先通过TCMSP和ETCM数据库对丹参的活性成分丹参酮ⅡA(TⅡA)、隐丹参酮(CT)、丹酚酸A(SAA)、丹酚酸B(SAB)、丹参酮Ⅰ(TⅠ)和二氢丹参酮Ⅰ(DⅠ)的靶点进行检索,再用STRING数据库、Cystoscape软件等进行靶点的筛选。然后用GO分析、KEGG富集分析和分子对接的方法,预测丹参的活性成分在治疗血淤证过程中出现的生物学过程、代谢通路和各活性成分与其靶点的结合活性。对检索到的丹参的活性成分的靶点进行GO功能富集分析,结果显示与血淤证相关的生物过程是血管内皮生长刺激因子的细胞反应和血管内皮生长因子受体信号通路;与血淤证相关的细胞组分是血小板α颗粒区、富ficolin-1颗粒区和血液微粒;与血淤证相关的分子功能是一氧化氮合酶调节活性功能。KEGG通路富集分析共富集到3条通路,其中与血淤证相关的通路是血小板激活通路。分子对接结果显示,TⅡA、CT、SAA和SAB与靶点p38和ERK紧密结合,SAA、SAB和DⅠ与靶点SRC紧密结合。研究证明丹参的活性成分可以通过靶点p38、ERK和SRC抑制血小板聚集从而治疗血淤证。
关键词
网络药理学
分子对接
丹参
血淤证
Keywords
Network pharmacology
Molecular docking
Salvia miltiorrhiza
Blood stasis syndrome
分类号
S853.7 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
基于网络药理学探究三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓的潜在位点分析
2
作者
田诗旸
刘欣瑜
边巴卓玛
范云鹏
麻武仁
张为民
刘迎秋
机构
西北农林科技大学
动物医学院/
西北农林科技大学中兽医药研究所
出处
《动物医学进展》
北大核心
2024年第7期88-94,共7页
基金
国家自然科学基金青年项目(31802230)。
文摘
为探讨三七中活性成分三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓疾病的作用机制,通过Swiss Target Prediction、Super-pred、BindingDB数据库检索三七Ft1、Fc靶点,在OMIM、Gene Cards、Drug Bank数据库中检索与血栓疾病发生相关靶点,借助Venny网站和STRING数据库建立靶蛋白互作网络模型,使用Centiscape 2.2进行拓扑参数分析,并且对三七Ft1和Fc核心靶点进行GO、KEGG通路富集分析,最后进行分子对接验证。结果表明,三七皂苷Ft1、Fc分别有90和149个预测靶点,4303个与血栓疾病发生相关靶点,维恩图分析核心靶点分别为14和18个,其中三七Ft1与其核心靶点STAT3、VEGFA、HSP90AA1紧密结合,三七Fc与其核心靶点STAT3、VEGFA、CXCR4紧密结合。基于网络药理学,探讨三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓多靶点和多途径的特性,为三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓疾病的研究提供了新思路。
关键词
三七皂苷Ft1
三七皂苷Fc
网络药理学
血栓疾病
血栓
Keywords
notoginsenoside Ft1
notoginsenoside Fc
network pharmacology
thrombotic diseases
thrombus
分类号
S853.74 [农业科学—临床兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接探究丹参治疗血淤证的分子机制
周迎晨
封彦飞
田诗旸
郭婷婷
边巴卓玛
刘迎秋
《动物医学进展》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
基于网络药理学探究三七皂苷Ft1和Fc治疗血栓的潜在位点分析
田诗旸
刘欣瑜
边巴卓玛
范云鹏
麻武仁
张为民
刘迎秋
《动物医学进展》
北大核心
2024
0
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