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鼻咽癌基因表达谱的免疫细胞浸润特征分析及临床意义被引量：6: 1; 作者杨月张培培 +1 位作者张浩轩陆进《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期1069-1075,共7页; 目的分析鼻咽癌(NPC)基因表达谱的免疫细胞浸润特征及临床意义。方法首先从基因表达数据集(GEO)下载NPC基因表达谱数据,并利用肿瘤免疫细胞浸润分析软件CIBERSORT的R软件包分析NPC中22种免疫细胞的浸润情况;其次,利用GEO2R筛选差异基因... 展开更多; 关键词鼻咽癌免疫浸润肿瘤微环境基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

miR-141-3p通过促进波形蛋白表达增强CNE-2人鼻咽癌细胞的增殖、侵袭和迁移被引量：4: 2; 作者孙哲周兰柱 +1 位作者吴俊王文忠《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期63-69,共7页; 目的探讨微小RNA 141-3p(miR-141-3p)能否通过调节波形蛋白(vimentin)促进CNE-2人鼻咽癌(NPC)细胞的迁移。方法实时定量PCR检测NPC组织和癌旁组织miR-141-3p表达,免疫组织化学染色法和Western blot法检测vimentin的表达水平。采用实时定... 展开更多; 关键词鼻咽癌 miR-141-3p 上皮间质转化(EMT) VIMENTIN 细胞侵袭细胞迁移; 在线阅读下载PDF 职称材料

垂体瘤转化基因1(PTTG1)在肝细胞癌组织高表达且与预后不良相关被引量：4: 3; 作者陶恒杨月 +1 位作者陈洁陆进《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期337-343,共7页; 目的分析垂体瘤转化基因1(PTTG1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床预后意义。方法首先利用肿瘤生存(Tumorsurvival)和肝细胞癌整合分子数据库(HCCDB)分析HCC组织PTTG1及其共表达基因的表达情况;再利用cBioPortal、MetaScape和Kaplan-Mei... 展开更多; 关键词垂体瘤转化基因1(PTTG1) 总体生存肝细胞癌; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于机器学习鼻咽癌关键特征基因筛选及其与免疫细胞相关性分析: 4; 作者张浩轩马俊杰 +3 位作者安韶光荀丽雪陆进蒋成义《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期988-995,共8页; 目的利用机器学习法筛选鼻咽癌(NPC)关键特征基因并分析其与免疫细胞相关性。方法从基因表达数据集(GEO)下载NPC训练集数据GSE12452与GSE13597以及验证训练集数据GSE53819。首先,对训练集数据进行合并,并筛选差异表达基因(DEG);其次,对... 展开更多; 关键词鼻咽癌机器学习免疫细胞浸润支持向量机; 在线阅读下载PDF 职称材料

AcCystatin减轻卵清蛋白诱导的小鼠变应性鼻炎病变和促炎细胞因子分泌被引量：6: 5; 作者王黎源袁圆 +12 位作者王伟李徽徽吴玥李坤龙李丁茹徐宇梁金宝郑欣王娅王馨徐伟孙永诚杨小迪《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期391-395,共5页; 目的观察广州管圆线虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂(AcCystatin)对卵清蛋白(OVA)诱导的变应性鼻炎小鼠的影响。方法将24只8周龄雌性BALB/c小鼠随机分为空白对照组、OVA变应性鼻炎致敏组和AcCystatin治疗组。OVA组以OVA为变应原,氢氧化铝为佐剂... 展开更多; 关键词变应性鼻炎广州管圆线虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂(AcCystatin) 卵清蛋白细胞因子; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名鼻咽癌基因表达谱的免疫细胞浸润特征分析及临床意义被引量：6: 1; 作者杨月张培培张浩轩陆进; 机构蚌埠医学院第一附属医院耳鼻喉科蚌埠医学院组织移植安徽省重点实验室蚌埠医学院人体解剖学教研室; 出处《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期1069-1075,共7页; 基金安徽省教育厅自然科学研究重点项目(KJ2018A0236,KJ2019A0338)。