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基于整合转录组学分析丝氨酸蛋白酶抑制剂Hespintor抑制肝癌裸鼠移植瘤生长的潜在机制被引量：4: 1; 作者伦永志孙杰 +3 位作者魏玲刘奔董雯潘凌鸿《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期202-212,共11页; 目的利用转录物组测序技术探寻差异表达长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)、mRNA与Hespintor抗肿瘤潜在机制的关联性。方法首先建立人肝癌裸鼠移植瘤模型,分组给药4周后取瘤体,分别构建Hespintor治疗组、溶剂对照组瘤组织cDNA... 展开更多; 关键词 Hespintor 晚期肝细胞癌转录物组测序技术长链非编码RNA 差异表达基因集; 在线阅读下载PDF 职称材料

人肠源植物乳杆菌PUM1785全基因组测序分析与功能挖掘被引量：7: 2; 作者孙杰沈敏 +1 位作者吴恬菲伦永志《微生物学杂志》 CAS CSCD 2021年第5期69-79,共11页; 植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)PUM1785是从潜在多重耐药患者的新鲜粪便标本中分离得到的一株具有良好生物学活性的乳酸菌,为了进一步研究其生物学特性和功能,对其进行全基因组测序并解析基因组序列信息及功能。利用Illumina HiSe... 展开更多; 关键词植物乳杆菌基因组学功能注释细菌素次级代谢分子进化分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

两种严重急性呼吸综合征冠状病毒S蛋白结构特征及抗原表位比较被引量：3: 3; 作者伦永志刘奔 +2 位作者董雯孙杰潘凌鸿《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期315-323,共9页; 目的:通过严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)-2与SARS-CoV S蛋白结构特征及抗原表位的比较分析,从分子水平为SARS-CoV-2致病机制研究提供数据支持,并为疫苗、抗体及药物研发寻找合适的候选靶点。方法:利用生物信息学方法和工具,基于... 展开更多; 关键词严重急性呼吸综合征冠状病毒2 S蛋白结构特征抗原表位; 在线阅读下载PDF 职称材料

PI3K-Ⅲ样功能多肽对白血病细胞K562程序性死亡的作用机制研究: 4; 作者刘奔董雯 +3 位作者孙杰潘凌鸿程学英伦永志《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期990-997,共8页; 目的:研究PI3K-Ⅲ样功能多肽诱导白血病细胞K562程序性死亡的作用机制。方法:采用毕赤酵母表达系统获得纯化PI3K-Ⅲ样功能多肽;采用MTT法与平板克隆形成试验检测PI3K-Ⅲ样功能多肽对K562细胞增殖能力的影响;流式细胞术检测K562细胞的凋... 展开更多; 关键词 PI3K-Ⅲ 白血病自噬凋亡; 在线阅读下载PDF 职称材料

沉默Bmi-1表达对K562/ADM细胞体内外增殖能力的影响: 5; 作者刘奔刘玉娇 +5 位作者刘丹丹赵宝霞张凯井如男懂思聪孟秀香《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期446-452,共7页; 目的:观察沉默Bmi-1表达对慢性髓系白血病阿霉素耐药细胞株-K562/ADM细胞增殖的影响并初步探讨其分子机制。方法:将Bmi-1小干扰RNA(siRNA)序列转染到K562/ADM细胞中降低其Bmi-1的表达;采用MTT法、软琼脂集落形成实验、裸鼠成瘤实验检测... 展开更多; 关键词 BMI-1 PTEN/p-AKT 增殖白血病; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于整合转录组学分析丝氨酸蛋白酶抑制剂Hespintor抑制肝癌裸鼠移植瘤生长的潜在机制被引量：4: 1; 作者伦永志孙杰魏玲刘奔董雯潘凌鸿; 机构莆田学院药学与医学技术学院医学微生态学福建省高校重点实验室北京市理化分析测试中心; 出处《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期202-212,共11页; 基金福建省自然科学基金项目(No.2021J011100) 2018年福建省高校新世纪优秀人才项目莆田市科技计划项目(No.2017S2001)。; 文摘目的利用转录物组测序技术探寻差异表达长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)、mRNA与Hespintor抗肿瘤潜在机制的关联性。方法首先建立人肝癌裸鼠移植瘤模型,分组给药4周后取瘤体,分别构建Hespintor治疗组、溶剂对照组瘤组织cDNA文库并进行转录物组测序,基于RNA-seq数据筛选差异表达lncRNA、mRNA基因集,继而进行功能富集及相互作用分析,再利用网络模块划分方法寻找Hespintor作用靶点基因并构建调控网络。结果筛选获得Hespintor治疗组高可信度的差异表达基因集lncRNA(DEGs lncRNA)2003个和mRNA(DEGs mRNA)1038个,DEGs lncRNA调控靶mRNA主要富集于PIP3激活Akt信号、p53信号通路、FOXO介导的转录和细胞周期等功能,DEGs mRNA主要富集于趋化因子信号通路、细胞外基质受体相互作用、补体和凝血级联等功能,两者关联性侧重体现在细胞行为、转录调控和细胞周期等三方面。