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药用美洲大蠊全基因组测序分析 被引量:12
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作者 晋家正 李午佼 +4 位作者 牟必琴 沈咏梅 耿福能 岳碧松 范振鑫 《四川动物》 北大核心 2018年第2期121-126,共6页
以美洲大蠊Periplaneta americana为原料生产的康复新液等药品临床疗效显著,得到了广泛应用。本文以四川好医生攀西药业有限责任公司饲养的药用美洲大蠊为材料,首次采用Illumina Hi Seq 2000和Pac Bio SMRT测序平台开展了全基因组测序,... 以美洲大蠊Periplaneta americana为原料生产的康复新液等药品临床疗效显著,得到了广泛应用。本文以四川好医生攀西药业有限责任公司饲养的药用美洲大蠊为材料,首次采用Illumina Hi Seq 2000和Pac Bio SMRT测序平台开展了全基因组测序,并进行基因组组装、注释和分析。原始测序数据经过滤后得到1.4 Tb的二代测序数据和33.81 Gb的三代测序数据。组装结果表明,美洲大蠊基因组大小为3.26 Gb,这在已报道的昆虫基因组中仅次于东亚飞蝗Locusta migratoria。基因组重复序列含量为62.38%,杂合度为0.635%,表明其为复杂基因组。组装的Contig N50和scaffold N50长度分别为28.2 kb、315 kb,单拷贝基因完整性为88.1%,小片段文库测序数据平均比对率为99.8%,测序和组装质量满足后续分析要求。采用De novo预测、同源预测和基于转录本预测3种方法共注释到14 568个基因,其中92.4%的基因获得了功能注释。本研究首次完成了美洲大蠊的全基因组测序,也是大蠊属Periplaneta昆虫的第一个基因组,为美洲大蠊遗传进化分析和药用基因资源挖掘打下了重要基础。 展开更多
关键词 美洲大蠊 药用昆虫 全基因组测序 基因组装 基因注释
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药用美洲大蠊氨基酸和维生素含量分析 被引量:8
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作者 王璐萱 巩荣艳 +1 位作者 曾陈娟 丁显平 《四川动物》 北大核心 2019年第1期87-91,共5页
以人工饲养条件下不同发育阶段的美洲大蠊Periplaneta americana为材料,测定了其氨基酸和维生素的含量。结果表明,美洲大蠊各虫态均含有18种氨基酸,氨基酸总量为23. 27%~29. 44%,人体必需氨基酸含量占44. 04%~49. 55%,优于联合国粮农... 以人工饲养条件下不同发育阶段的美洲大蠊Periplaneta americana为材料,测定了其氨基酸和维生素的含量。结果表明,美洲大蠊各虫态均含有18种氨基酸,氨基酸总量为23. 27%~29. 44%,人体必需氨基酸含量占44. 04%~49. 55%,优于联合国粮农组织/世界卫生组织推荐的40%的标准,属于优质蛋白质资源。与成虫期相比,若虫期氨基酸含量较高,色氨酸、谷氨酸、丙氨酸、天门冬氨酸和甘氨酸较为丰富。所检测的5种维生素中,维生素E含量最高,刚蜕皮成虫及雌成虫含量均超过12 mg·kg^(-1)。美洲大蠊相关产品促睡眠、抗氧化功能可能与其富含色氨酸、谷氨酸和维生素E有关。 展开更多
关键词 美洲大蠊 药用昆虫 氨基酸 维生素
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基于转录组测序分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制 被引量:15
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作者 陈佳松 陈峰 +2 位作者 彭锐 耿福能 邹方东 《四川动物》 北大核心 2017年第4期398-403,共6页
美洲大蠊Periplaneta americana是传统的中药材,其提取物已在临床上广泛用于创面治疗,但对其中的分子机制知之甚少。本文通过构建小鼠皮肤创伤模型,并基于转录组测序(RNA-seq)深入分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制。首先构... 美洲大蠊Periplaneta americana是传统的中药材,其提取物已在临床上广泛用于创面治疗,但对其中的分子机制知之甚少。本文通过构建小鼠皮肤创伤模型,并基于转录组测序(RNA-seq)深入分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制。