; 文摘目的分析鼻咽癌(NPC)基因表达谱的免疫细胞浸润特征及临床意义。方法首先从基因表达数据集(GEO)下载NPC基因表达谱数据,并利用肿瘤免疫细胞浸润分析软件CIBERSORT的R软件包分析NPC中22种免疫细胞的浸润情况;其次,利用GEO2R筛选差异基因,并通过R Studio对差异基因进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析;然后再分别利用STRING数据库绘制蛋白质相互作用(PPI)网络图以及Cytoscape软件的Degree算法筛选关键基因;最后分析关键基因在NPC中的表达和临床意义以及与免疫细胞之间的关系。结果NPC中M0型巨噬细胞、M1型巨噬细胞和γδT细胞等表达水平虽有增高,但差异不显著;而B记忆细胞和静息CD4+T记忆细胞表达减少,且差异显著。NPC中单核细胞与嗜酸性粒细胞(r=0.99)、浆细胞与调节性T细胞(r=0.88)、活化的肥大细胞与活化的树突状细胞(r=0.75)等呈正相关,而M1型巨噬细胞与B记忆细胞(r=-0.71)和活化的CD4+T记忆细胞(r=-0.63)呈负相关。此外,NPC差异基因的GO主要富集在与纤毛运动有关的功能上,KEGG主要富集在与细胞色素P450有关的通路上;卷曲螺旋结构域39(CCDC39)是NPC的关键基因,在NPC中高表达,且有利于患者的预后,而B记忆细胞的低表达不利于患者的预后。结论NPC微环境中分布大量免疫细胞,不同类型免疫细胞的表达有差异,但以B记忆细胞对NPC患者的预后影响最显著。; 关键词鼻咽癌免疫浸润肿瘤微环境基因; Keywords nasopharyngeal carcinoma immune infiltration tumor microenvironment gene; 分类号 R739.62 [医药卫生—肿瘤] R730.3 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名miR-141-3p通过促进波形蛋白表达增强CNE-2人鼻咽癌细胞的增殖、侵袭和迁移被引量：4: 2; 作者孙哲周兰柱吴俊王文忠; 机构蚌埠医学院第一附属医院耳鼻喉科; 出处《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期63-69,共7页; 基金安徽省高校自然科学研究重点项目(KJ2020A0568,KJ2020A0590); 文摘目的探讨微小RNA 141-3p(miR-141-3p)能否通过调节波形蛋白(vimentin)促进CNE-2人鼻咽癌(NPC)细胞的迁移。方法实时定量PCR检测NPC组织和癌旁组织miR-141-3p表达,免疫组织化学染色法和Western blot法检测vimentin的表达水平。采用实时定量PCR和Western blot法分别筛选5-8F、CNE-2、HNE1人NPC细胞中miR-141-3p相对表达量最高的细胞株,实时定量PCR和Western blot法共同验证miR-141-3p与vimentin表达关系;采用小干涉RNA(si-miR-141-3p)下调CNE-2细胞miR-141-3p、噻唑蓝(MTT)法检测细胞增殖抑制率、Transwell^(TM)小室法检测细胞侵袭和迁移、Western blot法检测vimentin表达量。结果与癌旁组织相比,NPC组织中miR-141-3p和vimentin表达量均显著增加,与NP69细胞相比,miR-141-3p和vimentin在CNE-2细胞中表达均显著增加;下调CNE-2细胞中miR-141-3p后,细胞侵袭和迁移能力均下降,细胞增殖能力显著降低,vimentin蛋白表达量显著降低。结论miR-141-3p能够通过促进vimentin表达增强CNE-2细胞的增殖和迁移。; 关键词鼻咽癌 miR-141-3p 上皮间质转化(EMT) VIMENTIN 细胞侵袭细胞迁移; Keywords nasopharyngeal carcinoma miR-141-3p epithelial-mesenchymal transition(EMT) vimentin invasion migration; 分类号 Q279 [生物学—细胞生物学] R739.6 [医药卫生—肿瘤] R766.3 [医药卫生—耳鼻咽喉科] R392-33 [医药卫生—免疫学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名垂体瘤转化基因1(PTTG1)在肝细胞癌组织高表达且与预后不良相关被引量：4: 3; 作者陶恒杨月陈洁陆进; 机构蚌埠医学院人体解剖学教研室蚌埠医学院组织移植安徽省重点实验室蚌埠医学院第一附属医院耳鼻喉科蚌埠医学院诊断学教研室; 出处《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期337-343,共7页; 基金安徽省教育厅自然科学研究重点项目(KJ2019A0338)。