结论PI3K/Akt信号通路可能在Hespintor抑制肿瘤效应中发挥主导作用,诱导细胞周期阻滞于G1/S期并引起细胞凋亡。; 关键词 Hespintor 晚期肝细胞癌转录物组测序技术长链非编码RNA 差异表达基因集; Keywords Hespintor advanced hepatocellular carcinoma RNA-seq lncrna differentially expressed gene; 分类号 R73‒362 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名人肠源植物乳杆菌PUM1785全基因组测序分析与功能挖掘被引量：7: 2; 作者孙杰沈敏吴恬菲伦永志; 机构莆田学院药学与医学技术学院医学微生态学福建省高校重点实验室莆田学院药学与医学技术学院医学检验系; 出处《微生物学杂志》 CAS CSCD 2021年第5期69-79,共11页; 基金 2018年福建省高等学校新世纪优秀人才项目福建省卫生健康科研人才培养项目(2019-CX-42) +1 种基金国家级大学生创新创业训练计划项目(201911498017)。; 文摘植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)PUM1785是从潜在多重耐药患者的新鲜粪便标本中分离得到的一株具有良好生物学活性的乳酸菌,为了进一步研究其生物学特性和功能,对其进行全基因组测序并解析基因组序列信息及功能。利用Illumina HiSeq平台对植物乳杆菌PUM1785进行全基因组测序,利用相关生物信息学软件对原始数据进行组装及其后续的功能注释、次级代谢产物合成基因簇、致病性及分子进化分析。植物乳杆菌PUM1785基因组全长3128032 bp,GC含量44.56%;基因组特征显示其具有高碳水化合物代谢能力以及强抑菌和耐受活性,毒力因子主要表现为黏附和抵抗宿主免疫防御系统作用,属无致病性的毒力减弱型菌株。植物乳杆菌PUM1785能够黏附于宿主细胞,产生抗性蛋白和毒力因子,保护自身不受机体免疫防御的清除和破坏,能够在肠道内稳定定殖,适合作为微生态制剂或功能性食品生产菌株。; 关键词植物乳杆菌基因组学功能注释细菌素次级代谢分子进化分析; Keywords Lactobacillus plantarum genomics functional annotation bacteriocin secondary metabolism molecular evolution; 分类号 Q933 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名两种严重急性呼吸综合征冠状病毒S蛋白结构特征及抗原表位比较被引量：3: 3; 作者伦永志刘奔董雯孙杰潘凌鸿; 机构莆田学院药学与医学技术学院医学微生态学福建省高校重点实验室; 出处《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期315-323,共9页; 基金福建省高等学校新世纪优秀人才项目福建省卫生健康科研人才培养项目(2019-CX-42)。; 文摘目的:通过严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)-2与SARS-CoV S蛋白结构特征及抗原表位的比较分析,从分子水平为SARS-CoV-2致病机制研究提供数据支持,并为疫苗、抗体及药物研发寻找合适的候选靶点。方法:利用生物信息学方法和工具,基于S蛋白参考序列进行理化性质、疏水性、信号肽、跨膜区、结构域、二级结构、三级结构分析及抗原表位预测,同时对受体血管紧张素转换酶2(ACE2)、C型凝集素(CLEC4M)的组织表达及关联通路、途径进行分析。结果:SARS-CoV-2、SARS-CoV S蛋白氨基酸序列一致性为75.80%,两者结构特征具有较高一致性,但SARS-CoV-2高级结构特征不如SARS-CoV明显。受体ACE2、CLEC4M在消化系统及心脏、肾脏、肺、胎盘中均有表达,主要关联的肾素-血管紧张素系统、蛋白质消化吸收通路及血管紧张素前体转化、G蛋白偶联受体(GPCR)配体结合途径与2019冠状病毒病典型症状相关。分析获得S蛋白三对高度或完全同源的抗原表位,即SARS-CoV-2 S蛋白第600~605位氨基酸残基与SARS-CoV第586~591位高度一致,SARS-CoV-2 S蛋白第695~703位、第888~896位氨基酸残基分别与SARS-CoV第677~685位、第870~878位高度或完全一致。结论:SARS-CoV-2与SARS-CoV S蛋白结构上的相似性决定了两者具有相近的感染模式和临床表现。筛选获得的高可信度的SARS-CoV-2候选抗原表位可为病毒诊断和疫苗研制提供参考。; 关键词严重急性呼吸综合征冠状病毒2 S蛋白结构特征抗原表位; Keywords Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 S protein Structural characteristic Epitope; 分类号 R373.1 [医药卫生—病原生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名PI3K-Ⅲ样功能多肽对白血病细胞K562程序性死亡的作用机制研究: 4; 作者刘奔董雯孙杰潘凌鸿程学英伦永志; 机构莆田学院药学与医学技术学院莆田学院附属医院神经内科; 出处《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期990-997,共8页; 基金福建省自然科学基金(2020J01903) 莆田学院引进人才科研启动项目(2019013) 药学与医学技术学院院级项目(Z202101)。