首先构建C57小鼠皮肤全层切除模型,并将其分为3组,其中实验组分别以2种美洲大蠊提取物(康复新液、精粉)为敷料,而对照组以75%乙醇为敷料。用药处理3 d后取伤口皮肤组织送样进行RNAseq,然后分析转录组数据找出与伤口愈合相关的差异性表达基因,并利用荧光定量PCR(Q-PCR)对伤口组织中相关基因的表达量进一步验证。实验结果显示,实验组小鼠伤口的结痂速度比对照组快,这表明了小鼠创面模型中,美洲大蠊提取物能促进伤口愈合。经转录组分析,得到显著性差异表达基因数:对照组vs.精粉组为545,对照组vs.康复新液组为938。结合生物信息分析结果和已发表的文献,发现3个可能参与调节伤口愈合的关键基因:表皮调节素(Ereg)、Gli-kruppel家族成员(Gli2)和表皮型转谷氨酰胺酶3(Tgm3)。Q-PCR实验表明,这3个基因在美洲大蠊提取物加药组中均高表达。本文研究结果表明,2种美洲大蠊提取物:康复新液、精粉可能通过诱导Ereg、Tgm3和Gli2的高表达来促进皮肤创面的愈合。 展开更多
关键词 美洲大蠊 伤口修复 转录组分析 关键基因
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美洲大蠊愈创活性成分研究 被引量:7
4
作者 晏永明 朱宏杰 +4 位作者 向斌 齐晶晶 王心龙 耿福能 程永现 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期591-596,共6页
采用色谱分离手段从美洲大蠊中分离得到17个化合物,利用波谱解析鉴定了它们的结构,分别命名为环(酪氨酸-酪氨酸)(1)、环(酪氨酸-脯氨酸)(2)、环(缬氨酸-酪氨酸)(3)、环(甘氨酸-苯丙氨酸)(4)、环(甘氨酸-色氨酸)(5)、环(色氨酸-丝氨酸)(6... 采用色谱分离手段从美洲大蠊中分离得到17个化合物,利用波谱解析鉴定了它们的结构,分别命名为环(酪氨酸-酪氨酸)(1)、环(酪氨酸-脯氨酸)(2)、环(缬氨酸-酪氨酸)(3)、环(甘氨酸-苯丙氨酸)(4)、环(甘氨酸-色氨酸)(5)、环(色氨酸-丝氨酸)(6)、环(色氨酸-天冬酰胺)(7)、ginsenine(8)、6-羟基香豆素(9)、6-羟基色满-2-酮(10)、1-(3-乙基苯基)-1,2-乙二醇(11)、1-(4-乙基苯基)-1,2-乙二醇(12)、(E)-3,4-二羟基苯亚甲基丙酮(13)、2-羟基-3',4'-二羟基苯乙酮(14)、原儿茶酸(15)、对羟基苯甲酸甲酯(16)和丁香酸(17)。其中,化合物1~14均为首次从美洲大蠊中分离得到。此外,对化合物促进创面愈合作用进行了观察,化合物13显示较强的抑制NO生成活性。 展开更多
关键词 药用昆虫 美洲大蠊 创面愈合
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虫药美洲大蠊水溶性成分及其促血管生成活性 被引量:12
5
作者 王心龙 向斌 +3 位作者 李亚美 耿福能 晏永明 程永现 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2004-2009,共6页
采用色谱手段从美洲大蠊中分离得到22个化合物,利用波谱解析鉴定了它们的结构,分别命名为甘油(1)、邻羟基苯甲酸(2)、苯丙氨酸(3)、色氨酸(4)、尿嘧啶(5)、腺嘌呤(6)、环(脯氨酸-苏氨酸)(7)、环(脯氨酸-丙氨酸)(8)、环(丙氨酸-缬氨酸)(9... 采用色谱手段从美洲大蠊中分离得到22个化合物,利用波谱解析鉴定了它们的结构,分别命名为甘油(1)、邻羟基苯甲酸(2)、苯丙氨酸(3)、色氨酸(4)、尿嘧啶(5)、腺嘌呤(6)、环(脯氨酸-苏氨酸)(7)、环(脯氨酸-丙氨酸)(8)、环(丙氨酸-缬氨酸)(9)、环(甘氨酸-异亮氨酸)(10)、环(甘氨酸-亮氨酸)(11)、腺嘌呤核苷(12)、次黄嘌呤核苷(13)、环(亮氨酸-丝氨酸)(14)、环(丝氨酸-苯丙氨酸)(15)、环(天冬酰胺-苯丙氨酸)(16)、环(酪氨酸-甘氨酸)(17)、环(酪氨酸-丙氨酸)(18)、环(酪氨酸-丝氨酸)(19)、环(酪氨酸-苏氨酸)(20)、环(酪氨酸-天冬氨酸)(21)和Cordyrrole A(22)。其中,化合物7~11、14~22为首次从美洲大蠊中分离得到,而化合物20和21为新的天然产物。此外,对化合物抗一氧化氮生成作用和促血管生成活性进行了测试。 展开更多
关键词 美洲大蠊 环二肽 一氧化氮生成 血管生成活性
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基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响 被引量:3
6
作者 陈峰 陈佳松 +2 位作者 彭锐 耿福能 邹方东 《四川动物》 北大核心 2017年第6期649-656,共8页