; 文摘目的分析垂体瘤转化基因1(PTTG1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床预后意义。方法首先利用肿瘤生存(Tumorsurvival)和肝细胞癌整合分子数据库(HCCDB)分析HCC组织PTTG1及其共表达基因的表达情况;再利用cBioPortal、MetaScape和Kaplan-Meier Plotter数据库分析PTTG1基因在HCC中共表达基因的突变、基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集情况,并分析共表达基因对HCC患者总体生存(OS)的影响;最后利用肿瘤免疫评估资源库(TIMER)数据库分析PTTG1基因在HCC免疫微环境中的表达及与免疫细胞的关系,并分析各种免疫细胞对HCC患者OS的影响。结果PTTG1基因在HCC组织中高表达,且不利于HCC患者的OS;PTTG1基因在HCC中有19个显著共表达基因,并且其共表达基因在HCC中也高表达,同样不利于HCC患者的OS;PTTG1基因及其共表达基因的GO功能主要富集在细胞分裂、有丝核分裂和蛋白激酶结合等功能上,而KEGG富集在细胞循环、p53信号通路和人类嗜T细胞病毒(HTLV)感染等通路上;PTTG1及其共表达基因在HCC中均发生一定的突变,并显著缩短HCC患者的OS和DFS;PTTG1基因在HCC免疫微环境中与各种免疫细胞的表达正相关,但各种免疫细胞的表达同样也不利于HCC患者的OS。结论PTTG1高表达不利于HCC患者的生存预后。; 关键词垂体瘤转化基因1(PTTG1) 总体生存肝细胞癌; Keywords pituitary tumor transforming gene 1(PTTG1) overall survival hepatocellular carcinoma; 分类号 Q811.4 [生物学—生物工程] R392.1 [医药卫生—免疫学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于机器学习鼻咽癌关键特征基因筛选及其与免疫细胞相关性分析: 4; 作者张浩轩马俊杰安韶光荀丽雪陆进蒋成义; 机构蚌埠医学院人体解剖学教研室蚌埠医学院数字医学与智慧健康安徽省重点实验室蚌埠医学院临床医学院蚌埠医学院第一附属医院耳鼻喉科; 出处《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期988-995,共8页; 基金安徽省教育厅自然科学研究重点项目(KJ2020A0553) 2022年国家级大学生创新训练项目(202210367002) 安徽省重点研究与开发计划人口健康专项(202104j00005)。; 文摘目的利用机器学习法筛选鼻咽癌(NPC)关键特征基因并分析其与免疫细胞相关性。方法从基因表达数据集(GEO)下载NPC训练集数据GSE12452与GSE13597以及验证训练集数据GSE53819。首先,对训练集数据进行合并,并筛选差异表达基因(DEG);其次,对DEG进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因集富集分析(GSEA)以及免疫细胞浸润分析;再次,采用最小绝对收缩选择(LASSO)算法和支持向量机(SVM)算法对训练集数据中NPC相关特征基因进行识别并在验证集中检验,同时利用受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)确定关键特征基因;最后,分析关键特征基因与免疫细胞的相关性。结果共得到55个DEG,43个下调基因,12个上调基因;其GO功能主要富集在体液免疫反应、细胞分化、中性粒细胞激活以及趋化因子受体结合等方面;而KEGG主要富集在细胞介素17(IL-17)信号通路上;GSEA富集在细胞周期、细胞外基质受体相互作用、癌症通路以及DNA复制。免疫细胞浸润分析显示,初始B细胞、记忆B细胞以及CD4+静息记忆细胞在NPC显著降低,而CD8+T细胞、CD4+初始T细胞、活化CD4+记忆T细胞、滤泡辅助T细胞、M0和M1巨噬细胞在NPC显著增加。通过LASSO和SVM筛选的特征基因中,仅卷曲螺旋结构域19(CCDC19)、层连蛋白β1亚基(LAMB1)、精子相关抗原6(SPAG6)和RAD51相关蛋白1(RAD51AP1)四个关键特征基因ROC的AUC在训练集与验证集均大于0.9,且与免疫细胞浸润密切相关。结论通过机器学习算法筛选出NPC发生过程中的关键特征基因CCDC19、LAMB1、SPAG6以及RAD51AP1,并与免疫细胞浸润密切相关。