; 文摘目的:研究PI3K-Ⅲ样功能多肽诱导白血病细胞K562程序性死亡的作用机制。方法:采用毕赤酵母表达系统获得纯化PI3K-Ⅲ样功能多肽;采用MTT法与平板克隆形成试验检测PI3K-Ⅲ样功能多肽对K562细胞增殖能力的影响;流式细胞术检测K562细胞的凋亡与细胞周期;透射电子显微镜检测细胞超微结构的变化;ELISA方法检测Caspase-3表达;Western blot检测K562细胞ATG4B、Beclin-1、Bcl-2、LC3-II等蛋白表达。结果:PI3K-Ⅲ样功能多肽能够抑制K562细胞的增殖及克隆形成,与对照组细胞相比抑制率明显增高(P<0.05);功能域蛋白作用后,K562细胞呈现凋亡状态,且伴随自噬体形成;细胞G0/G1期所占比例明显升高,S期所占比例明显降低,细胞生长多停滞于G0/G1期,与对照组细胞比例存在显著性差异(P<0.05);随着多肽作用浓度增加,Caspase-3蛋白表达显著增加,与对照组相比有显著差异(r=0.966,P<0.05);功能域蛋白作用K562细胞后不同时间点ATG4B、Beclin-1的表达呈先升后降、LC3-II的表达呈上升、Bcl-2的表达呈下降趋势。结论:PI3K-Ⅲ样功能多肽可诱导白血病细胞K562发生程序性死亡,Beclin-1/Bcl-2与Caspase通路可能参与其中,自噬与凋亡可能均有发挥作用。; 关键词 PI3K-Ⅲ 白血病自噬凋亡; Keywords PI3K-Ⅲ leukemia autophagy apoptosis; 分类号 R733.7 [医药卫生—肿瘤] R73-36 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名沉默Bmi-1表达对K562/ADM细胞体内外增殖能力的影响: 5; 作者刘奔刘玉娇刘丹丹赵宝霞张凯井如男懂思聪孟秀香; 机构莆田学院药学与医学技术学院大连医科大学检验医学院临床血液学教研室大连医科大学诊断学实验中心; 出处《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期446-452,共7页; 基金辽宁省自然科学基金(2015020297) 莆田学院科研项目(2019013)。; 文摘目的:观察沉默Bmi-1表达对慢性髓系白血病阿霉素耐药细胞株-K562/ADM细胞增殖的影响并初步探讨其分子机制。方法:将Bmi-1小干扰RNA(siRNA)序列转染到K562/ADM细胞中降低其Bmi-1的表达;采用MTT法、软琼脂集落形成实验、裸鼠成瘤实验检测沉默Bmi-1表达对K562/ADM细胞体内外增殖能力的影响;应用Western blot检测Bmi-1、PTEN、p-AKT等蛋白表达;免疫组织化学实验分析Bmi-1和Ki-67的表达情况。结果:Bmi-1基因的沉默能够抑制K562/ADM细胞的增殖活性、集落形成及裸鼠成瘤能力;Bmi-1基因沉默后,干扰组PTEN表达明显升高,而p-AKT活性明显下降;p-AKT抑制剂-LY294002处理K562/ADM细胞后,p-AKT表达降低,集落形成及裸鼠成瘤能力相比K562/ADM细胞降低;PTEN抑制剂-Bpv处理K562/ADM-S1细胞后,PTEN的表达降低,而p-AKT表达、集落形成及裸鼠成瘤能力得以重塑;Bmi-1基因沉默使得肿瘤组织中Bmi-1与Ki-67表达均下降。结论:Bmi-1基因有可能参与了对K562/ADM的体内外增殖能力的调控,PTEN/pAKT信号通路可能涉及其中。; 关键词 BMI-1 PTEN/p-AKT 增殖白血病; Keywords Bmi-1 PTEN/p-AKT proliferation leukemia; 分类号 R733.72 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于整合转录组学分析丝氨酸蛋白酶抑制剂Hespintor抑制肝癌裸鼠移植瘤生长的潜在机制	伦永志孙杰魏玲刘奔董雯潘凌鸿	《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2022	4	在线阅读下载PDF 职称材料
2	人肠源植物乳杆菌PUM1785全基因组测序分析与功能挖掘	孙杰沈敏吴恬菲伦永志	《微生物学杂志》 CAS CSCD	2021	7	在线阅读下载PDF 职称材料
3	两种严重急性呼吸综合征冠状病毒S蛋白结构特征及抗原表位比较	伦永志刘奔董雯孙杰潘凌鸿	《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2020	3	在线阅读下载PDF 职称材料
4	PI3K-Ⅲ样功能多肽对白血病细胞K562程序性死亡的作用机制研究	刘奔董雯孙杰潘凌鸿程学英伦永志	《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2022	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	沉默Bmi-1表达对K562/ADM细胞体内外增殖能力的影响	刘奔刘玉娇刘丹丹赵宝霞张凯井如男懂思聪孟秀香	《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心	2020	0	在线阅读下载PDF 职称材料