美洲大蠊Periplaneta americana提取物能够抑制多种肿瘤细胞生长,甚至能使肿瘤细胞发生凋亡,但是其对结直肠癌细胞信号通路的影响尚不清楚。本文基于RNA-seq技术初步分析了美洲大蠊提取物联合顺铂处理结直肠癌细胞后,细胞内信号通路的... 美洲大蠊Periplaneta americana提取物能够抑制多种肿瘤细胞生长,甚至能使肿瘤细胞发生凋亡,但是其对结直肠癌细胞信号通路的影响尚不清楚。本文基于RNA-seq技术初步分析了美洲大蠊提取物联合顺铂处理结直肠癌细胞后,细胞内信号通路的变化。结果表明:30μM顺铂和0.6%康复新液联合处理组与对照组相比,共有1 901个差异基因,其中1 555个基因表达上调,346个基因表达下调;30μM顺铂和0.8%精粉酵解液联合处理组与对照组比,共有2 587个差异基因,其中2 183个基因表达上调,404个基因表达下调;30μM顺铂和100μg·m L-1精粉联合处理组与对照组相比,共有1 488个差异基因,其中1 164个基因表达上调,324个基因表达下调。用WEGO和DAVID进行差异基因的GO和KEGG富集分析发现,美洲大蠊提取物联合顺铂处理组与对照组相比,表达上调的差异基因主要富集在p53、细胞粘附分子、MAPK、细胞凋亡等信号通路;表达下调的差异基因主要富集在氨基酰-tRNA生物合成、氨基酸生物合成、抗生素生物合成、一碳代谢等信号通路。 展开更多
关键词 美洲大蠊 提取物 转录组 差异基因 信号通路 功能注释
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美洲大蠊提取物促组织修复作用机制研究进展 被引量:18
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作者 高洁 朱娟娟 +3 位作者 刘瑾华 沈咏梅 岳碧松 李静 《四川动物》 北大核心 2019年第2期235-240,共6页
基础研究和临床实验都已证实康复新液等美洲大蠊Periplaneta americana提取物对烧伤、外伤、溃疡和术后创面修复等具有良好的治疗效果。本文综述了美洲大蠊提取物促组织修复作用机制,主要包括降低炎症反应、提高免疫和抗氧化活性、调节... 基础研究和临床实验都已证实康复新液等美洲大蠊Periplaneta americana提取物对烧伤、外伤、溃疡和术后创面修复等具有良好的治疗效果。本文综述了美洲大蠊提取物促组织修复作用机制,主要包括降低炎症反应、提高免疫和抗氧化活性、调节细胞生长因子表达、调控创面愈合相关信号通路等,为阐明美洲大蠊促修复作用的分子机制及其开发利用提供了科学参考。 展开更多
关键词 美洲大蠊 组织修复 作用机制
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美洲大蠊成虫肠道菌群多样性分析 被引量:10
8
作者 郝艳芹 周闯 +3 位作者 晋家正 沈咏梅 张修月 岳碧松 《四川动物》 北大核心 2018年第4期415-419,共5页
美洲大蠊Periplaneta americana既是卫生害虫,也是重要的药用昆虫。许多研究表明,其肠道菌群种类和数量与宿主健康密切相关。本实验利用16S r RNA高通量测序技术分析了人工饲养的美洲大蠊成虫肠道菌群。结果得到有效序列67 492条,归类为... 美洲大蠊Periplaneta americana既是卫生害虫,也是重要的药用昆虫。许多研究表明,其肠道菌群种类和数量与宿主健康密切相关。本实验利用16S r RNA高通量测序技术分析了人工饲养的美洲大蠊成虫肠道菌群。结果得到有效序列67 492条,归类为581个操作分类单元,注释到21门79目193属。厚壁菌门Firmicutes(56.96%)和拟杆菌门Bacteroidetes(33.13%)为美洲大蠊成虫肠道的优势菌门。葡萄球菌属Staphylococcus(16.59%)、芽孢杆菌属Bacillus(13.26%)和副杆菌属Parabacteroides(10.26%)为美洲大蠊成虫肠道的优势菌属。研究结果为进一步探讨美洲大蠊肠道菌群多样性以及与宿主之间的关系打下了基础。 展开更多
关键词 美洲大蠊 肠道菌群 高通量测序
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美洲大蠊精粉对小鼠血糖和肌酐的影响 被引量:2
9
作者 高洁 刘瑾华 +4 位作者 孙晓红 刘诗尧 沈咏梅 张修月 岳碧松 《四川动物》 北大核心 2018年第6期667-671,共5页
