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白头翁皂苷D通过多靶点和多途径抑制三阴性乳腺癌侵袭转移
1
作者
褚乔
王小娜
+5 位作者
续佳颖
彭荟林
赵裕琳
张静
陆国玉
王恺
《南方医科大学学报》
北大核心
2025年第1期150-161,共12页
目的采用网络药理学和计算机模拟探讨白头翁皂苷D(PSD)抑制三阴性乳腺癌(TNBC)侵袭转移的作用机制,并进行实验验证。方法运用Super-PRED、Swiss Target Prediction、PharmMapper、STITCH和BATMAN-TCM数据库收集PSD潜在靶点,利用GeneCard...
目的采用网络药理学和计算机模拟探讨白头翁皂苷D(PSD)抑制三阴性乳腺癌(TNBC)侵袭转移的作用机制,并进行实验验证。方法运用Super-PRED、Swiss Target Prediction、PharmMapper、STITCH和BATMAN-TCM数据库收集PSD潜在靶点,利用GeneCards和OMIM数据库获得TNBC侵袭转移靶点,将两者相交获得药物-疾病交集靶点,利用Cytoscape3.10.1软件绘制“PSD-靶点-疾病”互作网络。运用Cytoscape3.10.1中的Centiscape2.2插件设定阈值并获得核心靶点,使用String数据库进行蛋白质互作(PPI)分析,通过David数据库对核心靶点进行KEGG通路和GO功能富集分析。最后将核心靶点依次与PSD进行分子对接。通过Transwell和Western blotting法对PSD的作用及机制进行验证。结果网络药理学结果显示,共筛选出PSD潜在靶点285个及药物与疾病核心靶点26个。GO分析获得175个条目,涉及生物大分子(蛋白质、DNA、RNA)的结合、酶活性、基因转录调控等方面。KEGG分析获得46个条目,涉及癌症途径、化学致癌-受体活化、癌症中的微小RNA、化学致癌-活性氧、癌症中PD-L1表达和PD-1检查点通路等。分子对接显示,PSD与MTOR、HDAC2、ABL1、CDK1、TLR4、TERT、PIK3R1、NFE2L2、PTPN1有较高的结合性。Transwell和Western blotting结果显示,PSD抑制TNBC细胞侵袭迁移且降低其MMP2、MMP9、N-cadherin及关键蛋白p-mTOR、ABL1、TERT、PTPN1、HDAC2、PIK3R1、CDK1、TLR4和细胞核内NFE2L2的表达(P<0.05),PSD可通过这些靶点阻碍TNBC侵袭转移。结论PSD通过多靶点和多途径抑制TNBC侵袭转移,为后续深入的机制研究提供前期基础,为TNBC药物研发提供新思路。
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关键词
白头翁皂苷D
网络药理学
分子对接
三阴性乳腺癌
侵袭
转移
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职称材料
题名
白头翁皂苷D通过多靶点和多途径抑制三阴性乳腺癌侵袭转移
1
作者
褚乔
王小娜
续佳颖
彭荟林
赵裕琳
张静
陆国玉
王恺
机构
蚌埠
医科大学
第一
附属
医院
急诊内科
蚌埠市第一人民医院整形外科
西南医科大学医学基础研究中心
出处
《南方医科大学学报》
北大核心
2025年第1期150-161,共12页
基金
四川省科技厅项目(2023NSFSC0741)
国家级大学生创新创业训练项目(202310632039)。
文摘
目的采用网络药理学和计算机模拟探讨白头翁皂苷D(PSD)抑制三阴性乳腺癌(TNBC)侵袭转移的作用机制,并进行实验验证。方法运用Super-PRED、Swiss Target Prediction、PharmMapper、STITCH和BATMAN-TCM数据库收集PSD潜在靶点,利用GeneCards和OMIM数据库获得TNBC侵袭转移靶点,将两者相交获得药物-疾病交集靶点,利用Cytoscape3.10.1软件绘制“PSD-靶点-疾病”互作网络。运用Cytoscape3.10.1中的Centiscape2.2插件设定阈值并获得核心靶点,使用String数据库进行蛋白质互作(PPI)分析,通过David数据库对核心靶点进行KEGG通路和GO功能富集分析。最后将核心靶点依次与PSD进行分子对接。通过Transwell和Western blotting法对PSD的作用及机制进行验证。结果网络药理学结果显示,共筛选出PSD潜在靶点285个及药物与疾病核心靶点26个。GO分析获得175个条目,涉及生物大分子(蛋白质、DNA、RNA)的结合、酶活性、基因转录调控等方面。KEGG分析获得46个条目,涉及癌症途径、化学致癌-受体活化、癌症中的微小RNA、化学致癌-活性氧、癌症中PD-L1表达和PD-1检查点通路等。分子对接显示,PSD与MTOR、HDAC2、ABL1、CDK1、TLR4、TERT、PIK3R1、NFE2L2、PTPN1有较高的结合性。Transwell和Western blotting结果显示,PSD抑制TNBC细胞侵袭迁移且降低其MMP2、MMP9、N-cadherin及关键蛋白p-mTOR、ABL1、TERT、PTPN1、HDAC2、PIK3R1、CDK1、TLR4和细胞核内NFE2L2的表达(P<0.05),PSD可通过这些靶点阻碍TNBC侵袭转移。结论PSD通过多靶点和多途径抑制TNBC侵袭转移,为后续深入的机制研究提供前期基础,为TNBC药物研发提供新思路。
关键词
白头翁皂苷D
网络药理学
分子对接
三阴性乳腺癌
侵袭
转移
Keywords
Pulsatilla saponin D
network pharmacology
molecular docking
triple negative breast cancer
invasion
metastasis
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
白头翁皂苷D通过多靶点和多途径抑制三阴性乳腺癌侵袭转移
褚乔
王小娜
续佳颖
彭荟林
赵裕琳
张静
陆国玉
王恺
《南方医科大学学报》
北大核心
2025
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