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花苜蓿TCP基因家族的鉴定及其在干旱胁迫下的表达模式分析
1
作者
王苗苗
赵相龙
+2 位作者
王召明
刘志鹏
闫龙凤
《生物技术通报》
北大核心
2025年第6期179-190,共12页
【目的】TCP(Teosinte branched 1/Cincinnata/Proliferating cell factor)是调控植物生长发育和胁迫响应的一类转录因子。解析花苜蓿TCP基因家族成员的序列结构和理化性质,了解花苜蓿MruTCP基因在干旱胁迫下的作用,为牧草分子育种提供...
【目的】TCP(Teosinte branched 1/Cincinnata/Proliferating cell factor)是调控植物生长发育和胁迫响应的一类转录因子。解析花苜蓿TCP基因家族成员的序列结构和理化性质,了解花苜蓿MruTCP基因在干旱胁迫下的作用,为牧草分子育种提供基因资源。【方法】基于全基因组水平鉴定花苜蓿TCP基因,对其进行生物信息学分析和干旱胁迫下的表达模式分析。【结果】在花苜蓿中共鉴定到20个TCP基因,分布在7条染色体上。系统进化分析结果表明,MruTCP蛋白分为3个亚家族:PCF、CIN和CYC/TB1,各类蛋白的Motif种类和排列顺序有所差异,均含有一个共同的保守基序Motif 1,家族成员间的结构较为简单。共线性分析结果表明,花苜蓿TCP家族内存在2个片段重复事件,且与大豆之间的亲缘关系最近。启动子顺式作用元件分析的结果表明,MruTCP家族成员功能较为复杂,在信号传递、响应非生物胁迫、光信号响应、激素调节等方面均发挥作用。干旱胁迫下的转录组数据和RT-qPCR的结果表明,花苜蓿TCP基因家族成员在不同时间点和不同浓度干旱处理下的表达模式不同。其中,MruTCP05和MruTCP09包含了丰富的激素响应元件和胁迫响应元件,并且受干旱胁迫的强烈诱导。【结论】结合TCP基因家族的生物信息学分析和表达模式分析结果,推测MruTCP05和MruTCP09是调控花苜蓿耐旱性的候选基因。
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关键词
花苜蓿
TCP基因
干旱胁迫
转录表达分析
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题名
花苜蓿TCP基因家族的鉴定及其在干旱胁迫下的表达模式分析
1
作者
王苗苗
赵相龙
王召明
刘志鹏
闫龙凤
机构
草种创新与草地农业生态系统全国重点实验室、兰州大学草地农业科技学院
国家草业技术
创新
中心(筹)
兰州大学
生命科学
学院
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第6期179-190,共12页
基金
内蒙古自治区“揭榜挂帅”项目(2022JBGS0040)
2023年国家草业技术创新中心(筹)重大创新平台建设专项(CCPTZX2023N04)
国家现代农业产业技术体系(CARS-34)。
文摘
【目的】TCP(Teosinte branched 1/Cincinnata/Proliferating cell factor)是调控植物生长发育和胁迫响应的一类转录因子。解析花苜蓿TCP基因家族成员的序列结构和理化性质,了解花苜蓿MruTCP基因在干旱胁迫下的作用,为牧草分子育种提供基因资源。【方法】基于全基因组水平鉴定花苜蓿TCP基因,对其进行生物信息学分析和干旱胁迫下的表达模式分析。【结果】在花苜蓿中共鉴定到20个TCP基因,分布在7条染色体上。系统进化分析结果表明,MruTCP蛋白分为3个亚家族:PCF、CIN和CYC/TB1,各类蛋白的Motif种类和排列顺序有所差异,均含有一个共同的保守基序Motif 1,家族成员间的结构较为简单。共线性分析结果表明,花苜蓿TCP家族内存在2个片段重复事件,且与大豆之间的亲缘关系最近。启动子顺式作用元件分析的结果表明,MruTCP家族成员功能较为复杂,在信号传递、响应非生物胁迫、光信号响应、激素调节等方面均发挥作用。干旱胁迫下的转录组数据和RT-qPCR的结果表明,花苜蓿TCP基因家族成员在不同时间点和不同浓度干旱处理下的表达模式不同。其中,MruTCP05和MruTCP09包含了丰富的激素响应元件和胁迫响应元件,并且受干旱胁迫的强烈诱导。【结论】结合TCP基因家族的生物信息学分析和表达模式分析结果,推测MruTCP05和MruTCP09是调控花苜蓿耐旱性的候选基因。
关键词
花苜蓿
TCP基因
干旱胁迫
转录表达分析
Keywords
Medicago ruthenica
TCP gene
drought stress
transcriptional expression analysis
分类号
S541 [农业科学—作物学]
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1
花苜蓿TCP基因家族的鉴定及其在干旱胁迫下的表达模式分析
王苗苗
赵相龙
王召明
刘志鹏
闫龙凤
《生物技术通报》
北大核心
2025
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