目的研究美洲大蠊Periplaneta americana精粉对高脂饮食小鼠体质量、血糖和肌酐的影响。方法高脂饮食小鼠分为对照组和实验组(给予美洲大蠊精粉:低剂量100 mg·kg^(-1)、中剂量200 mg·kg^(-1)、高剂量400 mg·kg^(-1))。... 目的研究美洲大蠊Periplaneta americana精粉对高脂饮食小鼠体质量、血糖和肌酐的影响。方法高脂饮食小鼠分为对照组和实验组(给予美洲大蠊精粉:低剂量100 mg·kg^(-1)、中剂量200 mg·kg^(-1)、高剂量400 mg·kg^(-1))。灌胃第42天和第49天取血后,用试剂盒测定血清血糖和肌酐的含量,实时荧光定量PCR法检测肝脏中葡萄糖-6-磷酸酶(G-6-Pase)、葡萄糖转运蛋白2(GLUT2)和肾脏中单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1) mRNA的表达水平。结果与对照组相比,中、高剂量组体质量增长率在第42天和第49天均显著低于对照组(P <0. 05,P <0. 01)。第42天实验组小鼠的血糖、肌酐和MCP-1 mRNA水平与对照组相比有降低趋势,但差异无统计学意义(P> 0. 05),中、高剂量组的G-6-Pase mRNA水平极显著低于对照组(P <0. 01),GLUT2 mRNA水平的差异无统计学意义(P> 0. 05)。第49天,低、高剂量组小鼠的血糖和肌酐水平显著低于对照组(P <0. 05),且低、中、高剂量组的G-6-Pase、GLUT2和MCP-1 mRNA水平显著低于对照组(P <0. 05,P <0. 01)。结论美洲大蠊精粉可降低高脂饮食小鼠的体质量增长率以及血糖、血清肌酐水平,减少肝脏中G-6-Pase mRNA表达和调节GLUT2 mRNA表达水平可能是美洲大蠊精粉降血糖机制之一,并且可能通过降低肾脏中MCP-1 mRNA的表达减轻肾脏损伤。 展开更多
关键词 美洲大蠊 高脂饮食 血糖 肌酐
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美洲大蠊胸腺素对小鼠毛发生长的影响研究 被引量:2
10
作者 颜琳 高洁 +5 位作者 张毅鹏 王红梅 陈勤 沈咏梅 岳碧松 张修月 《四川动物》 北大核心 2021年第5期489-496,共8页
目的以C57BL/6小鼠为动物模型,观察美洲大蠊Periplaneta americana胸腺素对小鼠毛发生长及生长周期的影响。方法将背部脱毛的C57BL/6小鼠分为PBS组(空白处理)、THY1组(给药浓度500μg·mL^(-1))、THY2组(给药浓度500μg·mL^(-... 目的以C57BL/6小鼠为动物模型,观察美洲大蠊Periplaneta americana胸腺素对小鼠毛发生长及生长周期的影响。方法将背部脱毛的C57BL/6小鼠分为PBS组(空白处理)、THY1组(给药浓度500μg·mL^(-1))、THY2组(给药浓度500μg·mL^(-1))、THY3组(给药浓度500μg·mL^(-1))和Tβ4组(给药浓度500μg·mL^(-1)),连续给药18 d,记录小鼠皮肤颜色变化时间、脱毛区毛发生长状况以及毛囊组织学特征和毛囊数目的变化。通过实时荧光定量PCR法检测胰岛素样生长因子-1(IGF-1)、β-连环蛋白(β-catenin)和基质金属蛋白酶-2(MMP-2)的表达水平。结果与PBS组相比,给药组小鼠脱毛后皮肤颜色由粉红变黑的时间更短,毛囊数量均明显更多,且给药组小鼠毛发生长更快。在给药第6天,THY1组和THY3组的β-catenin表达明显高于PBS组;给药第18天,THY2组的MMP-2表达明显高于PBS组,且THY1组的IGF-1表达明显高于PBS组。结论美洲大蠊胸腺素可以促进C57BL/6小鼠的毛发生长,可能通过提高β-catenin、MMP-2和IGF-1的表达来调控小鼠的毛囊发育与毛发生长。 展开更多
关键词 美洲大蠊 胸腺素 C57BL/6小鼠 毛发生长
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美洲大蠊提取物对2,4,6-三硝基苯磺酸诱导大鼠溃疡性结肠炎的影响 被引量:5
11
作者 陶磊 陈金虎 +5 位作者 张汉超 刘彬 陈莹 万苹 何苗 杨志斌 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1889-1894,共6页
目的探究美洲大蠊提取物对2,4,6-三硝基苯磺酸诱导大鼠溃疡性结肠炎的影响。方法建立2,4,6-三硝基苯磺酸诱导UC大鼠模型,大鼠随机分为正常对照组、模型组、柳氮磺胺吡啶组(300 mg/kg)、肠炎宁组(600 mg/kg)及美洲大蠊提取物低、中、高... 目的探究美洲大蠊提取物对2,4,6-三硝基苯磺酸诱导大鼠溃疡性结肠炎的影响。方法建立2,4,6-三硝基苯磺酸诱导UC大鼠模型,大鼠随机分为正常对照组、模型组、柳氮磺胺吡啶组(300 mg/kg)、肠炎宁组(600 mg/kg)及美洲大蠊提取物低、中、高剂量组(50、100、200 mg/kg),于UC模型建立第8天进行相应药物灌胃治疗,1次/d,连续14 d。实验期间对大鼠进行DAI、CMDI、HS评分,检测血清IL-4、IL-17、TNF-α、IFN-γ水平和结肠组织TGF-β1、EGF、MPO水平。结果以DAI评分为依据,将轻中度炎症大鼠纳入实验,占造模大鼠比率为93.75%。与模型组比较,美洲大蠊提取物可降低DAI评分、HS评分(P<0.01),下调血清IL-17、TNF-α、IFN-γ及结肠组织MPO水平(P<0.01),降低结肠指数和CMDI评分(P<0.05,P<0.01),增加血清IL-4及结肠组织TGF-β1、EGF水平(P<0.01)。结论美洲大蠊提取物对UC大鼠有一定的治疗效果,其作用机制可能与上调IL-4、EGF、TGF-β1水平,下调TNF-α、IL-17、MPO、IFN-γ水平有关。 展开更多