; 关键词鼻咽癌机器学习免疫细胞浸润支持向量机; Keywords nasopharyngeal carcinoma(NPC) machine learning immune cell infiltration support vector machine(SVM); 分类号 R766.3 [医药卫生—耳鼻咽喉科] R392.2 [医药卫生—免疫学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名AcCystatin减轻卵清蛋白诱导的小鼠变应性鼻炎病变和促炎细胞因子分泌被引量：6: 5; 作者王黎源袁圆王伟李徽徽吴玥李坤龙李丁茹徐宇梁金宝郑欣王娅王馨徐伟孙永诚杨小迪; 机构蚌埠医学院基础医学院安徽省感染与免疫重点实验室蚌埠医学院第一附属医院耳鼻喉科; 出处《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期391-395,共5页; 基金国家自然科学基金(81441120) 国家级大学生创新创业计划(201910367051,201910367002,201910367021) +2 种基金蚌埠医学院科技发展基金(BYKF1853)。; 文摘目的观察广州管圆线虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂(AcCystatin)对卵清蛋白(OVA)诱导的变应性鼻炎小鼠的影响。方法将24只8周龄雌性BALB/c小鼠随机分为空白对照组、OVA变应性鼻炎致敏组和AcCystatin治疗组。OVA组以OVA为变应原,氢氧化铝为佐剂进行腹腔注射,第15天后OVA滴鼻建立小鼠AR模型;AcCystatin组在致敏时腹腔注射30μg AcCystatin,并在第15天后将含有OVA的混悬液中溶入AcCystatin滴鼻治疗;对照组均以PBS替代OVA。末次滴鼻激发后,按照生物学评分标准对3组小鼠的症状进行评分,HE染色观察小鼠鼻黏膜的病变情况,ELISA检测小鼠血清OVA-IgE、白细胞介素4(IL-4)、IL-5、IL-6、IL-10和γ干扰素(IFN-γ)的分泌水平。结果与对照组相比,OVA组小鼠生物学评分明显增加,AcCystatin组小鼠生物学评分较OVA组明显降低。镜下观察OVA组小鼠鼻黏膜纤毛明显脱落,杯状细胞增生,基底膜增厚、组织水肿且黏膜下小血管扩张,而AcCystatin组小鼠鼻黏膜病变明显减轻。同时OVA组血清中OVA-IgE、IL-4、IL-5、IL-6水平较对照组明显升高,IL-10水平降低;与OVA组相比,AcCystatin组OVA-IgE、IL-4、IL-5、IL-6和IL-10水平显著降低。结论AcCystatin减轻OVA诱导的小鼠变应性鼻炎病变和炎性细胞因子分泌。; 关键词变应性鼻炎广州管圆线虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂(AcCystatin) 卵清蛋白细胞因子; Keywords allergic rhinitis Angiostrongylus cantonensis Cystatin(AcCystatin) ovalbumin cytokine; 分类号 R765.21 [医药卫生—耳鼻咽喉科] R392.12 [医药卫生—免疫学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	鼻咽癌基因表达谱的免疫细胞浸润特征分析及临床意义	杨月张培培张浩轩陆进	《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2020	6	在线阅读下载PDF 职称材料
2	miR-141-3p通过促进波形蛋白表达增强CNE-2人鼻咽癌细胞的增殖、侵袭和迁移	孙哲周兰柱吴俊王文忠	《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2023	4	在线阅读下载PDF 职称材料
3	垂体瘤转化基因1(PTTG1)在肝细胞癌组织高表达且与预后不良相关	陶恒杨月陈洁陆进	《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2020	4	在线阅读下载PDF 职称材料
4	基于机器学习鼻咽癌关键特征基因筛选及其与免疫细胞相关性分析	张浩轩马俊杰安韶光荀丽雪陆进蒋成义	《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	AcCystatin减轻卵清蛋白诱导的小鼠变应性鼻炎病变和促炎细胞因子分泌	王黎源袁圆王伟李徽徽吴玥李坤龙李丁茹徐宇梁金宝郑欣王娅王馨徐伟孙永诚杨小迪	《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2021	6	在线阅读下载PDF 职称材料