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多重等位基因特异性扩增--微流控芯片电泳法同时测定多个单核苷酸多态性位点
被引量：
2
1
作者
汪维鹏
周国华
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期219-224,共6页
文章以微流控芯片电泳为检测平台,建立了一种基于DNA适配器连接介导的多重等位基因特异性扩增同时测定多个单核苷酸多态性(SNP)位点的方法。以白细胞介素1β(IL1B)基因中的7个SNP位点(794C>T、1274C>T、2143T>C、2766T>del...
文章以微流控芯片电泳为检测平台,建立了一种基于DNA适配器连接介导的多重等位基因特异性扩增同时测定多个单核苷酸多态性(SNP)位点的方法。以白细胞介素1β(IL1B)基因中的7个SNP位点(794C>T、1274C>T、2143T>C、2766T>del、3298G>A、5200G>A和5277C>T)为检测对象,通过PCR预扩增得一段含该7个待测SNP位点的长片段;用限制性内切酶MboⅠ将其消化成短片段,再与DNA适配器(adapter)相连;以连接产物为模板,在两管中分别用7条等位基因特异性引物和一条公用引物进行7重等位基因特异性扩增;最后用微流控芯片电泳法分离等位基因特异性扩增产物,根据两管扩增产物的芯片电泳图谱中扩增片段的大小判断SNP的类型。采用本法成功测定了48名健康中国人的IL1B基因上的7个SNP位点,与聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法(PCR-RFLP)和测序法测定结果完全一致。本法结果准确,可用于同时测定多个SNP位点;以微流控芯片电泳作为检测平台,分析速度快,样品需要量少;借助于自制筛分凝胶和重复使用芯片,使得SNP分析成本大大降低。
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关键词
单核苷酸多态性
等位基因特异性扩增
微流控芯片电泳
白细胞介素1β基因
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职称材料
题名
多重等位基因特异性扩增--微流控芯片电泳法同时测定多个单核苷酸多态性位点
被引量：
2
1
作者
汪维鹏
周国华
机构
华东医学生物技术研究所
苏州大学药学院药物分析教研室
南京
大学
医
学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期219-224,共6页
基金
国家自然科学基金项目(编号:30270368)资助
文摘
文章以微流控芯片电泳为检测平台,建立了一种基于DNA适配器连接介导的多重等位基因特异性扩增同时测定多个单核苷酸多态性(SNP)位点的方法。以白细胞介素1β(IL1B)基因中的7个SNP位点(794C>T、1274C>T、2143T>C、2766T>del、3298G>A、5200G>A和5277C>T)为检测对象,通过PCR预扩增得一段含该7个待测SNP位点的长片段;用限制性内切酶MboⅠ将其消化成短片段,再与DNA适配器(adapter)相连;以连接产物为模板,在两管中分别用7条等位基因特异性引物和一条公用引物进行7重等位基因特异性扩增;最后用微流控芯片电泳法分离等位基因特异性扩增产物,根据两管扩增产物的芯片电泳图谱中扩增片段的大小判断SNP的类型。采用本法成功测定了48名健康中国人的IL1B基因上的7个SNP位点,与聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法(PCR-RFLP)和测序法测定结果完全一致。本法结果准确,可用于同时测定多个SNP位点;以微流控芯片电泳作为检测平台,分析速度快,样品需要量少;借助于自制筛分凝胶和重复使用芯片,使得SNP分析成本大大降低。
关键词
单核苷酸多态性
等位基因特异性扩增
微流控芯片电泳
白细胞介素1β基因
Keywords
single nucleotide polymorphism
allele-specific amplification
microchip electrophoresis
interleukin 1B gene
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多重等位基因特异性扩增--微流控芯片电泳法同时测定多个单核苷酸多态性位点
汪维鹏
周国华
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009
2
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