关键词 美洲大蠊提取物 溃疡性结肠炎 2 4 6-三硝基苯磺酸
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美洲大蠊microRNA的初步研究 被引量:1
12
作者 宝钲 杨茗羽 +2 位作者 张修月 岳碧松 范振鑫 《四川动物》 北大核心 2019年第1期47-55,共9页
美洲大蠊Periplaneta americana是一种世界性的卫生害虫,但其提取物有较高的药用价值。本研究对饲养的雌雄美洲大蠊成虫进行microRNA测序,分别在雄性和雌性中得到12 155 616条和9 847 263条序列。序列长度主要为18~23 nt,且在22 nt和29... 美洲大蠊Periplaneta americana是一种世界性的卫生害虫,但其提取物有较高的药用价值。本研究对饲养的雌雄美洲大蠊成虫进行microRNA测序,分别在雄性和雌性中得到12 155 616条和9 847 263条序列。序列长度主要为18~23 nt,且在22 nt和29 nt处有2个峰值。将所得序列与数据库(NCBI、Rfam)进行比对注释,最终在雄性成虫中鉴定到57种已知的microRNA和152种潜在的新microRNA,在雌性成虫中鉴定到53种已知的microRNA和94种潜在的新microRNA。差异表达分析发现只有一种microRNA:miR-750在雌雄之间差异表达,其在雌虫中表达量显著高于雄虫。本研究首次在基因组水平研究了美洲大蠊microRNA的组成并对其功能进行了预测,为其后续研究奠定了基础。 展开更多
关键词 美洲大蠊 MICRORNA 差异表达
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糖尿病肛漏创面应用美洲大蠊提取液的lncRNA高通量测序及维恩图分析 被引量:1
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作者 李心甜 马乐 +2 位作者 耿越飞 沈咏梅 曾娟妮 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2021年第4期1147-1155,共9页
目的基于高通量测序及维恩图预测美洲大蠊提取液促进糖尿病肛漏创面愈合的顺、反式lnc RNA及Pathway。方法选取湖南中医药大学第二附属医院收治的糖尿病肛漏患者术后创面12例,利用高通量测序技术检测6例术后创面组(A组)和6例术后创面应... 目的基于高通量测序及维恩图预测美洲大蠊提取液促进糖尿病肛漏创面愈合的顺、反式lnc RNA及Pathway。方法选取湖南中医药大学第二附属医院收治的糖尿病肛漏患者术后创面12例,利用高通量测序技术检测6例术后创面组(A组)和6例术后创面应用美洲大蠊提取液创面组(B组)中lnc RNAs和m RNAs表达,进行GO分析和KEGG通路分析,构建lnc RNA-m RNA的共表达网络图,并通过Cis-及Trans-预测与创面愈合相关lnc RNA。结果实验组差异表达的lnc RNAs2242个(上调649个,下调1593个),m RNAs有13186个(上调5162个,下调8024个)。GO分析发现差异表达的lnc RNA-cis主要富集在表皮细胞分化、上皮细胞分化、细胞代谢过程的调节等;差异表达的lnc RNA-trans主要富集在细胞代谢过程、蛋白质结合、细胞内部分等。通过KEGG通路分析,筛选出与本研究相关的3条通路:IBD、MAPK signalingpathway、AMPK signaling pathway;lnc RNA靶标基因预测中最终筛选出3个lnc RNA(ENST00000443364、ENST00000576797、ENST00000620167),进行PCR验证,lnc RNAENST00000443364、ENST00000576797与芯片结果一致。结论美洲大蠊提取液可能通过lnc RNAENST00000443364、ENST00000576797顺式及反式调控靶标基因,影响表皮细胞分化、上皮细胞分化、细胞代谢过程的调节等功能以及影响IBD、MAPK signalingpathway、AMPK signaling pathway促进糖尿病肛漏创面愈合。 展开更多
关键词 糖尿病 肛漏 美洲大蠊提取液 创面愈合 lncRNA MRNA 高通量测序
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美洲大蠊基因组重复序列分析
14
作者 牟必琴 严超超 +3 位作者 李午佼 李静 沈咏梅 岳碧松 《四川动物》 北大核心 2017年第5期540-547,共8页
重复序列是真核生物基因组的重要组成部分。一些重复序列,如自主型的逆转录转座子LINE,在昆虫的系统进化和遗传多样性研究方面得到了广泛的应用。de novo从头预测和基于同源比对预测相结合的方法被用来搜索美洲大蠊Periplaneta american... 重复序列是真核生物基因组的重要组成部分。一些重复序列,如自主型的逆转录转座子LINE,在昆虫的系统进化和遗传多样性研究方面得到了广泛的应用。de novo从头预测和基于同源比对预测相结合的方法被用来搜索美洲大蠊Periplaneta americana基因组,共鉴定出大约占全基因组62%的重复序列。研究发现,散在重复序列中,DNA转座子占美洲大蠊基因组的16.18%;逆转座元件中LINE最多,占基因组的13.64%,SINE和LTR分别占基因组的3.52%和1.32%。LINEs中的Bov Bs亚家族在所有转座子亚家族中比例最高(约6.73%)。美洲大蠊与德国小蠊Blattella germanica相比,除LTR外,其他类型的转座子占基因组的比例均高于德国小蠊。通过分析逆转录转座子反转录酶完整度、氨基酸序列相似度及遗传距离,从美洲大蠊基因组中鉴定出一类BovBs:RTE-1_PAm。BovBs的反转录酶氨基酸序列的系统树表明,美洲大蠊与内华达古白蚁Zootermopsis nevadensis的进化关系比与其同属蜚蠊科Blattidae的德国小蠊的关系更近。昆虫中BovBs的进化关系与传统核基因进化关系的不同,表明转座子的进化相对宿主基因的进化具有一定的独立性。 展开更多
关键词 美洲大蠊 基因组 重复序列 转座子 BovBs 系统进化
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美洲大蠊胸腺素THY3的表达模式分析
15
作者 孙晓红 李萍 +6 位作者 景洁 高洁 杨振 沈咏梅 张修月 岳碧松 孟杨 《四川动物》 北大核心 2019年第4期415-419,共5页
美洲大蠊Periplaneta americana胸腺素基因具有THY1、THY2和THY3三个不同剪接体,其中THY3结构域最多。本研究使用实时荧光定量PCR技术比较分析了THY3在美洲大蠊不同性别、不同发育阶段及不同组织中的表达差异,以及大肠杆菌Escherichia c... 美洲大蠊Periplaneta americana胸腺素基因具有THY1、THY2和THY3三个不同剪接体,其中THY3结构域最多。本研究使用实时荧光定量PCR技术比较分析了THY3在美洲大蠊不同性别、不同发育阶段及不同组织中的表达差异,以及大肠杆菌Escherichia coli诱导对美洲大蠊血淋巴和脂肪体中THY3表达的影响。结果表明:THY3在成虫期的表达量显著高于其他虫期,雌虫表达量显著高于雄虫,脂肪体表达量显著高于血淋巴、头部、肌肉、体壁组织。雌性成虫体腔注射大肠杆菌3 h后血淋巴中THY3表达量显著增高,而在脂肪体中12 h后才检测到THY3表达明显上调,研究结果为进一步研究美洲大蠊胸腺素的功能打下了基础。 展开更多
关键词 美洲大蠊 胸腺素 相对表达量
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德国小蠊全基因组中微卫星分布规律 被引量:14
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作者 王晨 杜联明 +5 位作者 李鹏 杨茗羽 李午佼 沈咏梅 张修月 岳碧松 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1037-1045,共9页
【目的】分析德国小蠊Blattella germanica全基因组中微卫星的数量和分布规律,并对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释。【方法】使用微卫星搜索软件查找德国小蠊基因组中微卫星的数量、重复次数以及所有微卫星的位置信息,编写Pytho... 【目的】分析德国小蠊Blattella germanica全基因组中微卫星的数量和分布规律,并对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释。【方法】使用微卫星搜索软件查找德国小蠊基因组中微卫星的数量、重复次数以及所有微卫星的位置信息,编写Python脚本对微卫星进行定位,并通过Blast2Go和KASS程序对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释。【结果】共找到1~6碱基重复类型的微卫星序列604 386个,总长度15 301 255 bp,约占全基因组序列(约2.04 Gb)的0.75%,分布频率为1/3.37 kb,微卫星序列的长度主要在12~60个碱基长度范围内。不同类型的微卫星中,三碱基(226 876)重复类型微卫星数量最多,占微卫星总数的37.54%;四碱基(150 355)重复类型次之,占微卫星总数的24.88%;其余依次是单碱基(141 167)、二碱基(60 877)、五碱基(21 570)和六碱基(3 541)重复类型,分别占微卫星总数的23.36%,10.07%,3.57%和0.59%。出现最多的重复拷贝类别有:ATT,AAT,A,T,AAAT,ATTT和AT,共411 789个微卫星,占微卫星总数的68.13%,这7种类别的微卫星数量均大于30 000个。共有2 372个微卫星在外显子上,它们分别位于1 481个基因上。GO功能注释结果表明,其中434条归类于细胞组分(cellular component),402条归类于分子功能(molecular function),660条归类于生物学过程(biological process)。KEGG通路分析结果表明,与新陈代谢相关的基因最多(380个),其次是与机体系统相关的(276个),与遗传信息进程相关的基因最少(92个)。【结论】本研究为进一步系统深入分析德国小蠊微卫星功能及微卫星分子标记筛选打下了基础。 展开更多
关键词 德国小蠊 微卫星 生物信息学 功能注释 基因组 外显子
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复方蜚蠊提取物PB对异体抗原联合醋酸诱导大鼠慢性溃疡性结肠炎的作用机制 被引量:8
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作者 卢倩 孙敏哲 +5 位作者 杜雯雯 刘衡 沈咏梅 吴桃清 赵昱 巫秀美 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1296-1301,共6页
目的研究复方蜚蠊提取物PB对慢性溃疡性结肠炎(UC)大鼠的作用,并初步探讨其作用机制。方法采用异体抗原联合醋酸建立慢性UC模型,正常组及模型组灌肠给予氯化钠溶液,其余各组分别给予柳氮磺胺吡啶(SASP)、肠炎宁和PB低、中、高剂量药物... 目的研究复方蜚蠊提取物PB对慢性溃疡性结肠炎(UC)大鼠的作用,并初步探讨其作用机制。方法采用异体抗原联合醋酸建立慢性UC模型,正常组及模型组灌肠给予氯化钠溶液,其余各组分别给予柳氮磺胺吡啶(SASP)、肠炎宁和PB低、中、高剂量药物。评价疾病活动指数(DAI)和病理组织学评分(HS);测定脏器指数和结肠黏膜指数(CMDI);ELISA法检测血清中IL-4、IL-8、IL-17、INF-γ、CRP、IgG,以及结肠黏膜中TNF-α、MPO、EGF的含量。结果与正常组比较,模型组IL-8、IL-17、INF-γ、CRP、IgG、TNF-α、MPO含量均明显升高,IL-4、EGF含量明显降低(P<0.01,P<0.05);PB各剂量组DAI、CMDI、HS、IL-8、IL-17、INF-γ、CRP、IgG、TNF-α、MPO含量均明显降低,IL-4含量明显升高(P<0.01,P<0.05)。结论复方蜚蠊提取物PB灌肠给药后能够有效缓解异体抗原联合醋酸诱导的大鼠慢性UC,其作用机制可能与促进Th2细胞亚群活化,使倾向于Th1的Th1/Th2平衡向Th2移动,发挥细胞免疫和体液免疫调节作用,达到免疫平衡稳态有关。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 复方 蜚蠊 异体抗原 柳氮磺胺吡啶 作用机制
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复方蜚蠊提取物对大鼠溃疡性结肠炎肠道菌群的影响 被引量:5
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作者 段晓梅 闫爽 +5 位作者 倪连丽 耿福能 刘彬 刘衡 张成桂 李玥 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期591-592,共2页
溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)与人体肠道菌群的组成和改变密切相关[1]。复方蜚蠊提取物PA、PB、PC[P4]中的君药蜚蠊学名美洲大蠊(Periplaneta americana L.),有促进组织修复、调节免疫的作用[2-3]。本实验研究复方蜚蠊提取物对... 溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)与人体肠道菌群的组成和改变密切相关[1]。复方蜚蠊提取物PA、PB、PC[P4]中的君药蜚蠊学名美洲大蠊(Periplaneta americana L.),有促进组织修复、调节免疫的作用[2-3]。本实验研究复方蜚蠊提取物对慢性UC大鼠肠道菌群的影响。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 复方蜚蠊提取物 肠道菌群 荧光定量PCR 异体抗原 免疫模型
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蜚蠊提取部位灌胃给药对异体抗原联合醋酸诱导的大鼠慢性溃疡性结肠炎的作用研究 被引量:6
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作者 徐雨生 张俊 +5 位作者 杜雯雯 杨志斌 沈咏梅 孙敏哲 巫秀美 肖怀 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2020年第4期59-63,I0019,共6页
目的研究蜚蠊提取物PABA2对异体抗原联合醋酸诱导大鼠慢性溃疡性结肠炎(UC)的作用,并初步探讨其作用机制。方法采用家兔结肠抗原致敏联合醋酸建立大鼠UC模型,分别灌胃给予柳氮磺胺吡啶,肠炎宁及PABA2高、中、低剂量药物,连续给药14 d,... 目的研究蜚蠊提取物PABA2对异体抗原联合醋酸诱导大鼠慢性溃疡性结肠炎(UC)的作用,并初步探讨其作用机制。方法采用家兔结肠抗原致敏联合醋酸建立大鼠UC模型,分别灌胃给予柳氮磺胺吡啶,肠炎宁及PABA2高、中、低剂量药物,连续给药14 d,评估疾病活动指数(DAI)、结肠黏膜损伤指数(CMDI)及病理组织学评分(HS),酶联免疫吸附法检测大鼠血清中IL-4、IL-8、IL-17、CRP、IgG、IFN-γ及结肠中MPO、EGF、TNF-α的表达水平。结果与模型对照组比较,PABA2各剂量组具有降低大鼠DAI评分、CDMI评分和HS评分的趋势,并呈一定的剂量依赖性,其中高剂量组降低明显(P<0.01);PABA2各剂量组能降低大鼠血清中IL-8、IL-17、CRP、IFN-γ、IgG及结肠组织中TNF-α、MPO等炎性因子的表达(P<0.01或P<0.05),增加血清中IL-4的表达及结肠组织中EGF的含量(P<0.01)。结论 PABA2对慢性UC大鼠具有一定的治疗作用,其作用机制可能与下调炎性相关因子IL-8、IL-17、CRP、IFN-γ、TNF-α、IgG、MPO的表达,上调IL-4、EGF的表达有关。 展开更多
关键词 蜚蠊提取物 PABA2 溃疡性结肠炎 异体抗原 作用机制
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复方蜚蠊提取物缓解噁唑酮诱导大鼠活动期溃疡性结肠炎的作用机制 被引量:4
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作者 陈金虎 余万鑫 +3 位作者 耿福能 张成桂 何苗 巫秀美 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期337-343,共7页
目的研究复方蜚蠊提取物Ento⁃PB对噁唑酮诱导的活动期溃疡性结肠炎(UC)大鼠的治疗作用,并初步探讨其可能作用机制。方法采用噁唑酮诱导的溃疡性结肠炎大鼠模型,灌胃给予柳氮磺胺吡啶(SASP,0.3 g/kg)和复方Ento⁃PB(0.05、0.1、0.2 g/kg)... 目的研究复方蜚蠊提取物Ento⁃PB对噁唑酮诱导的活动期溃疡性结肠炎(UC)大鼠的治疗作用,并初步探讨其可能作用机制。方法采用噁唑酮诱导的溃疡性结肠炎大鼠模型,灌胃给予柳氮磺胺吡啶(SASP,0.3 g/kg)和复方Ento⁃PB(0.05、0.1、0.2 g/kg),通过测定大鼠DAI(疾病活动指数)、CMDI(结肠黏膜损伤指数)和HS(组织病理学)评分,ELISA法检测血清tNOS(总一氧化氮合酶)、iNOS(诱导型一氧化氮合酶)、IL⁃4(白细胞介素⁃4)、IL⁃10、IL⁃13、EGF(表皮生长因子)的含量及结肠MPO(髓过氧化物酶)、TNF⁃α(肿瘤坏死因子⁃α)的表达来评价复方Ento⁃PB对UC大鼠的作用。结果与模型组比较,复方Ento⁃PB高剂量组明显降低UC大鼠的DAI、CMDI及HS评分(P<0.05,P<0.01),降低结肠指数,升高血清IL⁃4、IL⁃10、EGF的水平(P<0.05,P<0.01),降低血清tNOS、iNOS、IL⁃13(P<0.05,P<0.01)和结肠MPO、TNF⁃α(P<0.05,P<0.01)的表达;复方Ento⁃PB低、中剂量有降低CMDI评分、iNOS、MPO表达和升高IL⁃4、IL⁃10、EGF表达的作用趋势,但无统计学差异(P>0.05)。结论复方Ento⁃PB对噁唑酮诱导UC大鼠有治疗作用,作用机制可能与提高抗炎水平,减轻炎性损伤,促进黏膜损伤后的愈合有关。 展开更多
关键词 复方蜚蠊提取物Ento⁃PB 噁唑酮 溃疡性结肠炎 柳氮磺胺吡啶
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